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Single-cell transcriptomics reveals cell type diversity of human prostate

Journal of Genetics and Genomics 2022年第11期49卷 1002-1015页

作者： Yang Chen Peng Zhang jinling liao Jiwen Cheng Qin Zhang Tianyu Li Haiying Zhang Yonghua Jiang Fangxing Zhang Yanyu Zeng Linjian Mo Haibiao Yan Deyun Liu Qinyun Zhang Chunlin Zou Gong-Hong Wei Zengnan Mo Center for Genomic and Personalized Medicine Guangxi Key Laboratory for Genomic and Personalized MedicineGuangxi Collaborative Innovation Center for Genomic and Personalized MedicineGuangxi Medical UniversityNanningGuangxi 530021China Department of Urology The First Affiliated Hospital of Guangxi Medical UniversityNanningGuangxi 530021China Key Laboratory of Metabolism and Molecular Medicine of the Ministry of Education&Department of Biochemistry and Molecular Biology School of Basic Medical SciencesFudan University Shanghai Cancer CenterFudan UniversityShanghai 201114China Biocenter Oulu Faculty of Biochemistry and Molecular MedicineUniversity of OuluOuluFinland Key Laboratory of Longevity and Ageing-Related Disease of Chinese Ministry of Education Center for Translational Medicine and School of Preclinical MedicineGuangxi Medical UniversityNanningGuangxi 530021China

Extensive studies have been performed to describe the phenotypic changes occurring during malignant transformation of the prostate.However,the cell types and associated changes that contribute to the development of prostate diseases and cancer remain elusive,largely due to the heterogeneous composition of prostatic tissues.Here,we conduct a comprehensive evaluation of four human prostate tissues by singlecell RNA sequencing(sc RNA-seq)to analyze their cellular compositions.We identify 18 clusters of cell types,each with distinct gene expression profiles and unique features;of these,one cluster of epithelial cells(Ep)is found to be associated with immune function.In addition,we characterize a special cluster of fibroblasts and aberrant signaling changes associated with prostate cancer(PCa).Moreover,we provide insights into the epithelial changes that occur during the cellular senescence and aging.These results expand our understanding of the unique functional associations between the diverse prostatic cell types and the contributions of specific cell clusters to the malignant transformation of prostate tissues and PCa development.

关键词： scRNA-seq Human prostate Cell type diversity Immunity Cellular senescence Prostate cancer

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基于EPC-MIMO编码设计的解距离模糊性能分析

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系统工程与电子技术 2022年第7期44卷 2166-2174页

作者：廖金玲廖桂生许京伟兰岚西安电子科技大学雷达信号处理国家重点实验室陕西西安710071

中高脉冲重复频率雷达中,目标的回波延迟时间大于发射脉冲的重复周期时会导致距离模糊。本文在多输入多输出(multiple-input multiple-output,MIMO)雷达中进行联合发射阵元与脉冲二维编码(element-pulse coding,EPC),对阵元脉冲编码的... 详细信息

中高脉冲重复频率雷达中,目标的回波延迟时间大于发射脉冲的重复周期时会导致距离模糊。本文在多输入多输出(multiple-input multiple-output,MIMO)雷达中进行联合发射阵元与脉冲二维编码(element-pulse coding,EPC),对阵元脉冲编码的设计方法进行了研究,可实现距离解模糊。对基于Fourier正交基的编码设计进行推广,提出了一般的EPC方法,对于M个发射阵元,可获得M!种编码方式。引入期望距离区与模糊距离区的信号模糊比(signal-to-ambiguous-plus-noise ratio,SANR)作为解模糊性能的评估准则,进行了性能分析。针对角度误差提出了稳健的权矢量优化方法,进一步提高了解距离模糊的稳健性。仿真实验验证了所提方法的有效性,不同编码方式在理想情况下均能有效分离不同距离区的目标,且优化权矢量后M!种编码方式对应的解距离模糊性能相近。

关键词：多输入多输出雷达阵元脉冲编码距离模糊信号模糊比

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植物线虫分子鉴定研究进展

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植物保护 2015年第6期41卷 1-8页

作者：卓侃廖金铃华南农业大学植物线虫研究室广州510642 广东生态工程职业学院广州510520

植物线虫可危害农作物和林木,对它们的准确鉴定是防治植物线虫病害的基础。由于植物线虫很小,而且在形态上种间常有覆盖,而种内有较大的变异,仅依据形态特征很难鉴定。分子鉴定技术给植物线虫的检测和鉴定提供了快速、精确、可靠的方法... 详细信息

植物线虫可危害农作物和林木,对它们的准确鉴定是防治植物线虫病害的基础。由于植物线虫很小,而且在形态上种间常有覆盖,而种内有较大的变异,仅依据形态特征很难鉴定。分子鉴定技术给植物线虫的检测和鉴定提供了快速、精确、可靠的方法。文章综述了植物线虫分子的DNA提取、分子鉴定靶标序列的选择及分子鉴定方法等方面的研究进展及现状,以促进对植物线虫分子鉴定更深入的研究。

关键词：植物线虫分子鉴定 DNA PCR

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根结线虫食道腺细胞表达的基因及其应用潜力

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植物保护 2009年第1期35卷 1-7页

作者：廖金铃卓侃崔汝强华南农业大学资源环境学院植物线虫研究室广州510642 广东出入境检验检疫局广州510623

根结线虫是国际公认的最为重要的植物病原线虫,研究其食道腺细胞表达的基因是了解其寄生性和致病性的基础。近年来国际上已从根结线虫食道腺细胞分离基因22个,其基因产物主要包括β-1,4内切葡聚糖酶、果胶酸裂解酶、分支酸变位酶、钙网... 详细信息

根结线虫是国际公认的最为重要的植物病原线虫,研究其食道腺细胞表达的基因是了解其寄生性和致病性的基础。近年来国际上已从根结线虫食道腺细胞分离基因22个,其基因产物主要包括β-1,4内切葡聚糖酶、果胶酸裂解酶、分支酸变位酶、钙网蛋白、类毒液过敏蛋白等。本文对上述工作的研究进展作简要评述,并对今后的应用潜力进行了讨论。

关键词：根结线虫食道腺细胞基因

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现代农林领域复合型技术技能人才需求分析及培养对策研究

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创新创业理论研究与实践 2023年第19期6卷 87-89页

作者：赵静刘晓丽卢坤菲廖金铃广东生态工程职业学院广东广州510520

随着乡村振兴战略的实施,现代农林领域复合型技术技能人才的重要性日益凸显。为更好地开展人才培养方案制定的实务研究,高职院校要认识现代农林领域人才发展现状,了解现代复合型技术技能人才需求情况。该文通过分析研究,从课程体系、课... 详细信息

随着乡村振兴战略的实施,现代农林领域复合型技术技能人才的重要性日益凸显。为更好地开展人才培养方案制定的实务研究,高职院校要认识现代农林领域人才发展现状,了解现代复合型技术技能人才需求情况。该文通过分析研究,从课程体系、课程思政、教师队伍等方面提出了促进现代农林领域复合型技术技能人才培养的对策建议。

关键词：农林领域复合型技术技能人才需求分析人才培养教师队伍教学改革

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淡紫拟青霉γ-actin基因cDNA全长的克隆与序列分析

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植物保护 2010年第3期36卷 78-81页

作者：卓侃罗梅廖金铃林抗美华南农业大学资源环境学院广州510642 福建省农业科学院福州350003 广东仲恺农业工程学院广州510225

利用同源克隆的策略对淡紫拟青霉(Paecilomyces lilacinus)γ-actin基因进行克隆,获得了淡紫拟青霉γ-ac-tin基因cDNA全长。该基因cDNA的ORF长1128bp,编码375个氨基酸,具有actin基因的保守特征序列。由该基因推导的氨基酸序列与多个子... 详细信息

利用同源克隆的策略对淡紫拟青霉(Paecilomyces lilacinus)γ-actin基因进行克隆,获得了淡紫拟青霉γ-ac-tin基因cDNA全长。该基因cDNA的ORF长1128bp,编码375个氨基酸,具有actin基因的保守特征序列。由该基因推导的氨基酸序列与多个子囊菌的γ-actin蛋白序列相似性达98%以上。系统进化树显示其系统发育关系与传统的分类关系基本一致。

关键词：淡紫拟青霉 γ-actin基因克隆

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毛草龙化学成分及其细胞毒活性研究

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广西植物 2024年第6期44卷 1195-1204页

作者：曾雨娴廖广凤李金玲李敏李兵朱小勇卢汝梅广西中医药大学药学院南宁530200

为探究毛草龙(Ludwigia octovalvis)中的活性成分,该研究采用硅胶、Sephadex LH-20、C 18中低压和半制备液相等色谱方法对毛草龙的80%乙醇提取物进行分离纯化,根据理化性质及波谱数据鉴定化合物结构,并通过MTS法检测单体化合物对5种肿... 详细信息

为探究毛草龙(Ludwigia octovalvis)中的活性成分,该研究采用硅胶、Sephadex LH-20、C 18中低压和半制备液相等色谱方法对毛草龙的80%乙醇提取物进行分离纯化,根据理化性质及波谱数据鉴定化合物结构,并通过MTS法检测单体化合物对5种肿瘤细胞增殖的抑制活性。结果表明:(1)从毛草龙中分离得到20个化合物,分别鉴定为(-)-南烛木树脂酚(1)、8,8′-bisdihydrosiringenin(2)、5-甲氧基-(-)-异落叶松脂素(3)、(-)-isolariciresinol(4)、3,4′-二甲氧基鞣花酸(5)、3,3′,4′-三甲氧基鞣花酸(6)、1,3,6-tri-O-galloyl-β-glucospyranose(7)、柯里拉京(8)、没食子酸甲酯(9)、没食子酸乙酯(10)、terminaliate A(11)、丁香酸(12)、3-hydroxy-1-(4-hydroxy-3,5-dimethoxyphenyl)-1-propanone(13)、木犀草素(14)、山柰酚(15)、5,8-dihydroxy-7-methoxyflavone(16)、川陈皮素(17)、桔皮素(18)、α-托可醌(19)、5-O-(E)-p-coumaroyl quinic acid ethyl ester(20)。其中,化合物1-5、7、8、11、13、16-20为首次从该属植物中分离得到,化合物6、9、10、12、15为首次从该植物中分离得到。(2)化合物19对白血病HL-60细胞显示细胞毒活性,IC_(50)为10.31μmol·L^(-1);化合物6-8、19对非小细胞肺癌细胞A549显示细胞毒活性,IC_(50)分别为25.82、42.05、36.94、17.54μmol·L^(-1);化合物6、7、11、14、19对肝癌SMMC-7721显示细胞毒活性,IC_(50)分别为24.24、26.35、26.51、33.34、20.44μmol·L^(-1);化合物6和化合物19对乳腺癌MDA-MB-231显示细胞毒活性,IC_(50)分别为34.91、21.13μmol·L^(-1);化合物6、7、19对结肠癌SW480显示细胞毒活性,IC_(50)分别为36.03、39.97、5.52μmol·L^(-1)。该研究结果丰富了毛草龙的化学成分,为毛草龙抗肿瘤活性研究奠定了基础。

关键词：毛草龙壮药丁香蓼属 α -托可醌细胞毒活性

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格木寄生线虫中国新记录种——卡勒萨隐皮孢囊线虫Cryphodera kalesari

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植物保护 2019年第5期45卷 178-185页

作者：王宏洪蔡润得黄少彬廖金铃广东生态工程职业学院植物有害生物防控与生物环境健康技术研究中心广州510520 华南农业大学植物线虫研究室广州510642

在对广东省主要珍贵树种上的线虫进行调查时从格木Erythrophleum fordii上分离到一种隐皮孢囊线虫,经形态特征观察和测量数据分析,将其鉴定为卡勒萨隐皮孢囊线虫Cryphodera kalesari。其诊断特征为:雌虫椭圆形至近球形,头部具有1个唇盘... 详细信息

在对广东省主要珍贵树种上的线虫进行调查时从格木Erythrophleum fordii上分离到一种隐皮孢囊线虫,经形态特征观察和测量数据分析,将其鉴定为卡勒萨隐皮孢囊线虫Cryphodera kalesari。其诊断特征为:雌虫椭圆形至近球形,头部具有1个唇盘和2~3个唇环,口针长33.6~37.8μm,阴门唇突出,阴门与肛门之间区域凹陷,肛阴距为42~72μm;2龄幼虫头部具1个明显的唇盘和3个唇后环纹,口针长24.8~29.5μm,口针基部球前缘凹陷,侧区3条侧线,尾长圆锥形,长38~53.5μm,尾末端细圆,透明尾长17.1~25.1μm,侧尾腺孔位于肛门后2~5环;雄虫未发现。本研究首次获得了卡勒萨隐皮孢囊线虫的rDNA(LSU D2D3和ITS)序列,为此线虫的鉴定提供了可靠的分子数据。本研究还分析了卡勒萨隐皮孢囊线虫与本属其他种类的系统进化关系。卡勒萨隐皮孢囊线虫为中国的地理新记录种。格木为隐皮孢囊线虫的新寄主。

关键词：格木卡勒萨隐皮孢囊线虫形态学分子数据中国新记录

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环介导等温扩增法(LAMP)检测最短尾短体线虫

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华中农业大学学报 2018年第6期37卷 17-24页

作者：刘星彤林柏荣廖金铃卓侃华南农业大学农学院广州510642 洛阳科技职业学院洛阳471822 广东省微生物信号与作物病害防控重点实验室广州510642

为了快速、简便、准确地检测重要植物病原线虫—最短尾短体线虫(Pratylenchus brachyurus),依据GenBank中短体线虫的线粒体DNA细胞色素氧化酶I(mtDNA COI)序列,设计了扩增最短尾短体线虫的环介导等温扩增(loop-mediated isothermal ampl... 详细信息

为了快速、简便、准确地检测重要植物病原线虫—最短尾短体线虫(Pratylenchus brachyurus),依据GenBank中短体线虫的线粒体DNA细胞色素氧化酶I(mtDNA COI)序列,设计了扩增最短尾短体线虫的环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)引物,并对LAMP反应条件进行优化,成功建立了一种可特异、快速检测最短尾短体线虫的LAMP体系。该体系在64℃下反应60min,扩增效率最高。用琼脂糖凝胶电泳、酶切分析和SYBR Green Ⅰ染色均能特异检测到最短尾短体线虫的扩增产物。所建立的LAMP体系能从供试的9种短体线虫和另外10种植物线虫中特异检测出最短尾短体线虫,其灵敏度可检测到1/200条线虫DNA,是常规PCR的10倍。表明本研究建立的最短尾短体线虫的LAMP检测体系,可用于最短尾短体线虫的快速检测。

关键词：最短尾短体线虫环介导等温扩增线粒体DNA细胞色素氧化酶I 快速检测

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大学生冗思与学业成就的相关研究

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校园心理 2020年第6期18卷 510-513页

作者：廖金玲邹增丽广西贵港市平南县大安高级中学 537307

探讨大学生冗思与学业成就二者的相关关系,采用冗思反应方式量表(RRS)与学业成就自评量表对随机抽取的415名在校大学生进行问卷调查。结果显示,大学生冗思和学业成就二者之间呈负相关,大学生冗思水平可以在一定程度上负向预测大学生学... 详细信息

探讨大学生冗思与学业成就二者的相关关系,采用冗思反应方式量表(RRS)与学业成就自评量表对随机抽取的415名在校大学生进行问卷调查。结果显示,大学生冗思和学业成就二者之间呈负相关,大学生冗思水平可以在一定程度上负向预测大学生学业成就。

关键词：大学生冗思学业成就

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