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Comprehensive functional annotation of susceptibility variants identifies genetic heterogeneity between lung adenocarcinoma and squamous cell carcinoma

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Frontiers of Medicine 2021年第2期15卷 275-291页

作者： Na Qin Yuancheng Li Cheng Wang Meng Zhu Juncheng Dai Tongtong Hong Demetrius Albanes Stephen Lam Adonina Tardon Chu Chen Gary Goodman Stig EBojesen Maria Teresa Landi Mattias Johansson Angela Risch H-Erich Wichmann Heike Bickeboller Gadi Rennert Susanne Arnold Paul Brennan John KField Sanjay Shete Loic Le Marchand Olle Melander Hans Brunnstrom Geoffrey Liu Rayjean JHung Angeline Andrew lambertus akiemeney Shan Zienolddiny Kjell Grankvist Mikael Johansson Neil Caporaso Penella Woll Philip Lazarus Matthew BSchabath Melinda CAldrich Victoria LStevens Guangfu Jin David CChristiani Zhibin Hu Christopher IAmos Hongxia Ma Hongbing Shen Department of Epidemiology Center for Global HealthSchool of Public HealthNanjing Medical UniversityNanjing 211166China State Key Laboratory of Reproductive Medicine Center for Global HealthNanjing Medical UniversityNanjing 211166China Department of Bioinformatics School of Biomedical Engineering and InformaticsNanjing Medical UniversityNanjing 211166China Jiangsu Key Lab of Cancer Biomarkers Prevention and TreatmentCollaborative Innovation Center for Cancer MedicineNanjing Medical UniversityNanjing 211166China China International Cooperation Center for Environment and Human Health School of Public HealthNanjing Medical UniversityNanjing 211166China Division of Cancer Epidemiology and Genetics National Cancer InstituteBethesdaMD 20892-9304USA Department of Integrative Oncology British Columbia Cancer AgencyVancouverBC V5Z 1L3Canada Faculty of Medicine University of Oviedo and CIBERESPOviedo 33006Spain Program in Epidemiology Public Health Sciences DivisionFred Hutchinson Cancer Research CenterSeattleWA 98109-1024USA Public Health Sciences Division Swedish Cancer InstituteSeattleWA 98026USA Department of Clinical Biochemistry Copenhagen University HospitalCopenhagen DK-1017Denmark National Cancer Institute BethesdaMD 20892-9304USA Genetic Epidemiology Group International Agency for Research on CancerLyon 69372France Cancer Center Cluster Salzburg at PLUS Department of Molecular BiologyUniversity of SalzburgHeidelberg 5020Austria Institute of Medical Informatics Biometry and EpidemiologyChair of EpidemiologyLudwig Maximilians UniversityMunichBavaria 80539Germany Department of Genetic Epidemiology University Medical Center GoettingenGoettingen 37075Germany Technion Faculty of Medicine Carmel Medical CenterHaifa 3448516Israel Markey Cancer Center University of KentuckyLexingtonKY 40506-0054USA Department of Molecular and Clinical Cancer Medicine Roy Castle Lung Cancer Research ProgrammeThe University of Liverpool Institute of Translational MedicineLiverpool L697Z

Although genome-wide association studies have identified more than eighty genetic variants associated with non-small cell lung cancer(NSCLC)risk,biological mechanisms of these variants remain largely *** integrating a large-scale genotype data of 15581 lung adenocarcinoma(AD)cases,8350 squamous cell carcinoma(SqCC)cases,and 27355 controls,as well as multiple transcriptome and epigenomic databases,we conducted histology-specific meta-analyses and functional annotations of both reported and novel susceptibility *** identified 3064 credible risk variants for NSCLC,which were overrepresented in enhancer-like and promoter-like histone modification peaks as well as DNase I hypersensitive *** factor enrichment analysis revealed that USF1 was AD-specific while CREB1 was *** annotation and genebased analysis implicated 894 target genes,including 274 specifics for AD and 123 for SqCC,which were overrepresented in somatic driver genes(ER=1.95,P=0.005).Pathway enrichment analysis and Gene-Set Enrichment Analysis revealed that AD genes were primarily involved in immune-related pathways,while SqCC genes were homologous recombination deficiency *** results illustrate the molecular basis of both wellstudied and new susceptibility loci of NSCLC,providing not only novel insights into the genetic heterogeneity between AD and SqCC but also a set of plausible gene targets for post-GWAS functional experiments.

关键词： lung cancer genome-wide association study function annotation immune homologous recombination repair deficiency genetic heterogeneity

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水泥基复合材料浆体厚度分布的定量表达

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硅酸盐学报 2007年第12期35卷 1622-1629页

作者：陈惠苏孙伟 SLUYS lambertus Johannes STORVEN Piet 东南大学江苏省土木工程材料重点实验室南京211189 东南大学材料科学与工程学院 Faculty of Civil Engineering and Geosciences Delft University of TechnologyP.O.Box 50482600 GA DelftThe Netherlands

依据统计物理学领域中的弦长密度函数,提出了水泥基复合材料邻近集料间浆体厚度分布的定量估计方法。借助计算机模拟方法生成的模型结构验证该理论方法的可靠性。通过浆体厚度的数量基概率密度曲线和累计概率曲线的比较发现,理论解和模... 详细信息

依据统计物理学领域中的弦长密度函数,提出了水泥基复合材料邻近集料间浆体厚度分布的定量估计方法。借助计算机模拟方法生成的模型结构验证该理论方法的可靠性。通过浆体厚度的数量基概率密度曲线和累计概率曲线的比较发现,理论解和模拟结果之间能较好吻合。在常用集料体积分数下,用该解析解预测了集料符合Fuller分布的砂浆和混凝土中浆体厚度分布及其平均值随集料体积分数和集料细度的变化关系。结果发现:邻近集料间浆体厚度平均值的变化范围为190～860μm。

关键词：混凝土浆体厚度分布定量表征弦长密度函数集料粒径分布体积分数

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新拌水泥浆体中邻近胶凝材料粒子表面最近间距分布的解析解

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复合材料学报 2007年第1期24卷 127-134页

作者：陈惠苏孙伟周焱昌 STROEVEN Piet SLUYS lambertus Johannes 东南大学材料科学与工程学院南京210096 江苏博特新材料有限公司南京210008 Faculty of Civil Engineering and Geosciences Delft University of Technology

依据Torquato的最邻近表面函数公式,推导了新拌水泥浆体邻近水泥粒子表面最近间距分布的解析解,并采用计算机模拟生成了1个水泥浆体结构模型,选取邻近粒子表面最近间距概率密度分布曲线、区间概率曲线和累计概率分布曲线这3个函数检验... 详细信息

依据Torquato的最邻近表面函数公式,推导了新拌水泥浆体邻近水泥粒子表面最近间距分布的解析解,并采用计算机模拟生成了1个水泥浆体结构模型,选取邻近粒子表面最近间距概率密度分布曲线、区间概率曲线和累计概率分布曲线这3个函数检验模拟结果与理论结果之间的差别。结果表明,该解析解与计算机模拟实验结果吻合良好。利用该解析解,以Rosin-Rammler分布为例,研究了胶凝材料细度以及水胶比对邻近水泥粒子表面最近间距分布及其平均值的影响。结果显示,水泥细度对邻近粒子表面最近间距平均值的影响高于水胶比的影响。邻近粒子表面最近间距解析解的获得,不但为基于不同粒径分布以及尺度范围粉体之间搭配的高粉体初始堆积密度的实现提供了依据,而且对多尺度模拟方法中选取各级模型的尺度、量化粉煤灰浆体中粉煤灰颗粒的微集料效应、了解邻近集料间的交互作用程度以及界面重叠程度等问题具有参考价值。

关键词：邻近粒子表面最近间距 Rosin—Rammler分布固相体积分数粒径分布概率水胶比胶凝材料细度

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水泥基复合材料浆体厚度分布的定量表达

水泥基复合材料浆体厚度分布的定量表达

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《硅酸盐学报》创刊50周年暨中国硅酸盐学会2007年学...

作者：陈惠苏孙伟 SLUYS lambertus Johannes STORVEN Piet 东南大学材料科学与工程系 Faculty of Civil Engineering and Geosciences Delft University of TechnologyP.O.Box 50482600GA DelftThe Netherlands

依据统计物理学领域中的弦长密度函数,本文引入了水泥基复合材料邻近集料间浆体厚度分布的定量估计方法。并借助计算机模拟方法生成的模型结构验证该理论方法的可靠性。通过浆体厚度的数量基概率密度曲线和累计概率曲线的比较发

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炼铁系统碳循环的可行性研究

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世界钢铁 2014年第5期14卷 1-6页

作者： Yukitaka Kato Arnoldus lambertus Dipu Yutaka Ujisawa 袁兵东京工业大学住友金属工业株式会社

一种基于碳循环的新型能源交换系统被认为是零CO2排放。这种能源系统被称为活性碳循环能源系统,简称ACRES。基于热力学对炼铁系统使用活性碳循环能源系统的可行性进行了讨论。活性碳循环能源系统包含三个部分,即CO2的回收、分离,以及从... 详细信息

一种基于碳循环的新型能源交换系统被认为是零CO2排放。这种能源系统被称为活性碳循环能源系统,简称ACRES。基于热力学对炼铁系统使用活性碳循环能源系统的可行性进行了讨论。活性碳循环能源系统包含三个部分,即CO2的回收、分离,以及从CO2中进行碳材料的再生和再生碳材料的使用。活性碳循环能源系统使用初级能源,不会释放CO2,这如同可再生能源和核能。在活性碳循环能源系统中含碳物质作为能源载体,并被重复循环使用。与使用氢能源系统相比,活性碳循环能源系统在热力学方面是可行的。CO的能量密度高于氢气,而且CO与传统炼铁工艺具有较高的兼容性。因此,在活性碳循环能源系统中,CO是适宜的循环介质。用碳作为介质的活性碳循环能源系统其可行性是基于热焓分析来评估的。CO的有效再生是建立活性碳循环能源系统的一个关键技术。评价了基于CO2氢化而获得CO再生方法的能源平衡,该再生过程需要超过800℃的热量输入。高温过程产生的800℃左右的剩余热量可用于反应。高温气体冷却反应堆可作为一种备用的初级能源。探讨了用氢还原CO2的活性碳循环能源系统在炼铁系统中应用的可行性。活性碳循环能源系统有望成为新型低CO2排放炼铁工艺的基础。

关键词：碳循环二氧化碳还原一氧化碳氢气炼铁工艺

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The complement component C5 is not responsible for the alternative pathway activity in rabbit erythrocyte hemolytic assays during eculizumab treatment

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Cellular & Molecular Immunology 2020年第6期17卷 653-655页

作者： lambertus P.van den Heuvel Nicole C.A.J.van de Kar Caroline Duineveld Andrei Sarlea Thea J.A.M.van der Velden Wilhelmus T.B.Liebrand Sanne van Kraaij Camilla Schjalm Romy Bouwmeester Jack F.M.Wetzels Tom E.Mollnes Elena B.Volokhina Department of Pediatric Nephrology Amalia Children’s Hospital Radboud University Medical CenterRadboud Institute for Molecular Life SciencesNijmegenThe Netherlands Department of Laboratory Medicine Radboud University Medical CenterRadboud Institute for Molecular Life SciencesNijmegenThe Netherlands Department of Pediatrics University Hospitals LeuvenLeuvenBelgium Department of Nephrology Radboud University Medical CenterRadboud Institute for Health SciencesNijmegenThe Netherlands Department of Immunology Oslo University Hospital and University of OsloOsloNorway Research Laboratory Nordland HospitalBodøand K.G.Jebsen TRECUniversity of TromsøTromsøNorway Center of Molecular Inflammation Research Norwegian University of Science and TechnologyTrondheimNorway

Dear Editors,Eculizumab is a therapeutic complement C5 inhibitor approved for the treatment of atypical hemolytic uremic syndrome(aHUS),paroxysmal nocturnal proteinuria(PNH),generalized myasthenia gravis and neuromyelitis optica spectrum *** dosing of eculizumab is important to ensure complete complement *** activity is often monitored by measuring either formation of the C5 activation product C5b-9 in vitro using an ELISA,independent of red blood cells,or by hemolytic assays measuring hemoglobin release from *** approaches allow analysis of complement activation via the classical(CP)and alternative(AP)pathways.

关键词： hemolytic rabbit gravis

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