检索结果-南通市图书馆

Natural Science 2014年第5期6卷 323-337页

作者： Aline S.Romao-dumaresq Adriana M.Fróes Rafael R.C.Cuadrat Floriano P.Silva Alberto M.R.dávila Laboratório de Biologia Computacional e Sistemas Instituto Oswaldo Cruz(IOC)FIOCRUZRio de JaneiroBrazil Laboratório de Bioquímica de Proteínas e Peptídeos Instituto Oswaldo Cruz(IOC)FIOCRUZRio de JaneiroBrazil Pólo de Biologia Computacional e Sistemas Instituto Oswaldo Cruz(IOC)FIOCRUZRio de JaneiroBrazil

Chitinases catalyze the hydrolysis of chitin, a linear homopolymer of β-(1,4)-linked N-acetylglucosamine. The broad range of applications of chitinolytic enzymes makes their identification and study very promising. Metagenomic approaches offer access to functional genes in uncultured representatives of the microbiota and hold great potential in the discovery of novel enzymes, but tools to extensively explore these data are still scarce. In this study, we develop a chitinase mining pipeline to facilitate the comprehensive search of these enzymes in environmental metagenomic databases and also to explore phylogenetic relationships among the retrieved sequences. In order to perform the analyses, UniprotKB fungal and bacterial chitinases sequences belonging to the glycoside hydrolases (gH) family-18, 19 and 20 were used to generate 15 reference datasets, which were then used to generate high quality seed alignments with the MAFFT program. Profile Hidden markov Models (pHMMs) were built from each seed alignment using the hmmbuild program of HMMER v3.0 package. The best-hit sequences returned by hmmsearch against two environmental metagenomic databases (Community Cyberinfrastructure for Advanced Microbial Ecology Research and Analysis—CAMERA and Integrated Microbial genomes—IMg/M) were retrieved and further analyzed. The NJ trees generated for each chitinase dataset showed some variability in the catalytic domain region of the metagenomic sequences and revealed common sequence patterns among all the trees. The scanning of the retrieved metagenomic sequences for chitinase conserved domains/signatures using both the InterPro and the RPS-BLAST tools confirmed the efficacy and sensitivity of our pHMM-based approach in detecting putative chitinases sequences. These analyses provide insight into the potential reservoir of novel molecules in metagenomic databases while supporting the chitinase mining pipeline developed in this work. By using our chitinase mining pipeline, a larg

关键词： Chitinase Metagenome pHMM Sequence Search

对比原发性肝细胞癌立体定向放疗与射频消融疗效成本的markov模型研究

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国际医学放射学杂志 2017年第4期 463-464页

作者： E.L.Pollom K.Lee B.Y.durkee M.grade d.A.Mokhtari d.R.Wahl 王争 department of Radiation Oncology Stanford University School of Medicine Stanford University Medical Center

摘要目的通过评估立体定向放射治疗(SBRT)与射频消融(RFA)对无法手术的局灶性肝细胞癌(HCC)病人的疗效成本,以找出最佳的治疗方法组合。材料与方法通过markov模型决策分析,为适合RFA和SBRT两种治疗方法的,且不能手术的局灶性HCC病人评...

摘要目的通过评估立体定向放射治疗(SBRT)与射频消融(RFA)对无法手术的局灶性肝细胞癌(HCC)病人的疗效成本,以找出最佳的治疗方法组合。材料与方法通过markov模型决策分析,为适合RFA和SBRT两种治疗方法的,且不能手术的局灶性HCC病人评估以下不同治疗组合的疗效成本:(1)SBRT作为初步治疗,随后SBRT用于局部进展治疗(SBRT-SBRT);(2)RFA初步治疗,随后RFA用于局部

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免疫算法抗体浓度调节定义的改进

数据采集与处理 2003年第1期18卷 44-48页

作者：吕岗陈小平谭得健苏州大学电子信息学院苏州215021 中国矿业大学信电学院徐州221008

基于信息熵的免疫算法存在计算复杂 ,设置的参数需要凭经验调节和含有冗余的计算信息而导致算法收敛速度慢的缺点 ,通过对免疫抗体定义的改进 ,本文提出了一种基于矢量距的改进免疫算法并证明了它的全局收敛性。多峰函数优化问题的测试... 详细信息

基于信息熵的免疫算法存在计算复杂 ,设置的参数需要凭经验调节和含有冗余的计算信息而导致算法收敛速度慢的缺点 ,通过对免疫抗体定义的改进 ,本文提出了一种基于矢量距的改进免疫算法并证明了它的全局收敛性。多峰函数优化问题的测试结果揭示基于矢量距的免疫算法在全局收敛性方面要优于遗传算法 ;在收敛速度方面要快于基于信息熵的免疫算法。

关键词：免疫算法熵矢量距收敛性

High-resolution microendoscopy for esophageal cancer screening in China: A cost-effectiveness analysis

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World Journal of gastroenterology 2015年第18期21卷 5513-5523页

作者： Chin Hur Sung Eun Choi Chung Yin Kong gui-Qi Wang Hong Xu Alexandros d Polydorides Li-Yan Xue Katherine E Perzan Angela C Tramontano Rebecca R Richards-Kortum Sharmila Anandasabapathy Institute for Technology Assessment Massachusetts General Hospital Harvard Medical School Boston MA 02114 United States gastrointestinal Unit Massa- chusetts General Hospital department of Endoscopy Cancer Institute and Hospital Chinese Academy of Medical Sciences department of Endoscopy The First Hospital of Jilin University department of Pathology The Mount Sinai Medical Center Icahn School of Medicine department of Pathology Cancer Institute and Hospital Chinese Academy of Medical Sciences department of Bioengineering Rice University Baylor global Initiatives and the Baylor global Innovation Center Baylor College of Medicine

AIM:To study the cost-effectiveness of high-resolution microendoscopy(HRME)in an esophageal squamous cell carcinoma(ESCC)screening program in ***:A decision analytic markov model of ESCC was *** model analyses were conducted for cohorts consisting of an averagerisk population or a high-risk population in *** 50-year-old individuals were followed until age 80 or *** compared three different strategies for both cohorts:(1)no screening;(2)standard endoscopic screening with Lugol’s iodine staining;and(3)endoscopic screening with Lugol’s iodine staining and an *** parameters were estimated from the literature as well as from gLOBOCAN,the Cancer Incidence and Mortality Worldwide cancer *** states in the model included non-neoplasia,mild dysplasia,moderate dysplasia,high-grade dysplasia,intramucosal carcinoma,operable cancer,inoperable cancer,and *** ESCC incidence transition rates were generated for the average-risk and high-risk *** in Chinese currency were converted to international dollars(I$)and were adjusted to 2012dollars using the Consumer Price ***:The main outcome measurements for this study were quality-adjusted life years(QALYs)and incremental cost-effectiveness ratio(ICER).For the average-risk population,the HRME screening strategy produced 0.043 more QALYs than the no screening strategy at an additional cost of I$646,resulting in an ICER of I$11808 per QALY *** endoscopic screening was weakly *** the high-risk population,when the HRME screening strategy was compared with the standard screening strategy,the ICER was I$8173 per *** both the high-risk and average-risk screening populations,the HRME screening strategy appeared to be the most cost-effective strategy,producing ICERs below the willingness-topay threshold,I$23500 per ***-way sensitivity analysis showed that,for the average-risk population,higher specificity of Lugol’s i

关键词： Cost-effectiveness analysis diagnostic imaging Endoscopy Esophageal squamous cell cancer Simulation disease model

人均碳排放和效益协调视角下的中国分省碳减排潜力数据集

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全球变化数据学报（中英文） 2019年第4期3卷 356-363,463-470页

作者：周迪华诗润广东外语外贸大学粤港澳大湾区研究院广州510006 广东外语外贸大学经济贸易学院广州510006

在人均碳排放和效率协调基础上,计算区域碳减排潜力,对于更好地促进绿色低碳经济发展具有积极意义。《人均碳排放和效益协调视角下的中国分省碳减排潜力数据集》是基于《中国统计年鉴》、《中国能源统计年鉴》和"国泰安金融数据库"中199... 详细信息

在人均碳排放和效率协调基础上,计算区域碳减排潜力,对于更好地促进绿色低碳经济发展具有积极意义。《人均碳排放和效益协调视角下的中国分省碳减排潜力数据集》是基于《中国统计年鉴》、《中国能源统计年鉴》和"国泰安金融数据库"中1997–2015年中国29个省级地区(海南、西藏、香港、澳门、台湾因数据不全,没有统计)的数据开发得到。研发的流程包括:首先,按照各省的投资隐含平减指数将历年的固定资本形成额统一折算成1952年不变价的数值;然后,根据所设定的折旧率和基期资本存量,运用永续盘存法对历年资本存量进行估算,得到资本存量数据;将1997–2015年各省名义gdP除以1952年为基期的gdP平减指数得到以1952年为基期的实际gdP;根据化石燃料燃烧以及水泥的消耗量以及对应的碳排放系数折算得到各省碳排放总量,再除以年末总人口数计算得到人均碳排放量;利用每单位国民生产总值的增长所带来的二氧化碳排放量表征碳排放强度;通过Super-SBM模型测算碳排放效率;基于markov链框架测算人均碳排放和效率的俱乐部趋同指数,以分析人均碳排放和效率原则在考察中国碳减排潜力中的重要性以及在制定碳减排政策时的侧重点,进而在人均碳排放与效率协调的视角下重新测算出各省份的碳减排潜力,得到人均碳排放与效率协调视角下的中国分省碳减排潜力数据集。该数据集包括:(1)1997–2015年中国29省资本存量;(2)1997–2015年中国29省以1952年为基期的实际gdP;(3)1997–2015年中国29省人均碳排放量;(4)1997–2015年中国29省碳排放强度;(5)1997–2015年中国29省碳排放效率(Super-SBM模型);(6)1997–2015年中国29省能源消费数据;(7)中国人均碳排放与效率的markov转移概率结果;(8)不同时长下人均碳排放和效率的俱乐部趋同指数模型;(9)人均碳排放与效率的区域固化程度差异性检验;(10)人均碳排放与效率协调视角下中国分省碳减排潜力指数测算。数据集存储为.xlsx格式,由1个文件组成,数据量为134 KB。基于该数据集的分析研究成果发表在《自然资源学报》2019年第34卷第1期。

关键词：碳减排潜力人均碳排放碳排放效率中国自然资源学报

全髋翻修术使用双动全髋与大直径股骨头全髋的费用分析

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临床骨科杂志 2022年第5期25卷 686-686页

作者： ABdEL M P MILLER L E HANSSEN A d 胡孔足(摘译) 不详

作者采用markov模型分析单侧全髋翻修术,采用双动全髋(126例)、大直径股骨头全髋(176例),模拟3年内产生的费用。模型参数来源于国家关节登记系统,费用数值来源于医保支付系统。私人支付费用数值来源于医疗计费系统。

关键词： markov模型全髋大直径股骨头费用分析登记系统计费系统医保支付双动

在高收入国家的γ干扰素释放试验与结核病筛查:成本-效益分析

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国际结核病与肺部疾病杂志 2007年第1期2卷 17-29页

作者： O. Oxlade K. Schwartzman d. Menzies 张宗德（译）杨振旦（校）张立兴（审） Respiratory Epidemiology and Clinical Research Unit Montreal Chest Institute McGill University Montreal Canada 不详

目的:结核菌素皮肤试验(TST)是发现潜伏性结核感染(LTBI)的经典方法,目前γ干扰素试验(IgRA)也是可供选择的技术。我们比较了不同人群、不同临床状态下TST及IgRA的成本效益。方法:20年来加拿大对入境的外国移民或结核病接触者采用了不... 详细信息

目的:结核菌素皮肤试验(TST)是发现潜伏性结核感染(LTBI)的经典方法,目前γ干扰素试验(IgRA)也是可供选择的技术。我们比较了不同人群、不同临床状态下TST及IgRA的成本效益。方法:20年来加拿大对入境的外国移民或结核病接触者采用了不同的筛查策略,我们采用markov模式比较了预期发现的病例数与成本的分析。并对比较便宜的商品试剂盒IgRA:γ干扰素定量测定(QFT)进行了调查。模型(model)输入数据均源于已发表的文献。结果:对入境移民,采用胸部X线拍片(CXR)是符合成本-效益原则的,而QFT是最不符合成本- 效益原则者。序贯进行TST及QFT比任何情况下单一行QFT更符合成本-效益。在特定的(选择的)亚群中,也比单一进行TST更符合成本-效益原则。在密切接触者及不定期接触者中,采用TST或QFT筛查是节约成本的(cost saving):除在婴儿期后接种BCg的接触者外,采用TST的收益(savings)大于QFT。结论:只有在结核病高危人群中,以TST或QFT筛查LTBI是符合成本-效益的。TST阳性者再行QFT是最符合成本-效益原则的。

关键词：筛查干扰素定量测定结核病控制结核病预防经济学分析

成人手术患者术前尿钠肽浓度的预测价值：系统回顾与荟萃分析

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麻醉与镇痛 2013年第2期9卷 17-33页

作者： giovanna A. Lurati Buse Michael T. Koller Christoph Burkhart Manfred d. Seeberger Miodrag Filipovic 安博(译) 杜金(校) department of Anesthesia and Intensive Care Medicine University Hospital Basel Basel Switzerland department of Basel Institute of Clinical Epidemiology University Hospital Basel Basel Switzerland 不详

背景一些研究对术前B型尿钠肽（natriuretic peptides，NPs）用于预测术后死亡率进行了评估，然而，每项研究中死亡例数较少，致使研究效能较差。我们对涉及术前NP水平预测心脏和非心脏手术后死亡的研究进行了系统回顾和荟萃分析。方法... 详细信息

背景一些研究对术前B型尿钠肽（natriuretic peptides，NPs）用于预测术后死亡率进行了评估，然而，每项研究中死亡例数较少，致使研究效能较差。我们对涉及术前NP水平预测心脏和非心脏手术后死亡的研究进行了系统回顾和荟萃分析。方法我们用“尿钠肽”、“手术或外科手术”检索MEdLINE和EMBASE，与诊断和预测的词有效组合。两名研究人员独立评价研究的入选资格并提取数据。终点为所有≥6个月和≤90天引起死亡的研究。我们使用双变量模型获得预测的精确度和其异质性，用Bayesian markov chain Monte Carlo法计算混合的阳性预测值（positive predicti vevalue，PPV）和阴性预测值（negative predictive value，NPV）。结果回顾的1558篇文献中，23项研究满足入选标准。心脏手术后，NP对≥6个月死亡的诊断比值比为4．11（95％可信区间，2．22—7．60），PPV为0．17（95％Bayesian可信区间，0．07—0．36），NPV为0．96（0．90—0．98）。非心脏手术后，NP对≥6个月死亡的诊断比值比为4．97（3．06—8．07），相应的PPV为0．24（0．14—0．38），NPV为0．94（0．88—0．97），结果与≤90天死亡的预测值相似。结论术前NP浓度与心脏和非心脏手术后的死亡率相关。NP在两类手术中的NPV均较高，表明术前NP浓度可能有助于术前风险评估分层。

关键词：术前风险评估 B型尿钠肽手术后死亡预测价值荟萃分析系统回顾浓度非心脏手术后

基于象素形态测量法分析精神分裂症患者脑白质结构

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中国组织工程研究与临床康复 2007年第13期11卷 2454-2458页

作者：董问天刘琳裴新龙袁慧书谢敬霞阎浩张岱北京大学精神卫生研究所北京市100083 北京大学第三医院放射科北京市100083

目的:应用基于象素的形态测量学方法,分析精神分裂症大脑白质结构与健康人的差异。方法:①分组:精神分裂症组为10名北京大学精神卫生研究所和北京回龙观医院2005-04/2006-03收治,符合ICd-10、dSM-Ⅳ精神分裂症偏执型诊断标准的患者;健... 详细信息

目的:应用基于象素的形态测量学方法,分析精神分裂症大脑白质结构与健康人的差异。方法:①分组:精神分裂症组为10名北京大学精神卫生研究所和北京回龙观医院2005-04/2006-03收治,符合ICd-10、dSM-Ⅳ精神分裂症偏执型诊断标准的患者;健康对照组是年龄、性别和受教育程度与精神分裂症组相匹配的健康志愿者10名。所有受试者均签署知情同意书。②检测方法和参数:采用西门子1.5TSonataMRI成像系统,对所有受试者行全脑扫描,解剖图像采用T1加权序列矢状成像(MPRAgE),共采集96层。TR=1900ms,TE=3.93ms,flip15°,FOV=220mm×220mm,图像分辨率0.43mm×0.43mm×1.70mm。③数据处理:在SPM5平台上,使用VBM5工具箱进行技术进行处理。采用MNI的标准脑图谱配准,配准后图像分辨率2mm×2mm×2mm;采用HMRF算法进行组织分割,目标是测量白质密度,故未经体积调制;用12mm半高全宽高斯核对脑白质密度图进行平滑;然后采用SPM的组分析方法,对两组进行成组t检验,t>3.61,P<0.001(未校正)、相连象素大于20个的信号变化脑区视为有差异脑区。结果:20名受试者均完成测试进入结果分析。精神分裂症组密度低于对照组的区域有双侧颞下回、双侧额下回、双侧梭状回、左侧海马旁回、左侧胼胝体、左侧丘脑、左侧顶下叶、左侧楔前叶、右侧额中回、右侧颞中回,没有发现精神分裂症组白质密度高于对照组的区域。结论:①精神分裂症患者白质缺陷部位广泛。结合同一研究对象的功能磁共振成像研究结果提示左侧丘脑和双侧梭状回与精神分裂症有密切关系。②基于象素的形态测量学的方法有快速和全自动的特点,具有不受分析人员主观影响等优点。

关键词：磁共振成像基于体素的形态学分析精神分裂症脑白质丘脑梭状回康复工程