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Epigenome-wide DNA methylation analysis reveals differentially methylation patterns in skeletal muscle between Chinese Chenghua and Qingyu pigs

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Journal of Integrative Agriculture 2022年第6期21卷 1731-1739页

作者： WANG Kai WU Ping-xian WANG Shu-jie JI Xiang CHEN Dong JIANG An-an XIAO wei-hang JIANG Yan-zhi ZHU li ZENG Yang-shuang XU Xu QIU Xiao-tian li Ming-zhou li xue-wei TANG Guo-qing Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province Sichuan Agricultural UniversityChengdu 611130P.R.China College of life Science Sichuan Agricultural UniversityYa’an 625014P.R.China Sichuan Animal Husbandry Station Chengdu 610041P.R.China National Animal Husbandry Service Beijing 100125P.R.China Chongqing Academy of Animal Science Chongqing 402460P.R.China

Chenghua(CH)pig and Qingyu(QY)pig are typical Chinese native fatty breeds.CH pig is mainly distributed in Chengdu Plain,while QY pig is widely distributed throughout the mountain areas around the Sichuan Basin.There are significant differences in their phenotypic traits,including body image,growth performance,and meat quality.This study compared several meat quality traits of CH and QY pigs and conducted a genome-wide DNA methylation analysis using reduced representation bisulfite sequencing(RRBS).It was observed that the pH at 45 min(pH_(45min),P=5.22e-13),lightness at 45 min(L^(*)_(45min),P=4.85e-5),and lightness at 24 h(L^(*)_(24h),P=3.57e-5)of CH pigs were higher than those of QY pigs.We detected 10699 differentially methylated cytosines(DMCs)and 2760 differentially methylated genes(DMGs)associated with these DMCs.Functional analysis showed that these DMGs were mainly enriched in the AMPK signaling pathway,Type II diabetes mellitus,Insulin signaling pathway,mTOR signaling pathway,and Insulin resistance.Furthermore,15 DMGs were associated with fat metabolism(ACACA,CAB39,CRADD,CRTC2,FASN,and GCK),muscle development(HK2,IKBKB,MTOR,PIK3CD,PPARGC1A,and RPTOR),or meat quality traits(PCK1,PRKAG2,and SLC2A4).The findings may help to understand further the epigenetic regulation mechanisms of meat quality traits in pigs and provide new basic data for the study of local pigs.

关键词： DNA methylation reduced representation bisulfite sequencing(RRBS) Chenghua pig Qingyu pig

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模糊性政策执行模式的动态转换逻辑——以异地就医即时结算政策为例

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中国卫生政策研究 2024年第4期17卷 1-7页

作者：徐发新李雪伟中国人民大学公共管理学院北京100872 北京体育大学管理学院北京100084

目的:在高度复杂性和不确定性条件下,模糊性日益成为公共政策的显要属性。缘于模糊性,政策执行过程往往伴随执行模式的动态转换,而学界对该转换过程和机制缺乏足够探讨。方法:本研究基于修正的模糊—冲突模型和多源流模型,构建了一个解... 详细信息

目的:在高度复杂性和不确定性条件下,模糊性日益成为公共政策的显要属性。缘于模糊性,政策执行过程往往伴随执行模式的动态转换,而学界对该转换过程和机制缺乏足够探讨。方法:本研究基于修正的模糊—冲突模型和多源流模型,构建了一个解释模糊性政策执行模式动态转换的分析框架,并以异地就医即时结算政策为例对模式转换逻辑进行了阐释。结果:同一项模糊性政策在执行中会经历从试验性执行到象征性执行,再到政治性执行,最终进入常态化行政性执行的动态转换过程。促使执行模式转换的原因与对应阶段的主导动力源流密不可分。结论与建议:细化的执行手段、清晰的权责关系、自上而下的高位推动、充足的执行资源及数字化技术都有助于降低政策的模糊性和冲突性,提升政策执行效果。

关键词：模糊性政策政策执行模糊—冲突模型多源流模型执行模式转换

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撤县设区对县域公共服务供给水平的影响研究——基于江苏省县级面板数据的实证分析

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城市问题 2024年第1期 65-74页

作者：徐发新李雪伟中国人民大学公共管理学院北京体育大学管理学院

基于江苏省2006—2020年的县域面板数据,使用多期双重差分法考察了撤县设区改革对县域政府公共服务供给水平的影响。结果显示,撤县设区改革提升了交通基础设施等经济性公共服务供给水平,对教育和医疗等民生性公共服务供给水平则带来了... 详细信息

基于江苏省2006—2020年的县域面板数据,使用多期双重差分法考察了撤县设区改革对县域政府公共服务供给水平的影响。结果显示,撤县设区改革提升了交通基础设施等经济性公共服务供给水平,对教育和医疗等民生性公共服务供给水平则带来了负面影响。分样本回归结果显示,撤县设区改革在不同经济发展水平地区的政策效应存在显著差异。总体而言,“重经济而轻民生”的问题仍然存在,尤其在中低发展水平地区更为明显。机制分析结果显示,撤县设区改革促进了中低发展水平地区的人口增长,但公共服务供给的增长不及人口规模的增长,从而导致了“拥挤效应”。因此,是否实行撤县设区改革需要因地制宜,综合考量。而已经实行改革的地区则应转变政府职能,优化资源配置,以服务型政府建设推动公共服务供给水平提升,确保经济与民生同步发展。

关键词：撤县设区改革公共服务供给水平县域发展双重差分法

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GC-MS/MS同时测定加热卷烟烟气中的酮类香味成分

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质谱学报 2024年第3期45卷 447-456,I0006页

作者：刘洋顾丽莉蔡洁云杨发容李伟雪王惠平顾健龙昆明理工大学化学工程学院云南昆明650500 云南省烟草质量监督检测站云南昆明650106

本研究采用管式炉加热-溶剂吸收结合气相色谱-串联质谱(GC-MS/MS)建立了可同时定量测定28种加热卷烟烟气中酮类香味物质的方法。对该方法进行验证,28种酮类化合物的检出限及定量限分别为0.65~2.77μg/L和2.18~9.24μg/L,回收率为81.88%~... 详细信息

本研究采用管式炉加热-溶剂吸收结合气相色谱-串联质谱(GC-MS/MS)建立了可同时定量测定28种加热卷烟烟气中酮类香味物质的方法。对该方法进行验证,28种酮类化合物的检出限及定量限分别为0.65~2.77μg/L和2.18~9.24μg/L,回收率为81.88%~119.32%,日内精密度为0.04%~3.51%(n=6),日间精密度为0.11%~3.36%(n=6),能够满足定量分析要求,且可以有效区分二氢-β-紫罗兰酮/香叶基丙酮、法尼基丙酮/金合欢基丙酮2对同分异构体。利用该方法检测27种不同口味加热卷烟烟气中的酮类香味物质,结果表明,不同口味的加热卷烟烟气中酮类香味成分含量不同。

关键词：管式炉加热-溶剂吸收气相色谱-串联质谱(GC-MS/MS) 酮类香味成分

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堆土坡道对高速铁路桥梁结构的影响及施工控制分析

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智能城市 2024年第3期10卷 126-128页

作者：李学伟中铁十六局集团第一工程有限公司北京101300

结合现场实际工况,基于有限元数值计算软件建立堆土坡道数值分析模型,分析堆土和桥梁结构之间的影响,并对箱梁翼缘板位置混凝土的局部受压进行验算。结果表明,采用堆土坡道会对承台墩身水平方向产生较小的影响,水平方向变形值均在规范... 详细信息

结合现场实际工况,基于有限元数值计算软件建立堆土坡道数值分析模型,分析堆土和桥梁结构之间的影响,并对箱梁翼缘板位置混凝土的局部受压进行验算。结果表明,采用堆土坡道会对承台墩身水平方向产生较小的影响,水平方向变形值均在规范要求范围内,箱梁翼缘板处局部受压满足承载力要求,为同类工程的应用提供参考依据。

关键词：高速铁路桥梁工程堆土坡道数值分析

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Genome-wide scan for selection signatures based on whole-genome re-sequencing in Landrace and Yorkshire pigs

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Journal of Integrative Agriculture 2021年第7期20卷 1898-1906页

作者： WANG Kai WU Ping-xian CHEN De-juan ZHOU Jie YANG Xi-di JIANG An-an MA Ji-deng TANG Qian-zi XIAO wei-hang JIANG Yan-zhi ZHU li QIU Xiao-tian li Ming-zhou li xue-wei TANG Guo-qing Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province Sichuan Agricultural UniversityChengdu 611130P.R.China College of life Science Sichuan Agricultural UniversityYa'an 625014.P.R.China National Animal Husbandry Service Beijing 100125P.R.China

We performed a genome-wide scan to detect selection signatures that showed evidence of positive selection in the domestication process by re-sequencing the whole genomes of Landrace and Yorkshire pigs.Fifteen annotated elements with 13 associated genes were identified using the Z-transformed FST(Z(FST))method,and 208 annotated elements with 140 associated genes were identified using the Z-transformed heterozygosity(ZHp)method.The functional analysis and the results of previous studies showed that most of the candidate genes were associated with basic metabolism,disease resistance,cellular processes,and biochemical signals,and several were related to body morphology and organs.They included PPP3CA,which plays an essential role in the transduction of intracellular Ca2+-mediated signals,and WWTR1,which plays a pivotal role in organ size control and tumor suppression.These results suggest that genes associated with body morphology were subject to selection pressure during domestication,whereas genes involved in basic metabolism and disease resistance were subject to selection during artificial breeding.Our findings provide new insights into the potential genetic variation of phenotypic diversity in different pig breeds and will help to better understand the selection effects of modern breeding in Landrace and Yorkshire pigs.

关键词： pig variation whole-genome sequence selection signature phenotypic trait

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结合套接字地址结构信息的网络入侵检测系统

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计算机仿真 2024年第4期41卷 357-362,407页

作者：李昊冉王宝亮李雪威天津大学智能与计算学部天津300300 天津大学信息与网络中心天津300300

在过去的几年里,不断增长的网络攻击严重威胁社会经济与隐私安全,需要准确的网络入侵检测系统。现有主流的基于机器学习的网络入侵检测系统通常独立地处理网络流量,近些年很多研究开始尝试使用图神经网络技术捕获流量间的关系,然而它们... 详细信息

在过去的几年里,不断增长的网络攻击严重威胁社会经济与隐私安全,需要准确的网络入侵检测系统。现有主流的基于机器学习的网络入侵检测系统通常独立地处理网络流量,近些年很多研究开始尝试使用图神经网络技术捕获流量间的关系,然而它们都没有捕获流量的套接字地址结构,即主机IP地址与其端口号间的结构信息。结构信息对于一些依赖主机IP地址与端口作为切入点网络攻击的检测非常重要,所以提出基于图神经网络的结合套接字地址结构信息的网络入侵检测系统,设计一个可以保存网络流量连接IP地址与其端口号间结构信息的异质图表示方法,然后提出一个适配上述图表示方法的消息传递与聚合方法用以捕获套接字地址的结构信息,最后使用门控循环单元结合捕获的结构信息检测入侵行为。实验结果表明,提出的图卷积网络模型在著名的CIC-IDS2017,CSE-CIC-IDS2018数据集上能得到更好的性能。

关键词：网络安全入侵检测深度学习图卷积网路网络流量

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Molecular characterization and tissue expression profile of the Dnmts gene family in pig

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Journal of Integrative Agriculture 2017年第6期16卷 1367-1374页

作者： LUO Zong-gang ZHANG Kai CHEN Lei YANG Yuan-xin FU Peng-hui WANG Ke-tian WANG ling li Ming-zhou li xue-wei ZUO Fu-yuan WANG Jin-yong Chongqing Academy of Animal Science Chongqing 402460 P.R. China Department of Animal Science Southwest University (Rongchang Campus) Chongqing 402460 P.R. China Key Laboratory of Pig Industry Sciences Ministry of Agriculture Chongqing 402460 P.R. China Sichuan Academy of Grassland Sciences Chengdu 610000 P.R.China Institute of Animal Genetics & Breeding College of Animal Science & Technology Sichuan Agricultural University Chengdu 611130 P.R.China

DNA methyltransferases（Dnmts）comprise a family of proteins which involved in the establishment and maintenance of DNA methylation patterns.In pig,the molecular characterization and tissue expression profile of Dnmt gene family are not clear.To solve this problem,reverse transcriptase PCR and rapid amplification of c DNA ends were used to clone the sequences of the porcine Dnmt2 and Dnmt3b genes.Furthermore,the m RNA expression profiles of Dnmt1,Dnmt2,Dnmt3a and Dnmt3b genes from 54 adult tissues and 2 entire fetuses of Rongchang pig were analyzed by quantitative real-time PCR（q RT-PCR）.As a result,the lengths of porcine Dnmt2 and Dnmt3b gene c DNAs were 1 227 and 2 559 bp with cytosine-C5specific DNA methylase domain,respectively.The four Dnmt genes were highly expressed in longissimus dorsi muscle（P〈0.01）.Dnmt1 is highly expressed in heart（P〈0.01）and Dnmt 2 shows its preference in liver and seminal vesicle tissue（P〈0.01）.Dnmt3a and Dnmt3b are highly expressed in the two fetus stages（P〈0.01）.All these results suggested that each gene has its specific expression profile,and deeper study is required to dig more details between the methylation level and Dnmt family m RNA expressions in different tissues.

关键词： pig Dnmt gene family cloning mRNA expression

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Identifying SNPs associated with birth weight and days to 100 kg traits in Yorkshire pigs based on genotyping-by-sequencing

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Journal of Integrative Agriculture 2021年第9期20卷 2483-2490页

作者： WU Ping-xian ZHOU Jie WANG Kai CHEN De-juan YANG Xi-di liU Yi-hui JIANG An-an SHEN lin-yuan JIN Long XIAO wei-hang JIANG Yan-zhi li Ming-zhou ZHU li ZENG Yang-shuang XU Xu QIU Xiao-tian li xue-wei TANG Guo-qing Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province Sichuan Agricultural UniversityChengdu 611130P.R.China College of life Science Sichuan Agricultural UniversityYa’an 625014P.R.China Sichuan Animal Husbandry Station Chengdu 610041P.R.China National Animal Husbandry Service Beijing 100125P.R.China

Birth weight(BW)and days to 100 kg(D100)are important economic traits that are both affected by polygenes.However,the genetic architecture of these quantitative traits is still elusive.Genotyping-by-sequencing(GBS)data containing a large number of single nucleotide polymorphisms(SNPs)have become a powerful tool in genomic analysis.To better understand their complex genetic structure,a total of 600 Yorkshire pigs were sequenced using GBS technology.After quality control,279787 SNPs were generated for subsequent genome-wide association study(GWAS).A total of 30 genome-wide SNPs(P<1.79 E–07)were identified for D100.Furthermore,a total of 22 and 2 suggestive SNPs(P<3.57 E–06)were detected for D100 and BW,respectively.Of these,one locus located on SSC12(position:46226512 bp)were evaluated to affect both BW and D100 in Yorkshire pigs,indicating the pleiotropism in different traits.Considering the function of candidate genes,two genes,NSRP1 and DOCK7,were suggested as the most promising candidate genes involved in growth traits.Thus,use of GBS is able to identify novel variants and potential candidate genes for BW and D100,and provide an opportunity for improving pig growth traits using genomic selection in pigs.

关键词： genotyping-by-sequencing GWAS birth weight days to 100 kg Yorkshire pigs

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烟草甲在我国的潜在地理分布

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应用昆虫学报 2024年第1期61卷 162-168页

作者：李通王云明刘珏廷李学卫崔冰艺秦誉嘉赵紫华中国农业大学植物保护学院植物生物安全系农业农村部植物检疫性有害生物监测防控重点实验室北京100193 云南省烟草公司玉溪市公司玉溪653100 云南省烟草公司丽江市公司丽江674100 烟台文化旅游职业学院烟台264003

【目的】预测当前及未来气候场景下烟草甲Lasioderrmaserricorne(Fabricius)在我国的潜在地理分布,阐述烟草甲与气候因子之间的关系,为烟草甲的可持续治理提供理论基础。【方法】收集烟草甲的分布数据与气候数据,采用MaxEnt模型进行潜... 详细信息

【目的】预测当前及未来气候场景下烟草甲Lasioderrmaserricorne(Fabricius)在我国的潜在地理分布,阐述烟草甲与气候因子之间的关系,为烟草甲的可持续治理提供理论基础。【方法】收集烟草甲的分布数据与气候数据,采用MaxEnt模型进行潜在地理分布研究,模拟烟草甲在当前与未来气候变化下的潜在地理分布的情况。【结果】最冷月的最低温度和最暖月的最高温度是影响烟草甲潜在地理分布的关键因素,烟草甲的高度适生区集中在我国南方,烟草甲的潜在地理分布未来有从北向南缩减的趋势。【结论】本研究筛选出了6个影响烟草甲的关键气候因子,预测了其在当前及未来气候场景下在我国的潜在地理分布,为烟草甲的绿色防控提供依据。

关键词： MaxEnt 烟草甲分布气候变化潜在地理分布

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