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Cost-effective hybrid long-short read assembly delineates alternative gC-rich Streptomyces hosts for natural product discovery

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Synthetic and Systems Biotechnology 2023年第2期8卷 253-261页

作者： Elena Heng Lee Ling Tan Dillon W.P.Tay Yee Hwee Lim Lay-kien Yang Deborah C.S.Seow Chung Yan Leong Veronica Ng Siew Bee Ng Yoganathan Kanagasundaram Fong Tian Wong Lokanand Koduru Molecular Engineering Laboratory Institute of Molecular and Cell Biology(IMCB)Agency for ScienceTechnology and Research(A*STAR)61 Biopolis Drive#07-06ProteosSingapore138673Singapore green Chemistry and Biocatalysis Institute of Sustainability for ChemicalsEnergy and Environment(ISCE2)Agency for ScienceTechnology and Research(A*STAR)8 Biomedical GroveNeuros#07-01Singapore138665Singapore Singapore Institute of Food and Biotechnology Innovation(SIFBI) Agency for ScienceTechnology and Research(A*STAR)31 Biopolis WayLevel 2NanosSingapore138669Singapore

With the advent of rapid automated in silico identification of biosynthetic gene clusters(BgCs),genomics pre-sents vast opportunities to accelerate natural product(NP)***,prolific NP producers,Strepto-myces,are exceptionally gC-rich(>80%)and highly repetitive within *** pose challenges in sequencing and high-quality genome assembly which are currently circumvented via intensive ***,we outline a more cost-effective workflow using multiplex Illumina and Oxford Nanopore sequencing with hybrid long-short read assembly algorithms to generate high quality *** protocol involves subjecting long read-derived assemblies to up to 4 rounds of polishing with short reads to yield accurate BgC *** successfully sequenced and assembled 8 gC-rich Streptomyces genomes whose lengths range from 7.1 to 12.1 Mb with a median N50 of 8.2 *** analysis revealed previous misrepresentation among these strains and allowed us to propose a potentially new species,Streptomyces *** comprehensive characterization of their biosynthetic,pan-genomic and antibiotic resistance features especially for molecules derived from type I polyketide synthase(PKS)BgCs reflected their potential as alternative NP ***,the genome assemblies and insights presented here are envisioned to serve as gateway for the scientific community to expand their avenues in NP discovery.

关键词： Streptomyces gC-Rich Hybrid assembly Biosynthetic gene cluster(BgC) Natural product(NP)chassis Type I polyketide Synthase(PKS)

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中国农村征地补偿安置模式的利弊分析及对越南的启示

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城市 2015年第6期 36-38页

作者： NgUYEN THE kien 南京师范大学商学院越南太原大学

随着越南经济的快速发展和城市化进程的不断推进,大量农户的土地被征用,与失地农民相关的问题不断涌现,如何选择有效的补偿安置模式是其中主要难题之一。笔者通过分析中国各种补偿安置模式的利弊,从而对越南创新征地补偿安置模式提供了... 详细信息

随着越南经济的快速发展和城市化进程的不断推进,大量农户的土地被征用,与失地农民相关的问题不断涌现,如何选择有效的补偿安置模式是其中主要难题之一。笔者通过分析中国各种补偿安置模式的利弊,从而对越南创新征地补偿安置模式提供了重要的启示。

关键词：城市化失地农民补偿安置

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TRANSCENDENCY OF FUNCTIONS SATISFYINg RICCATI DIFFERENTIAL EQUATION,Ⅱ

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中国数学会学报 1937年第1期 84-97页

作者：陈建功 National University of Chekiang

*** *** R(x),S(x) and T(x)be three rationalfuncitions such that R(x)/0,(A)(?)then no algcbraical function of order/2 can satisfy the Riccatidifferential equation

关键词： TRANSCENDENCY OF FUNCTIONS SATISFYINg RICCATI DIFFERENTIAL EQUATION 110 PI ST

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中国大陆投资对越南经济增长的影响研究

中国大陆投资对越南经济增长的影响研究

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作者：陶忠坚（Dao Trung kien）辽宁大学

学位级别：硕士

越南革新开放以来,国家走上了外向型的经济战略发展道路,在借鉴社会主义发展中国家发展的经验基础上大力发展本国的经济,采取了一系列的措施以推进越南经济的发展。越南正在积极建设和完善法律体系,从而逐步适应国际惯例。因此,在全球... 详细信息

越南革新开放以来,国家走上了外向型的经济战略发展道路,在借鉴社会主义发展中国家发展的经验基础上大力发展本国的经济,采取了一系列的措施以推进越南经济的发展。越南正在积极建设和完善法律体系,从而逐步适应国际惯例。因此,在全球经济一体化进程中不断改善投资环境,完善相关法律,积极发掘经济增长潜力,推动经济多元化发展,增强经济政策的开放度和透明度,是保持越南社会经济可持续发展的重要保障。在外国对越投资方面,诸多中国企业对越南进行了投资,从投资规模上.来自中国企业的投资进入了越南外来投资排行榜的前十名,但从中国投资越南的现状来看,中国投资越南多是质量一般,规模不大,这与中国的国际地位以及经济发展规模不相匹配。为发掘中国对越南投资的潜力,加大越南对外招商引资的力度,需要中越两国探索新的路径。中国企业到越南投资过程中的投资风险不可忽视,尤其是跨境投资,面临的风险更加复杂。越南建设规模迅速扩张,中国企业对越投资项目面临着来自不断增加的东盟和其他国家投资的竞争,无论是对越南还是包括中国在内的其他国家,构筑有效的投资风险防范体系都具有迫切性。本论文全文共分五个部分,第一部分是对本文的研究的一些研究现状和理论的概述,第二部分分析了国际投资的发展现状与问题,从行业分布、区位选择等几个方面加以分析,分析了越南利用外资存在的问题,包括:资金支付率、投资回报率低、技术转移效率不高、投资区域不平衡等诸多方面。第三部分是定性地分析中国大陆投资对越南经济发展影响,从资本贡献,技术贡献以及对经济发展的产业结构调整等正负影响两个方面来说明;第四部分是定量地分析中国投资对越南经济发展影响,分别从中国投资与越南经济增长的关系及与产业结构的关系两个方面来分析,最后一部分是在前文分析的基础上,得出研究结论并提出相关建议。

关键词：中国大陆投资越南经济增长

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单独补充维生素D与维生素D结合钙防治中老年骨质疏松性骨折的系统评价

单独补充维生素D与维生素D结合钙防治中老年骨质疏松性骨折的系统...

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作者：阮中坚（Nguyen Trung kien）广西医科大学

学位级别：硕士

目的：对单独补充维生素D与结合补充维生素D和钙与安慰剂和钙剂对比预防中老年骨质疏松性骨折的疗效进行系统评价。方法：计算机检索Cochrane协作网数据库(1992-2014年12月份),MEDLINE(1992-2014年12月份),EMBASE(1992-2014年12月份)、... 详细信息

目的：对单独补充维生素D与结合补充维生素D和钙与安慰剂和钙剂对比预防中老年骨质疏松性骨折的疗效进行系统评价。方法：计算机检索Cochrane协作网数据库(1992-2014年12月份),MEDLINE(1992-2014年12月份),EMBASE(1992-2014年12月份)、中国生物医学文献数据库(CBM,1992-2014年12月份)、中文期刊全文数据库(CNKI,1992-2014年12月份)。手工检索国内期刊已发表的论文和会议资料,收集所有相关随机对照试验,并评价纳入研究的方法学质量。统计软件使用Cochrane协作网提供的RevMan5.3结果：计算机检索到相关文献81篇,最终纳入24个随机对照试验(RCT),包括141047例患者。Meta分析结果：1、关于死亡率治疗组与对照组对比的死亡率无统计学意义,其中维生素D结合钙组与对照组分析结果：RR=1.24(95%CI=0.91-1.70,P=0.18);维生素D组与对照组分析结果：RR=1.05(95%CI=0.97-1.13,P=0.27);2、关于骨折发生率单纯维生素D组与对照组的发生率无明显优势：RR=0.97(95%CI=0.89-1.04,P=0.38);维生素D结合钙组与对照组的发生率有统计学差异：RR=0.90(95%CI=0.82-0.98,P=0.02);3、关于血清25羟基维生素D浓度治疗组的血清25羟基维生素D浓度明显比对照组提高。结论：单独补充维生素D和结合维生素D和钙与对照组对比的死亡率没有区别;血清25羟基维生素D浓度通过治疗虽然改善但还没达到骨健康状态;单独补充维生素D预防骨质疏松性骨折无明显优势;维生素D结合钙可降低骨质疏松性骨折的发生率。

关键词：骨质疏松性骨折维生素D 钙剂系统评价

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红锥4种叶部病害病原鉴定

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云南农业大学学报（自然科学版） 2015年第6期30卷 853-858页

作者：张艳明韦继光 PHAN Cong kien 周颖谢红辉广西大学农学院广西南宁530004

为调查广西地区红锥(Castanopsis hystrix)叶部真菌性病害的种类,本研究从广西南宁市良凤江森林公园、博白林科所、博白林场和高峰林场4个地区采集红锥叶部病害样本,使用常规组织块分离法获取其致病菌,结合形态学观察和r DNA-ITS序列分... 详细信息

为调查广西地区红锥(Castanopsis hystrix)叶部真菌性病害的种类,本研究从广西南宁市良凤江森林公园、博白林科所、博白林场和高峰林场4个地区采集红锥叶部病害样本,使用常规组织块分离法获取其致病菌,结合形态学观察和r DNA-ITS序列分析进行病害鉴定。结果表明:红锥叶部发生的主要病害有4种,分别为赤斑病(Pilidella granati)、褐斑病(Pestalotiopsis pauciseta)、炭疽病(Colletotrichum gloeosporioides)、藻斑病(Cephaleuros virescens Kunze);其中,前3种病害为在红锥上新发生的病害。

关键词：红锥叶部病害鉴定

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基于非侵入式的事件检测方法统计评估

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电测与仪表 2020年第1期57卷 106-112,120页

作者：张露 Francois Auger 荆朝霞 Sarra Houidi Huu kien Bui 肖江华南理工大学广州510640 法国南特大学法国南特44600

非侵入式负荷监测是负荷监测的重要发展方向,事件检测是非侵入式负荷监测的重点研究内容。多维信号相比一维信号可以提供多源信息,若信号不同维度间相关度大,则可以提高检测精度。文章基于统计假设首次推导BIC、CUSUM和gLRT三种算法的... 详细信息

非侵入式负荷监测是负荷监测的重要发展方向,事件检测是非侵入式负荷监测的重点研究内容。多维信号相比一维信号可以提供多源信息,若信号不同维度间相关度大,则可以提高检测精度。文章基于统计假设首次推导BIC、CUSUM和gLRT三种算法的决策函数,并以二维信号为例进行仿真实验,比较了三种算法的检测结果。仿真实验证明补充合适的第二维信号可以提高整体检测精度,且得到不同算法的适用条件,即CUSUM算法适用于高阈值检测,gLRT算法适用于低阈值检测。

关键词：非侵入式负荷监测事件检测二维信号决策函数统计评估

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Sustainable Construction --An International Comparison of Civil Engineering Students

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Journal of Civil Engineering and Architecture 2012年第12期6卷 1648-1653页

作者： Thanh Trung Le Chris Ian goodier Hanh Huu Pham Marios N. Soutsos kien Ton Tong School of Civil and Building Engineering Loughborough University Leicestershire LE112NS UK Department of Building Materials National University of Civil Engineering (NUCE) Hanoi 111110 Vietnam School of Planning Architecture and Civil Engineering Queen's University Northern Ireland BT9 5AG UK

Sustainable construction in the future will be influenced significantly by the beliefs and actions of civil engineering students studying at university today. A comparative investigation of the appreciation and attitudes regarding sustainable construction of civil engineering students at The NUCE （National University of Civil Engineering） in Vietnam, and the Universities of Loughborough and Liverpool in the UK were therefore conducted. Results indicate that students at all three universities appreciate the importance of the development of sustainable construction and have positive attitudes with regards to sustainability. Construction design and appropriate use of materials were two issues generally considered the most important with regards to sustainability, but were also thought to be adequately covered on the courses in all three institutions.

关键词： Sustainable construction education sustainability civil engineering Vietnam UK.

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Evaluation of Interaction between Surface Water and groundwater in the South of Hanoi City by Stable Isotope Technique

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Journal of Environmental Protection 2022年第11期13卷 870-880页

作者： Vo Thi Anh Tran Khanh Minh Ha Lan Anh Mai Dinh kien Vu Hoai Dang Duc Nhan Institute for Nuclear Science and Technology Hanoi Vietnam

The δ18O and δ2H stable isotope techniques for studying properties of groundwater and surface help us to understand more clearly about the distribution and movement of groundwater in the South of Hanoi area. There were 68 water samples from the studying area and analyzed by a Liquid Water Isotope Analyzer (LWIA-24D). The stable isotope values of the groundwater from Pleistocene aquifers were range from -3.21‰ to -9.55‰ δ18O and -35.32‰ to -67.44‰ δ2H;rainwater from -8.18‰ to -4.13‰ δ18O and -61.19‰ to -17.93‰ δ2H;Red river water from -7.51‰ to -5.29‰ δ18O and -51.60‰ to -38.99‰ δ2H. Based on stable isotope characteristics, the results show that there was a relationship between surface water and groundwater in the South of Hanoi city. It is that groundwater recharges for river water in the dry season with 74%, and in the rainfall season groundwater is recharged from river with 87%.

关键词： Stable Isotopes groundwater Surface Water River Water Precipitation Recharge

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竹柏叶部真菌性病害的病原鉴定

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江苏农业科学 2015年第8期43卷 125-128页

作者：周颖张艳明江洁韦继光谢红辉 Phan Cong kien 广西大学农学院广西南宁530005

通过对竹柏4种叶部真菌性病害进行病原鉴定,以期为竹柏的病害防治工作提供一定的参考依据。从广西南宁市良凤江国家森林公园苗圃基地、南宁市林业科学研究所标本园、博白县林业科学研究所、博白林场分别采集竹柏病叶标本,进行病原菌的... 详细信息

通过对竹柏4种叶部真菌性病害进行病原鉴定,以期为竹柏的病害防治工作提供一定的参考依据。从广西南宁市良凤江国家森林公园苗圃基地、南宁市林业科学研究所标本园、博白县林业科学研究所、博白林场分别采集竹柏病叶标本,进行病原菌的分离和致病性测定,观察并描述病原菌的培养性状、形态特征,并通过r DNA-ITS PCR序列测定以确定病原菌。根据形态特征和r DNA-ITS序列分析将病害鉴定为藻斑病(致病菌为Cephaleuros virescens Kunze)、炭疽病(致病菌为Colletotrichum gloeosporioides)、叶尖枯病(致病菌为Pestalotiopsis longisetula)及叶枯病(致病菌为Alternaria tenuissima)。前2种病害为竹柏上已发生的病害,叶尖枯病、叶枯病为竹柏上发生的新病害。

关键词：竹柏叶部病害病原菌真菌鉴定

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