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融合结构知识的蛋白质预训练模型进展

物理学报 2024年第18期73卷 1-15页

作者：汤天一熊翊名张睿格张建李文飞王骏王炜南京大学物理学院南京210093 南京大学脑科学研究院南京210093

自然语言和图像处理领域引发的人工智能革命给蛋白质计算领域带来了新的思路和研究范式.其中一个重大的进展是从海量蛋白质序列通过自监督学习得到预训练的蛋白质语言模型.这类预训练模型编码了蛋白质的序列、进化、结构乃至功能等多种... 详细信息

自然语言和图像处理领域引发的人工智能革命给蛋白质计算领域带来了新的思路和研究范式.其中一个重大的进展是从海量蛋白质序列通过自监督学习得到预训练的蛋白质语言模型.这类预训练模型编码了蛋白质的序列、进化、结构乃至功能等多种信息,可方便地迁移至多种下游任务,并展现了强大的泛化能力.在此基础上,人们正进一步发展融合更多种类数据的多模态预训练模型.考虑到蛋白质结构是决定其功能的主要因素,融合了结构信息的蛋白质预训练模型可更好地支持下游多种任务,本文对这一方向的研究工作进行了介绍和总结.此外,还简介了融合先验知识的蛋白质预训练模型、RNA语言模型、蛋白质设计等方面的工作,讨论了这些领域目前的现状、困难及可能的解决方案.

关键词：蛋白质基础模型蛋白质多模态模型蛋白质结构机器学习

65Mn/Q235双金属复合管的热处理工艺优化及其耐磨性

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上海金属 2024年第1期46卷 9-14,23页

作者：王庭昆樊剑李涛马贤勇李俊李绍宏宝武集团云南昆钢新型复合材料开发有限公司云南安宁650302 昆明理工大学材料科学与工程学院云南昆明650093

采用金相显微镜、扫描电子显微镜、洛氏硬度计、显微硬度计和磨粒磨损试验机,分析了65Mn/Q235双金属复合管在使用过程中失效的原因,并对其热处理工艺进行了优化。结果表明:65Mn钢中存在大量的未溶碳化物和层片状珠光体,导致其韧性降低... 详细信息

采用金相显微镜、扫描电子显微镜、洛氏硬度计、显微硬度计和磨粒磨损试验机,分析了65Mn/Q235双金属复合管在使用过程中失效的原因,并对其热处理工艺进行了优化。结果表明:65Mn钢中存在大量的未溶碳化物和层片状珠光体,导致其韧性降低、焊缝硬度较低,使65Mn/Q235双金属复合管在服役过程中因耐磨性不足而失效。采用优化的热处理工艺即840℃保温10~30 min油冷后,65Mn/Q235双金属复合管的组织为均匀细小的马氏体,未溶碳化物和层片状珠光体基本消除,焊缝硬度得到提高,耐磨性明显改善。

关键词：双金属复合管 65Mn钢热处理耐磨性

Effects of TMCP Schedule on Precipitation,Microstructure and Properties of Ti-microalloyed High Strength Steel

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Journal of Iron and Steel Research International 2016年第6期23卷 593-601页

作者： Xiang-dong HUO lie-jun li Zheng-wu PENG Song-jun CHEN School of Material Science and Engineering Jiangsu University School of Mechanical and Automotive Engineering South China University of Technology

Using the similar compositions of the Ti-microalloyed high-strength steels produced by the thin-slab casting process of compact strip production（CSP）,four thermo-mechanical control processes（TMCP）after the simulated thickslab casting,*** two hot rolling routes and the two cooling processes,were designed,aiming at achieving the same mechanical properties as the thin strip *** final microstructures after the four TMCP processes were examined by optical microscope（OM）,scanning electron microscope（SEM）and transmission electron microscope（TEM）.The tensile properties and Charpy impact energy were measured ***-induced TiC precipitation was found in the two-stage rolling route with the finish rolling temperature at low levels,leading to grain refinement due to the pinning effect during austenite *** hardening in ferrite was observed when a period of isothermal holding was applied after hot *** could be concluded that both finish rolling temperature and the subsequent isothermal holding temperature were crucial for the achieved strength level due to the combined effect of grain refinement and precipitation *** the same time,it was found that the isothermal holding led to poor impact toughness because of remarkable precipitation ***,it was suggested that the precipitation kinetics of titanium carbides in both austenite and ferrite should be investigated in future.

关键词： TMCP refinement hardening holding rolling titanium isothermal Precipitation austenite ferrite

A physics-constrained deep residual network for solving the sine-Gordon equation

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Communications in Theoretical Physics 2021年第1期73卷 1-5页

作者： jun li Yong Chen Shanghai Key Laboratory of Trustworthy Computing East China Normal UniversityShanghai200062China School of Mathematical Sciences Shanghai Key Laboratory of PMMPShanghai Key Laboratory of Trustworthy ComputingEast China Normal UniversityShanghai200062China College of Mathematics and Systems Science Shandong University of Science and TechnologyQingdao266590China Department of Physics Zhejiang Normal UniversityJinhua321004China

Despite some empirical successes for solving nonlinear evolution equations using deep learning,there are several unresolved ***,it could not uncover the dynamical behaviors of some equations where highly nonlinear source terms are included very ***,the gradient exploding and vanishing problems often occur for the traditional feedforward neural *** this paper,we propose a new architecture that combines the deep residual neural network with some underlying physical *** the sine-Gordon equation as an example,we show that the numerical result is in good agreement with the exact soliton *** addition,a lot of numerical experiments show that the model is robust under small perturbations to a certain extent.

关键词： sine-Gordon equation deep residual network soliton integrable system

Investigation of Novel Short Fiber-like Polyaniline/Cerium Nitrate Composite

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Journal of Wuhan University of Technology(Materials Science) 2019年第1期34卷 183-188页

作者： li Zhihua SHEN Yuting li Yanbo liU jun School of Materials Science and Engineering Central South University Key Laboratory of Nonferrous Metal Materials Science and Engineering Ministry of Education

Polyaniline(PANI)/Ce(NO_3)_3 composite with short fiber-like shape was synthesized successfully in a poly(2-arcylamido-2-methylpropane sulfonic acid) aqueous solution. A comparison of SEM images found that short fiber-like composites can be obtained by controlling the dosage of Ce(NO_3)_3. The length and diameter of short fiber-like PANI/Ce(NO_3)_3 composite was about 630 and 200 nm, respectively. A special conjugated structure had formed via Ce^(3+) ions and –NH– group in the quinonoid ring of PANI, which was characterized by means of Fourier transform infrared(FTIR) spectroscopy, Ultraviolet-visible(UV-Vis) spectroscopy and X-ray photoelectron spectroscopy(XPS). Short fiber-like PANI/Ce(NO_3)_3 composite exhibited a high conductivity, a large capacitance and an enhanced anticorrosion property. linear four-probe method confirmed that the electrical conductivity of composites was improved with the presence of Ce^(3+) ions. The corrosion potential of PANI/Ce(NO_3)_3 composite increased to-79 mV at 10 wt% of Ce(NO_3)_3. Meanwhile, the minimum density of corrosion current(1.4 μA/cm^2) was also achieved.

关键词： conducting polymers polyaniline cerium nitrate electrochemical properties

Hydrogen Bonding in Thermoplastic Polyurethane Elastomers:IR Thermal Analysis

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Chemical Research in Chinese Universities 2002年第1期18卷 84-87页

作者： CHEN Da-jun li Yao-jun State Key Laboratory of Fiber Materials Modification Donghua UniversityShanghai 200051P.R.China

The hydrogen bond percentage and its temperature dependence of the three TPU samples synthesized from polytetrahydrofuran, 4,4'-diphenylmethane diisocyanate, N -methyl diethanol amine or 1,4-butane diol were studied by means of IR thermal analysis. The enthalpy and the entropy of the hydrogen bond dissociation were determined by the Van't Hoff plot.

关键词： Thermoplastic polyurethane elastomers IR thermal analysis Hydrogen Bond effect

考虑粉土温度效应与排水状态的CPTu计算模型

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岩土力学 2024年第6期45卷 1731-1742,1754页

作者：王宽君刘彬莫品强李国耀朱启银沈侃敏胡静中国电建集团华东勘测设计研究院有限公司海洋岩土工程勘察技术与装备浙江省工程研究中心浙江杭州311122 中国矿业大学深地工程智能建造与健康运维全国重点实验室江苏徐州221116 中国矿业大学力学与土木工程学院江苏徐州221116 浙大城市学院浙江省城市盾构隧道安全建造与智能养护重点实验室浙江杭州310015

温度变化对土体性质和行为的潜在影响已成为许多岩土工程设计和应用的重要组成部分。针对粉土中孔压静力触探试验(piezocone penetration test,简称CPTu)的温度效应及部分排水状态,提出了基于小孔扩张理论的计算模型和分析方法。采用一... 详细信息

温度变化对土体性质和行为的潜在影响已成为许多岩土工程设计和应用的重要组成部分。针对粉土中孔压静力触探试验(piezocone penetration test,简称CPTu)的温度效应及部分排水状态,提出了基于小孔扩张理论的计算模型和分析方法。采用一种能够表征粉土强度温度效应的本构模型,给出了完全不排水和排水条件下的解析解;以Bourke粉土为例,分析了温度对扩张压力的影响,揭示了扩张压力随温度升高而减小的规律。采用一种线性映射方法给出了部分排水条件下的小孔扩张半解析解,并基于物理模型试验的结果得出了排水状态与温度的相关关系,建立了考虑粉土温度效应与排水状态的CPTu计算模型。研究了不同贯入速率下温度对CPTu测试结果的影响,结果表明,温度升高导致锥尖阻力与锥肩孔压减小,且变化幅度随超固结比的增加而增大,通过试验结果与计算模型预测结果的对比验证了模型的可靠性。

关键词：孔压静力触探试验小孔扩张理论粉土部分排水温度效应

238例老年耐多药肺结核临床特点及不良治疗结局影响因素分析

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中国热带医学 2024年第3期24卷 276-281页

作者：梁博文鲜馥阳李波罗敬月赵丽萍安军高孟秋李华首都医科大学附属北京胸科医院北京101149

目的分析老年耐多药肺结核临床特点和不良治疗结局的影响因素,为老年耐多药肺结核临床诊治提供参考。方法回顾性收集2008—2023年北京胸科医院初次收治的老年耐多药肺结核患者临床数据,对合并症/并发症、药物不良反应、初治和复治耐药... 详细信息

目的分析老年耐多药肺结核临床特点和不良治疗结局的影响因素,为老年耐多药肺结核临床诊治提供参考。方法回顾性收集2008—2023年北京胸科医院初次收治的老年耐多药肺结核患者临床数据,对合并症/并发症、药物不良反应、初治和复治耐药情况进行统计描述,并对不良治疗结局影响因素进行χ^(2)检验及logistic回归分析。结果共收集老年耐多药肺结核患者238例,其中出现药物不良反应发生152例(占63.9%),复治耐多药184例(占77.3%),广泛耐药结核(XDR-TB)广泛耐药27例(占11.3%),治愈41例,完成治疗6例,治疗失败39例,死亡6例,失访107例,无法评价31例,治疗未结束8例,治疗成功率20.4%(47/230)。治疗不良结局占比79.6%(183/230)。单因素分析显示不同年龄、是否有药物不良反应、患者来源对治疗结局的影响具有统计学意义(P<0.05)。以治疗结局良好和不良为因变量对三因素进行logistic回归分析,结果显示年龄70岁及以上、治疗中出现药物不良反应和外埠病人是不良治疗结局的影响因素[OR(95%CI):2.507(1.027~6.121)、3.253(1.635~6.473)、2.563(1.285~5.111)]。结论老年耐多药肺结核患者合并症/并发症多、药物不良反应发生率高、治疗结局不理想。异地就医、高龄、出现药物不良反应是不良治疗结局的危险因素。

关键词：老年人耐多药结核临床特点治疗结局影响因素

人参皂苷Rg1、Re对感染LPS猪空肠上皮细胞IPEC-J2的保护作用

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中国兽医学报 2024年第6期44卷 1256-1267页

作者：杜林张莉胡卫东马琪杜红旭李俊甘玲毕师诚西南大学动物医学院重庆荣昌402460 汉中市动物疫病预防控制中心陕西汉中723099 国家生猪技术创新中心重庆荣昌402460 西南大学中兽医研究所重庆荣昌402460

基于网络药理学和体外试验,共同探讨人参皂苷Rg1和Re对感染LPS猪空肠上皮细胞IPEC-J2的保护作用。采用网络药理学获取并筛选Rg1、Re缓解肠道屏障损伤的交集靶点,并采用分子对接技术验证网络药理学的预测结果。本试验分组为Control、LPS... 详细信息

基于网络药理学和体外试验,共同探讨人参皂苷Rg1和Re对感染LPS猪空肠上皮细胞IPEC-J2的保护作用。采用网络药理学获取并筛选Rg1、Re缓解肠道屏障损伤的交集靶点,并采用分子对接技术验证网络药理学的预测结果。本试验分组为Control、LPS、Rg1和Re组。观察不同浓度Rg1、Re对IPEC-J2细胞存活率、凋亡率、TEER值、FD4通透性和炎性因子的影响,同时采用荧光定量PCR检测不同浓度Rg1、Re对凋亡相关基因mRNA表达水平的影响。网络药理学结果显示,Rg1、Re预防肠道屏障损伤主要涉及PI3K-Akt、MAPK信号通路等过程。分子对接结果显示,Rg1与所有交集靶点结合能均小于0,而人参皂苷Re仅与SRC靶点的结合能小于0。体外试验显示不同浓度的Rg1、Re预处理均会不同程度地提高LPS处理的IPEC-J2的存活率、TEER值,减少细胞凋亡、FD4通透性降低、炎性因子TNF-α的分泌,表明Re、Rg1可有效降低LPS处理对IPEC-J2细胞的影响。Rg1显著上调MAPK8、MAPK10、HRAS,显著下调MAP2K1、PIK3CG、IL-2、SRC的mRNA表达水平;Re显著上调MAPK8、MAPK10、HRAS、PIK3R1、BCL2基因的mRNA表达水平。这些结果提示,人参皂苷Rg1、Re和含有Rg1、Re的人参皂苷产品在预防仔猪肠道屏障损伤方面值得进一步研究。

关键词：人参皂苷猪空肠上皮细胞网络药理学