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Genome-Wide Discovery and Expression Profiling of the SWEET Sugar Transporter Gene Family in Woodland Strawberry (Fragaria vesca) under Developmental and Stress Conditions: Structural and Evolutionary Analysis

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Phyton-International Journal of Experimental Botany 2024年第7期93卷 1485-1502页

作者： Shoukai Lin Yifan Xiong Shichang Xu manegdebwaoaga arthur fabrice kabore Fan Lin Fuxiang Qiu College of Environmental and Biological Engineering Putian UniversityPutian351100China College of Life Science Fujian Agriculture and Forestry UniversityFuzhou350002China Fujian Provincial Key Laboratory of Ecology-Toxicological Effects&Control for Emerging Contaminants Putian UniversityPutian351100China Key Laboratory of Ecological Environment and Information Atlas(Putian University) Fujian Provincial UniversityPutian351100China Affiliated Hospital of Putian University Putian351100China

The SWEET(sugar will eventually be exported transporter)family proteins are a recently identiﬁed class of sugar transporters that are essential for various physiological *** the functions of the SWEET proteins have been identiﬁed in a number of species,to date,there have been no reports of the functions of the SWEET genes in woodland strawberries(Fragaria vesca).In this study,we identiﬁed 15 genes that were highly homolo-gous to the *** AtSWEET genes and designated them as FvSWEET1–*** then conducted a structural and evolutionary analysis of these 15 FvSWEET *** phylogenetic analysis enabled us to categor-ize the predicted 15 SWEET proteins into four distinct *** observed slight variations in the exon‒intron structures of these genes,while the motifs and domain structures remained highly ***,the developmental and biological stress expression proﬁles of the 15 FvSWEET genes were extracted and ***,WGCNA coexpression network analysis was run to search for possible interacting genes of FvSWEET *** results showed that the FvSWEET10 genes interacted with 20 other genes,playing roles in response to bacterial and fungal *** outcomes of this study provide insights into the further study of FvSWEET genes and may also aid in the functional characterization of the FvSWEET genes in woodland strawberries.

关键词： Woodland strawberry SWEET gene sugar transporter genome-wide identiﬁcation characterization expression

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蓝莓根部的真菌群落结构对氮和磷增加的响应

蓝莓根部的真菌群落结构对氮和磷增加的响应

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作者： kabore manegdebwaoaga arthur fabrice 绍兴文理学院

学位级别：硕士

杜鹃花科植物广泛分布于陆地生态系统中。众所周知,它们在杜鹃花类菌根真菌(ERMF)与根形成的共生体的帮助下,能够在严酷的环境中生存。近年来,人为氮(N)和磷(P)的沉积急剧增加,从而影响了全球生态系统,以及植物根部的真菌群落。然而,人... 详细信息

杜鹃花科植物广泛分布于陆地生态系统中。众所周知,它们在杜鹃花类菌根真菌(ERMF)与根形成的共生体的帮助下,能够在严酷的环境中生存。近年来,人为氮(N)和磷(P)的沉积急剧增加,从而影响了全球生态系统,以及植物根部的真菌群落。然而,人们对其影响仍然知之甚少。本实验在盆栽条件下,通过添加不同浓度梯度的N(NHCl),P(Na HPO)和共同添加N(NHCl)和P(Na HPO),对3年生高丛蓝莓进行温室试验。经过4个月(春季)和8个月(夏季)的营养添加处理,采集毛根样本。利用高通量测序技术,对添加营养物质条件下与宿主毛根相关的真菌群落进行了测定,并对菌根侵染率和土壤的理化参数进行了测定。结果表明:春季和夏季发现蓝莓毛根中分别有259个OTUs和549个OTUs。主要优势目为子囊菌的Archaeorhizomycetales,担子菌的Sebacinales(公认的ERMF)。此外,与对照相比,营养添加导致真菌群落发生了较大变化,排序图清楚地说明了这一点。与对照组和其他处理组相比,氮和磷共同添加的处理组真菌群落的丰富度和多样性最高。另外,氮和磷共同添加处理在两个季节都能促进ERMF的相对丰度的增加,与其他处理组相比,其ERMF的增长更为稳定。而在单独进行氮或磷的处理组中,ERMF相对丰度随浓度梯度、季节都有变化。总体上,ERMF的相对丰度在夏季更高,与土壤参数无显著相关性。此外,本研究还发现了一些功能未知的特殊真菌目(Branch06和GS34)和一些病原真菌目(Olpidiales),它们都与土壤因子密切相关。本实验的测序结果中公认的ERMF——子囊菌的Helotiales相对丰度很低。与对照相比,添加了N和P的宿主根部菌根侵染率都有一定程度的下降。这些结果可能有助于更好地了解蓝莓根部的真菌群落结构在营养素添加下的响应。然而,今后对于这些未知真菌的鉴定,以及不同栽培品种蓝莓根部ERMF对营养的持续胁迫的响应,还需要在温室和苗圃中进行深入的研究。

关键词：蓝莓真菌群落结构杜鹃花类菌根氮磷

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