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Expression changes of mi RNA-regulated genes associated with the formation of the leafy head in cabbage

Horticultural Plant Journal 2024年第4期10卷 1007-1019页

作者： Jorge Aleman-Baez Jose Fernando Acevedo-Zamora johan Bucher Chengcheng Cai Roeland E.Voorrips Guusje Bonnema Plant Breeding Wageningen University and ResearchWageningenThe Netherlands

The vegetative development of cabbage(Brassica oleracea ***)passes through seedling,rosette,folding and heading *** that form the rosette are large and mostly *** the following developmental stages,the plants produce leaves that curve inward to produce the leafy *** microRNAs and their target genes have been described participating in leaf development and leaf *** aim of this study is to investigate the role of miRNA-regulated genes in the transition from the rosette to the heading *** compared the mi RNA and gene abundances between emerging rosette and heading *** remove transcripts(miRNAs and genes)whose regulation was most likely associated with plant age rather than the change from rosette to heading stage,we utilized a non-heading collard green(*** ***)morphotype as *** resulted in 33 DEMs and 1998 DEGs with likely roles in the transition from rosette to heading stage in *** these 1998 DEGs,we found enriched GO terms related to DNA-binding transcription factor activity,transcription regulator activity,iron ion binding,and *** predicted the target genes of these 33 DEMs and focused on the subset that was differentially expressed(1998DEGs)between rosette and heading stage leaves to construct mi RNA-target gene interaction *** main finding is a role for miR396b-5p targeting two Arabidopsis thaliana orthologues of GROWTH REGULATING FACTORs 3(GRF3)and 4(GRF4)in pointed cabbage head formation.

关键词： Brassica oleracea var.capitata RNA sequencing miRNA-target gene network leafy head formation

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