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Tomato CYP94C1 inactivates bioactive JA-lle to attenuate jasmonate-mediated defense during fruit ripening

Molecular Plant 2024年第4期17卷 509-512页

作者： Tianxia Yang Lei Deng Qinyang Wang Chuanlong Sun Muhammad Ali Fangming Wu Huawei Zhaj Qian Xu Peiyong Xin Shujing Cheng Jinfang Chu Tingting Huang Chang-Bao li chuanyou li Key Laboratory of Seed Innovation Institute of Genetics and Developmental BiologyChinese Academy of SciencesBeijing 100101China College of life Sciences Shandong Agricultural UniversityTai'an 271018China Taishan Academy of Tomato Innovation Tai'an 271018China CAS Center for Excellence in Biotic Interactions University of Chinese Academy of SciencesBeijing 100049China College of Horticulture Science and Engineering Shandong Agricultural UniversityTaian 271018China Institute of Vegetable Qingdao Academy of Agricultural SciencesQingdao 266100China Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops(North China) Ministry of AgricultureBeijing Vegetable Research CenterBeijing Academy of Agriculture and Forestry SciencesBejing 100097China Frontiers Science Center for Molecular Design Breeding(MOE) Department of Plant Genetics and BreedingChina Agricultural UniversityBeijing 100193China

Dear Editor,Fruit rot caused by necrotrophic pathogens results in substantial reductions in fruit yield and revenues worldwide(Petrasch et al.,2019).A widespread phenomenon in fleshy fruit species is the susceptibility of ripe fruits to necrotrophs(Silva et al.,2021),which facilitates seed dispersal(Forlani et al.,2019)but causes severe post-harvest losses in *** most of the nutritional and sensory qualities of fruits are elaborated at the ripening stage(liu et al.,2015),balancing fruit ripening and pathogen resistance to maintain fruit quality has proven to be challenging.A deeper understanding of the mechanisms underlying the increased susceptibility of fruits to necrotrophs during ripening could lead to new strategies for producing necrotrophy-resistant fruits without compromising ripening-relatedquality.

关键词： susceptibility maintain fruit

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不同耕作方式及气候对土壤扬尘产生量的影响

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现代农业装备 2024年第3期45卷 76-83页

作者：李震张岚刘京蕊李传友张莉李志强北京市农业机械试验鉴定推广站北京100079

为探索不同耕作方式及气候对农田扬尘产生量的影响,在田间架设气象环境监测站记录一年的试验数据然后进行分析研究。试验设置4个处理组,结果表明,在4个不同处理组中,组2的PM2.5、PM10和TSP浓度显著高于组1、组4及组3;除组2以外,组1、组... 详细信息

为探索不同耕作方式及气候对农田扬尘产生量的影响,在田间架设气象环境监测站记录一年的试验数据然后进行分析研究。试验设置4个处理组,结果表明,在4个不同处理组中,组2的PM2.5、PM10和TSP浓度显著高于组1、组4及组3;除组2以外,组1、组4和组3的月均PM2.5、PM10和TSP浓度依次递减;土壤温度、湿度及风速对4个处理组的PM2.5、PM10及TSP浓度影响均极显著。该研究为农田生产过程中降低扬尘产生量、选择合理耕作方式提供了数据支撑。

关键词：耕作方式扬尘大气环境风速

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鄂尔多斯活动地块边界带第四纪晚期构造活动特征及强震孕育机制

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地质力学学报 2024年第2期30卷 206-224页

作者：郑文俊孙鑫雷启云龚志康王银刘兴旺李传友冯子鉴中山大学地球科学与工程学院广东珠海519082 广东省地球动力作用与地质灾害重点实验室广东珠海519082 南方海洋科学与工程广东省实验室(珠海) 广东珠海519082 宁夏回族自治区地震局宁夏银川750001 甘肃省地震局甘肃兰州730000 中国地震局地质研究所北京100029 地震动力学国家重点实验室北京100029

鄂尔多斯地块是位于中国内地中心位置的典型活动地块,由于受西南部青藏地块和东部太平洋板块远程作用的影响,地块各边界带构造活动特征和变形具有明显的特殊性和差异性。文章总结了多年来围绕鄂尔多斯活动地块周缘边界带开展的活动断裂... 详细信息

鄂尔多斯地块是位于中国内地中心位置的典型活动地块,由于受西南部青藏地块和东部太平洋板块远程作用的影响,地块各边界带构造活动特征和变形具有明显的特殊性和差异性。文章总结了多年来围绕鄂尔多斯活动地块周缘边界带开展的活动断裂定量、地震孕育机制及活动特征等的已有研究结果,对地块周缘断裂活动特征及强震孕育机制进行系统总结。鄂尔多斯活动地块不同边界带断裂第四纪晚期活动特征的不同是强震孕育环境差异的最直接的证据。鄂尔多斯活动地块西边界构造变形样式复杂,受青藏高原向北东挤压扩展的影响,西边界南段断裂以走滑、逆走滑和逆冲为主要特征。而向北到西边界北段,以右旋走滑为主要特征;以青藏高原最新扩展前缘的三关口-牛首山断裂为界,北部的银川盆地表现为典型的断陷盆地,边界断裂有右旋走滑特征,地震活动多以正走滑型为主。北边界的河套盆地以北侧的正断层为其控盆构造,历史和古地震多集中在北侧边界断裂上。南边界的渭河盆地构造特征相对较为复杂,由两组正断层组成,历史大地震多发生在盆地南缘,盆地中北部有中强地震发生。东边界的山西地堑系由多个裂谷型盆地斜列组成,历史大地震表现为南强北弱,北部盆地受张-渤构造带的影响,盆地走向和断层运动性质均发生了明显变化,多具备发生7级左右地震的构造条件。综合认为,断裂活动特征典型的鄂尔多斯活动地块周缘各边界带,未来强震多发生在大地震离逝时间长的地震空区/空段,或是构造带的转换和交汇区。

关键词：活动构造强震孕震机制活动地块边界带鄂尔多斯

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Mediator complex subunit MED25 physically interacts with DST to regulate spikelet number in rice

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Journal of Integrative Plant Biology 2022年第4期64卷 871-883页

作者： lihao lin Minmin Du Shuyu li Chuanlong Sun Fangming Wu Lei Deng Qian Chen chuanyou li State Key Laboratory of Plant Genomics National Centre for Plant Gene Research(Beijing)Institute of Genetics and Developmental BiologyThe Innovative Academy of Seed DesignThe Chinese Academy of SciencesBeijing 100101China State Key Laboratory of Crop Biology College of AgronomyShandong Agricultural UniversityTaian 271018China

Grain number is a flexible trait and contributes significantly to grain *** rice,the zinc finger transcription factor DROUGHT AND SALT TOLERANCE(DST)controls grain number by directly regulating cytokinin oxidase!dehydrogenase 2(OsCKX2)*** specific upstream regulators of the DST-OsCKX2 module have been identified,the mechanism employed by DST to regulate the expression of OsCKX2 remains ***,we demonstrate that DST-interacting protein 1(DIP1),known as Mediator subunit OsMED25,acts as an interacting coactivator of *** analyses revealed that OsMED25-RNAi and the osmed25 mutant plants exhibited enlarged panicles,with enhanced branching and spikelet number,similar to the dst *** analysis indicated that OsMED25 acts in the same pathway as the DST-OsCKX2 module to regulate spikelet number per *** biochemical analysis showed that OsMED25 physically interacts with DST at the promoter region of OsCKX2,and then recruits RNA polymerase II(Pol II)to activate OsCKX2 ***,OsMED25 was involved in the communication between DST and Pol II general transcriptional machinery to regulate spikelet *** general,our findings reveal a novel function of OsMED25 in DST-OsCKX2 modulated transcriptional regulation,thus enhancing our un derstanding of the regulatory mechanism underlying DST-OsCKX2-mediated spikelet number.

关键词： DST MED25 OsCKX2 rice spikelet number

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利福平耐药与敏感肺结核患者痰液样本微生物菌群多样性对比分析

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中国防痨杂志 2024年第6期46卷 625-633页

作者：张泓泰任怡宣胡培磊王嫩寒李洁田丽丽赵琰枫陈双双李传友北京市疾病预防控制中心结核病实验室北京100035 湖南省胸科医院检验科长沙410000

目的:利用16S高通量测序技术,探索利福平耐药与利福平敏感肺结核患者呼吸道菌群的差异。方法:收集北京市疾病预防控制中心(70份)和湖南省胸科医院(10份)确诊的肺结核患者的痰液(共80份)进行前瞻性研究,通过痰液样本GeneXpert MTB/RIF检... 详细信息

目的:利用16S高通量测序技术,探索利福平耐药与利福平敏感肺结核患者呼吸道菌群的差异。方法:收集北京市疾病预防控制中心(70份)和湖南省胸科医院(10份)确诊的肺结核患者的痰液(共80份)进行前瞻性研究,通过痰液样本GeneXpert MTB/RIF检测、靶向rpoB高通量测序(tNGS测序)和利福平药物敏感性试验,将80例患者分为利福平耐药组(RFP-R组,41例;利福平耐药决定区突变)和利福平敏感组(RFP-S组,39例;利福平耐药决定区无突变)。对痰液微生物16S V4区域进行高通量测序,测序结果进行生物信息学分析及统计分析。结果:RFP-R组和RFP-S组共获得41950224个原始16S rRNA序列。RFP-R组的平均操作分类单元(operational taxonomic units,OTU)为344个,RFP-S组的平均OTU为342个。厚壁菌门(47.72%)、拟杆菌门(22.36%)、变形菌门(14.67%)、放线菌门(7.57%)、梭杆菌门(6.46%)是肺结核患者痰液中检出的主要细菌门,占微生物群落的98.78%。与RFP-S组相比,RFP-R组梭杆菌门(7.531%vs.5.167%;t=2.218,P=0.030)和螺旋体门(0.596%vs.0.246%;t=2.128,P=0.038)相对丰度显著增加。与RFP-S组相比,RFP-R组颤杆菌克属(0.690%vs.0.326%;t=3.112,P=0.003)、产线菌属(0.135%vs.0.030%;t=2.171,P=0.035)、Allisonella菌属(0.046%vs.0.006%;t=3.237,P=0.002)、假单胞菌属(0.205%vs.0.054%;t=2.040,P=0.046)和密螺旋体属(0.601%vs.0.242%;t=2.155,P=0.036)相对丰度显著增加;二氧化碳噬纤维菌属(0.351%vs.0.772%;t=―2.044,P=0.046)和Pauljensenia菌属(2.314%vs.3.706%;t=―2.660,P=0.010)相对丰度显著减少。结论:利福平耐药与敏感结核分枝杆菌感染不影响肺结核患者呼吸道菌群的整体结构,但利福平耐药与敏感患者在2个门(梭杆菌门、螺旋体门)和7个属(颤杆菌克属、产线菌属、Allisonella菌属、假单胞菌属、密螺旋体属、二氧化碳噬纤维菌属、Pauljensenia菌属)的丰度中存在差异,其中二氧化碳噬纤维菌属和Pauljensenia菌属在利福平敏感患者中丰度较高,其余在利福平耐药患者中丰度较高。

关键词：结核,肺痰利福平抗药性生物多样性细菌

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Regulation of jasmonate signaling by reversible acetylation of TOPLESS in Arabidopsis

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Molecular Plant 2022年第8期15卷 1329-1346页

作者： Chunpeng An Lei Deng Huawei Zhai Yanrong You Fangming Wu Qingzhe Zhai Alain Goossens chuanyou li State Key Laboratory of Plant Genomics National Center for Plant Gene Research(Beijing)Institute of Genetics and Developmental BiologyInnovation Academy of Seed DesignChinese Academy of SciencesBeijing 100101China CAS Center for Excellence in Biotic Interactions University of Chinese Academy of SciencesBeijing 100049China State Key Laboratory of Crop Biology College of Horticulture Science and EngineeringShandong Agricultural UniversityTai'an 271018China Department of Plant Biotechnology and Bioinformatics Ghent UniversityTechnologiepark 719052 GhentBelgium VIB Center for Plant Systems Biology Technologiepark 719052 GhentBelgium

The plant hormone jasmonate(JA)regulates plant immunity and adaptive growth by orchestrating a genome-wide transcriptional *** regulators of JA-responsive gene expression include the master transcription factor MYc2,which is repressed by the conserved Groucho/Tup1-like corepressor TOPLESS(TPL)in the resting ***,the mechanisms underlying TPL-mediated transcriptional repression of MYc2 activity and hormone-dependent switching between repression and de-repression ***,we report the regulation of TPLactivity and JAsignaling byreversibleacetylation of *** found that the histone acetyltransferase GCN5 could mediate TPL acetylation,which enhances its interaction with the NOVEL-INTERACTOR-OF-JAZ(NINJA)adaptor and promotes its recruitment to MYc2 target promoters,facilitating transcriptional ***,TPL deacetylation by the histonedeacetylase HDA6 weakens TPL-NINJA interaction and inhibitsTPL recruitmentto MYC2 target promoters,facilitating transcriptional *** the resting state,the opposing activities of GCN5 and HDA6 maintain TPL acetylation homeostasis,promoting transcriptional repression activity of *** response to JA elicitation,HDA6 expression is transiently induced,resulted in decreased TPL acetylation and repressor activity,thereby transcriptional activation of MYC2 target ***,the GCN5-TPL-HDA6 module main tains the homeostasis of acetylated TPL,thereby determining the transcriptional state of JA-responsive *** findings uncovered a mechanism by which the TPL corepressor activity in JA signaling is activelytuned inarapidandreversiblemanner.

关键词： jasmonate signaling transcriptional repression TOPLESS corepressor GCN5 HDA6 acetylation

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利福平耐药结核分枝杆菌对氟喹诺酮类药物表型耐药与其基因突变的一致性研究

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中国防痨杂志 2024年第8期46卷 942-950页

作者：于兰陈双双王嫩寒田丽丽赵琰枫樊瑞芳刘海灿李传友代小伟北京市疾病预防控制中心结核病实验室北京100035 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所北京102206

目的:研究利福平耐药结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)对氟喹诺酮类药物(fluoroquinolones,FQs)耐药基因突变特征与FQs最低抑菌浓度(minimum inhibitory concentration,MIC)的关系。方法:选取2016—2021年北京市结核病防治机构及定点医院收治的利福平耐药结核病(rifampicin resistant tuberculosis,RR-TB)患者分离培养阳性菌株进行微孔板法药物敏感性检测,总结RR-TB患者菌株对左氧氟沙星(levofloxacin,Lfx)和莫西沙星(moxifloxacin,Mfx)的MIC值;同时进行一代测序。分析FQs耐药相关基因gyrA和gyrB突变特征与FQs MIC之间的关系;以表型药物敏感性试验(phenotypic drug susceptibility testing,pDST)结果为参照标准,评价基因型药物敏感性试验(genotypic drug susceptibility testing,gDST)对FQs耐药的检测效能;探讨RR-MTB对FQs表型耐药与基因型耐药差异的原因。结果:303株RR-TB患者菌株中,FQs pDST耐药率为27.7%(84/303),gyrA基因突变检出率为25.1%(76/303),未检测到gyrB基因突变。以pDST结果为参照标准,gDST检测RR-MTB的FQs耐药性的敏感度和特异度分别为84.5%(71/84;95%CI:74.6.1%~91.2%)和97.7%(214/219;95%CI:94.5%~99.1%)。两种方法结果不一致的菌株有25株,不一致率为8.3%(25/303)。FQs耐药菌株的MIC主要为2μg/ml,最常见的突变位点发生在第94位点(53.9%,41/76),gyrA基因在第88和94位点突变与pDST耐药完全一致,而第90和91位点突变的pDST耐药一致率分别为95.8%(23/24)和3/5。第88位点的突变与Lfx pDST耐药相关,与Mfx pDST高浓度耐药相关;第90位点的突变以丙氨酸转变为缬氨酸为主(92.3%,24/26),该突变发生的Lfx和Mfx最低MIC为临界浓度(1μg/ml和0.25μg/ml)。第94位点天冬氨酸突变为天冬酰胺均为Lfx和Mfx高浓度耐药(1/1),该位点天冬氨酸突变为酪氨酸与Lfx耐药(1/1)相关,与Mfx高浓度耐药相关(1/1)。结论:北京地区RR-MTB的FQs耐药的主要机制是gyrA基因突变,不同gyrA基因突变提示FQs耐药水平存在差异。FQs pDST和gDST检测RR-MTB的结果高度一致,可及早应用gDST检测RR-TB患者的FQs的耐药性,以指导临床制定合理治疗方案。

关键词：分枝杆菌,结核荧光喹诺酮类微生物敏感性试验 DNA突变分析抗药性,细菌

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17种抗生素对北京地区快速生长分枝杆菌体外抑菌效果分析

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中国防痨杂志 2024年第9期46卷 1056-1062页

作者：陈双双田丽丽王嫩寒杨新宇赵琰枫李传友代小伟北京市疾病预防控制中心结核病实验室北京100035

目的:分析17种抗生素对北京地区快速生长分枝杆菌(rapidly growing mycobacteria,RGM)临床分离株的抑菌效果,为RGM引起的非结核分枝杆菌病的临床治疗提供可靠的理论依据。方法:收集北京市疾病预防控制中心结核病实验室2016年1月至2020... 详细信息

目的:分析17种抗生素对北京地区快速生长分枝杆菌(rapidly growing mycobacteria,RGM)临床分离株的抑菌效果,为RGM引起的非结核分枝杆菌病的临床治疗提供可靠的理论依据。方法:收集北京市疾病预防控制中心结核病实验室2016年1月至2020年12月五年间分离保存的130株非结核分枝杆菌菌株,对其进行菌种鉴定。对鉴定出的RGM临床分离株和相应标准株复苏后,采用微量肉汤稀释法进行17种药物(阿米卡星、环丙沙星、磺胺甲噁唑-甲氧苄啶、克拉霉素、利奈唑胺、莫西沙星、多西环素、米诺环素、头孢西丁、替加环素、妥布霉素、亚胺培南、美罗培南、阿莫西林/克拉维酸、贝达喹啉、德拉马尼和氯法齐明)的敏感性试验,记录其最低抑菌浓度(MIC)及抑制50%或90%受试菌的MIC值(MIC90和MIC50)。结果:经菌种鉴定且复苏成功的RGM为37株,包括19株脓肿分枝杆菌、17株偶发分枝杆菌和1株龟分枝杆菌。已明确耐药折点的14种抗生素中,所检测的3种RGM临床分离株对替加环素均敏感,龟分枝杆菌、脓肿分枝杆菌临床分离株对克拉霉素均敏感,脓肿分枝杆菌临床分离株对利奈唑胺敏感。另外,偶发分枝杆菌临床分离株对阿米卡星、环丙沙星、磺胺甲噁唑-甲氧苄啶、莫西沙星对均敏感。脓肿分枝杆菌临床分离株对阿米卡星的敏感率为73.7%(14/19),偶发分枝杆菌临床分离株对利奈唑胺、美罗培南敏感率分别为82.4%(14/17)、88.2%(15/17)。所检测的19株脓肿分枝杆菌对多西环素、阿莫西林/克拉维酸均耐药,偶发分枝杆菌临床分离株对妥布霉素均耐药。此外,贝达喹啉和氯法齐明对RGM临床分离株的MIC90均小于药敏板最低检测限值,而德拉马尼的MIC90均高于药敏板最大检测限值。结论:替加环素、阿米卡星、利奈唑胺、贝达喹啉和氯法齐明对RGM均具有较好的体外抑菌活性,而多西环素、阿莫西林/克拉维酸、德拉马尼几乎没有体外抑菌活性。非结核分枝杆菌种间耐药谱差异较大,建议用药前进行菌种鉴定和药物敏感性试验,以选择合适的抗菌药物。

关键词：分枝杆菌非典型性快速生长分枝杆菌微生物敏感性试验评价研究

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Toward Understanding the Stem-Cell Origin and Molecular Regulation of Rice Tillering

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Journal of Genetics and Genomics 2015年第2期42卷 47-48页

作者： chuanyou li State Key Laboratory of Plant Genomics and National Center for Plant Gene Research (Beijing) Institute of Genetics and Developmental BiologyChinese Academy of Sciences

Rice tiller is a specialized grain-bearing branch that contrib- utes greatly to grain production. Therefore, rice tillering is an important agronomic trait and provides a model system for the study of branching in monocots. Owing its importance both to agriculture and to fundamental science, much attention has been given to understand the molecular mechanisms under- lying rice tillering.

关键词： MOC Toward Understanding the Stem-Cell Origin and Molecular Regulation of Rice Tillering

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农机无人驾驶系统的构建及在耕种环节应用试验研究

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现代农业装备 2024年第2期45卷 21-28,44页

作者：刘婞韬徐岚俊张传帅陈华李传友吴才聪北京市农业机械试验鉴定推广站北京100079 中国农业大学信息与电气工程学院北京100083

为解决我国人口老龄化劳动力短缺问题,提升京郊农机智能化、自动化、无人化水平,实现农机自动动力换挡、机具提升、自动掉头,实现农机在农田行驶、作业、质量监测的全程无人化,本试验对无人作业示范区内的地块进行了数字化规划,并开展... 详细信息

为解决我国人口老龄化劳动力短缺问题,提升京郊农机智能化、自动化、无人化水平,实现农机自动动力换挡、机具提升、自动掉头,实现农机在农田行驶、作业、质量监测的全程无人化,本试验对无人作业示范区内的地块进行了数字化规划,并开展农机无人驾驶技术在耕整地及播种环节的可行性、关键控制模块研究,验证无人驾驶技术可行性及性能表现。试验表明:农机无人驾驶作业精度可控制在3 cm之内,与人工驾驶相比,无人驾驶拖拉机机车时间利用率提升约10%,减少油耗约3.5%;利用作业轨迹数据进行深入分析,有人作业覆盖率达94.38%,无人驾驶作业覆盖率达99.39%,无人驾驶进行作业土地利用效率达到最高;另外,在播种质量方面,无人驾驶作业后的播种粒距合格率为95%,漏播率为5%,符合精量播种机作业质量标准。

关键词：农机无人驾驶农机智能化无人化作业农机无人作业

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