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Estimating SVCV waterborne transmission and predicting experimental epidemic development:A modeling study using a machine learning approach

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Water Biology and Security 2024年第1期3卷 60-70页

作者： Jiaji Pan Qijin Zeng Wei Qin jixiang chu Haibo Jiang Haiyan Chang Jun Xiao Hao Feng State Key Laboratory of Developmental Biology of Freshwater Fish College of Life ScienceHunan Normal UniversityChangsha410081China College of Engineering and Design Hunan Normal UniversityChangsha410081China

Viral infectious diseases significantly threaten the sustainability of freshwater fish *** lack of studies on epidemic transmission patterns and mechanisms inhibits the development of containment strategies from the viewpoint of veterinary public *** study raises an epidemic mathematical model considering water transmission with the aim of analyzing the transmission process more *** basic reproduction number R0 was derived by the model parameter including the water transmission coefficient and was used for the analysis of the virus *** viremia of carp virus(SVCV)and zebrafish were used as model viruses and animals,respectively,to conduct the transmission *** through water was achieved by connecting two aquarium tanks with a water channel but blocking the fish movement between the *** the collected experimental data,we determined the optimal hybrid machine learning algorithm to analyze the transmission process using an established mathematical *** addition,future transmission was predicted and validated using the epidemic model and an optimal ***,the sensitivity of model parameters and the simulations of R0 variation were performed based on the modified complex epidemic *** study is of significance in providing theoretical guidance for minimizing R0 by manipulating model parameters with containment *** importantly,since the modified model and algorithm demonstrated better performance in handling freshwater fish transmission problems,this study advances the future application of transmissible disease modeling with larger datasets in freshwater fish aquaculture.

关键词： Epidemic mathematical model Hybrid machine learning algorithm Reproduction number Sensitivity analysis SVCV transmission

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KLF4 facilitates chromatin accessibility remodeling in porcine early embryos

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Science China(Life Sciences) 2024年第1期67卷 96-112页

作者： Wei Zhu Guowei Bu Ruifeng Hu jixiang Zhang Lianyong Qiao Kai Zhou Tingting Wang Qiao Li Jingjing Zhang Linhui Wu Yali Xie Taotao Hu Shichun Yang Jiaqi Guan Xiaoyu chu Juanjuan Shi Xia Zhang Falong Lu Xin Liu Yi-Liang Miao Institute of Stem Cell and Regenerative Biology College of Animal Science and Veterinary MedicineHuazhong Agricultural UniversityWuhan 430070China Key Laboratory of Agricultural Animal Genetics Breeding and Reproduction(Huazhong Agricultural University)Ministry of EducationWuhan 430070China State Key Laboratory of Molecular Developmental Biology Institute of Genetics and Developmental BiologyInnovative Academy of Seed DesignChinese Academy of SciencesBeijing 100101China Frontiers Science Center for Animal Breeding and Sustainable Production Huazhong Agricultural UniversityWuhan 430070China Hubei Hongshan Laboratory Wuhan 430070China

Chromatin accessibility remodeling driven by pioneer factors is critical for the development of early *** studies have illustrated several pioneer factors as being important for agricultural animals,but what are the pioneer factors and how the pioneer factors remodel the chromatin accessibility in porcine early embryos is not *** employing low-input DNase-seq(liDNase-seq),we profiled the landscapes of chromatin accessibility in porcine early embryos and uncovered a unique chromatin accessibility reprogramming pattern during porcine preimplantation *** data revealed that KLF4 played critical roles in remodeling chromatin accessibility in porcine early *** down of KLF4 led to the reduction of chromatin accessibility in early embryos,whereas KLF4 overexpression promoted the chromatin openness in porcine ***,KLF4 deficiency resulted in mitochondrial dysfunction and developmental failure of porcine *** addition,we found that overexpression of KLF4 in blastocysts promoted lipid droplet accumulation,whereas knockdown of KLF4 disrupted this *** together,our study revealed the chromatin accessibility dynamics and identified KLF4 as a key regulator in chromatin accessibility and cellular metabolism during porcine preimplantation embryo development.

关键词： porcine embryos liDNase-seq chromatin accessibility KLF4 mitochondrion lipid droplets

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基于MRI的人工智能在直肠癌中的应用进展

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磁共振成像 2023年第9期14卷 176-180页

作者：朱钰欧阳治强单海燕杨露褚吉祥廖承德柯腾飞杨军云南省肿瘤医院(昆明医科大学第三附属医院)放射科昆明650118 昆明市延安医院(昆明医科大学附属延安医院)放射科昆明650051

直肠高分辨率MRI具有极高的软组织分辨率,能够清晰显示直肠肠壁、直肠系膜筋膜、腹膜反折及邻近器官的受侵状况,是评估直肠癌(rectal cancer,RC)的首选影像学方法。然而,常规MRI的语义特征仍然不足以辅助临床医生做出诊疗决策。因此,在R... 详细信息

直肠高分辨率MRI具有极高的软组织分辨率,能够清晰显示直肠肠壁、直肠系膜筋膜、腹膜反折及邻近器官的受侵状况,是评估直肠癌(rectal cancer,RC)的首选影像学方法。然而,常规MRI的语义特征仍然不足以辅助临床医生做出诊疗决策。因此,在RC患者的诊疗随访过程中,需要新型无创影像学标志物来定量描述肿瘤特征,指导临床制订治疗策略,实现个体化诊疗。随着人工智能(artificial intelligence,AI)在医学中的发展及广泛应用,其为基于高分辨MRI的RC评估提供了客观的参考依据,能更好地辅助临床医生做出精准的诊疗决策。本文总结了近年来AI在RC病灶分割、T分期评估、淋巴结转移预测、新辅助治疗后疗效评估、预后预测中的应用,并进行了总结与展望,旨在帮助读者更好地了解基于MRI的AI在RC方面的应用进展,并为将来的研究提供一定参考方向。

关键词：直肠癌人工智能磁共振成像机器学习

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骨旁脂肪瘤4例影像学表现分析并文献复习

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肿瘤影像学 2022年第4期31卷 409-413页

作者：褚吉祥马焕王瑶李鹍廖承德昆明医科大学第三附属医院云南省肿瘤医院放射科云南昆明650018

目的:分析总结骨旁脂肪瘤影像学表现特点,以提高对该病的认识。方法:对4例骨旁脂肪瘤患者的临床及影像资料进行回顾分析。结果:4例患者中,男性2例,女性2例。发生部位分别为肩胛骨、跟骨、肱骨及股骨。临床表现主要为单发、生长缓慢的无... 详细信息

目的:分析总结骨旁脂肪瘤影像学表现特点,以提高对该病的认识。方法:对4例骨旁脂肪瘤患者的临床及影像资料进行回顾分析。结果:4例患者中,男性2例,女性2例。发生部位分别为肩胛骨、跟骨、肱骨及股骨。临床表现主要为单发、生长缓慢的无痛性肿块。X射线(X-ray)以骨旁“透光”肿块伴邻近骨皮质肥厚并骨性突起为特点。计算机体层成像(computed tomography,CT)上病变主体呈脂肪密度,类圆形或分叶状,边缘清晰,中央为“鹿角样”或“珊瑚状”骨化,与附着处增厚骨皮质或骨突连续,可有骨质侵蚀、破坏。磁共振成像(magnetic resonance imaging,MRI)上的T1加权成像(T1-weighted imaging,T1WI)为高信号,T2加权成像(T2-weighted imaging,T2WI)为高信号,脂肪抑制序列呈低信号,内见长T1、短T2信号骨化和等T1、等T2信号纤维分隔,边缘见纤维包膜,增强包膜及间隔轻微强化。结论:骨旁脂肪瘤属罕见病,具有骨旁脂肪密度或信号肿块伴骨化及邻近骨质改变等特征性影像学表现,结合CT及MRI检查,术前多可正确诊断。

关键词：骨旁脂肪瘤计算机体层成像磁共振成像

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2012-2022年山东省肝癌发病与死亡趋势及其年龄-时期-队列分析

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中华肿瘤防治杂志 2024年第5期31卷 280-291页

作者：姜帆付振涛鹿子龙楚洁郭晓雷马吉祥山东省疾病预防控制中心慢性非传染性疾病防治所山东济南250014 山东大学预防医学研究院(山东省预防医学科学院) 山东济南250014

目的分析2012-2022年山东省肝癌发病及死亡变化趋势,并估计其年龄-时期-队列效应。方法基于2012-2022年山东省肿瘤登记地区肝癌新发和死亡病例资料,采用Joinpoint回归分析其发病率及死亡率变化趋势,计算平均年度变化百分比(AAPC)。拟合... 详细信息

目的分析2012-2022年山东省肝癌发病及死亡变化趋势,并估计其年龄-时期-队列效应。方法基于2012-2022年山东省肿瘤登记地区肝癌新发和死亡病例资料,采用Joinpoint回归分析其发病率及死亡率变化趋势,计算平均年度变化百分比(AAPC)。拟合年龄-时期-队列模型分析≥20岁人群肝癌发病、死亡风险的年龄效应、时期效应及队列效应。结果2012-2022年山东省肝癌标化发病率呈显著下降趋势,每年下降6.0%(AAPC=-6.0%,95%CI:-6.9%~-5.1%,P<0.05);男性下降5.9%(AAPC=-5.9%,95%CI:-6.9%~-4.9%,P<0.05),女性下降6.0%(AAPC=-6.0%,95%CI:-6.7%~5.2%,P<0.05);城市下降6.6%(AAPC=-6.6%,95%CI:-8.0%~-5.3%,P<0.05),农村下降4.9%(AAPC=-4.9%,95%CI:-5.9%~-3.9%,P<0.05)。2012-2022年山东省肝癌标化死亡率呈显著下降趋势,每年下降5.1%(AAPC=-5.1%,95%CI:-5.9%~-4.4%,P<0.05);男性下降4.9%(AAPC=-4.9%,95%CI:-5.6%~-4.2%,P<0.05),女性下降5.5%(AAPC=-5.5%,95%CI:-6.6%~4.4%,P<0.05);城市下降4.6%(AAPC=-4.6%,95%CI:-6.0%~3.1%,P<0.05),农村下降4.8%(AAPC=-4.8%,95%CI:-6.1%~3.6%,P<0.05)。肝癌发病和死亡风险均随年龄增加而增大,发病和死亡时期效应和队列效应均随年份推移而减小。结论2012-2022年山东省肝癌发病和死亡均呈下降趋势。年龄是增加肝癌发病和死亡风险重要因素,未来肝癌疾病负担仍然较重。应重视肝癌高危人群早诊早治,同时加强病因学探索性研究,为肝癌防控策略提供参考依据。

关键词：肝癌发病率死亡率 Joinpoint 年龄-时期-队列模型

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安徽太平矿业有限公司井下巷道矽卡岩体力学参数反演

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黄金 2022年第8期43卷 37-40页

作者：褚吉祥于庆磊曹永胜孙鹏安徽太平矿业有限公司东北大学岩石破裂与失稳研究所

以矽卡岩型巷道位移及松动圈实测数据为依据,选取围岩的弹性模量及内聚力作为反演参数,采用黄金分割法进行位移-松动圈反演分析的优化迭代计算。结果表明:位移-松动圈反演分析方法在巷道参数反演中的应用是可行的,其结果可用于反馈并指... 详细信息

以矽卡岩型巷道位移及松动圈实测数据为依据,选取围岩的弹性模量及内聚力作为反演参数,采用黄金分割法进行位移-松动圈反演分析的优化迭代计算。结果表明:位移-松动圈反演分析方法在巷道参数反演中的应用是可行的,其结果可用于反馈并指导巷道支护设计与施工。该反演方法为类似工程的岩体力学参数分析提供了很好的借鉴。

关键词：矽卡岩体力学参数反演分析松动圈位移监测黄金分割法

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基于年龄-时期-队列效应模型分析2012—2022年山东省甲状腺癌流行趋势

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中华预防医学杂志 2024年第1期58卷 56-64页

作者：姜帆付振涛鹿子龙楚洁郭晓雷徐爱强马吉祥山东省疾病预防控制中心慢性非传染性疾病防治所济南250014 山东大学公共卫生学院济南250014 山东省预防医学科学院(山东大学预防医学研究院) 济南250014

目的分析2012—2022年山东省甲状腺癌发病死亡趋势,并估计其发病的年龄-时期-队列效应。方法基于2012—2022年山东省肿瘤登记地区甲状腺癌数据,利用Joinpoint回归分析甲状腺癌发病、死亡的变化趋势,计算平均年度变化百分比(AAPC)。拟合... 详细信息

目的分析2012—2022年山东省甲状腺癌发病死亡趋势,并估计其发病的年龄-时期-队列效应。方法基于2012—2022年山东省肿瘤登记地区甲状腺癌数据,利用Joinpoint回归分析甲状腺癌发病、死亡的变化趋势,计算平均年度变化百分比(AAPC)。拟合年龄-时期-队列模型分析20岁以上人群甲状腺癌发病风险的年龄、时期及队列效应。结果2012—2022年山东省甲状腺癌发病率呈上升趋势,AAPC值为21.68%(95%CI:19.14%~24.27%,P<0.001),且女性发病率高于男性,城市发病率高于农村;甲状腺癌死亡率变化趋势相对稳定,AAPC值为-3.04%(95%CI:-8.81%~3.09%,P=0.323)。甲状腺癌发病的年龄效应在60岁之前随年龄增长而增加,60岁之后随年龄增长而降低,发病高峰集中在55~59岁年龄组;时期效应随时间推移而增加;队列效应则表现为1957年之前出生的队列随时间推移呈下降趋势,1957年之后出生的队列呈上升趋势。结论2012—2022年山东省甲状腺癌发病率呈上升趋势,年龄是重要影响因素;甲状腺癌死亡率较为稳定。

关键词：甲状腺肿瘤发病率回归分析监测年龄-时期-队列模型

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复杂地质条件下矿区初始地应力场反演分析

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黄金 2022年第1期43卷 54-58页

作者：褚吉祥于庆磊勒治华郑浩田孙鹏安徽太平矿业有限公司东北大学岩石破裂与失稳研究所

初始地应力场是地下工程设计和稳定性分析的重要依据。前常铁矿矿区地质构造复杂、巷道围岩破坏严重,掌握矿区地应力场的分布规律对了解巷道破坏、进行支护设计具有重要意义。采用三维有限差分数值计算软件(Flac^(3D)),建立了考虑矿区... 详细信息

初始地应力场是地下工程设计和稳定性分析的重要依据。前常铁矿矿区地质构造复杂、巷道围岩破坏严重,掌握矿区地应力场的分布规律对了解巷道破坏、进行支护设计具有重要意义。采用三维有限差分数值计算软件(Flac^(3D)),建立了考虑矿区主要断层、岩层等的三维数值模型,进行矿区地应力场的模拟,分析了矿区整体、地质构造处和-480 m中段地应力场特征。结果表明:矿区地应力以自重应力为主,分层现象明显,应力值随埋深增加而逐渐增大,地质构造和岩性交接带对地应力的影响十分显著,出现不同程度的应力集中现象;F_(1)断层形成的构造应力对-480 m中段主运输巷道影响相对较大;-480 m中段主运输巷道侧压力系数为0.46~0.58,最大水平主应力与巷道走向的夹角为2.60°~47.75°,对维持其稳定性不利。为减小地应力场对巷道稳定性的影响,建议矿区地下巷道的布置遵循巷道走向与最大水平主应力方向平行的原则。

关键词：复杂地质构造地应力场数值计算反演分析主应力方向

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太平矿业公司矽卡岩型软岩巷道支护优化及应用

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黄金 2021年第7期42卷 41-46,49页

作者：褚吉祥蒲江涌孙鹏安徽太平矿业有限公司 235115 东北大学岩石破裂与失稳研究所

锚杆支护参数的合理选择是实现锚杆支护作用效果的重要依据,合理地设计及优化锚杆的支护参数可以提高支护的有效性和针对性。针对太平矿业公司矽卡岩型铜铁矿床的支护问题,采用理论分析与数值模拟,以原有支护方案为参照,设计不同参数的... 详细信息

锚杆支护参数的合理选择是实现锚杆支护作用效果的重要依据,合理地设计及优化锚杆的支护参数可以提高支护的有效性和针对性。针对太平矿业公司矽卡岩型铜铁矿床的支护问题,采用理论分析与数值模拟,以原有支护方案为参照,设计不同参数的锚杆支护方案,进行优化研究。基于松动圈现场测量结果,通过理论计算确定了合理的锚杆长度为2.0 m;利用Flac3D软件,建立井下巷道锚杆支护的三维数值模型,采用应变软化本构模型描述矽卡岩型软岩特性,对不同锚杆间排距的支护方案进行计算与分析。通过对巷道顶底板及两帮位移量的分析,结合巷道断面塑性区面积结果对比,确定了锚杆的间排距为800 mm×800 mm,合理支护参数的选择为矿山安全高效生产提供技术支撑。

关键词：软岩巷道巷道支护锚杆参数矽卡岩松动圈数值模拟

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山东省居民原发性蛛网膜下腔出血的流行特征分析

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中华医学杂志 2024年第24期104卷 2249-2255页

作者：张丙银张吉玉楚洁鹿子龙徐晓慧于晓慧郭晓雷徐爱强马吉祥山东省疾病预防控制中心慢性非传染性疾病防制所济南山东省疾病预防控制中心业务管理部济南山东大学预防医学研究院济南山东省疾病预防控制中心济南

目的了解山东省居民原发性蛛网膜下腔出血(SAH)发病特征和流行趋势。方法本研究从山东省慢性病监测信息管理系统收集居民2012—2021年SAH发病数据, 包括门诊、急诊或住院以及院外死亡病例基本信息和疾病诊断信息。以粗发病率和年龄标化... 详细信息

目的了解山东省居民原发性蛛网膜下腔出血(SAH)发病特征和流行趋势。方法本研究从山东省慢性病监测信息管理系统收集居民2012—2021年SAH发病数据, 包括门诊、急诊或住院以及院外死亡病例基本信息和疾病诊断信息。以粗发病率和年龄标化发病率为指标描述不同性别、年龄组、地区(城市和农村)常住人口SAH发病水平, 采用Joinpoint回归分析发病率和发病年龄随年份变化趋势。应用率的差别分解法估计人口老龄化对SAH发病率上升的贡献度。采用DeoDa 1.12软件进行全局和局部空间自相关分析。结果 2012—2021年, 山东省19个省级监测点共报告SAH发病11 629例次;其中, 女性占54.11%(6 293例次), ≥45岁居民占91.87%(10 684例次)。报告粗发病率从5.26/10万上升至9.50/10万, 年均上升7.75%(Z趋势=7.30, P趋势0.05)。SAH发病率随年龄增长呈上升趋势(P趋势0, P<0.05);局部空间自相关分析发现, 高发区县主要集中在鲁西北的德州市和鲁西南的菏泽市。结论山东省居民SAH发病率呈上升趋势, 且具有空间聚集性和季节聚集性, ≥45岁居民、女性居民和农村居民是发病高危人群, 应针对高发季节、高危人群和高发聚集区域采取重点防控措施。

关键词：蛛网膜下腔出血发病率流行趋势空间分布

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