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Integrated bioinformatics analysis reveals correlations of high TRIM59 expression with worse prognosis and immune infiltrates in lung adenocarcinoma

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Journal of Bio-X Research 2022年第2期5卷 67-80页

作者： Lingge Yang Yuan Wu liangkun you Binbin Xie Jun Lou Weidong Han Kai Wang Department of Respiratory Medicine The Fourth Affiliated HospitalCollege of MedicineZhejiang UniversityYiwu Department of Medical Oncology Sir Run Run Shaw HospitalCollege of MedicineZhejiang UniversityHangzhouZhejiang ProvinceChina

Objective:Most patients with advanced lung cancer have a poor *** studies have identified TRIM59 as a novel molecule that serves as a prognostic factor for the progression of non-small cell lung *** the present study,we investigated the role of TRIM59 in predicting the prognosis of lung adenocarcinoma(LUAD)as well as the correlation between TRIM59 expression and immune ***:We analyzed TRIM59 expression in normal and tumor tissues based on RNA-sequencing datasets from The Cancer Genome Atlas and Genotype-Tissue Expression ***-seven cases of LUAD tissues and their matching adjacent tissues were collected,and TRIM59 expression in tissue samples was demonstrated by *** tissue specimens were obtained under the approval of the Medical Ethics Committee of the Second Affiliated Hospital of Zhejiang University School of Medicine(approval ***2019001101;approved on April 3,2019).The immune cell scores were calculated using the CIBERSORT *** Tumor Immune Estimation Resource database was used to analyze the correlation between TRIM59 and immune cell ***:TRIM59 was up-regulated in most cancer *** TRIM59 expression predicted a worse prognosis in patients with LUAD(overall survival,P=0.00096;disease-specific survival,P=0.00056;disease-free interval,P=0.0009;progression-free interval,P=0.0012).Moreover,TRIM59 was highly expressed in patients with LUAD who had a poorer ***59 also showed a significant correlation with the ESTIMATE score(P=0.04)and stromal score(P=0.005)in patients with ***,a significant correlation between TRIM59 and the tumor mutation burden was found in LUAD but in no other cancer types(P<0.001).Further investigation showed that TRIM59 had a significant correlation with gene markers on neutrophils and dendritic ***:TRIM59 is a potential prognosticator in LUAD and may be correlated with immune cell identification,immune cell infiltrati

关键词： immune checkpoints immune infiltrates lung adenocarcinoma prognosticator TRIM59

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Lymph node involvement in pancreatic neuroendocrine tumors: significance as a predictor of survival

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Journal of Bio-X Research 2019年第1期2卷 25-33页

作者： Li Yu Rongjie Zhao Xufeng Han Jiawei Shou liangkun you Hanliang Jiang Xiaoyun Zhou Zhen Liu Hongming Pan Weidong Han Department of Medical Oncology Sir Run Run Shaw HospitalCollege of MedicineZhejiang UniversityHangzhou Department of Internal Medicine Yuyao Hospital of Traditional Chinese MedicineYuyao Department of Respiratory Medicine Sir Run Run Shaw HospitalCollege of MedicineZhejiang UniversityHangzhouZhejiang ProvinceChina

Whether regional lymph node involvement exerts significant effect on the prognosis still remains obscure for pancreatic neuroendocrine *** clarify this association and identify predictors for lymph node involvement,we studied the data of patients aged>18 years with regional lymph node involvement histologically confirmed pancreatic neuroendocrine tumors from 2004 to 2014 in the Surveillance,Epidemiology,and End Results database(http://***/about).We evaluated Lymph node involvement as a prognostic factor by Cox *** reduced 9 variables of demographic and tumor characteristics to 5 potential predictors using least absolute shrinkage and selection operator(LASSO)regression *** further constructed a lymph node involvement model by logistic *** model was verified by the verification set,and the visual expression of the model was realized by a nomogram.A total of 1545 cases of pancreatic neuroendocrine tumors were included in our *** node positivity was significantly associated with disease-specific survival(Pyounger patients(P<0.05),patients with tumors in the pancreatic head(P<0.05),patients at high American Joint Committee on Cancer T stage(P<0.001),and patients of an undifferentiated status(P<0.05)showed a significantly higher possibility of developing lymph node *** reliability of this model was verified by cross-validation between the training and testing set,and we obtained good discrimination and calibration *** model also showed great performance in C-index and area under receiver operating characteristic *** node positivity was an important negative prognostic predictor for pancreatic neuroendocrine *** developed a lymph node involvement model based on the predictors including age,marital status,primary site,T status,and tumor grade.

关键词： Surveillance Epidemiology and End Results database logistic regression lymph node involvement nomogram pancreatic neuroendocrine tumors

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青藤碱对小鼠非酒精性脂肪性肝炎的改善作用及机制

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中国药房 2024年第14期35卷 1701-1707页

作者：曾诚翁良坤广东药科大学附属第一医院临床药学重点专科广州510699 广东药科大学新药研发中心广州510006

目的探究青藤碱(Sin)对非酒精性脂肪性肝炎(NASH)的改善作用及潜在机制。方法以雄性C57BL/6J小鼠为对象,将其随机分为标准饲料(SCD)组、高脂饲料(HFD)组、Sin低剂量组(Sin-L组,50 mg/kg)、Sin高剂量组(Sin-H组,100 mg/kg),每组6只。SC... 详细信息

目的探究青藤碱(Sin)对非酒精性脂肪性肝炎(NASH)的改善作用及潜在机制。方法以雄性C57BL/6J小鼠为对象,将其随机分为标准饲料(SCD)组、高脂饲料(HFD)组、Sin低剂量组(Sin-L组,50 mg/kg)、Sin高剂量组(Sin-H组,100 mg/kg),每组6只。SCD组小鼠以SCD正常喂养,其余组小鼠均以HFD连续饲养24周以复制NASH模型;于17周起,各药物组小鼠分别灌胃相应药液,每天1次,连续8周。末次给药后,称定各组小鼠体重、肝脏质量并计算肝脏指数;检测其肝组织中总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)含量和血清中天冬氨酸转移酶(AST)、丙氨酸转氨酶(ALT)、白细胞介素1β(IL-1β)、IL-18含量;观察其肝细胞脂肪变性、肝纤维化,并定位肝脏脂滴;检测其IL-18、IL-1β mRNA和炎症相关蛋白[IL-1β、剪切的IL-1β(cleaved-IL-1β)]、纤维化相关蛋白[Ⅰ型胶原蛋白(Col-Ⅰ)、α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)、结缔组织生长因子(CTGF)]、通路相关蛋白[腺苷一磷酸活化的蛋白激酶(AMPK)、磷酸化AMPK(p-AMPK)、Yes相关蛋白(YAP)、磷酸化YAP(p-YAP)]的表达情况。以人肝癌细胞HepG2为对象,将其分为对照组、油酸(OA)组、Sin 50μmol/L组、Sin 100μmol/L组、OA+Sin 50μmol/L组和OA+Sin 100μmol/L组,处理24 h后,观察其脂滴蓄积情况,并检测其通路相关蛋白的表达情况。结果与HFD组比较,Sin各剂量组小鼠的肝细胞脂肪变性、纤维化病变和脂滴蓄积均有所缓解;其体重,肝脏质量,肝脏指数(Sin-L组除外),血清AST、ALT、IL-1β、IL-18含量,肝组织中TG、TC含量,IL-1β、IL-18 mRNA的表达水平,以及cleaved-IL-1β蛋白和纤维化相关蛋白的表达水平均显著降低(P<0.01);肝组织中IL-1β蛋白的表达水平和AMPK、YAP蛋白的磷酸化水平均显著升高(P<0.01)。与OA组比较,OA+Sin各浓度组细胞的脂滴蓄积均明显减少,AMPK、YAP蛋白的磷酸化水平均显著升高(P<0.05)。结论 Sin可改善NASH小鼠肝组织的炎症反应、脂质沉积和纤维化,其机制可能与激活AMPK信号通路、促进YAP蛋白磷酸化相关。

关键词：非酒精性脂肪性肝炎青藤碱腺苷一磷酸活化的蛋白激酶 Yes相关蛋白炎症反应

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妊娠期低剂量抗生素暴露对新生儿肠道菌群及健康影响的研究进展

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中华围产医学杂志 2024年第7期27卷 599-602页

作者：刘英李雅清马良坤大同市第一人民医院(山西大同大学附属妇女儿童医院)科研实验室大同037009 中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院妇产科北京100730

残留在孕妇体内的动物源性低剂量抗生素检出率较高。低剂量抗生素累积效应将影响新生儿肠道菌群的建立,导致微生物菌群结构的失衡。低剂量抗生素的暴露可能对孕妇、胎儿和新生儿健康均产生不利的影响。本文综述了妊娠期持续低剂量抗生... 详细信息

残留在孕妇体内的动物源性低剂量抗生素检出率较高。低剂量抗生素累积效应将影响新生儿肠道菌群的建立,导致微生物菌群结构的失衡。低剂量抗生素的暴露可能对孕妇、胎儿和新生儿健康均产生不利的影响。本文综述了妊娠期持续低剂量抗生素暴露对新生儿肠道菌群的建立与定植的影响,新生儿肠道菌群多样性的改变及新生儿生长发育不良的影响研究进展。

关键词：妊娠低剂量抗生素新生儿肠道菌群

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国家级水利风景区空间格局及其资源供需评价

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华北水利水电大学学报（自然科学版） 2024年第3期45卷 103-110页

作者：李良琨李虎张宸铭华北水利水电大学河南郑州450046

水利风景区是以水域岸线或水利工程为依托的专题性景区,对建设幸福河湖、实现全流域生态保护和促进水利高质量发展具有重要作用。揭示了国家级水利风景区在全国尺度下的空间格局,借助可达机会累计算法对水利风景资源的地域供需进行评价... 详细信息

水利风景区是以水域岸线或水利工程为依托的专题性景区,对建设幸福河湖、实现全流域生态保护和促进水利高质量发展具有重要作用。揭示了国家级水利风景区在全国尺度下的空间格局,借助可达机会累计算法对水利风景资源的地域供需进行评价。结果表明:(1)景区分布在全国尺度上表现出以人口格局为主导的空间特征,在胡焕庸线以东密集成簇、以西稀疏散布;(2)景区与城市的连接网络呈现多层级性;以省为单元的组团化结网特征明显,省际间的连通性不足;(3)水利风景资源供给与居民需求整体上呈现出空间不匹配特性,资源供需比局部出现西北高,京津冀、华南及西南低的空间差异。研究结果可为水利风景资源的调控与配置提供依据。

关键词：水利风景区空间格局资源供需两步移动搜索法

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高速铁路0.01~1 m波段高低轨道不平顺特性分析

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铁道科学与工程学报 2024年第3期21卷 891-900页

作者：陈宪麦彭良坤孙宪夫魏子龙杨飞董春敏中南大学土木工程学院湖南长沙410075 高速铁路建造技术国家工程研究中心湖南长沙410075 中国铁道科学研究院集团有限公司基础设施检测研究所北京100081

随着我国高速铁路发展规模的不断扩大及运营速度的不断提升,轨道短波不平顺引起的振动与噪声问题日益严重。深入研究高速铁路短波不平顺的时域、频域与时频域特征,对精准掌握高速铁路轨道短波平顺状态及其引起的车-轨系统振动、伤损等... 详细信息

随着我国高速铁路发展规模的不断扩大及运营速度的不断提升,轨道短波不平顺引起的振动与噪声问题日益严重。深入研究高速铁路短波不平顺的时域、频域与时频域特征,对精准掌握高速铁路轨道短波平顺状态及其引起的车-轨系统振动、伤损等一系列问题具有重要的参考价值。以某高速铁路实测0.01~1 m波段轨面高低不平顺数据为研究对象,经过数据预处理剔除异常值并消除趋势项后,对实测不平顺数据进行时域分析,得到该高铁线路短波不平顺数据的统计与分布特性。采用平均周期图法计算该高铁线路轨道短波不平顺功率谱密度,应用非线性最小二乘拟合优化算法进行拟合,提出高速铁路轨道短波不平顺谱。从时频域角度对该段数据进行经验模态分解与希尔伯特变换,分析该高铁线路短波不平顺的希尔伯特谱与边际谱。研究结果表明:该高铁线路轨道短波不平顺数据各统计量幅值都较小,且近似服从正态分布;该高铁线路轨道短波不平顺功率谱密度存在与钢轨波磨有关的多个周期性成分,提出的高速铁路短波不平顺谱函数能够很好地对实测功率谱密度进行拟合,且拟合效果优于经典的SATO建议的短波谱与50 kg/m钢轨的短波谱;对该高铁线路轨道可能存在的短波病害进行识别与定位,时频域分析的方法可以较好地应用于高速铁路轨道平顺性的分析与日常的管理维护。

关键词：短波不平顺时域分析轨道谱拟合希尔伯特变换

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基于水-经济社会-生态环境协同演变的生态流量阈值适宜性研究

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水资源与水工程学报 2024年第4期35卷 47-55,65页

作者：王钰张翔闫少锋刘浩源邓梁堃付湘武汉大学水资源工程与调度全国重点实验室湖北武汉430072 武汉大学海绵城市建设水系统科学湖北省重点实验室湖北武汉430072 湖北省水利水电规划勘测设计院有限公司湖北武汉430064

针对天门河-汉北河流域生活-生产-生态“三生”用水矛盾突出、水生态退化及经济社会发展受限等问题,基于水系统理论与系统动力学方法,构建“水-经济社会-生态环境”耦合模型,从系统层面研究河道内生态流量阈值的适宜性。应用情景模拟法... 详细信息

针对天门河-汉北河流域生活-生产-生态“三生”用水矛盾突出、水生态退化及经济社会发展受限等问题,基于水系统理论与系统动力学方法,构建“水-经济社会-生态环境”耦合模型,从系统层面研究河道内生态流量阈值的适宜性。应用情景模拟法,考虑高效节水、再生水利用率提高等调控措施及未来天然来水的不确定性,设置9种情景模拟2022—2035年研究区高、中、低3种生态流量阈值下的水资源供需及经济社会发展态势。结果表明:高效节水和再生水利用率提高均有利于缓解因生态流量阈值增大而引起的区域水资源用户间的冲突问题;从“水-经济社会-生态环境”协调发展的角度分析,建议研究区丰水年(P=25%)生态流量阈值设置为年径流量的30%~50%,平水年(P=50%)和枯水年(P=75%)生态流量阈值设置为年径流量的10%~30%;增大生态流量阈值的同时应采取提高水资源利用效率的调控措施。研究结果从“水-经济社会-生态环境”耦合系统的协同演化机制出发分析河流生态流量阈值的适宜性,为复杂水资源系统的优化运行与科学管理提供了理论基础。

关键词：水系统 “水-经济社会-生态环境”耦合生态流量阈值适宜性系统动力学

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Steklov-Lame特征值问题自适应多网格方法的后验误差估计

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新疆大学学报（自然科学版中英文） 2024年第2期41卷 157-170,180页

作者：徐良坤闭海贵州师范大学数学科学学院贵州贵阳550025

建立Steklov-Lame特征值问题的一种基于移位反迭代的有限元多网格离散方案,并研究该方案基于残差型的后验误差估计.首先给出近似特征函数在L^(2)(∂Ω)范数意义下的误差估计,其次给出多网格方案近似解的后验误差指示子,并证明后验误差指... 详细信息

建立Steklov-Lame特征值问题的一种基于移位反迭代的有限元多网格离散方案,并研究该方案基于残差型的后验误差估计.首先给出近似特征函数在L^(2)(∂Ω)范数意义下的误差估计,其次给出多网格方案近似解的后验误差指示子,并证明后验误差指示子的可靠性和有效性.最后利用后验误差指示子设计自适应多网格算法并用于求解Steklov-Lame特征值问题.

关键词： Steklov-Lame特征值基于移位反迭代的多网格离散后验误差估计自适应多网格算法

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游离骨间背动脉穿支皮瓣修复多指皮肤软组织缺损的临床疗效

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中华烧伤与创面修复杂志 2024年第5期40卷 476-481页

作者：郑云程良坤崔留超谭玉忠田林重庆长城骨科医院手显微外科重庆400041

目的探讨采用游离骨间背动脉穿支皮瓣修复多指皮肤软组织缺损的临床效果。方法该研究为回顾性观察性研究。2020年4月—2022年6月,重庆长城骨科医院手显微外科收治7例多指皮肤软组织缺损患者,其中男4例、女3例,年龄27~54岁。7例患者共18... 详细信息

目的探讨采用游离骨间背动脉穿支皮瓣修复多指皮肤软组织缺损的临床效果。方法该研究为回顾性观察性研究。2020年4月—2022年6月,重庆长城骨科医院手显微外科收治7例多指皮肤软组织缺损患者,其中男4例、女3例,年龄27~54岁。7例患者共18指受伤,其中4指受累者1例、3指受累者2例、2指受累者4例。Ⅰ期清创后皮肤软组织缺损面积为3.0 cm×2.0 cm~7.5 cm×3.0 cm。所有患者均行Ⅰ期清创、Ⅱ期骨间背动脉穿支皮瓣移植修复创面、Ⅲ期皮瓣断蒂及分指。皮瓣切取面积为4.0 cm×2.5 cm~10.5 cm×3.5 cm。将骨间背动脉与指固有动脉进行端端吻合,将2条骨间背动脉的伴行静脉与手指2条皮下浅静脉进行端端吻合。采用充分减张后皮下缝合的方法处理供区。观察Ⅲ期术后皮瓣成活情况。Ⅲ期术后每3个月进行1次随访,观测手指术区外观、质地、感觉情况,手指关节活动度,供区创面愈合情况。末次随访时,根据中华医学会手外科学会上肢部分功能评定试用标准评定手指功能。结果7例患者Ⅲ期术后皮瓣均成活。Ⅲ期术后随访6~36个月,仅3例患者皮瓣臃肿,于3个月及以后行皮瓣减容手术,其余患者手指外观恢复良好;6例患者供区仅遗留线性瘢痕,1例患者出现供区瘢痕增生且经激光治疗后明显好转。末次随访时,手指功能评定为优者5例、良者2例。结论采用以多条骨间背动脉穿支为蒂的皮瓣修复多指皮肤软组织缺损,术中仅吻合一套血管且不损伤主干血管,降低了术后血管危象的发生率;分指手术操作简单,术后供受区外观和功能较佳,值得临床推广。

关键词：指损伤穿支皮瓣外科皮瓣显微外科手术皮肤软组织缺损创面修复

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循环血中胰岛素样生长因子-Ⅰ水平与非小细胞肺癌临床病理特征的相关性研究

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华中科技大学学报（医学版） 2009年第6期38卷 821-823页

作者：付圣灵廖永德游良琨曾敏邢昕付向宁华中科技大学同济医学院附属同济医院普胸外科武汉430030

目的探讨循环血胰岛素样生长因子-Ⅰ(IGF-Ⅰ)在非小细胞肺癌(NSCLC)发展中的作用及其临床意义。方法运用双抗夹心酶联免疫吸附反应定量检测80例原发性NSCLC患者和45例肺良性疾病患者循环血中IGF-Ⅰ,分析循环血IGF-Ⅰ水平与临床病理特征... 详细信息

目的探讨循环血胰岛素样生长因子-Ⅰ(IGF-Ⅰ)在非小细胞肺癌(NSCLC)发展中的作用及其临床意义。方法运用双抗夹心酶联免疫吸附反应定量检测80例原发性NSCLC患者和45例肺良性疾病患者循环血中IGF-Ⅰ,分析循环血IGF-Ⅰ水平与临床病理特征的相关性。结果NSCLC组循环血IGF-Ⅰ水平显著高于肺良性疾病组;NSCLC患者循环血中IGF-Ⅰ水平在肿瘤直径≥3cm组显著高于直径<3cm组,在伴局部淋巴结转移组显著高于无局部淋巴结转移组,在晚期(Ⅲ～Ⅳ)组显著高于早期(Ⅰ～Ⅱ)组。结论IGF-Ⅰ可能以自分泌和/或旁分泌的方式促进NSCLC恶性进展,其自分泌和/或旁分泌水平与肿瘤大小、病理分期和淋巴结转移相关,体积大、分期晚、伴淋巴结转移的肺癌能分泌更多的IGF-Ⅰ。检测循环血IGF-Ⅰ水平对辅助判断NSCLC的分期可能有应用前景。

关键词：非小细胞肺癌胰岛素样生长因子-Ⅰ 酶联免疫吸附实验

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