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Draft Genome of White-blotched River Stingray Provides Novel Clues for Niche Adaptation and Skeleton Formation

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Genomics, Proteomics & Bioinformatics 2023年第3期21卷 501-514页

作者： jingqi zhou Ake Liu Funan He Yunbin Zhang Libing Shen Jun Yu Xiang Zhang School of Public Health Shanghai Jiao Tong University School of MedicineShanghai 200025China Department of Life Sciences Changzhi UniversityChangzhi 046011China Greehey Children’s Cancer Research Institute UT Health San AntonioSan AntonioTX 78229USA State Key Laboratory of Cell Biology Shanghai Key Laboratory of Molecular AndrologyShanghai Institute of Biochemistry and Cell BiologyCenter for Excellence in Molecular Cell ScienceChinese Academy of SciencesShanghai 200031China International Human Phenome Institutes(Shanghai) Shanghai 200433China Institute of Neuroscience Center for Excellence in Brain Science and Intelligence TechnologyChinese Academy of SciencesShanghai 200031China Beijing Institute of Genomics Chinese Academy of Sciences and China National Center for BioinformationBeijing 100101China University of Chinese Academy of Sciences Beijing 100049China Shanghai Nanmulin Biotechnology Company Limited Shanghai 200031China

The white-blotched river stingray(Potamotrygon leopoldi)is a cartilaginous fish native to the Xingu River,a tributary of the Amazon River *** a rare freshwater-dwelling cartilaginous fish in the Potamotrygonidae family in which no member has the genome sequencing information available,*** provides the evolutionary details in fish phylogeny,niche adaptation,and skeleton *** this study,we present its draft genome of 4.11 Gb comprising 16,227 contigs and 13,238 scaffolds,with contig N50 of 3937 kb and scaffold N50 of 5675 kb in *** analysis shows that *** is a slow-evolving fish that diverged from elephant sharks about 96 million years ***,two gene families related to the immune system(immunoglobulin heavy constant delta genes and T-cell receptor alpha/delta variable genes)exhibit expansion in *** *** also identified the Hox gene clusters in *** and discovered that seven Hox genes shared by five representative fish species are missing in *** RNA sequencing data from *** and other three fish species demonstrate that fishes have a more diversified tissue expression spectrum when compared to *** functional studies suggest that lack of the gc gene encoding vitamin D-binding protein in cartilaginous fishes(both *** and Callorhinchus milii)could partly explain the absence of hard bone in their ***,this genome resource provides new insights into the niche adaptation,body plan,and skeleton formation of ***,as well as the genome evolution in cartilaginous fishes.

关键词： White-blotched river stingray Potamotrygon leopoldi De novo genome assembly Vitamin D-binding protein Niche adaptation

Characteristics and classification of paleozoic tight reservoirs in the central uplift of the South Yellow Sea Basin

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Energy Geoscience 2022年第4期3卷 383-393页

作者： Yumao Pang Xingwei Guo Xiangchun Chang Junjian Zhang jingqi zhou Laixing Cai Shandong Provincial Key Laboratory of Depositional Mineralization and Sedimentary Minerals Shandong University of Science and TechnologyQingdaoShandong266590China Laboratory for Marine Mineral Resources Qingdao National Laboratory for Marine Science and TechnologyQingdaoShandong266237China Qingdao Institute of Marine Geology QingdaoShandong266071China Key Laboratory of Marine Geology and Environment Institute of OceanologyChinese Academy of SciencesQingdaoShandong266071China

Several sets of Paleozoic tight reservoirs are developed in the Central Uplift of the South Yellow Sea Basin.A qualitative analysis of the microscopic pore structure of the tight reservoir rocks was carried out through cast thin slice and scanning electron microscopic image *** on reservoir pet-rophysical properties,thirty core samples in the Central Uplift of the South Yellow Sea Basin were selected for high-pressure mercury intrusion(HPMI)analysis,which was then combined with fractal calculation to classify and evaluate the tight *** analysis of the HPMI curves and related parameters shows that the Paleozoic tight reservoirs can be divided into three types:Type-A,Type-B and ***-A sandstone reservoirs contain pores with size mostly ranging between 0.01 and 0.1 mm,followed by pores with size range of 0.001-0.01 m m,and relatively fewer pores larger than 0.1 m *** Type-B reservoirs are carbonate rocks with extremely heterogeneous pore size distribution,which is closely related to the development of dissolution pores and ***-C sandstone reservoirs are dominated by nanopores and submicron pores that distribute more heterogeneously than pores in Type-A *** pore distribution in sandstone reservoirs shows significant fractal characteristics and is closely related to the pore *** heterogeneity of nanopore distribution has a negative cor-relation with porosity and median pressure and a relatively weak correlation with *** study has important implications for petroleum exploration in the South Yellow Sea Basin.

关键词： South Yellow Sea Basin Tight reservoir High-pressure mercury injection Fractal characteristics

Effects of Zingber mioga Aqueous Extract on Hepatic Anti-alcoholism in Mice

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Medicinal Plant 2020年第2期11卷 58-60,72页

作者： Xuewei DUAN Yuling HE jingqi zhou Wei TIAN Department of Forestry and Biotechnology State Key Laboratory of Forest Culture Cultivation Base Natural Medicine Laboratory Zhejiang Agriculture and Forestry University Hangzhou 311300 China

[Objectives]To study the anti-alcoholism effects of Zingber mioga(Thunb)Rosc aqueous extract(ZME)in drunken mice.[Methods]After all animals were administered with red star Erguotou by gavage to drunk,orally given ZME[0.4 mL/(10 g·BW)]or isometric *** Drinking[0.5 mL/(10 g·BW)]was used as positive control to compare the anti-alcoholism *** the time of righting reflex and climbing test,the activity of ADH and ALDH were measured.[Results]ZME(0.4 mL/10 g)can accelerate ethanol metabolism,also reduce the sober time and extend the time of climbing ***,the activity of alcohol dehydrogenase(ADH)and acetaldehyde dehydrogenase(ALDH)were obviously increased in mouse *** lower ethanol and acetaldehyde concentrations in the assay systems after enzyme reactions mean higher ADH and ALDH activities.[Conclusions]ZME can prevent drunkenness by enhancing the activities of ADH and ALDH in liver.

关键词： Anti-alcoholism Mice ADH ALDH Metabolism

城乡一体化进程中农村社区图书馆的可持续发展研究

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图书馆 2014年第6期 105-109页

作者：周菁齐阮海红浙江传媒学院图书馆浙江杭州310018

农村社区基层图书馆是衡量一个国家图书馆事业发展水平的必要要素。在城乡一体化进程中要引领农村读者群体实现普遍均等服务,其中可持续发展问题尤为突出。文章整体把握国内外农村社区图书馆的研究概况,剖析国内农村社区图书馆研究的不... 详细信息

农村社区基层图书馆是衡量一个国家图书馆事业发展水平的必要要素。在城乡一体化进程中要引领农村读者群体实现普遍均等服务,其中可持续发展问题尤为突出。文章整体把握国内外农村社区图书馆的研究概况,剖析国内农村社区图书馆研究的不足之处,从制高点、着力点、突破点、切入点四个方面来厘清可持续发展研究的若干问题并进行对策研究,指出了探索可持续发展问题的新模式。

关键词：农村图书馆社区图书馆农家书屋可持续发展

一种污泥活性炭的制备及其在兰炭废水处理中的应用

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环境工程学报 2016年第11期10卷 6337-6342页

作者：段婧琦刘永军周璐刘羽西安建筑科技大学环境与市政工程学院西安710055

以城市生活污水厂脱水污泥和木屑的混合物为原料,利用ZnCl_2为活化剂制备污泥活性炭。研究了活化温度、活化时间、固液比和活化剂浓度对吸附性能的影响。在活化温度为650℃、活化时间30 min、固液比1∶1.5、活化剂浓度为5 mol·L^(-1)... 详细信息

以城市生活污水厂脱水污泥和木屑的混合物为原料,利用ZnCl_2为活化剂制备污泥活性炭。研究了活化温度、活化时间、固液比和活化剂浓度对吸附性能的影响。在活化温度为650℃、活化时间30 min、固液比1∶1.5、活化剂浓度为5 mol·L^(-1)的最佳工艺条件下,制备得到的活性炭碘吸附值为584.85 mg·g^(-1),利用扫描电镜可以观察到其发达的孔隙结构。将制备的污泥活性炭应用于兰炭废水处理中,结果表明,污泥活性炭的投加量为180 g·L^(-1),pH为7,吸附时间60min,挥发酚和氨氮的去除率分别为73.38%和48.27%,废水中污染物浓度明显降低。

关键词：污泥活性炭兰炭废水挥发酚氨氮

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全民阅读理念下微阅读价值的辩证思考

高等继续教育学报 2016年第6期29卷 33-37页

作者：周静琦曲阜师范大学职业与成人教育学院山东曲阜273165

全民阅读自提出以来,逐渐受到各方的重视,发展迅速。微阅读作为全民阅读的主要推动力,在全民阅读活动中发挥着重要的作用。然则,微阅读的弊端也十分明显,这就需要我们辩证地看待微阅读,找到微阅读与传统阅读最佳的契合点以及微阅读在全... 详细信息

全民阅读自提出以来,逐渐受到各方的重视,发展迅速。微阅读作为全民阅读的主要推动力,在全民阅读活动中发挥着重要的作用。然则,微阅读的弊端也十分明显,这就需要我们辩证地看待微阅读,找到微阅读与传统阅读最佳的契合点以及微阅读在全民阅读推广过程中正确的角色定位,实现全民阅读的可持续发展。

关键词：全民阅读微阅读价值思考

NSE、CEA、CYFRA21-1与GP73对肺癌的诊断价值

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中国实用医刊 2017年第1期44卷 70-73页

作者：周竞奇河南省济源市人民医院 454650

目的探讨血清肿瘤标志物神经元特异性烯醇化酶（NSE）、癌胚抗原（CEA）、细胞角蛋白19片段（CYFRA21-1）与高尔基蛋白73（GP73）在肺癌诊断中的临床价值。方法选取58例肺癌患者，分为鳞癌、腺癌和小细胞肺癌（SCLC）三组，采用电化学... 详细信息

目的探讨血清肿瘤标志物神经元特异性烯醇化酶（NSE）、癌胚抗原（CEA）、细胞角蛋白19片段（CYFRA21-1）与高尔基蛋白73（GP73）在肺癌诊断中的临床价值。方法选取58例肺癌患者，分为鳞癌、腺癌和小细胞肺癌（SCLC）三组，采用电化学发光法检测各组间与24例肺良性疾病和39例健康体检者血清中的NSE、CEA和CYFRA21-1水平，采用酶联免疫吸附法（ELISA）检测其血清中GP73的水平，并对结果进行统计学分析。结果肺癌组CEA、NSE、CYFRA21-1和GP73含量均高于肺良性病变组和正常组（P〈0.05）。GP73的含量在肺腺癌中最高，敏感度为88.21%；NSE的含量在小细胞肺癌（SCLC）中升高最为明显，敏感度为83.07%；CYFRA21-1以肺鳞癌增高为主，敏感度为80.00%。四项血清肿瘤标志物在肺癌检测中的敏感性依次为GP73（72.31%）、CYFRA21-19（51.29）、CEA（48.67%）、NSE（39.76%）；GP73、CEA、NSE和CYFRA21-1检测肺癌的ROC曲线下面积（AUC）依次为0.892±0.042，0.852±0.050，0.763±0.061，0.691±0.067。结论NSE对SCLC，CYFRA21-1对鳞癌，CEA对肺癌均有较大的辅助诊断价值，但是GP73对肺癌的诊断效能最高，对其进行监测可以有利于肺癌的早期诊断。

关键词：神经元特异性烯醇化酶癌胚抗原细胞角蛋白19片段高尔基蛋白73 肺癌诊断肿瘤标志物

子宫内膜癌中P53、Ki-67和CA125的表达

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肿瘤基础与临床 2017年第1期30卷 23-26页

作者：周竞奇济源市人民医院河南济源459000

目的探讨子宫内膜癌组织中P53、Ki-67和血清中CA125的表达及其临床意义。方法采用免疫组化染色检测35例子宫内膜癌(试验组)和30例子宫内膜增生(对照组)组织中P53和Ki-67蛋白表达情况,并采用放射免疫法测定2组患者血清中CA125水平。结果 ... 详细信息

目的探讨子宫内膜癌组织中P53、Ki-67和血清中CA125的表达及其临床意义。方法采用免疫组化染色检测35例子宫内膜癌(试验组)和30例子宫内膜增生(对照组)组织中P53和Ki-67蛋白表达情况,并采用放射免疫法测定2组患者血清中CA125水平。结果 P53蛋白在试验组有22例呈阳性表达,Ki-67蛋白有24例呈阳性表达,且两者在对照组均呈阴性表达(P<0.05)。血清CA125水平在试验组为(32.19±12.35)u·L^(-1),高于对照组的(8.23±2.58)u·L-1(P<0.05)。结论 P53、Ki-67和CA125在子宫内膜癌的发生、发展中起着重要的作用,三者联合检测不但可以指导临床治疗,同时也可用于观察疗效和判断预后。

关键词：子宫内膜癌 P53 CA125 Ki-67 免疫组化染色

Neuropilin1单克隆抗体对胶质瘤大鼠Bcl-2/Bax表达的影响

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现代肿瘤医学 2019年第19期27卷 3373-3377页

作者：周竞奇济源市人民医院病理科

目的:研究Neuropilin1单克隆抗体对胶质瘤大鼠Bcl-2/Bax表达的影响。方法:将36只SD大鼠随机分为假手术组、模型组和治疗组,每组12只;假手术组只行颅骨开窗手术,其余各组均建立胶质细胞瘤模型。模型组腹腔注射0.9%氯化钠,治疗组腹腔注射N... 详细信息

目的:研究Neuropilin1单克隆抗体对胶质瘤大鼠Bcl-2/Bax表达的影响。方法:将36只SD大鼠随机分为假手术组、模型组和治疗组,每组12只;假手术组只行颅骨开窗手术,其余各组均建立胶质细胞瘤模型。模型组腹腔注射0.9%氯化钠,治疗组腹腔注射NRP-1 MAb,均每日1次。干预14天后取材。对肿瘤组织称重,免疫组化检测Bax和Bcl-2表达,Western blot检测NRP-1蛋白、Bax蛋白和Bcl-2蛋白表达量,qPCR检测Bax mRNA和Bcl-2 mRNA表达情况,TUNEL检测细胞凋亡情况。结果:假手术组无肿瘤,治疗组肿瘤组织重量显著小于模型组,差异具有统计学意义(P<0.05)。免疫组化显示:与假手术组比较,模型组和治疗组Bax表达显著下降,Bcl-2表达显著上升,差异具有统计学意义(P<0.05);与模型组比较,治疗组Bax表达上升,Bcl-2表达下降,差异具有统计学意义(P<0.05)。Western blot检测显示:与假手术组比较,模型组和治疗组NRP-1蛋白和Bcl-2蛋白表达量显著上升,Bax蛋白表达量显著下降,差异具有统计学意义(P<0.05);与模型组比较,治疗组NRP-1蛋白和Bcl-2蛋白表达量显著下降,Bax蛋白表达量显著上升,差异具有统计学意义(P<0.05)。qPCR检测显示:与假手术组比较,模型组和治疗组Bax mRNA表达显著下降,Bcl-2mRNA表达显著上升,差异具有统计学意义(P<0.05);与模型组比较,治疗组Bax mRNA表达上升,Bcl-2mRNA表达下降,差异具有统计学意义(P<0.05)。TUNEL检测显示:与假手术组比较,模型组和治疗组的细胞凋亡率显著上升,差异具有统计学意义(P<0.05);与模型组比较,治疗组的细胞凋亡率显著下降,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论:NRP-1MAb可通过抑制NRP-1表达而上调Bax蛋白表达,下调Bcl-2蛋白表达促进胶质细胞瘤凋亡。

关键词：胶质细胞瘤凋亡 Neuropilin1 Bax Bcl-2