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Overview of guide RNA design tools for CRISPR-Cas9 genome editing technology

Frontiers in Biology 2015年第4期10卷 289-296页

作者： Lihua julie zhu Department of Molecular Cell and Cancer Biology Program in Bioinformatics and Integrated Biology Program in Molecular MedicineUniversity of Massachusetts Medical School Worcester MA O1605 USA

CRISPR-Cas （Clustered, Regularly Interspaced, Short Palindromic Repeats - CRISPR-associated （Cas）） RNA guided endonuclease has emerged as the most effective and widely used genome editing technology, which has become the most exciting and rapidly advancing research field. Efficient genome editing by the CRISPR-Cas9 system has been demonstrated in many species, and several laboratories have established CRISPR-Cas9 as a screening tool for systematic genetic analysis, similar to sbRNA screening. At least three companies have been founded to leverage this technology for therapeutic uses. To facilitate the implementation of this technology, many software tools have been developed to identify guide RNAs that effectively target a desired genomic region. Here, I provide an overview of the technology, focusing on guide RNA design principles, available software tools and their strengths and weaknesses.

关键词： CRISPR-Cas9 genome editing gRNA design off-target analysis gRNA efficacy

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前列腺癌的立体定向放射治疗

前列腺癌的立体定向放射治疗

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中华医学会放射肿瘤治疗学分会六届二次暨中国抗癌协会肿瘤放疗专业委员会二届二次学术会议

作者：高远红王小震 julie zhu 麦伟元黄莹 Arnold Paulino Michael ittmann E.Brian Butler Bin S.Teh The Methodist Hospital Baylor College of Medicine Michael E.DeBakey VA Medical Center 华南肿瘤学国家重点实验室中山大学肿防治中心中国医学科学院中国协医科大学肿瘤医院

目的:立体定向放射治疗(SBRT)日益受到人们重视,它是采用少分次、大分割的放射治疗技术;本研究的目的是通过体外及动物实验模型研究人前列腺癌进行大分割放射治疗的价值。材料与方法:选用人前列腺癌细胞CWR22RV1,分次照射剂量采用5Gy/次...

目的:立体定向放射治疗(SBRT)日益受到人们重视,它是采用少分次、大分割的放射治疗技术;本研究的目的是通过体外及动物实验模型研究人前列腺癌进行大分割放射治疗的价值。材料与方法:选用人前列腺癌细胞CWR22RV1,分次照射剂量采用5Gy/次和1 5Gy/次;应用成克

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PI3K/AKT抑制剂Perifosine联合照射治疗前列腺癌

PI3K/AKT抑制剂Perifosine联合照射治疗前列腺癌

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中华医学会放射肿瘤治疗学分会六届二次暨中国抗癌协会肿瘤放疗专业委员会二届二次学术会议

作者：高远红王小震 julie zhu 麦伟元黄莹 Daniel Floryk Michael Ittmann Timothy C.Thompson E.Brian Butler Bin S.Teh Department of radiation oncology the Methodist Hospital Department of radiology/radiation oncology Baylor College of Medicine Michael E.DeBakey VA Medical Center 华南肿瘤学国家重点实验室中山大学肿防治中心中国医学科学院中国协医科大学肿瘤医院

目的:前列腺在美国是最常见的非上皮性恶性肿瘤,占其男性癌症死因的第二位。放射治疗是前列腺癌重要的治疗手段。新一代的生物反应修饰剂,如以细胞膜为靶点的烷基化磷脂复合物Perifosine,增强了多种恶性肿瘤的放射效应。本研究的目的是...

目的:前列腺在美国是最常见的非上皮性恶性肿瘤,占其男性癌症死因的第二位。放射治疗是前列腺癌重要的治疗手段。新一代的生物反应修饰剂,如以细胞膜为靶点的烷基化磷脂复合物Perifosine,增强了多种恶性肿瘤的放射效应。本研究的目的是探导Perifosine通过抑制PI3K/AKT信号转导通路是否增强了人前列腺癌的放射效应。

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Cognitive and Functional Profiles in Mild-to-Moderate Alzheimer’s Disease and Mild Cognitive Impairment Compared to Healthy Elderly

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Advances in Alzheimer's Disease 2014年第4期3卷 168-186页

作者： Mark Marsico Celeste A. de Jager April Grant Xingshu zhu Arwen Markwick julie Chandler Epidemiology Department Merck Research Laboratories North Wales USA OPTIMA Nuffield Department of Medicine University of Oxford Oxford UK Division of Geriatric Medicine Department of Medicine Faculty of Health Sciences University of Cape Town Cape Town South Africa Statistical Programming Merck Research Laboratories North Wales USA

Background: Amnestic mild cognitive impairment (aMCI) and mild-to-moderate Alzheimer’s disease (AD) are clinically distinct but impact cognitive and functional ability similarly. Comprehensive assessment of cognitive and functional deficits may prove useful in informing differential diagnosis in early stages of dementia and in informing endpoint selection in therapeutic AD trials. Objective: The objective of this study was to characterize patterns of cognitive and functional impairment in aMCI and mild-to-moderate AD subjects compared to cognitively intact healthy elderly (HE). Methods: Thirty-one healthy elderly, 20 aMCI and 19 AD participants were administered a cognitive test battery that included the ADAS-Cog and functional assessments. Z-scores were calculated for all endpoints based on the HE reference group. Results: Cognitive deficits were observed in AD and aMCI participants relative to the referent group. On average, aMCI participants performed 1 - 2 standard deviations below HE on cognitive tests, and AD participants performed 2 - 3 standard deviations below HE. Domain-specific functional deficits among AD participants (z- score -0.4 to -6.4) were consistently greater than those of aMCI participants (z-score 0 to -1.7). Conclusion: This study provides further support for comprehensive assessment and monitoring of cognitive and functional domain scores in the diagnosis and treatment of aMCI and mild AD. Domain-specific cognitive scores may be more useful than composite scores in characterizing impairment and decline. Measuring domains such as attention, processing speed and executive function may increase the sensitivity of detecting disease progression and therapeutic effects, particularly in mild-moderate AD where memory decline may be too slow to detect drug effects during a typical clinical trial.

关键词： Alzheimer’s Disease Amnestic Mild Cognitive Impairment Dementia Cognition

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A prolonged cholera outbreak caused by drinking contaminated stream water,Kyangwali refugee settlement,Hoima District,Western Uganda:2018

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Infectious Diseases of Poverty 2020年第6期9卷 107-108页

作者： Fred Monje Alex Riolexus Ario Angella Musewa Kenneth Bainomugisha Bernadette Basuta Mirembe Dativa Maria Aliddeki Daniel Eurien Godfrey Nsereko Carol Nanziri Esther Kisaakye Vivian Ntono Benon Kwesiga Daniel Kadobera Lilian Bulage Godfrey Bwire Patrick Tusiime julie Harris Bao-Ping zhu Uganda Public Health Fellowship Program KampalaUganda 不详

Background: On 23 February 2018,the Uganda Ministry of Health(MOH)declared a cholera outbreak affecting more than 60 persons in Kyangwali Refugee Settlement,Hoima District,bordering the Democratic Republic of Congo(DRC).We investigated to determine the outbreak scope and risk factors for transmission,and recommend evidence-based control ***:: We defined a suspected case as sudden onset of watery diarrhoea in any person aged≥2 years in Hoima District,1 February–9 May 2018.A confirmed case was a suspected case with Vibrio cholerae cultured from a stool *** found cases by active community search and record reviews at Cholera Treatment *** calculated case-fatality rates(CFR)and attack rates(AR)by sub-county and *** a case-control study,we compared exposure factors among case-and *** estimated the association between the exposures and outcome using Mantel-Haenszel *** conducted an environmental assessment in the refugee settlement,including testing samples of stream water,tank water,and spring water for presence of fecal *** tested suspected cholera cases using cholera rapid diagnostic test(RDT)kits followed by culture for ***: We identified 2122 case-patients and 44 deaths(CFR=2.1%).Case-patients originating from Demographic Republic of Congo were the most affected(AR=15/1000).The overall attack rate in Hoima District was 3.2/1000,with Kyangwali sub-county being the most affected(AR=13/1000).The outbreak lasted 4 months,which was a multiple *** assessment showed that a stream separating two villages in Kyangwali Refugee Settlement was a site of open defecation for *** three water sources tested,only stream water was feacally-contaminated,yielding>100 CFU/100 *** 130 stool samples tested,124(95%)yielded *** by *** water was most strongly associated with illness(odds ratio[OR]=14.2,95%CI:1.5–133),although tank water also appeared to

关键词： Outbreak Cholera Refugees Uganda

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足月儿缺氧缺血性脑病的常规MRI、DWI、DTI及MRS表现(英文)

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磁共振成像 2011年第1期2卷 13-18页

作者： Yan Liu Patrice Jissendi-Tchofo Thierry Metens julie Absil Ming zhu Danielle Baleriaux Department of Radiology ULB- Hopital Erasme Brussels Belgium 上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心放射科 200127

近年,先进的磁共振(MR)技术和3特斯拉磁体(3T)已越来越多地被应用于新生儿,拓宽了围产期缺氧缺血性脑病(HIE)的知识。本文介绍了足月儿缺氧缺血性脑病在3T磁共振的表现,其中包括常规和先进的成像技术,如扩散加权成像(DWI),扩散张量成像(... 详细信息

近年,先进的磁共振(MR)技术和3特斯拉磁体(3T)已越来越多地被应用于新生儿,拓宽了围产期缺氧缺血性脑病(HIE)的知识。本文介绍了足月儿缺氧缺血性脑病在3T磁共振的表现,其中包括常规和先进的成像技术,如扩散加权成像(DWI),扩散张量成像(DTI)和磁共振波谱(MRS);重点强调了每种技术发现病灶的时间过程,以及与神经系统预后的关联。

关键词：缺氧缺血性脑病扩散加权成像扩散张量成像质子波谱 3T磁体

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抑制肾透明细胞癌细胞STAT1表达对放射敏感性的影响

抑制肾透明细胞癌细胞STAT1表达对放射敏感性的影响

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2007第六届全国放射肿瘤学学术年会

作者：惠周光 Maria Tretiakova Zhong fa Zhang julie Xiao hong zhu Weiyuan Mai E Brian Butler BinTean Teh BinSing Teh 中国医学科学院肿瘤医院放疗科 Department of Pathology University of Chicago Laboratory of Cancer Genetics Van Andel Research Institute Department of Radiology/Radiation Oncology Baylor College of Medicine Laboratory of Cancer Genetics VanAndel Research Institute

目的肾透明细胞癌是放射抗拒的恶性肿瘤,但是人们对其放射抗拒的分子机理了解甚少。近来文献报道 IFN 信号途径的下游转录因子 STAT1与头颈部鳞癌的放射抗拒有关。本研究主要观察 STAT1对肾透明细胞癌放射敏感性的影响。方法采用 Affyme...

目的肾透明细胞癌是放射抗拒的恶性肿瘤,但是人们对其放射抗拒的分子机理了解甚少。近来文献报道 IFN 信号途径的下游转录因子 STAT1与头颈部鳞癌的放射抗拒有关。本研究主要观察 STAT1对肾透明细胞癌放射敏感性的影响。方法采用 Affymetrix HGU133 Plus 2．0基因芯片寡聚核苷酸矩阵法检测135例人肾透明细胞癌标本和12例人正常肾组织标本的 STAT1表达,并用免疫组化验证基因芯片的检测结果。离体实验采用两株人肾透明细胞癌细胞 (SKRC-39和 CRL-1932)、人纤维母细胞(CCL-116)和人 Wilm’s 瘤细胞(CRL-1441),用 western 印迹法检测细胞

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铿锵玫瑰:朱莉·黛尔比

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当代电影 2014年第7期 110-114页

作者：朱晓洁北京大学外国语学院讲师100871

清新浪漫的文艺女神,这是演员朱莉·黛尔比在很多中国电影观众心目中的形象。然而,她自编自导自演,有时还合作制片、谱曲献唱的五部长片却展示了一个更真实的黛尔比。从地下实验电影到通俗喜剧,从家庭情节剧到历史悲剧,她是一个涉猎广... 详细信息

清新浪漫的文艺女神,这是演员朱莉·黛尔比在很多中国电影观众心目中的形象。然而,她自编自导自演,有时还合作制片、谱曲献唱的五部长片却展示了一个更真实的黛尔比。从地下实验电影到通俗喜剧,从家庭情节剧到历史悲剧,她是一个涉猎广泛、多才多艺的独立电影作者。更可贵的是,她将一个女性独有的生活体验和她个性中的温情、幽默和冷酷写进了作品中。她的电影不是阳春白雪,而更像一首歌,平实却生动,还有些吊诡和激扬之气,让人想起李宗盛的《铿锵玫瑰》,一朵看破了爱情、却倔强地在爱中体验生命的热情和残酷的铿锵玫瑰。

关键词：作者电影个性风格女性视角

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排名前10的与预防运动和体育活动猝死相关的关键问题

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体育科研 2018年第2期39卷 31-46页

作者： Rachel K.Katch Samantha E.Scarneo William M.Adams Lawrence E.Armstrong Luke N.Belval julie M.Stamm Douglas J.Casa 朱为模(审校) 科里斯特林格研究所美国康涅狄格大学北卡罗来纳大学格林斯博罗校区美国威斯康辛-麦迪逊大学美国美国伊利诺伊大学美国

参加有组织的体育运动和休闲活动存在发生严重伤病甚至死亡的内在风险。虽然造成体育运动或体育活动中猝死的原因有很多,但运动医学和循证标准治疗方面的进展已使临床医生得以更有效地预防、发现和治疗可能致死的伤患。随着研究与技术... 详细信息

参加有组织的体育运动和休闲活动存在发生严重伤病甚至死亡的内在风险。虽然造成体育运动或体育活动中猝死的原因有很多,但运动医学和循证标准治疗方面的进展已使临床医生得以更有效地预防、发现和治疗可能致死的伤患。随着研究与技术不断发展进步,当前的治疗标准正在不断发展以更好地改善患者的治疗效果。本文提出了10个与运动和体育活动中猝死的主要原因及其治疗手段有关的关键问题,未来开展的研究将提高运动员和休闲运动爱好者参与运动的安全度。当前证据表明,如采取正确的预防策略或最佳治疗方案,绝大多数的死亡案例是可以避免的。

关键词：教育劳力性中暑体检预筛查心源性猝死

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