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In the name of the rose:a roadmap for rose research in the genome era

Horticulture Research 2019年第1期6卷 948-964页

作者： Marinus J.M.Smulders Paul Arens Peter M.Bourke Thomas Debener Marcus Linde Jan De Riek leen leus Tom Ruttink Sylvie Baudino Laurence Hibrant Saint-Oyant Jeremy Clotault Fabrice Foucher Plant Breeding Wageningen University and ResearchP.O.Box 3866700 AJ WageningenThe Netherlands Faculty of Natural Sciences Institute for Plant GeneticsMolecular Plant BreedingLeibniz University of HannoverHerrenhäuser Strasse 230419 HannoverGermany ILVO Plant Sciences UnitFlanders Research Institute for AgricultureFisheries and FoodCaritasstraat 399090 MelleBelgium BVpam CNRS FRE 3727UJM-Saint-ÉtienneUniv.LyonSaint-EtienneFrance IRHS Agrocampus-OuestINRAUniversitéd’AngersSFR 4207 QuaSaV42 rue Georges Morel BP 6005749071 BeaucouzéFrance

The recent completion of the rose genome sequence is not the end of a process,but rather a starting point that opens up a whole set of new and exciting *** to a high-quality genome sequence other genomic tools have also become available for rose,including transcriptomics data,a high-density single-nucleotide polymorphism array and software to perform linkage and quantitative trait locus mapping in *** cultivars are highly heterogeneous and *** vast diversity in cultivated roses can be explained through the genetic potential of the genus,introgressions from wild species into commercial tetraploid germplasm and the inimitable efforts of historical *** can now investigate how this diversity can best be exploited and refined in future breeding work,given the rich molecular toolbox now available to the rose breeding *** paper presents possible lines of research now that rose has entered the genomics era,and attempts to partially answer the question that arises after the completion of any draft genome sequence:‘Now that we have“the”genome,what’s next?’.Having access to a genome sequence will allow both(fundamental)scientific and(applied)breeding-orientated questions to be *** outline possible approaches for a number of these questions.

关键词： breeding cultivar linkage

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