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8 Å structure of the outer rings of the Xenopus laevis nuclear pore complex obtained by cryo-EM and AI

Protein & Cell 2022年第10期13卷 760-777页

作者： linhua tai Yun Zhu He Ren Xiaojun Huang Chuanmao Zhang Fei Sun National Key Laboratory of Biomacromolecules Institute of BiophysicsCAS Center for Excellence in BiomacromoleculesChinese Academy of SciencesBeijing 100101China The Ministry of Education Key Laboratory of Cell Proliferation and Differentiation and the State Key Laboratory of Membrane Biology College of Life SciencesPeking UniversityBeijing 100871China Center for Biological Imaging Institute of BiophysicsChinese Academy of SciencesBeijing 100101China University of Chinese Academy of Sciences Beijing 100049China Bioland Laboratory(Guangzhou Regenerative Medicine and Health Guangdong Laboratory) Guangzhou 510005China

The nuclear pore complex(NPC),one of the largest protein complexes in eukaryotes,serves as a physical gate to regulate nucleocytoplasmic transport.Here,we determined the 8Åresolution cryo-electron microscopic(cryo-EM)structure of the outer rings containing nuclear ring(NR)and cytoplasmic ring(CR)from the Xenopus laevis NPC,with local resolutions reaching 4.9Å.With the aid of AlphaFold2,we managed to build a pseudoatomic model of the outer rings,including the Y complexes and flanking components.In this most comprehensive and accurate model of outer rings to date,the almost complete Y complex structure exhibits much tighter interaction in the hub region.In addition to two copies of Y complexes,each asymmetric subunit in CR contains five copies of Nup358,two copies of the Nup214 complex,two copies of Nup205 and one copy of newly identified Nup93,while that in NR contains one copy of Nup205,one copy of ELYS and one copy of Nup93.These in-depth structural features represent a great advance in understanding the assembly of NPCs.

关键词： nuclear pore complex cryo-EM Xenopus laevis AlphaFold2 nuclear ring cytoplasmic ring

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大豆异黄酮genistein的长期暴露通过下调MCM复合物抑制胆囊癌增殖的研究

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Science Bulletin 2022年第8期67卷 813-824,M0003页

作者：耿亚军陈世礼杨洋苗慧洁李雪川李国强马建张彤任泰李永盛李霖刘立果杨佳华王子逸邹路刘珂李洋严思远崔旭雅孙旭恒杨波张凌宵韩旭晟王传磊陈勃岳学良梁威任建军贾建光顾剑峰李志臻赵天锁王鹏魏东邱世梅向冬喜许鑫森陈炜何敏杨林华王辉陈涛花荣王许安吴向嵩龚伟王广义李茂岚张薇邵荣吴文广刘颖斌 Department of Biliary-Pancreatic Surgery Ren Ji HospitalShanghai Jiao Tong University School of MedicineShanghai 200127China Department of General Surgery Xinhua Hospital Affiliated to Shanghai Jiao Tong University School of MedicineShanghai 200092China Shanghai Key Laboratory of Biliary Tract Disease Research Shanghai 200127China Department of Hepatobiliary Surgery Affiliated Hospital of Jining Medical UniversityJining 272129China Department of General Surgery The Affiliated Hospital of Inner Mongolia Medical UniversityHohhot 010050China Department of Hepatobiliary and Pancreatic Surgery The First Hospital of Jilin UniversityChangchun 130021China Department of Hepatobiliary and Pancreatic Surgery Henan Provincial People’s HospitalZhengzhou 450003China Department of Surgical Oncology First Affiliated Hospital of Bengbu Medical CollegeBengbu 233099China Department of General Surgery Changshu No.1 People’s Hospital Affiliated to Soochow UniversityChangshu 215500China Department of Biliary Surgery Eastern Hepatobiliary Surgery HospitalShanghai 200433China Department of Pancreatic Cancer Tianjin Medical University Cancer Institute and HospitalTianjin 300060China Department of Hepatobiliary Surgery Affiliated Hospital of Nantong UniversityNantong 226001China State Key Laboratory of Oncogene and Related Genes and Department of Epidemiology Shanghai Cancer InstituteShanghai 200127China Department of Pharmacology Shanghai Jiao Tong University School of MedicineShanghai 200025China State Key Laboratory of Oncogenes and Related Genes Shanghai Cancer InstituteShanghai 200127China

大豆异黄酮是天然的酪氨酸激酶抑制剂,与多种肿瘤发病率和死亡率的降低密切相关.同时,酪氨酸激酶如ERBB2的激活是胆囊炎转化为胆囊癌的重要机制,因此,研究长期接触大豆异黄酮与胆囊癌的发生和发展之间的关系十分重要.这项85对的病例对... 详细信息

大豆异黄酮是天然的酪氨酸激酶抑制剂,与多种肿瘤发病率和死亡率的降低密切相关.同时,酪氨酸激酶如ERBB2的激活是胆囊炎转化为胆囊癌的重要机制,因此,研究长期接触大豆异黄酮与胆囊癌的发生和发展之间的关系十分重要.这项85对的病例对照研究发现,高血浆大豆异黄酮genistein水平与较低的胆囊癌风险相关(≥326.0与≤19.3 ng/mL对比,OR=0.15,95%可信区间0.04~0.59;趋势检验P=0.016),并且genistein暴露水平与胆囊癌组织中Ki67表达负相关(85例).与这些结果一致,体外和体内的长期genistein暴露模型中,胆囊癌细胞的增殖受到抑制.长期暴露于genistein降低了ERBB2的酪氨酸激酶活性,并影响了PTK6-AKT-GSK3β轴的功能,导致胆囊癌细胞中MCM复合物的表达下调.总之,长期接触与大豆制品摄入相关的genistein可能在预防甚至抑制胆囊癌的增殖方面起到一定的作用.

关键词： Gallbladder cancer Dietary exposure Genistein ERBB2 pathway activation MCM protein complex

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中国胆囊癌流行病学特征与诊治及预后分析(附6 159例报告)

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中华消化外科杂志 2022年第1期21卷 114-128页

作者：孙旭恒王一钧张薇耿亚军李永盛任泰李茂岚王许安吴向嵩吴文广陈炜陈涛何敏王辉杨林华邹路蒲鹏杨明杰刘照南陶雯琦冯佳毅贾子衡郑志元钟丽静钱源滢董平王雪峰顾钧刘连新钱叶本顾剑峰柳咏崔云甫孙备李兵邵成浩姜小清马强郑进方刘昌军曹宏陈晓亮李其云王琳王昆华张磊郑林辉朱春富蔡鸿宇曹景玉朱海宏刘军党学义刘建生张学利徐军明费哲为杨晓平杨佳华张再洋王旭林王益郝继辉张启瑜金慧涵刘昌韩玮闫军武步强戴朝六吕文才全志伟彭淑牖龚伟刘颖斌上海交通大学医学院附属仁济医院胆胰外科上海市肿瘤研究所癌基因及相关基因国家重点实验室上海市胆道疾病研究重点实验室上海200127 上海交通大学医学院附属新华医院普通外科上海200092 中国科学技术大学附属第一医院(安徽省立医院)肝胆外科合肥230001 安徽医科大学第一附属医院肝胆胰外科合肥230022 常熟市第一人民医院普外科常熟215500 常州市中医医院肿瘤科常州213003 哈尔滨医科大学附属第二医院胆胰外科哈尔滨150001 哈尔滨医科大学附属第一医院肝胆胰腺外科哈尔滨150001 哈尔滨医科大学附属肿瘤医院肝胆胰外科哈尔滨150081 海军军医大学第二附属医院(上海长征医院)普通外科四科上海200003 海军军医大学东方肝胆外科医院胆道一科上海200438 海南省人民医院肝脏外科海口570311 湖南师范大学附属第一医院(湖南省人民医院)肝胆外科长沙410000 吉林大学中日联谊医院新民院区肝胆外科长春130499 江西省人民医院肝胆外科南昌330006 江西省肿瘤医院腹部肿瘤外科南昌330029 空军军医大学西京医院肝胆胰脾外科西安710032 昆明医科大学第一附属医院胃肠外科昆明650032 兰州大学第一医院普通外科五科兰州730020 南昌大学第一附属医院急诊科南昌330006 南京医科大学附属常州第二人民医院肝胆胰外科常州213004 南通市肿瘤医院肝胆外科南通226361 青岛大学附属医院肝胆胰外科青岛266000 青海省人民医院普通外科西宁810007 山东第一医科大学附属省立医院(山东省立医院)器官移植肝胆外二科济南250021 山西省肿瘤医院普通外科一病区太原030009 山西医科大学第一医院普通外科太原030001 上海交通大学附属第六人民医院南院上海市奉贤区中心医院普通外科上海201499 上海交通大学附属第一人民医院普通外科上海200080 上海交通大学医学院附属新华医院崇明分院普通外科上海200092 上海市浦东医院普外科上海201399 上海中医药大学附属普陀医院普通外科上海200062 绍兴第二医院全科医学科绍兴312099 台州市立医院肝胆外科台州318000 太仓市第一人民医院胃肠外科太仓215413 天津市肿瘤医院胰腺肿瘤科天津300181 温州医科大学附属第一医院肝胆胰外科温州325000 无锡市第二人民医院肝胆外科无锡214002 西安交通大学第一附属医院肝胆外科西安710061 新疆医科大学第一附属医院胰腺外科乌鲁木齐830054 徐州市中心医院肝胆胰脾外科徐州221009 长治医学院附属和平医院肝胆外科长治046099 中国医科大学附属盛京医院肝胆脾外科沈阳110004 大连医科大学附属大连市友谊医院肝胆外科大连116100 浙江大学医学院附属第二医院肝胆胰外科杭州310009

目的探讨2010—2017年中国胆囊癌临床流行病学特征、诊断、治疗与预后情况。方法采用单病种回顾性登记队列研究方法。基于“真实世界研究”理念,收集2010年1月至2017年12月中国胆囊癌研究小组(CRGGC)建立的中国胆囊癌多中心回顾性临床... 详细信息

目的探讨2010—2017年中国胆囊癌临床流行病学特征、诊断、治疗与预后情况。方法采用单病种回顾性登记队列研究方法。基于“真实世界研究”理念,收集2010年1月至2017年12月中国胆囊癌研究小组(CRGGC)建立的中国胆囊癌多中心回顾性临床资料数据库中42家医院收治的6159例胆囊癌患者的临床病理资料。观察指标:(1)病例来源情况。(2)年龄与性别分布情况。(3)诊断情况。(4)外科治疗与预后情况。(5)综合治疗与预后情况。随访数据由CRGGC对各协作中心的临床随访数据进行收集整理,主要结局指标为手术治疗患者手术之日或未手术患者确诊之日起,至结局事件发生或随访截至时间的总体生存时间。正态分布的计量资料以x±s表示,组间比较采用t检验;偏态分布的计量资料以M(Q1,Q3)或M(范围)表示,组间比较采用U检验。计数资料以绝对数和(或)百分比表示,组间比较采用χ^(2)检验。单因素分析采用强迫引入Logistic回归模型,将P<0.1的因素引入多因素分析。多因素分析采用逐步后退Logistic回归模型。采用寿命表法计算生存率,采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线,采用Log-rank检验进行生存分析。结果(1)病例来源情况:42家医院中,三级甲等医院35家,三级乙等医院7家;胆囊癌收治高流量医院16家,非高流量医院26家。42家医院地域分布:中部地区9家,东北地区5家,东部地区22家,西部地区6家。6159例患者地域分布:2154例(34.973%)来自中部地区,705例(11.447%)来自东北地区,1969例(31.969%)来自东部地区,1331例(21.611%)来自西部地区。6159例患者总体院均诊断与治疗数为(18.3±4.5)例/年;其中4974例(80.760%)来源于高流量医院,院均诊断与治疗患者数为(38.8±8.9)例/年;1185例(19.240%)来源于非高流量医院,院均诊断与治疗患者数为(5.7±1.9)例/年。(2)年龄与性别分布情况:6159例患者确诊年龄为64(56,71)岁;其中男性2247例(36.483%),确诊年龄为64(58,71)岁;女性3912例(63.517%),确诊年龄为63(55,71)岁。性别比例为女性:男性=1.74∶1。3886例(63.095%)患者确诊年龄为56~75岁。不同性别患者确诊年龄比较,差异有统计学意义(Z=-3.99,P<0.001)。(3)诊断情况:6159例患者中,初步诊断为胆囊癌2503例(40.640%),初步诊断非胆囊癌3656例(59.360%)。未手术患者2110例(34.259%),其中初步诊断为胆囊癌200例(9.479%),初步诊断为非胆囊癌1910例(90.521%)。手术患者4049例(65.741%),其中初步诊断为胆囊癌2303例(56.878%),初步诊断为非胆囊癌1746例(43.122%)[术中诊断为胆囊癌774例(19.116%)、术后诊断为胆囊癌972例(24.006%)]。6159例患者中,初步诊断前行超声、CT、磁共振成像(MRI)检查分别为2521例(40.932%)、2335例(37.912%)、1114例(18.087%),行血清癌胚抗原(CEA)、CA19-9、CA125检测分别为3259例(52.914%)、3172例(51.502%)、4016例(65.205%)。同一例患者可行多种检查。单因素分析结果显示:来源医院地区(东部地区、西部地区),年龄(≥72岁),收治医院胆囊癌患者流量,初步诊断前超声检查,初步诊断前CT检查,初步诊断前MRI检查,初步诊断前CEA检测,初步诊断前血清CA19-9检测,初步诊断前血清CA125检测均是影响胆囊癌患者初步诊断为胆囊癌的相关因素(优势比=1.45、1.98,0.69,0.68,2.43,0.41,1.63,0.41,0.39,0.42,95%可信区间为1.21~1.74、1.64~2.40,0.59~0.80,0.60~0.78,2.19~2.70,0.37~0.45,1.43~1.86,0.37~0.45,0.35~0.43,0.38~0.47,P<0.05)。多因素分析结果显示:来源医院地区(东部地区、西部地区),性别,年龄(≥72岁),收治医院胆囊癌患者流量,初步诊断前超声检查,初步诊断前CT检查,初步诊断前血清CA19-9检测是影响胆囊癌患者初步诊断为胆囊癌的独立影响因素(优势比=1.36、1.42,0.89,0.67,1.85,1.56,1.57,0.39,95%可信区间为1.13~1.64、1.16~1.73,0.79~0.99,0.57~0.78,1.60~2.14,1.38~1.77,1.38~1.79,0.35~0.43,P<0.05)。(4)外科治疗与预后情况:4049例手术治疗患者中,2447例(60.435%)分期资料和随访资

关键词：胆道肿瘤术前诊断外科治疗辅助治疗流行病学影响因素预后

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