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PARAMETER ESTIMATION IN liNEAR REGRESSION MODELS FOR LONGITUDINAL CONTAMINATED DATA

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Applied Mathematics(A Journal of Chinese Universities) 2005年第1期20卷 64-74页

作者： QianWeimin liyumei Dept.ofAppl.Math. TongjiUniv.Shanghai200092China.

The parameter estimation and the coefficient of contamination for the regression models with repeated measures are studied when its response variables are contaminated by another random variable *** the suitable condi... 详细信息

关键词： longitudinal data coeffcient of contamination parameter estimation,strong consistency.

Genome-wide Analysis of MYB Gene Family in Potato Provides Insights into Tissue-specific Regulation of Anthocyanin Biosynthesis

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Horticultural Plant Journal 2021年第2期7卷 129-141页

作者： yumei li Jun liang Xiangzhi Zeng Han Guo Youwei Luo Philip Kear Shouming Zhang Guangtao Zhu Faculty of Information Engineering and Automation Kunming University of Science and TechnologyKunming650500China Yunnan Key Lab for Potato Biology The CAAS-YNNU Joint Academy of Potato SciencesYunnan Normal UniversityKunming650500China Agricultural Genomics Institute at Shenzhen Chinese Academy of Agricultural SciencesShenzhenGuangdong518124China Yunnan Dehong Dai and Jinpo Nationality Institute of Agricultural Sciences DehongYunnan678400China International Potato Center(CIP) CIP China Center for Asia PacificBeijing100081China

The MYB transcription factor is one of the largest gene families in plants,playing an important role in regulating plant growth,development,response to stress,senescence,and especially the anthocyanin *** this study,A total of 217 MYB genes,including 901R-MYBs,124 R2R3-MYBs,and 3 R1R2R3-MYBs have been identified from the potato *** 1R-MYB and R2R3-MYB family members could be divided into 20 and 35 subgroups *** of gene structure and protein motifs revealed that members within the same subgroup presented similar exon/intron and motif organization,further supporting the results of phylogenetic *** is an ideal plant to reveal the tissue-specific anthocyanins biosynthesis regulated by MYB,as the anthocyanins could be accumulated in different tissues,showing colorful *** pairs of colored and colorless tissues,stigma,petal,stem,leaf,and tuber flesh,were applied to the transcriptomic analysis.A total of 70 MYB genes were found to be differentially expressed between colored and colorless tissues,and these differentially expressed genes were suspected to regulate the biosynthesis of anthocyanin of different ***-expression analysis identified numerous potential interactive regulators of anthocyanins biosynthesis,involving 39 MYBs,24 bHLHs,2 WD-repeats,and 29 biosynthesis ***-wide association study(GWAS)of tuber flesh color revealed amajor signal at the end of Chromosome 10,which was co-localized with reported I gene(StMYB88),controlling tuber peel *** of DEGs(Differentially Expression Genes)revealed that both StMYB88 and StMYB89 were closely related to regulating anthocyanin biosynthesis of tuber *** work offers a comprehensive overview of the MYB family in potato and will lay a foundation for the functional validation of these genes in the tissue-specific regulation of anthocyanin biosynthesis.

关键词： potato MYB transcription factor anthocyanin differentially expressed co-expression tuber flesh

Population-scale genetic control of alternative polyadenylation and its association with human diseases

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Quantitative Biology 2022年第1期10卷 44-54页

作者： Lei li yumei li Xudong Zou Fuduan Peng Ya Cui Eric J.Wagner Wei li Institute of Systems and Physical Biology Shenzhen Bay LaboratoryShenzhen 518055China Division of Computational Biomedicine Department of Biological ChemistrySchool of MedicineUniversity of CaliforniaIrvineCA 92697USA Department of Biochemistry&Molecular Biology University of Texas Medical BranchGalvestonTX 77555USA

Background:Genome-wide association studies(GWAS)have identified thousands of genomic non-coding variants statistically associated with many human traits and diseases,including ***,the functional interpretation of these non-coding variants remains a significant challenge in the post-GWAS *** polyadenylation(APA)plays an essential role in post-transcriptional regulation for most human *** employing different poly(A)sites,genes can either shorten or extend the 3'-UTRs that contain cu-regulatory elements such as miRNAs or RNA-binding protein binding ***,APA can affect the mRNA stability,translation,and cellular localization of ***-scale studies have revealed many inherited genetic variants that potentially impact APA to further influence disease susceptibility and phenotypic diversity,but systematic computational investigations to delineate the connections are in their earliest ***:Here,we discuss the evolving definitions of the genetic basis of APA and the modern genomics tools to identify,characterize,and validate the genetic influences of APA events in human *** also explore the emerging and surprisingly complex molecular mechanisms that regulate APA and summarize the genetic control of APA that is associated with complex human diseases and ***:APA is an intermediate molecular phenotype that can translate human common non-coding variants to individual phenotypic variability and disease susceptibility.

关键词： GWAS eQTL disease alternative polyadenylation

幽门螺杆菌微生物学特征及其与慢性萎缩性胃炎的相关性

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检验医学 2024年第5期39卷 497-503页

作者：李玉梅龙小平毛晓雪胡小英辜程鸿自贡市第四人民医院检验科四川自贡643000

目的探讨幽门螺杆菌(Hp)微生物学特征及其与慢性萎缩性胃炎(CAG)的关系。方法回顾性分析2020年11月—2022年11月自贡市第四人民医院300例慢性胃炎(CG)伴Hp感染患者临床资料,根据是否发生胃黏膜萎缩分为未萎缩组(136例)和萎缩组(164例)... 详细信息

目的探讨幽门螺杆菌(Hp)微生物学特征及其与慢性萎缩性胃炎(CAG)的关系。方法回顾性分析2020年11月—2022年11月自贡市第四人民医院300例慢性胃炎(CG)伴Hp感染患者临床资料,根据是否发生胃黏膜萎缩分为未萎缩组(136例)和萎缩组(164例)。分析2组患者临床特征、分离的Hp菌株微生物学特征和对常用抗菌药物的耐药性。采用Logistic回归分析评价胃黏膜萎缩的影响因素。构建贝叶斯网络预测模型,采用受试工作者特征(ROC)曲线和校准曲线对预测模型的区分度和准确度进行评价。结果萎缩组饮食不规律、有胃肠道疾病家族史、食用腌制品所占比例高于未萎缩组(P<0.05)。分离自萎缩组患者的Hp血清型、毒力基因和Ⅰ型菌株均高于未萎缩组(P<0.05)。分离自萎缩组患者的Hp对阿莫西林、甲硝唑和左氧氟沙星的耐药率均高于未萎缩组(P<0.05)。Logistic回归分析结果显示,饮食不规律、有胃肠道疾病家族史、食用腌制品、携带CagA抗体和cagA毒力基因、Ⅰ型菌株,以及阿莫西林、甲硝唑、左氧氟沙星耐药是胃黏膜萎缩的危险因素(P<0.05)。ROC曲线分析结果显示,贝叶斯网络预测模型具有良好的区分度和准确度。结论Hp菌株微生物学特征与CAG密切相关。

关键词：幽门螺杆菌慢性萎缩性胃炎微生物学特征

KRAS单突变及KRAS/TP53共突变在肺腺癌中的治疗及预后分析

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包头医学院学报 2024年第5期40卷 33-38,54页

作者：张珊珊李玉梅黄柱华毕明宏蚌埠医学院第一附属医院安徽蚌埠233000

目的:比较Kristen鼠肉瘤致癌基因(kirsten rat sarcoma viral oncogene,KRAS)突变型肺腺癌患者不同突变状态、分子分型的治疗及其预后。方法:收集2019年04月-2022年04月于蚌埠医学院第一附属医院确诊且接受一线治疗的晚期KRAS突变肺腺... 详细信息

目的:比较Kristen鼠肉瘤致癌基因(kirsten rat sarcoma viral oncogene,KRAS)突变型肺腺癌患者不同突变状态、分子分型的治疗及其预后。方法:收集2019年04月-2022年04月于蚌埠医学院第一附属医院确诊且接受一线治疗的晚期KRAS突变肺腺癌患者资料,统计TP53共突变情况、分子分型并分析其治疗预后的相关性。结果:随访至2022年4月,KRAS/TP53共突变患者相较于KRAS单突变的患者,中位无进展生存期(median progression-free survival,mPFS)明显缩短(HR=0.613,95%CI:0.396-0.951,P=0.029),差异有统计学意义;化疗联合抗血管生成治疗对比单纯化疗mPFS明显延长,差异有统计学意义(HR=0.593,95%CI:0.355-0.990,P=0.038);化疗联合免疫治疗组对比单纯化疗mPFS明显延长,差异有统计学意义(HR=0.426,95%CI:0.247-0.736,P=0.02);化疗联合抗血管生成治疗组相较于化疗联合免疫治疗组mPFS对比,差异无统计学意义(HR=0.648,95%CI:0.371-1.130,P=0.126)。结论:TP53为晚期KRAS突变肺腺癌患者不良预后因素;G12C和非G12C不同分子分型间的治疗及预后无明显差异;化疗联合免疫或抗血管生成治疗对比单纯化疗可延长晚期肺腺癌患者的PFS,但联合治疗组之间的PFS无明显差异。

关键词：肺腺癌 KRAS突变一线治疗

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用于热流测量的空腔绝对辐射计研究

宇航计测技术 2024年第2期44卷 14-16页

作者：王阔传卢超李玉梅杨静张伟北京航天计量测试技术研究所北京100076

辐射热流传感器在航空、航天及军事领域应用广泛,其中空腔绝对辐射计作为热流标准器具有多方面的优势。介绍了空腔绝对辐射计的研究背景、研制意义、测量原理、结构形式及组成部分的功能构成,提出了空腔绝对辐射计的测试方法,对测量结... 详细信息

辐射热流传感器在航空、航天及军事领域应用广泛,其中空腔绝对辐射计作为热流标准器具有多方面的优势。介绍了空腔绝对辐射计的研究背景、研制意义、测量原理、结构形式及组成部分的功能构成,提出了空腔绝对辐射计的测试方法,对测量结果进行了验证,所研制的空腔绝对辐射计可满足热流校准工作需求。

关键词：热流空腔辐射计

基于网络药理学和分子对接探讨黄芪-川芎配伍治疗瘢痕的作用机制

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特产研究 2024年第3期46卷 113-122页

作者：洪玉书宋张婕张佳欢刘婧李玉梅长春中医药大学药学院吉林长春130117

基于网络药理学探讨黄芪-川芎配伍治疗瘢痕的作用机制。通过TCMSP数据库筛选出黄芪和川芎的有效成分及其靶点,同时使用OMIM、GeneCards和DrugBank数据库获取得到黄芪-川芎配伍治疗瘢痕的潜在交集靶点。采用Cytoscape3.7.0软件构建中药-... 详细信息

基于网络药理学探讨黄芪-川芎配伍治疗瘢痕的作用机制。通过TCMSP数据库筛选出黄芪和川芎的有效成分及其靶点,同时使用OMIM、GeneCards和DrugBank数据库获取得到黄芪-川芎配伍治疗瘢痕的潜在交集靶点。采用Cytoscape3.7.0软件构建中药-有效成分-靶点-疾病网络,并通过STRING数据库构建PPI网络,利用微生信网站进行KEGG富集分析及GO功能分析可视化,再佐以分子对接验证。结果显示,共筛选得到川芎有效成分7个,对应靶点42个;黄芪有效成分20个,对应靶点462个;瘢痕靶点2216个。黄芪-川芎配伍治疗瘢痕的关键成分有槲皮素和山柰酚等;治疗瘢痕的关键靶点是TP53和白细胞介素6等。KEGG富集分析结果表明,黄芪-川芎主要与IL-17信号通路和TNF信号通路有关。分子对接表明,黄芪-川芎主要活性成分槲皮素、山柰酚和杨梅酮与关键靶点AKT1、IL6和TNF具有良好的稳定性。本文基于网络药理学和分子对接验证研究表明,黄芪和川芎可能通过多成分、多靶点和多通路来治疗瘢痕。

关键词：黄芪川芎瘢痕网络药理学

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首发难治性精神分裂症患者的头颅CT扫描及脑部形态改变特征分析

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当代医学 2024年第7期30卷 73-77页

作者：卢童新李玉美吴东汪爱妩赵勇宜春市第三人民医院医技科江西宜春336000

目的探究首发难治性精神分裂症患者的头颅CT扫描及脑部形态改变特征。方法选取2019年1月至2021年12月宜春市第三人民医院接诊的90例首发难治性精神分裂症患者作为研究组,另选取同期接诊的90例普通精神分裂症患者作为对照组,均进行头颅C... 详细信息

目的探究首发难治性精神分裂症患者的头颅CT扫描及脑部形态改变特征。方法选取2019年1月至2021年12月宜春市第三人民医院接诊的90例首发难治性精神分裂症患者作为研究组,另选取同期接诊的90例普通精神分裂症患者作为对照组,均进行头颅CT检查,比较两组检查结果及颅脑CT影像改变。结果研究组皮质异常、侧脑室异常、小脑萎缩、透明隔腔检出率高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。研究组前纵裂池最大宽度、额叶额上沟最宽距离、外侧裂垂直部最宽距离(右)、外侧裂垂直部最宽距离(左)、外侧裂水平部最宽距离(左)、外侧裂水平部最宽距离(右)长于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);研究组侧脑室占脑室指数(VBR)、前角指数(FHI)高于对照组,室中央指数(CMI)、前额叶萎缩指数(PFAI)低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);研究组侧脑室前角间最大宽度短于对照组,侧脑室前角间最小宽度、第三脑室体部最大宽度、侧脑室颞角最大宽度(左)、侧脑室颞角最大宽度(右)均长于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);研究组左侧中央旁小叶、左侧额极、右侧额上回、左侧额上回均短于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论采用颅脑CT检查首发难治性精神分裂症患者,可明确患者脑部形态改变特征,判断脑损害及脑萎缩程度,以指导后续治疗,具有较高应用价值。

关键词：首发难治性精神分裂症头颅CT检查脑部形态特征改变相关性分析

重复性经脊髓磁刺激促进脊髓损伤小鼠运动功能恢复

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中国组织工程研究 2025年第11期29卷 2252-2260页

作者：宋海旺姜冠华穆盈盈付善羽孙宝飞李玉美余资江杨丹贵州医科大学基础医学院人体解剖学教研室贵州省贵安新区561113 贵州医科大学基础医学院贵州省贵安新区561113

背景:研究表明重复性经脊髓磁刺激能够抑制脊髓损伤炎症反应,在脊髓区域施加磁场刺激,以调节神经元的兴奋性和突触传递,从而促进神经系统的可塑性和修复。目的:观察重复性经脊髓磁刺激对脊髓损伤后小鼠Toll样受体4/核因子κB/NLRP3信号... 详细信息

背景:研究表明重复性经脊髓磁刺激能够抑制脊髓损伤炎症反应,在脊髓区域施加磁场刺激,以调节神经元的兴奋性和突触传递,从而促进神经系统的可塑性和修复。目的:观察重复性经脊髓磁刺激对脊髓损伤后小鼠Toll样受体4/核因子κB/NLRP3信号通路的影响,探讨其对运动功能恢复的机制。方法:将SPF级雄性C57BL/6J小鼠随机分为假手术组、脊髓损伤组、重复性经脊髓磁刺激组,后2组小鼠麻醉后采用咬骨钳剔除T9椎板,暴露脊髓,使用小型动脉瘤夹夹持脊髓20 s建立脊髓损伤模型。重复性经脊髓磁刺激组小鼠脊髓损伤的第1天开始进行为期21 d的重复性经脊髓磁刺激干预。每天持续10 min,每周刺激5 d,休息2 d。于脊髓损伤后1,3,7,14,21 d进行小鼠运动功能BMS评分,利用Western Blot检测脊髓损伤处的水通道蛋白AQP4、凋亡因子Bax、Bcl-2、CL-Caspase-3、炎症因子肿瘤坏死因子α、干扰素γ、白细胞介素6、白细胞介素4和Toll样受体4/核因子κB/NLRP3信号通路相关蛋白的表达,氧化应激试剂盒检测脊髓损伤处超氧化物歧化酶、谷胱甘肽过氧化物酶的活性及丙二醛浓度,免疫荧光染色法检测神经元核抗原的表达。结果与结论:(1)重复性经脊髓磁刺激组小鼠的BMS评分高于脊髓损伤组(P<0.05);(2)与脊髓损伤组相比,重复性经脊髓磁刺激组脊髓含水量降低、AQP4蛋白表达降低;丙二醛浓度、Bax、CL-Caspase-3、肿瘤坏死因子α、干扰素γ、白细胞介素6与Toll样受体4/核因子κB/NLRP3信号通路相关蛋白的表达均降低(P<0.05),而超氧化物歧化酶活性、谷胱甘肽过氧化物酶活性、Bcl-2、白细胞介素4与神经元核抗原的表达均升高(P<0.05);(3)结果说明,重复性经脊髓磁刺激能下调Toll样受体4/核因子κB/NLRP3信号通路相关蛋白的表达,缓解脊髓损伤后的脊髓水肿、氧化应激、凋亡反应和炎症反应等,发挥神经保护作用,从而促进脊髓损伤后小鼠后肢运动功能的恢复。

关键词：脊髓损伤重复性经脊髓磁刺激 TLR4/NF-κB/NLRP3信号通路脊髓水肿氧化应激凋亡反应炎症反应神经保护运动功能