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Chinese Medical Journal 2022年第1期135卷 113-115页

作者： Jingjun Huang Mingyue Cai Wensou Huang Yongjian Guo jingwen zhou Licong Liang Liteng Lin Zhimei zhou Hui Lian Mingji He Kangshun Zhu Department of Minimally Invasive Interventional Radiology The Second Affiliated Hospital of Guangzhou Medical UniversityGuangzhouGuangdong 510260China Department of Radiology The Second Affiliated Hospital of Guangzhou Medical UniversityGuangzhouGuangdong 510260China

To the Editor:Portal vein tumor thrombus(PVTT)is present in 10%to 40%of patients with hepatocellular carcinoma(HCC)at diagnosis and has a profound adverse effect on progno-sis.[1]Sorafenib is recommended as the first-line treatment for patients with advanced HCC,including those who have ***,its efficacy is modest.[1,2]A combination of transarterial chemoembolization(TACE)and sorafenib(TACE-S)has been reported to be associated with improved outcomes.[1,3]But unfortunately,its efficacy in controlling PVTT remained limited,with an objective response rate(ORR)of only 9.7%.[3]Previous studies have demonstrated that iodine-125(125I)seed brachytherapy targeting PVTT can lead to a significant reduction in tumor thrombus with few complications.[4,5]We hypothesized that TACE-S combined with 125I seed brachytherapy(TACE-S-I)could improve the control of PVTT and confer a greater survival ***,we conducted this study to evaluate the efficacy and safety of TACE-S-I compared with TACE-S in HCC patients with *** study was approved by our institutional review board(No.2020-hg-ks-03).

关键词： arterial sorafenib diagnosis

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维生素C生物合成相关脱氢酶研究进展

生物工程学报 2021年第6期37卷 1827-1844页

作者：陈玥周景文陈坚江南大学粮食发酵工艺与技术国家工程实验室江南大学未来食品科学中心

维生素C是一种人体必需的维生素,在食品制药等领域拥有巨大的市场。工业上维生素C主要以微生物发酵生产的2-酮基-L-古龙酸为前体,然后通过内酯化反应获得。微生物发酵中,山梨糖途径和葡萄糖酸途径因为转化率高一直是研究的热点。文中从... 详细信息

维生素C是一种人体必需的维生素,在食品制药等领域拥有巨大的市场。工业上维生素C主要以微生物发酵生产的2-酮基-L-古龙酸为前体,然后通过内酯化反应获得。微生物发酵中,山梨糖途径和葡萄糖酸途径因为转化率高一直是研究的热点。文中从维生素C生物合成相关脱氢酶的角度阐述了:山梨糖途径和葡萄糖酸途径中关键脱氢酶在定位、底物谱、辅因子和电子传递上的特点;山梨糖途径和葡萄糖酸途径中面临的主要问题和改造策略等。最后讨论了维生素C生物合成中山梨糖途径和葡萄糖酸途径可能的研究方向。

关键词：维生素C 2-酮基-L-古龙酸脱氢酶山梨糖葡萄糖酸微生物发酵生产

水飞蓟来源黄酮3-羟化酶鉴定及黄杉素发酵优化

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生物工程学报 2020年第12期36卷 2838-2849页

作者：高松周景文陈坚江南大学粮食发酵工艺与技术国家工程实验室江苏无锡214122 江南大学生物工程学院江苏无锡214122

黄杉素是一种重要的黄酮类化合物,具有抗炎症、抗氧化等功效,在医药及保健品行业有着广泛的应用。黄酮3-羟化酶(Flavanone 3-hydroxylase,F3H)可以催化圣草酚合成黄杉素等3位羟基化的黄酮类化合物。一直以来,由于黄酮3-羟化酶催化效率低... 详细信息

黄杉素是一种重要的黄酮类化合物,具有抗炎症、抗氧化等功效,在医药及保健品行业有着广泛的应用。黄酮3-羟化酶(Flavanone 3-hydroxylase,F3H)可以催化圣草酚合成黄杉素等3位羟基化的黄酮类化合物。一直以来,由于黄酮3-羟化酶催化效率低,使得利用微生物法合成黄杉素等多种3位羟基化黄酮的产量较低。文中从水飞蓟转录组中鉴定得到一个黄酮3-羟化酶SmF3H。发酵验证结果表明,SmF3H具有黄酮3位羟基化功能,且催化效率显著高于常用的来源于番茄(Solanum lycopersicum)的SlF3H。选取6个转录强度不同的启动子优化从黄酮前体柚皮素到黄杉素的合成途径,发现PGAL7启动子起始转录SmF3H时黄杉素合成产量最高,在摇瓶中产量达到695.90 mg/L;在5-L发酵罐上进行发酵优化,以柚皮素为底物发酵得到3.54 g/L黄杉素,是目前可见报道的最高产量。

关键词：黄酮 3-羟化酶黄杉素圣草酚柚皮素酿酒酵母

多学科交叉背景下人工智能融入“合成生物学”课程教学的设计与实践

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生物工程学报 2024年第9期40卷 3282-3295页

作者：王锴栾小丽周景文江南大学物联网工程学院江苏无锡214122 江南大学生物工程学院江苏无锡214122 江南大学未来食品科学中心江苏无锡214122

近年来,人工智能赋能合成生物学迅速发展,特别是在蛋白质结构模拟与预测、调控元件与代谢网络设计与优化等方面展现了巨大的潜力。加强人工智能融入“合成生物学”课程的教学,顺应合成生物学前沿发展趋势,将有效推动多学科高水平复合型... 详细信息

近年来,人工智能赋能合成生物学迅速发展,特别是在蛋白质结构模拟与预测、调控元件与代谢网络设计与优化等方面展现了巨大的潜力。加强人工智能融入“合成生物学”课程的教学,顺应合成生物学前沿发展趋势,将有效推动多学科高水平复合型人才培养与协同创新。本文从构建多学科融合的课程内容体系与教学模式、兼顾人工智能基础及其在合成生物学的应用、培养自主学习与创新实践能力、加强人工智能相关的科技伦理教育等方面,阐述了人工智能融入“合成生物学”课程的教学理念。在此基础上,从人工智能基础的补充、人工智能融入“合成生物学”的课堂教学内容、人工智能融入实验教学内容这三个方面,设计了人工智能与“合成生物学”课程内容融合的体系。进而结合教学理念与内容构设,并以江南大学“合成生物学”课程为例,阐述了多学科交叉背景下人工智能融入课程的建设路径。最后,对于教学的预期成效进行了展望。

关键词： “合成生物学”课程人工智能学科交叉教学改革

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吡咯喹啉醌高通量检测方法的建立与优化

食品与生物技术学报 2017年第2期36卷 122-128页

作者：夏雨周景文陈坚江南大学工业生物技术教育部重点实验室江苏无锡214122 江南大学生物工程学院江苏无锡214122

吡咯喹啉醌(Pyrroloquinoline quinone,PQQ)是一种新型辅酶,具有广阔的应用前景。传统PQQ检测方法在检测发酵液中PQQ浓度时都存在一定的缺陷,且检测效率偏低。本研究在大肠杆菌(Escherichia coli BL21(DE3))中表达*** K-12来源的葡萄糖... 详细信息

吡咯喹啉醌(Pyrroloquinoline quinone,PQQ)是一种新型辅酶,具有广阔的应用前景。传统PQQ检测方法在检测发酵液中PQQ浓度时都存在一定的缺陷,且检测效率偏低。本研究在大肠杆菌(Escherichia coli BL21(DE3))中表达*** K-12来源的葡萄糖脱氢酶(PQQGDH),并通过亲和层析分离纯化PQQGDH,得到了高浓度、高纯度的PQQGDH。通过酶液和PQQ样品用量的双因素正交实验对传统重组酶法的反应体系加以改进,得到适用于96孔板高通量检测的反应体系。结果表明30μL纯化后酶液、2μL PQQ样品配合1.2 m L的显色剂组成的显色体系检测效果最佳。该方法线性范围大且具有较高的精确度和重现性。本研究中利用高浓度、高纯度的PQQGDH配合96孔板和酶标仪,所建立的PQQ高通量检测方法,不仅降低了实验误差,而且大幅提高了PQQ发酵液样品的检测效率。

关键词：吡咯喹啉醌葡萄糖脱氢酶亲和纯化重组酶法检测高通量检测

基于时差效用的双目标资源约束型鲁棒性项目调度优化

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系统管理学报 2018年第2期27卷 299-308页

作者：张静文周杉乔传卓西北工业大学管理学院西安710072

进度计划的稳定性对不确定环境下项目的顺利实施具有重要影响。从活动自由时差效用函数的新视角度量调度方案的鲁棒性,进而,同时考虑项目工期和鲁棒性两个目标函数,构建了基于时差效用的双目标资源约束型鲁棒性项目调度优化模型(BORRCP... 详细信息

进度计划的稳定性对不确定环境下项目的顺利实施具有重要影响。从活动自由时差效用函数的新视角度量调度方案的鲁棒性,进而,同时考虑项目工期和鲁棒性两个目标函数,构建了基于时差效用的双目标资源约束型鲁棒性项目调度优化模型(BORRCPSP)。针对模型的NP-hard和多目标组合优化特征,设计一种调整的快速非支配性排序多目标遗传进化算法(NSGA-II)求解模型。基于PSPLIB中的480个标准算例进行大规模数值仿真测试。采用获得Pareto最优解集合的算例比率、与最优工期的偏差以及Pareto最优解集合的规模和计算时间作为4个评价指标,实验数据的统计结果验证了BORRCPSP模型和调整的NSGA-II算法的有效性。结论表明,BORRCPSP的Pareto最优解集合可以给项目经理综合考虑项目工期和进度计划的稳定性提供定量化决策依据。

关键词：鲁棒性双目标调度方案效用函数约束型调度优化

柚皮素合成关键基因表达水平对目标产物积累水平的量化影响

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生物工程学报 2019年第7期35卷 1256-1265页

作者：焦亭亭周景文徐沙江南大学粮食发酵工艺与技术国家工程实验室江苏无锡214122 江南大学生物工程学院江苏无锡214122

柚皮素是一种天然黄酮类化合物,具有抗炎、抗氧化、抗病毒、预防动脉粥样硬化等多种药理活性,也是其他黄酮类化合物合成的重要前体,具有重要的应用价值。目前,微生物法生产柚皮素等黄酮类化合物由于代谢通路不平衡等原因导致产量较低,... 详细信息

柚皮素是一种天然黄酮类化合物,具有抗炎、抗氧化、抗病毒、预防动脉粥样硬化等多种药理活性,也是其他黄酮类化合物合成的重要前体,具有重要的应用价值。目前,微生物法生产柚皮素等黄酮类化合物由于代谢通路不平衡等原因导致产量较低,在很大程度上限制了其工业应用。文中以一株产柚皮素的酿酒酵母菌株Y-01为研究对象,利用启动子和拷贝数控制柚皮素合成代谢途径关键酶4-香豆酸:CoA连接酶(4CL)、查尔酮合成酶(CHS)和查尔酮异构酶(CHI)编码基因的表达水平,考察这些基因的表达水平对目标产物积累水平的量化影响。结果表明,柚皮素产量与4CL或CHI编码基因的表达量之间关联性较低,而与chs基因的表达量存在显著的正相关性。通过调控chs基因的表达水平,获得一株高产柚皮素的酿酒酵母工程菌株Y-04,产量较出发菌株Y-01提高了4.1倍。研究结果表明,CHS是柚皮素合成过程的关键调控靶点,合理调控CHS表达可以显著促进酿酒酵母积累柚皮素。相关结果为采用代谢工程强化微生物合成柚皮素等重要黄酮类化合物提供了重要的理论参考。

关键词：柚皮素表达量关键基因启动子拷贝数

生长曲线模型中参数的Bayes线性无偏估计

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应用概率统计 2008年第6期24卷 639-647页

作者：周静雯韦来生中国科学技术大学统计与金融系合肥230026

本文在平方损失下导出了生长曲线模型中参数的Bayes线性无偏估计(LUE),并在均方误差矩阵(MSEM)准则下研究了Bayes LUE相对于广义最小二乘估计(GLSE)的优良性.对于非满秩情形,获得了可估函数的Bayes LUE并讨论了其优良性问题.

关键词：生长曲线模型 Bayes线性无偏估计广义最小二乘估计均方误差矩阵准则

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代谢工程改造酿酒酵母合成玉米黄质

食品与发酵工业 2024年第5期50卷 1-6页

作者：赵崇屹周景文徐沙江南大学粮食发酵工艺与技术国家工程实验室江苏无锡214122 江南大学生物工程学院江苏无锡214122 江南大学未来食品科学中心江苏无锡214122

玉米黄质是一种类胡萝卜素,在很多领域都有一定的应用。该研究在前期构建的脂质体积累酿酒酵母的基础上,表达玉米黄质合成酶,初步得到一株能够积累玉米黄质的酿酒酵母工程菌。进一步优化补料碳源、补料时间和补料方式,最终在5 L的发酵罐... 详细信息

玉米黄质是一种类胡萝卜素,在很多领域都有一定的应用。该研究在前期构建的脂质体积累酿酒酵母的基础上,表达玉米黄质合成酶,初步得到一株能够积累玉米黄质的酿酒酵母工程菌。进一步优化补料碳源、补料时间和补料方式,最终在5 L的发酵罐从48 h开始以指数流加的方式流加葡萄糖,得到玉米黄质的产量为47.7 mg/L。综上,该研究构建了一株高产玉米黄质重组菌并对其进行了发酵验证,研究结果为后续进行发酵优化提供了基础以及改进的方向。

关键词：玉米黄质指数流加酿酒酵母脂质载体补加葡萄糖

氧化葡萄糖酸杆菌产2-酮基-D-葡萄糖酸的发酵过程优化

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食品与发酵工业 2019年第11期45卷 40-45页

作者：蔡文曾伟主周景文国家工程实验室(江南大学)

2-酮基- D -葡萄糖酸(2-keto-D-gluconic acid,2-KGA)可作为食品添加剂、照片显影剂、洗涤剂等,也是合成 D -异抗坏血酸的重要前体。为提高2-KGA的产量及转化率,对2-KGA发酵生产工艺条件进行优化。从5株野生菌株中筛选出最优菌株 Glucon... 详细信息

2-酮基- D -葡萄糖酸(2-keto-D-gluconic acid,2-KGA)可作为食品添加剂、照片显影剂、洗涤剂等,也是合成 D -异抗坏血酸的重要前体。为提高2-KGA的产量及转化率,对2-KGA发酵生产工艺条件进行优化。从5株野生菌株中筛选出最优菌株 Gluconobacter japonicus CGMCC 1.49,在摇瓶上进行培养基以及培养条件的优化。在此基础上,在3 L发酵罐中进行发酵优化实验,提高2-KGA的产量。当葡萄糖质量浓度为100 g/L,玉米浆粉质量浓度为20 g/L,发酵温度为30 ℃时,摇瓶水平发酵产量为76.3 g/L,较优化前提高了120.0%。在3 L发酵罐上控制恒定pH值为6、溶氧浓度30%条件下,一次性补料发酵产量最高为122.1 g/L,较摇瓶水平提高了26.7%,转化率达75.5%。研究表明,发酵过程优化对提高野生菌株产2-KGA是一种行之有效的方法,优化结果可为后续的放大实验节省发酵成本,为氧化葡萄糖酸杆菌产2-KGA的工业化生产奠定了基础。

关键词：氧化葡萄糖酸杆菌 2-酮基-D-葡萄糖酸过程控制发酵优化补料发酵