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Radial Basis Function Networks Applied in Bacterial Classification Based on MALDI-TOF-MS

Chemical Research in Chinese Universities 2002年第4期18卷 453-457页

作者： HARRINGTON Peter de B. VOORHEES Kent J. rees jon Ohio University Center for Intelligent Chemical Instrumentation Department of Chemistry and Biochemistry Ohio UniversityDepartment of Chemistry and Geochemistry Colorado School of MinesDepartment of Chemistry and Geochemistry Colorado School of Mines Athens Ohio 45701-2979 USA Golden CO 80401 USAGolden CO 80401 USA

The radial basis function networks were applied to bacterial classification based on the matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometric (MALDI-TOF-MS) data. The classification of bacteria cultured at different time was discussed and the effect of the network parameters on the classification was investigated. The cross-validation method was used to test the trained networks. The correctness of the classification of different bacteria investigated changes in a wide range from 61.5% to 92.8%. Owing to the complexity of biological effects in bacterial growth, the more rigid control of bacterial culture conditions seems to be a critical factor for improving the rate of correctness for bacterial classification.

关键词： Radial basis function network Matrix-assisted laser desorption/ionization Time-of-flight mass spectrometry Bacterium Classification

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温度限制串联相关神经网络及其在细菌辨识中的应用

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高等学校化学学报 2002年第4期23卷 570-572页

作者：张卓勇 Aaron Urbas Peter de B Harrington Kent J.Voorhees jon rees 首都师范大学化学系北京100037 俄亥俄大学化学系科罗拉多矿学院地球化学系

蛋白质在微生物研究中可用作生物标记物, 故在生物技术中其表征工作很重要. 各种质谱技术已被用于细菌的表征[1～3]. 1994年, Cain等[4]首先报道了将色谱和基体辅助激光解离/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)用于细菌的辨识. Holland等[5... 详细信息

蛋白质在微生物研究中可用作生物标记物, 故在生物技术中其表征工作很重要. 各种质谱技术已被用于细菌的表征[1～3]. 1994年, Cain等[4]首先报道了将色谱和基体辅助激光解离/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)用于细菌的辨识. Holland等[5]采用高质量离子MALDI-TOF-MS对细菌全细胞进行辨识. 最近, Lay[6]对该技术的细菌辨识做了综述. MALDI-TOF-MS是目前对细菌全细胞分析的最佳手段.

关键词：细菌 MALDI 飞行时间质谱 TCCCN 人工神经网络辨识温度限制串联相关神经网络

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径向基函数网络用于细菌的MALDI-TOF-MS分类

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计算机与应用化学 2002年第1期19卷 45-48页

作者：张卓勇王丹 Peter de B.Harrington Kent J.Voorhees jon rees 东北师范大学化学学院 Department of Chemistry and Biochemistry Ohio UniversityAthensOhio 45701-2979 Department ofChemistry and Geochemistry Colorado School ofMinesGoldenCO 80401

径向基函数(RBF)网络被用于根据基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)对细菌的分类辨识。为了加速网络训练和减少网络的复杂性,本文采用小波变换对原始质谱数据进行压缩,将原来的13828个数据点压缩至328个,且保持了原来的... 详细信息

径向基函数(RBF)网络被用于根据基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)对细菌的分类辨识。为了加速网络训练和减少网络的复杂性,本文采用小波变换对原始质谱数据进行压缩,将原来的13828个数据点压缩至328个,且保持了原来的特征谱峰。本文研究了在不同培养时间(24、48和72小时)的5种细菌分类,并对RBF网络参数的影响做了详细地研究,为生物学研究提供了有用的信息。结果表明,约60％以上的细菌样本能够被正确地分类辨识。由于细菌培养的生物学影响因素复杂,因而进一步严格控制细菌的培养条件是改善细菌分类正确率的关键。

关键词：径向基函数网络细菌分类基质辅助激光解解吸/电离飞行时间质谱

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度过经济衰退,企业需要大胆战略

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当代经理人 2009年第9期 94-97页

作者： Andrew rees(安德鲁.里斯) jon Weber(乔恩.韦伯) 陈玮 L.E.K.(艾意凯)咨询波士顿分公司 L.E.K.(艾意凯)咨询上海分公司

出色的管理团队会在经济衰退时致力于制订一套完整的计划以保证近期内企业的生存,并使得他们得以在衰退中对企业业务进行调整。

关键词：经济衰退企业需要管理团队竞争优势企业业务

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