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Inference and prioritization of tissue-specific regulons in Arabidopsis and Oryza

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aBIOTECH 2024年第3期5卷 309-324页

作者： Honggang Dai Yaxin Fan Yichao Mei Ling-Ling Chen junxiang gao Hubei Key Laboratory of Agricultural Bioinformatics College of InformaticsHuazhong Agricultural UniversityWuhan430070China State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Subtropical Agro-bioresources College of Life Science and TechnologyGuangxi UniversityNanning530004China

A regulon refers to a group of genes regulated by a transcription factor binding to regulatory motifs to achieve specific biological *** infer tissue-specific gene regulons in Arabidopsis,we developed a novel pipeline named *** utilizes a gene expression matrix that includes 3400 Arabidopsis transcriptomes to make initial predictions about the regulatory relationships between transcription factors(TFs)and target genes(TGs)using co-expression *** further improves these anticipated interactions by integrating TF binding site enrichment analysis to eliminate false positives that are only supported by expression *** further trained a graph convolutional network with 133 transcription factors,supported by ChIP-seq,as positive samples,to learn the regulatory logic between TFs and TGs to improve the accuracy of the regulatory *** evaluate the functionality of InferReg,we utilized it to discover tissue-specific regulons in 5 Arabidopsis tissues:flower,leaf,root,seed,and *** ranked the activities of regulons for each tissue based on reliability using Borda ranking and compared them with existing *** results demonstrated that InferReg not only identified known tissue-specific regulons but also discovered new *** applying InferReg to rice expression data,we were able to identify rice tissue-specific regulons,showing that our approach can be applied more *** used InferReg to successfully identify important regulons in various tissues of Arabidopsis and Oryza,which has improved our understanding of tissue-specific regulations and the roles of regulons in tissue differentiation and development.

关键词： Transcriptional regulation Graph convolutional network Tissue-specific Regulon Transcription factor

Ribosome profiling reveals the translational landscape and allele-specific translational efficiency in rice

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Plant Communications 2023年第2期4卷 119-135页

作者： Xi-Tong Zhu Run Zhou Jian Che Yu-Yu Zheng Muhammad Tahir ul Qamar Jia-Wu Feng Jianwei Zhang junxiang gao Ling-Ling Chen National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement College of InformaticsHuazhong Agricultural UniversityWuhan 430070China State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Subtropical Agro-bioresources College of Life Science and TechnologyGuangxi UniversityNanning 530004China

Translational regulation is a critical step in the process of gene expression and governs the synthesis of proteins from *** studies have revealed translational regulation in plants in response to various environmental ***,there have been no studies documenting the comprehensive landscape of translational regulation and allele-specific translational efficiency in multiple plant tissues,especially those of rice,a main staple crop that feeds nearly half of the world’s *** we used RNA sequencing and ribosome profiling data to analyze the transcriptome and translatome of an elite hybrid rice,Shanyou 63(SY63),and its parental varieties Zhenshan 97 and Minghui *** results revealed that gene expression patterns varied more among tissues than among varieties at the transcriptional and translational *** identified 3392 upstream open reading frames(uORFs),and the uORF-containing genes were enriched in transcription *** 668 of 13492 long non-coding RNAs could be translated into ***,we discovered numerous genes with allele-specific translational efficiency in SY63 and demonstrated that some cis-regulatory elements may contribute to allelic divergence in translational ***,these findings may improve our understanding of translational regulation in rice and provide information for molecular breeding research.

关键词： Ribo-seq translational landscape uORFs lncRNAs allele-specific translational efficiency rice Oryza sativa

基于生物特征纹理信息的西瓜追溯标识算法设计与实现

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农业工程学报 2017年第18期33卷 298-305页

作者：邢向阳刘峰高俊祥华中农业大学信息学院武汉430070

为了将生物特征识别技术应用于追溯系统中的果品标识,该文提出了一种采用西瓜蒂外围纹理信息标识果品个体的方法。该方法首先采集西瓜图像并在瓜蒂外围构造一个环形区域;将环形区域归一化后利用Gabor滤波器对图像纹理进行特征提取及编码... 详细信息

为了将生物特征识别技术应用于追溯系统中的果品标识,该文提出了一种采用西瓜蒂外围纹理信息标识果品个体的方法。该方法首先采集西瓜图像并在瓜蒂外围构造一个环形区域;将环形区域归一化后利用Gabor滤波器对图像纹理进行特征提取及编码;然后通过计算码间的Hamming距进行纹理编码的匹配。在试验中,为100个西瓜在采后贮藏初始、第7天和第14天各采集一幅图像并计算出3组每组100个纹理编码,将第7天、第14天的每一个编码与初始阶段的每一个编码两两比对,累计完成20 000次比对证实西瓜纹理具有唯一性,不同个体的纹理特征各不相同。使用成对数据的假设检验证实在采收后14 d内纹理特征不随时间的推移产生显著变化(P>0.05)。通过理论和试验证实算法对平移、尺度和旋转具有适应性,即西瓜在图像中的平移、尺度和旋转对Hamming距的计算不会产生显著影响(P>0.05)。使用最大类间方差法在50个西瓜的纹理编码内训练出判别阈值,并用该阈值判别另外50个西瓜3个时间点间相互比对生成的100个来自同一个西瓜的Hamming距和4 900个来自不同西瓜的Hamming距,结果表明上述Hamming距均能正确判别,准确率与召回率为100%。该研究为农产品追溯系统的标识技术提供新的思路。

关键词：生物特征纹理算法追溯系统食品安全特征提取

1例2型糖尿病酮症患者合并胰岛素过敏患者的护理

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中华护理杂志 2020年第7期55卷 1081-1083页

作者：高俊香秦静河北医科大学第二医院内分泌科石家庄市050000

报告1例2型糖尿病酮症患者合并胰岛素过敏的护理经验。护理要点包括:积极与患者家属沟通,采用综合措施补液和降低血糖,监测血糖、血酮变化;准确实施过敏试验及脱敏治疗,密切观察过敏反应,做好应急准备;做好心理护理、出院指导。补液治疗... 详细信息

报告1例2型糖尿病酮症患者合并胰岛素过敏的护理经验。护理要点包括:积极与患者家属沟通,采用综合措施补液和降低血糖,监测血糖、血酮变化;准确实施过敏试验及脱敏治疗,密切观察过敏反应,做好应急准备;做好心理护理、出院指导。补液治疗4 h后,患者血酮下降至0.1 mmol/L,采用胰岛素泵持续皮下输注进行脱敏治疗,入院第4天成功实现赖脯胰岛素脱敏,血糖控制平稳出院。随访3~6个月,未再出现过敏反应,血糖控制良好。

关键词：糖尿病,2型,酮症胰岛素过敏过敏试验脱敏治疗护理

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矿井提升机控制系统的设计及应用探讨

低压电器 2011年第22期 54-57,62页

作者：高俊祥高孝亮衡阳财经工业职业技术学院湖南衡阳421008 湖南科技经贸职业技术学院湖南衡阳421002

设计基于PLC技术的矿井提升控制系统,替代线路复杂、可靠性差、调速精度低、故障发生率高的老式提升控制系统,并对其实际应用中的相关操作进行了探讨。其不仅运行更加平稳、准确,而且系统安全性高,可以适应矿山生产的各种要求,有利于实... 详细信息

设计基于PLC技术的矿井提升控制系统,替代线路复杂、可靠性差、调速精度低、故障发生率高的老式提升控制系统,并对其实际应用中的相关操作进行了探讨。其不仅运行更加平稳、准确,而且系统安全性高,可以适应矿山生产的各种要求,有利于实现矿山的安全、节能、高效生产。

关键词：提升机 PLC技术控制系统可靠性

车载多普勒激光雷达在1550 nm的距离和速度测量

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现代雷达 2022年第11期44卷 85-90页

作者：高俊祥陈文波湖南财经工业职业技术学院汽车工程系汽湖南衡阳421001 南华大学电气工程学院湖南衡阳421001

文中基于车载多普勒激光雷达,对其在1 550 nm的距离和速度测量进行了研究,并且对车载激光雷达以及距离同步测量数值进行了设置,通过傅里叶分析法求出外差信号多普勒频率,从而求出目标速度。提出提高发射信号带宽调制方案,测量目标距离,... 详细信息

文中基于车载多普勒激光雷达,对其在1 550 nm的距离和速度测量进行了研究,并且对车载激光雷达以及距离同步测量数值进行了设置,通过傅里叶分析法求出外差信号多普勒频率,从而求出目标速度。提出提高发射信号带宽调制方案,测量目标距离,解决最大测量距离及距离分辨率间的矛盾。通过分析影响的原因,拟周期代码插入伪随机码调制编码,并在接收端通过使用相关的功能计算出激光飞行时间和外差信号的多普勒频率。仿真结果表明:车载激光雷达使用脉冲、调幅方式对提高系统灵敏度有利,在伪随机码中插入周期码,可实现车载激光雷达速度、距离同步测量,调制码宽度决定距离测量精度,发送信号长度决定速度测量精度。

关键词：激光雷达速度距离多普勒傅里叶分析法

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功率对304L车板上激光熔覆Fe-Cr层组织和冲蚀性能的影响

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真空科学与技术学报 2020年第10期40卷 914-918页

作者：高俊祥邹伟陈涛李强湖南财经工业职业技术学院汽车工程系衡阳421002 浙江工业职业技术学院电气工程学院绍兴312000 湖南汽车制造有限责任公司邵阳422000

在304L不锈钢车板上激光熔覆Fe-Cr层,通过实验测试的手段研究功率对其组织和冲蚀性能的影响。研究结果表明:对熔覆层进行熔覆过程中引起了组织晶化现象,逐渐提高功率后,晶体组织衍射峰也变得更加明显。经过0.5 kW以上功率的激光熔覆层... 详细信息

在304L不锈钢车板上激光熔覆Fe-Cr层,通过实验测试的手段研究功率对其组织和冲蚀性能的影响。研究结果表明:对熔覆层进行熔覆过程中引起了组织晶化现象,逐渐提高功率后,晶体组织衍射峰也变得更加明显。经过0.5 kW以上功率的激光熔覆层中已基本观察不到层状组织,获得更致密的组织,实现了熔覆层和基体间的冶金结合作用。随着功率的增加,激光熔覆Fe-Cr层的密度表现出单调增加的变化规律。提高激光功率后,获得了更低硬度的熔覆层。通过喷涂工艺制得的熔覆层与基体间形成了机械结合的状态,使界面组织硬度发生快速降低,熔覆层的硬度呈现阶梯降低的变化规律。相对于304L不锈钢,熔覆层试样达到了更低体积磨损率。以更高冲击角进行处理时,可以使砂粒获得更集中的能量,从而更易在熔覆层中产生凹坑和裂纹,从而提高了体积损失率。

关键词：激光熔覆 Fe-Cr层微观组织冲蚀

大变形软材料接触摩擦的在线测试装备与技术分析

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摩擦学学报 2022年第1期42卷 187-201页

作者：谭桂斌黄兴高军翔张永康田应成广东工业大学省部共建精密电子制造技术与装备国家重点实验室广东广州510006 广州机械科学研究院有限公司广东广州510700 中油国家油气钻井装备工程技术研究中心有限公司陕西宝鸡721002

我国高档密封件与液压件产品几乎全部依赖进口,国家重大技术装备及国防装备等配套零部件行业的许多问题与摩擦学有十分重要的关系,基础件摩擦学又是国际上的研究热点与发达国家的竞争高地.在本文中阐述了国内外关键机械零部件的接触界... 详细信息

我国高档密封件与液压件产品几乎全部依赖进口,国家重大技术装备及国防装备等配套零部件行业的许多问题与摩擦学有十分重要的关系,基础件摩擦学又是国际上的研究热点与发达国家的竞争高地.在本文中阐述了国内外关键机械零部件的接触界面原位在线测试的研究进展,及其在大变形软材料密封系统中的应用,综述了摩擦润滑中迁移状态实时在线观测技术、聚合物密封界面在线观测技术和国内在摩擦过程的微区域原位研究等进展,还分析了特殊与极端工况条件下大变形聚合物密封的性能测试、可靠性寿命分析以及多工况联合测试的技术进展,分析和讨论了高性能密封件行业的基础共性难题,最后进行了总结与展望.

关键词：橡塑密封摩擦学系统界面软材料在线测试

700℃新型涂层双管系统关键特征参数分析及结构优化

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稀有金属材料与工程 2023年第11期52卷 3757-3766页

作者：郭晓峰张子龙秦磊袁博高俊翔庞自强内蒙古科技大学内蒙古包头014010 中国华能集团有限公司包头第一热电厂内蒙古包头014060

以含双陶瓷结构的700℃新型涂层双管系统为研究对象,采用有限元顺次耦合的计算方法,研究了关键特征参数对系统传热与应力分布的影响。在此基础上,基于MATLAB与ABAQUS平台,开发了一种优化算法与有限元相结合的多层异质涂层系统结构优化... 详细信息

以含双陶瓷结构的700℃新型涂层双管系统为研究对象,采用有限元顺次耦合的计算方法,研究了关键特征参数对系统传热与应力分布的影响。在此基础上,基于MATLAB与ABAQUS平台,开发了一种优化算法与有限元相结合的多层异质涂层系统结构优化设计方法,用以确定涂层双管系统的最优几何结构尺寸与材料物理性能参数。结果表明:陶瓷层厚度比、外陶瓷层导热系数、热膨胀系数、冷却蒸汽温度和压力均会对涂层双管系统的温度和应力分布产生重要影响;系统结构优化前后,P91钢管内表面温度下降约27℃,系统中热生长氧化物与粘接层界面处的最大Mises应力下降约151 MPa,这表明当前提出的系统结构优化方法可以用于自动确定多层异质涂层系统的最优关键特征参数。

关键词：涂层双管系统双陶瓷层界面应力结构优化