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Screening of Serum Biomarkers for Distinguishing between Latent and Active Tuberculosis Using Proteome Microarray

Biomedical and Environmental Sciences 2018年第7期31卷 515-526页

作者： CAO Shu Hui CHEN Yan Qing SUN Yong liU Yang ZHENG Su Hua ZHANG Zhi Guo li chuan you Department of Bacteriology and Immunology Beijing Key Laboratory on Drug-Resistant Tuberculosis Research Beijing Tuberculosis and Thoracic Tumor Research Institute/Beijing Chest Hospital Capital Medical University. Beijing 101149 China Department of Laboratory Center Beijing Children's Hospital Capital Medical University National Center for Children's Health Beijing 100045 China Department of Clinical Laboratory Beijing Tuberculosis and Thoracic Tumour Research Institute/Beijing Chest Hospital Capital Medical University Beijing 101149 China Department of Epidemiological Research Beijing Tuberculosis and Thoracic Tumour Research lnstitute/Beijing Chest Hospital Capital Medical University Beijing 101149 China Institute of Tuberculosis Prevention and Control of District Changping Beijing 102200 China

Objective To identify potential serum biomarkers for distinguishing between latent tuberculosis infection（LTBI） and active tuberculosis（TB）. Methods A proteome microarray containing 4,262 antigens was used for screening serum biomarkers of 40 serum samples from patients with LTBI and active TB at the systems level. The interaction network and functional classification of differentially expressed antigens were analyzed using STRING 10.0 and the TB database, respectively. Enzyme-linked immunosorbent assays（EliSA） were used to validate candidate antigens further using 279 samples. The diagnostic performances of candidate antigens were evaluated by receiver operating characteristic curve（ROC） analysis. Both antigen combination and logistic regression analysis were used to improve diagnostic ability. Results Microarray results showed that levels of 152 Mycobacterium tuberculosis（Mtb）-antigenspecific IgG were significantly higher in active TB patients than in LTBI patients（P 〈 0.05）, and these differentially expressed antigens showed stronger associations with each other and were involved in various biological processes. Eleven candidate antigens were further validated using EliSA and showed consistent results in microarray analysis. ROC analysis showed that antigens Rv2031 c, Rv1408, and Rv2421 c had higher areas under the curve（AUCs） of 0.8520, 0.8152, and 0.7970, respectively. In addition, both antigen combination and logistic regression analysis improved the diagnostic ability. Conclusion Several antigens have the potential to serve as serum biomarkers for discrimination between LTBI and active TB.

关键词： LTBI Active TB Proteome microarray Serum biomarkers

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香山-天景山断裂带西段晚第四纪的特征滑动行为

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地震地质 2015年第2期37卷 482-495页

作者：李新男李传友中国地震局地质研究所活动构造与火山重点实验室100029

香山-天景山断裂带是青藏高原东北缘弧形构造带的重要组成部分,其东段曾发生1709年7级地震。虽然该断裂带西段缺乏历史地震记录,但在其各次级段上却保留了最新一次地震产生的较新鲜的地表破裂,以及沿其发生的大量冲沟同步左旋位错... 详细信息

香山-天景山断裂带是青藏高原东北缘弧形构造带的重要组成部分,其东段曾发生1709年7级地震。虽然该断裂带西段缺乏历史地震记录,但在其各次级段上却保留了最新一次地震产生的较新鲜的地表破裂,以及沿其发生的大量冲沟同步左旋位错。为了确定西段晚第四纪以来的活动特征,通过野外实测与卫星解译获得了240个冲沟或山脊的左旋水平位移量,以及62个垂直位移量。将所测位移量值投影到断裂展布方向上,得到了水平和垂直位移量沿断裂的分布特征。对水平位移量做进一步的概率密度模拟和频率统计分析,结果显示水平位移量具有明显的分组性与倍数关系。6组水平位移量可能分别代表了6次古地震事件,而西段上开挖的探槽也揭露了相似的事件期次。其中,最新一次地震的同震水平位移量为3m,而其他几次较老地震产生的累积位移量分别为6m,9m,12m,16m和20m,每次地震的同震位移量近似。因此,推断香山-天景山断裂带西段晚第四纪以来的地震活动遵循特征滑动模型。

关键词：香山-天景山断裂带西段位移量分布特征古地震特征滑动

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东海平湖气田天然气运移地球化学特征

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石油勘探与开发 2005年第5期32卷 34-37页

作者：傅宁李友川刘东周莉中国海洋石油有限公司研究中心中国石油青海油田勘探开发研究院

油气的物性和低分子正构、异构烷烃、芳烃、非烃及碳同位素资料均是较好的天然气运移地球化学指标,它们的垂向变化规律显示天然气垂向运移的特征。根据这些指标的垂向变化规律,东海盆地西湖凹陷平湖气田八角亭构造天然气运移方向为从PH... 详细信息

油气的物性和低分子正构、异构烷烃、芳烃、非烃及碳同位素资料均是较好的天然气运移地球化学指标,它们的垂向变化规律显示天然气垂向运移的特征。根据这些指标的垂向变化规律,东海盆地西湖凹陷平湖气田八角亭构造天然气运移方向为从PHB井指向PHF井;放鹤亭构造天然气运移方向为从PHA井到PHD井、从PHD井再到PHE井。平湖断裂是天然气垂向运移的主要通道。

关键词：天然气垂向运移运移参数运移通道平湖气田西湖凹陷

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汶川M_S 8.0地震地表破裂带北端位置的修订

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地震地质 2009年第1期31卷 1-8页

作者：李传友魏占玉中国地震局地质研究所国家地震活动断层研究中心北京100029

对汶川MS8.0地震地表破裂石坎乡以北段的野外地质调查显示,这一段地表破裂仍然十分明显。地表破裂并未沿地质填图所标定的位置发育,而是在走向上稍有变化,但清楚的地貌显示它在此段并不是一条新生断裂。与前期工作相比,可观察到的地表... 详细信息

对汶川MS8.0地震地表破裂石坎乡以北段的野外地质调查显示,这一段地表破裂仍然十分明显。地表破裂并未沿地质填图所标定的位置发育,而是在走向上稍有变化,但清楚的地貌显示它在此段并不是一条新生断裂。与前期工作相比,可观察到的地表破裂又往NE方向延长了约12km。该段破裂位于平武县石坎乡至青川县马公乡窝前村之间,走向为15°～45°,运动学性质主要为右旋走滑逆冲。地震地表破裂显示的同震垂直位移与石坎乡一带相近,为1～2m左右;右旋水平位移略有增加,为2.0～3.0m之间。地表调查的情况显示,地表破裂在北端可能消失在红光乡东河口一带。

关键词：汶川地震地表破裂同震位移破裂长度

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Clinical isolates of Mycobacterium abscessus in Guangzhou area most possibly from the environmental infection showed variable susceptibility

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Chinese Medical Journal 2013年第10期126卷 1878-1883页

作者： ZHUO Feng-lin SUN Zhao-gang li chuan-you liU Zhi-hui CAI lin ZHOU Cheng ZHANG Jian-zhong Department of Dermatology Peking University People's HospitalBeijing 100044 China Beijing Key Laboratory in Tuberculosis Drug Resistance BeijingChest Hospital Capital Medical University Beijing 101149 China Department of Clinical Laboratory Guangzhou Chest HospitalGuangzhou Guangdong 510095 China

Background Mycobacterium abscessus （M. abscessus） can cause a variety of human infections, involving the lung, skin and soft tissues, and is generally believed to be acquired from environmental sources. The aim of this study was to investigate the molecular diversity and antibiotic susceptibility of M. abscessus isolates as the basis for strategies to improve control and management of infection. Methods Seventy M. abscessus isolates from patients attending the Guangzhou Thoracic Hospital were identified from 2003 to 2005 by biochemical tests, gas chromatography, polymerase chain reaction （PCR）-restriction analysis （PRA） of heat shock protein gene hsp65, and sequencing of the quinolone resistance determining regions （QRDRs） of gyrA. Susceptibilities to six antibiotics were determined by micro-broth dilution. Isolates were genotyped using randomly amplified polymorphic DNA （RAPD） analysis. Results Most isolates （63/70; 90%） were susceptible to amikacin but rates of susceptibility to other antibiotics varied from moderate, clarithromycin （60%） and imipenem （43%）, to low for ciprofloxacin and ofloxacin （3%）, and 87% of isolates had intermediate susceptibility to cefoxitin. RAPD analysis showed that the 70 clinical isolates displayed 69 unique RAPD patterns. Conclusions The high genetic diversity of isolates suggests that they are not transmitted from person to person but, presumably, are acquired independently from environmental sources. M. abscessus isolates displayed variable levels of susceptibility to all antibiotics tested, other than amikacin, indicating a need for routine susceptibility testing to guide treatment.

关键词： Mycobacterium abscessus prevalence genetic diversity," susceptibility

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天山东端喀尔里克山北缘断裂晚第四纪活动与转换挤压变形

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地震地质 2022年第1期44卷 46-62页

作者：任光雪李传友孙凯中国地震局地质研究所地震动力学国家重点实验室北京100029 中国铁路设计集团有限公司天津300251

喀尔里克山位于天山最东端,是天山造山带往东地貌和构造的终止端,研究该地区断裂结构和运动学特征对于全面认识天山新生代变形模式具有重要意义。喀尔里克山北缘断裂呈弧形展布在喀尔里克山北侧,向E延伸与戈壁-天山左旋走滑断裂系相连... 详细信息

喀尔里克山位于天山最东端,是天山造山带往东地貌和构造的终止端,研究该地区断裂结构和运动学特征对于全面认识天山新生代变形模式具有重要意义。喀尔里克山北缘断裂呈弧形展布在喀尔里克山北侧,向E延伸与戈壁-天山左旋走滑断裂系相连。根据其走向和运动性质的差异可将喀尔里克山北缘断裂分为东、西2段,西段长约61km,走向NW,呈逆冲性质,断裂活动在山前洪积扇上形成了多条断层陡坎。利用光释光测年方法对变形阶地进行定年,得到西段全新世垂直滑动速率介于0.19~0.35mm/a之间,该滑动速率略大于喀尔里克山南侧的哈密盆地北缘断裂的垂直滑动速率,这与山体向S掀斜的地貌特征一致。东段长约95km,走向NE,以左旋走滑变形为主,断裂左旋错断了一系列冲沟和河流阶地,剖面显示该断裂段还具有一定逆冲分量。喀尔里克山北缘断裂与山体两侧其他逆冲断裂共同构成了戈壁-天山左旋走滑断裂系的挤压性马尾状端部构造,这些断裂在深部收敛会聚并在剖面上呈现不对称的正花状构造。喀尔里克山体的抬升受南北两侧逆冲断裂和东侧左旋走滑断裂共同控制,表现为转换挤压变形抬升的特征,山体通过山前逆冲断裂向盆地内部的迁移逐渐向外扩展。

关键词：喀尔里克山北缘断裂运动特征转换挤压变形天山东端

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Differences in the population of genetics of Mycobacterium tuberculosis between urban migrants and local residents in Beijing, China

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Chinese Medical Journal 2013年第21期126卷 4066-4071页

作者： Dai Guang-ming Zhang Zhi-guo Ding Peng-ju Zhang Qian Wang li Wang li-xia van Soolingen, Dick Huang Hai-rong li Wei-min li chuan-you Beijing TB & Thorac Tumor Res Inst Natl TB Clin Lab China Beijing 101149 Peoples R China Changping TB Prevent & Control Inst Beijing Beijing 102206 Peoples R China Henan Univ Technol Coll Bioengn Zhengzhou 450001 Henan Peoples R China Chinese Acad Sci Inst Genet & Dev Biol Beijing 100101 Peoples R China Hangzhou Normal Univ Sch Med Hangzhou 3110036 Zhejiang Peoples R China Chinese Ctr Dis Control & Prevent Natl Ctr TB Control & Prevent Beijing 102206 Peoples R China Natl Inst Publ Hlth & Environm RIVM Natl Mycobacteria Reference Lab NL-3720 BA Bilthoven Netherlands Capital Med Univ Beijing Chest Hosp Beijing Key Lab Drug Rresistant TB Res Beijing 101149 Peoples R China TB & Thorac Tumor Res Inst Dept Bacteriol & Immunol Beijing 101149 Peoples R China

Background Currently, migration has become one of the risk factors of high burden of tuberculosis in China. This study was to explore the influence of mass migration on the dynamics of Mycobacterium （M.） tuberculosi... 详细信息

关键词： Beijing lineage Mycobacterium tuberculosis urban migrants phylogeny population of genetics

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Interleukin 8 Gene Polymorphisms Are Not Associated with Tuberculosis Susceptibility in the Chinese Population

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Biomedical and Environmental Sciences 2016年第2期29卷 158-161页

作者： MA Yan liU Yu Hong ZHANG Zhi Guo WANG li YANG Xiao Wei li chuan you CHE Nan Ying Center office Beijing Tuberculosis & Thoracic Tumor Research Institute Beijing 101149 China Beijing Chest Hospital Capital Medical University Beijing 101149 China Clinical Center on Tuberculosis China CDC Beijing 101149 China Beijing Changping Center for Tuberculosis Control and Prevention Beijing 102200 China Department of Bacteriology and Immunology Beijing Tuberculosis & Thoracic Tumor Research Institute Beijing Chest Hospital Capital Medical University Beijing 101149 China Department of Pathology Beijing Tuberculosis & Thoracic Tumor Research Institute Beijing Chest Hospital Capital Medical University Beijing 101149 China

Interleukin 8 （IL8） is an important chemokine that elicits host immune response against tuberculosis （TB）. However, whether there is an association between IL8 gene polymorphism and TB susceptibility in the Chinese population is unknown. IL8 gene was amplified and sequenced to search for nucleotide polymorphisms among the Chinese population. Four single nucleotide polymorphisms （SNPs） were identified, selected, and analyzed in a cohort of 438 patients with TB and 536 healthy controls. Allelic, genotypic, and haplotypic analysis demonstrated that the distribution of the four IL8 SNPs between patients with TB and healthy controls was not significantly different （P〉0.05）. The four IL8 SNPs detected in this study were not associated with TB susceptibility in the Chinese population. Secretion of IL8 by peripheral blood cells was greatly stimulated upon exposure to Mycobacterium tuberculosis whole cell extract, but such enhanced secretion was not associated with the IL8 rs4073 alleles.

关键词： TB Figure

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机械深松对土壤理化属性和夏玉米生长特性的影响

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沈阳农业大学学报 2014年第6期45卷 746-750页

作者：李传友北京市农业机械试验鉴定推广站北京100079

为了改善北京地区农田土壤结构、提高土壤蓄水保墒能力,提升农田生产能力,增加作物产量,针对长期采取保护性耕作技术,造成土壤板结层加厚,影响农作物产量的问题,采取单因素二水平试验方法,进行了免耕和深松2种技术模式对土壤理化属性及... 详细信息

为了改善北京地区农田土壤结构、提高土壤蓄水保墒能力,提升农田生产能力,增加作物产量,针对长期采取保护性耕作技术,造成土壤板结层加厚,影响农作物产量的问题,采取单因素二水平试验方法,进行了免耕和深松2种技术模式对土壤理化属性及作物生长特性和产量影响的试验研究。结果表明:与免耕相比深松后土壤容重在0~30cm耕层可降低0.08~0.123g·cm-3,;深松夏玉米产量达到7542kg·hm-2,增产13.60%。说明可以通过土壤深松作业来消除因多年免耕出现的土壤板结问题。

关键词：保护性耕作深松免耕容重

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M畦膜下沟灌溉对水分利用率及番茄产量的影响

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北方园艺 2015年第1期 45-47页

作者：李传友北京市农业机械试验鉴定推广站北京100079

为了缓解水资源紧缺现状,研究果蔬类科学灌溉,全面提升水资源的利用率和水分生产效率。以＂朝研229＂番茄为试材,研究比较了M畦膜下沟灌溉、膜上灌溉和传统的畦灌对番茄水分生产效率的影响。结果表明：各处理番茄的株高、茎粗、叶面积,... 详细信息

为了缓解水资源紧缺现状,研究果蔬类科学灌溉,全面提升水资源的利用率和水分生产效率。以＂朝研229＂番茄为试材,研究比较了M畦膜下沟灌溉、膜上灌溉和传统的畦灌对番茄水分生产效率的影响。结果表明：各处理番茄的株高、茎粗、叶面积,随生育期呈增加趋势,M畦膜下和膜上灌溉处理单果质量与小区产量、667m^2产量无显著差异,但与传统灌溉差异显著,M畦膜下沟灌溉、膜上灌溉比传统灌溉分别节水175.0、200.0m3/667m^2。设施果类蔬菜灌溉采用M畦膜下沟灌具有节水、节肥、增产、省时省工,提高水分生产的作用。

关键词：水资源紧缺大棚番茄 M畦膜下沟灌

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