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铜绿假单胞菌SQ6开放式发酵生产鼠李糖

生态学杂志 2024年第9期43卷 2901-2907页

作者：马信张阳修建龙白雪韩斯琴梁小龙张颖沈阳师范大学生命科学学院沈阳110034 中国科学院污染生态与环境工程重点实验室中国科学院沈阳应用生态研究所沈阳110016 中国石油勘探开发研究院提高采收率研究中心河北廊坊065000

为降低发酵成本,提高微生物采油效率,本研究开展了采油功能菌SQ6(鼠李糖脂产生菌)的开放式发酵探索研究。考察了菌株SQ6在常规发酵和开放式发酵方式不同温度下的生长、鼠李糖脂产量、表面张力及乳化指数等参数,采用液相色谱高分辨质谱... 详细信息

为降低发酵成本,提高微生物采油效率,本研究开展了采油功能菌SQ6(鼠李糖脂产生菌)的开放式发酵探索研究。考察了菌株SQ6在常规发酵和开放式发酵方式不同温度下的生长、鼠李糖脂产量、表面张力及乳化指数等参数,采用液相色谱高分辨质谱联用仪分析了鼠李糖脂产物同系物组成,高通量测序分析了开放式发酵的细菌群落结构和杂菌率。结果表明:菌株SQ6最高生长温度是45℃,能够合成大量鼠李糖脂的最高温度是40℃;开放式发酵产量最高、杂菌率最低的发酵温度是37℃,鼠李糖脂产量达到7050.1 mg·L^(-1),仅比常规发酵的10513.2 mg·L^(-1)降低了33%,杂菌率最低,达到3.13%;针对SQ6菌株,高温发酵并没有更好的杂菌抑制效果并且降低了鼠李糖脂产量,发酵产物结构显示产物以单鼠李糖脂为主,占比达到96.1%。高浓度单鼠李糖脂的合成可能是中温条件下开放式发酵具有较好杂菌抑制率的主要原因。菌株SQ6是一株具有较大开放式发酵潜力的采油功能菌。

关键词：铜绿假单胞菌开放式发酵鼠李糖脂杂菌抑制率

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基于混合知识蒸馏的轻量级胸部疾病分类算法

光电子．激光 2024年第9期35卷 993-1000页

作者：赖裕李锵聂为之白云鹏赵丰天津大学微电子学院天津300072 天津大学电气自动化与信息工程学院天津300072 天津市胸科医院心血管外科天津300222

针对现有胸部疾病分类算法参数量较大、对运行设备的硬件资源要求较高的问题,本文基于混合知识蒸馏(knowledge distillation,KD)的训练策略提出一种轻量级胸部疾病分类算法RMSNet。首先,该算法将优化后的残差收缩模块加入到基础网络Mobi... 详细信息

针对现有胸部疾病分类算法参数量较大、对运行设备的硬件资源要求较高的问题,本文基于混合知识蒸馏(knowledge distillation,KD)的训练策略提出一种轻量级胸部疾病分类算法RMSNet。首先,该算法将优化后的残差收缩模块加入到基础网络MobileViT中,利用软阈值化的方式过滤X光片中的背景噪声;其次,提出混合知识蒸馏训练策略,利用多层级注意力图和相似性激活矩阵作为监督信号,提升轻量级模型的分类性能;最后,使用焦点损失函数(focal loss,FL)缓解数据集正负样本不均衡的问题。在ChestX-ray14数据集上展开验证,蒸馏训练后的RMSNet学生模型识别14类胸部疾病的平均AUC值为0.836,而参数量和浮点计算量分别为0.96 M和0.27 G。实验结果表明,本文算法在保持轻量化的同时分类精度更高,能有效降低算法运行时的硬件要求。

关键词： ChestX-ray14 多标签分类卷积神经网络(CNN) 医学图像处理知识蒸馏(KD)

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融合先验知识和字形特征的中文命名实体识别

计算机应用 2024年第3期44卷 702-708页

作者：董永峰白佳明王利琴王旭河北工业大学人工智能与数据科学学院天津300401 河北省大数据计算重点实验室(河北工业大学) 天津300401 河北省数据驱动工业智能工程研究中心(河北工业大学) 天津300401

针对命名实体识别(NER)任务中相关模型通常仅对字符及相关词汇进行建模,未充分利用汉字特有的字形结构信息和实体类型信息的问题,提出一种融合先验知识和字形特征的命名实体识别模型。首先,采用结合高斯注意力机制的Transformer对输入... 详细信息

针对命名实体识别(NER)任务中相关模型通常仅对字符及相关词汇进行建模,未充分利用汉字特有的字形结构信息和实体类型信息的问题,提出一种融合先验知识和字形特征的命名实体识别模型。首先,采用结合高斯注意力机制的Transformer对输入序列进行编码,并从中文维基百科中获取实体类型的中文释义,采用双向门控循环单元(BiGRU)编码实体类型信息作为先验知识,利用注意力机制将它与字符表示进行组合;其次,采用双向长短时记忆(BiLSTM)网络编码输入序列的远距离依赖关系,通过字形编码表获得繁体的仓颉码和简体的现代五笔码,采用卷积神经网络(CNN)提取字形特征表示,并根据不同权重组合繁体与简体字形特征,利用门控机制将它与经过BiLSTM编码后的字符表示进行组合;最后,使用条件随机场(CRF)解码,得到命名实体标注序列。在偏口语化的数据集Weibo、小型数据集Boson和大型数据集PeopleDaily上的实验结果表明,与基线模型MECT(Multi-metadata Embedding based Cross-Transformer)相比,所提模型的F1值别提高了2.47、1.20和0.98个百分点,验证了模型的有效性。

关键词：命名实体识别注意力机制卷积神经网络双向长短时记忆条件随机场

二次供水系统不锈钢改造对水质微生物安全性的成效

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净水技术 2024年第9期43卷 136-141页

作者：范晶璟白晓慧上海临港供排水发展有限公司上海201305 上海交通大学生命科学技术学院上海200240

二次供水系统材质对输配水质有重要影响。为了研究二次供水系统更新不锈钢材质对管网微生物水质改善成效,采用基于R2A贫营养培养基的异养菌平皿计数(HPC)检测方法和基于16S rRna基因高通量测序的微生物组学技术对上海市直饮水示范区不... 详细信息

二次供水系统材质对输配水质有重要影响。为了研究二次供水系统更新不锈钢材质对管网微生物水质改善成效,采用基于R2A贫营养培养基的异养菌平皿计数(HPC)检测方法和基于16S rRna基因高通量测序的微生物组学技术对上海市直饮水示范区不锈钢材质改造前后的微生物质量进行了评估。结果表明,不锈钢管道改造可以有效降低二次供水系统中的微生物数量。在夏季对供水末端实施不锈钢材质改造后,供水水质中HPC数量明显下降。其中,高层泵后从改造前的平均968 CFU/mL降至178 CFU/mL,降幅约达82%;6楼立管从改造前的平均1383 CFU/mL降至88 CFU/mL降幅约达93.7%。未改造小区B的HPC整体水平高于改造小区A,改造后的小区B的HPC数量低于改造前。温度对二次供水末端微生物数量影响明显,10月数量明显高于11月和12月。从原水、出厂水到泵房水池进水,优势菌属由不动杆菌属转变为假单胞菌属,入户后Phreatobacter菌属逐渐占据优势。改造前的小区B相比改造后小区A拥有潜在致病表型和生物膜形成能力表型的微生物相对丰度更高,并主要由高丰度的不动杆菌属组成。二次供水不锈钢管材更换可以通过降低有关生物膜形成功能相关和致病相关的细菌丰度来控制饮用水中的部分微生物风险。

关键词：饮用水不锈钢管材异养菌平板计数微生物组高通量测序管网水质

Chinese national clinical practice guideline on diagnosis and treatment of biliary tract cancers

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中华医学杂志(英文版) 2024年第19期137卷 2024 Sep 4页

作者： Wang Xu’an bai Yongrui Chai Ningli Li Yexiong Linghu Enqiang Wang Liwei Liu Yingbin Society of Hepato-pancreatobiliary Surgery of Chinese Research Hospital Association Society of Digestive Endoscopy of the Chinese Medical Association Chinese Medical Journal Clinical Practice Guideline Collaborative Department of Biliary and Pancreatic Surgery Renji Hospital Shanghai Jiao Tong University School of Medicine State Key Laboratory of Systems Medicine for Cancers Shanghai Cancer Institute Shanghai Key Laboratory for Cancer Systems Regulation and Clinical Translation Shanghai China Department of Radiation Oncology Renji Hospital School of Medicine Shanghai Jiao Tong University Shanghai China Department of Gastroenterology and Hepatology the First Medical Center Chinese People’s Liberation Army General Hospital Beijing China State Key Laboratory of Molecular Oncology and Department of Radiation Oncology National Cancer Center/National Clinical Research Center for Cancer/Cancer Hospital Chinese Academy of Medical Sciences (CAMS) and Peking Union Medical College (PUMC) Beijing China State Key Laboratory of Oncogenes and Related Genes Shanghai Cancer Institute Department of Oncology Renji Hospital School of Medicine Shanghai Jiao Tong University Shanghai China

Background: Biliary tract carcinoma (BTC) is relatively rare and comprises a spectrum of invasive tumors arising from the biliary tree. The prognosis is extremely poor. The incidence of BTC is relatively high in Asian countries, and a high number of cases are diagnosed annually in China owing to the large population. Therefore, it is necessary to clarify the epidemiology and high-risk factors for BTC in China. The signs associated with BTC are complex, often require collaborative treatment from surgeons, endoscopists, oncologists, and radiation therapists. Thus, it is necessary to develop a comprehensive Chinese guideline for ***: This clinical practice guideline (CPG) was developed following the process recommended by the World Health Organization. The Grading of Recommendations Assessment, Development, and Evaluation approach was used to assess the certainty of evidence and make recommendations. The full CPG report was reviewed by external guideline methodologists and clinicians with no direct involvement in the development of this CPG. Two guideline reporting checklists have been adhered to: Appraisal of Guidelines for Research and Evaluation (AGREE) and Reporting Items for practice Guidelines in Healthcare (RIGHT).Results: The guideline development group, which comprised 85 multidisciplinary clinical experts across China. After a controversies conference, 17 clinical questions concerning the prevention, diagnosis, and treatment of BTC were proposed. Additionally, detailed descriptions of the surgical principles, perioperative management, chemotherapy, immunotherapy, targeted therapy, radiotherapy, and endoscopic management were ***: The guideline development group created a comprehensive Chinese guideline for the diagnosis and treatment of BTC, covering various aspects of epidemiology, diagnosis, and treatment. The 17 clinical questions have important reference value for the management of BTC.

关键词： Biliary tract carcinoma Etiology Diagnosis Treatment Surgery

Single-cell analyses of circulating tumor cells

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Cancer Biology & Medicine 2015年第3期12卷 184-192页

作者： Xi-Xi Chen Fan bai Biodynamic Optical Imaging Center School of Life Science Peking University

Circulating tumor cells(CTCs) are a population of tumor cells mediating metastasis, which results in most of the cancer related deaths. The number of CTCs in the peripheral blood of patients is rare, and many platforms have been launched for detection and enrichment of CTCs. Enumeration of CTCs has already been used as a prognosis marker predicting the survival rate of cancer patients. Yet CTCs should be more potential. Studies on CTCs at single cell level may help revealing the underlying mechanism of tumorigenesis and metastasis. Though far from developed, this area of study holds much promise in providing new clinical application and deep understanding towards metastasis and cancer development.

关键词： Circulating tumor cells (CTCs) single cell sequencing metastasis

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结合注意力机制的多重引导点云配准网络

计算机科学 2024年第2期51卷 142-150页

作者：刘旭珩柏正尧许祝杜佳锦肖霄云南大学信息学院昆明650221

针对点云配准过程中仅仅利用点云特征寻求对应关系使得离群点多、配准精度不高的问题进行研究,提出了一种使用点云之间匹配点概率矩阵和点云空间信息特征矩阵共同搜寻对应关系,并且相互配合确定对应点权重的点云配准网络——AMGNet。首... 详细信息

针对点云配准过程中仅仅利用点云特征寻求对应关系使得离群点多、配准精度不高的问题进行研究,提出了一种使用点云之间匹配点概率矩阵和点云空间信息特征矩阵共同搜寻对应关系,并且相互配合确定对应点权重的点云配准网络——AMGNet。首先使用点云特征提取网络获得两片待配准点云的高维特征;然后采用Transformer对独立特征进行上下文信息融合,之后利用关键点提取模块选取出特征更强的点,使用SoftBBS方法获得点云匹配点概率矩阵后,结合点云空间特征矩阵搜索到最终的对应关系,同时,权重分配也使用了双重矩阵共同决定的策略;最后使用奇异值分解获得需要的刚性变换矩阵。在ModelNet40,7Scenes等人工合成数据集和真实场景数据集上进行了多次实验。结果表明,在ModelNet40目标未知实验中的旋转矩阵和平移向量的均方误差分别降低至0.025和0.0046。AMGNet配准精度较高,抗干扰能力强,泛化能力强。

关键词：点云配准注意力机制多重矩阵引导加权SVD

基于BIM的CAD/CAE一体化分析技术在水利水电工程中的应用

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江西水利科技 2024年第3期50卷 188-193页

作者：罗成杨琳白青壮上海勘测设计研究院有限公司上海200335

在设计企业数字化转型的背景下,为提高水利水电工程数字化设计过程中结构分析水平,提高数据利用效率,本文研究了一个CAD/CAE一体化分析插件。插件基于MicroStation和Ansys软件平台研发,能够将BIM设计模型中的几何数据及材料数据导入至CA... 详细信息

在设计企业数字化转型的背景下,为提高水利水电工程数字化设计过程中结构分析水平,提高数据利用效率,本文研究了一个CAD/CAE一体化分析插件。插件基于MicroStation和Ansys软件平台研发,能够将BIM设计模型中的几何数据及材料数据导入至CAE软件中用于前处理工作,扩大了对复杂结构进行CAD/CAE一体化的适用范围;将Ansys软件中的计算结果数据转换至MicroStation平台中用于后处理工作,独立于CAE软件的后处理模块,有利于数据的流转和存储。插件在某面板堆石坝的结构分析过程中得到了良好应用,提高了数据利用水平。相关技术可用于其他水利水电工程结构分析模块中。

关键词：数据转换模型重绘 CAD/CAE 面板堆石坝

财政研发补贴的创新激励效应——来自中国规模种子企业的证据

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中国农村经济 2024年第4期 32-55页

作者：刘春青胡瑞法邓海艳白格全国农业技术推广服务中心北京大学现代农业研究院北京理工大学经济学院

财政研发补贴政策作为激励企业科技创新的政策工具,在提升中国种子企业科技创新能力方面发挥着至关重要的作用。本文研究基于2014-2021年中国2074家规模种子企业的调查数据,实证考察财政研发补贴对中国规模种子企业研发投入的影响及其... 详细信息

财政研发补贴政策作为激励企业科技创新的政策工具,在提升中国种子企业科技创新能力方面发挥着至关重要的作用。本文研究基于2014-2021年中国2074家规模种子企业的调查数据,实证考察财政研发补贴对中国规模种子企业研发投入的影响及其内在作用机制。研究结果表明:第一,财政研发补贴显著提升了规模种子企业的自主研发投资额与自主研发投资强度。多种计量方法的稳健性检验均支持这一结论。第二,财政研发补贴主要通过缓解企业的融资约束,促进规模种子企业增加其研发投入。第三,财政研发补贴对私有企业与非育繁推一体化企业的研发投资有显著正向影响,而对国有企业与育繁推一体化企业的影响则不显著。因此,本文研究认为,继续增加对规模种子企业的财政研发补贴将助力种子企业研发创新能力的提升,但需注意财政研发补贴对企业影响的异质性,制定更有针对性的政策,以更好地推动中国种业科技创新,并促进产业升级。

关键词：种子企业财政研发补贴研发投资融资约束