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LONG-RANGE CORRELATIONS IN DNA SEQUENCES USING TWO-DIMENSIONAL DNA WALKS

Chinese Journal of Polymer Science 2005年第1期23卷 11-16页

作者： JinChena lin-xizhanga De-luZhaob DepartmentofPhysics WenzhouNormalCollegeWenzhou325027China PolymerPhysicsLaboratory CenterofMolecularScienceInstituteofChemistryChineseAcademyofSciencesBeijing100080China

The characterization of long-range correlations and fractal properties of DNA sequences has proved to be adifficult though rewarding task mainly due to the mosaic character of DNA consisting of many patches of various lengthswith different nucleotide *** this paper we investigate statistical correlations among different positions in DNAsequences using the two-dimensional DNA *** root-mean-square fluctuation F(l)is described by a power *** function C(l),which is used to measure the linear dependence and periodicity,exists a power law ofC(l)-l^(-μ).We also calculate the mean-square distancealong the DNA chain,and it may be expressed as-l^(?)with 2>γ>*** investigations can provide some insights into long-range correlations in DNA sequences.

关键词： Autocorrelation function DNA sequence Long-range correlation.

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