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A GmNINa-miR172c-NNC1 Regulatory Network Coordinates the Nodulation and Autoregulation of Nodulation Pathways in Soybean

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Molecular Plant 2019年第9期12卷 1211-1226页

作者： Lixiang Wang Zhengxi Sun Chao Su Yongliang Wang Qiqi Yan jiahuan chen Thomas Ott Xia Li State Key Laboratory of Agricultural Microbiology College of Plant Science and TechnologyHuazhong Agricultural UniversityNo.1 Shizishan RoadHongshan DistrictWuhanHubei 430070P.R.China College of Biological Science and Engineering Panzhihua UniversityNo.10 Airport RoadEastern DistrictPanzhihuaSichuanChina University of Freiburg.Faculty of Biology.University of Freiburg Schdnz丨estrasse 179104 Freiburg.Germany CIBSS-Centre for Integrative Biological Signalling Studies University of Freiburg79104 FreiburgGermany

Symbiotic root nodules are root lateral organs of plants in which nitrogen-fixing bacteria(rhizobia)convert atmospheric nitrogen to *** formation and number of nodules in legumes are precisely controlled by a rhizobia-induced signal cascade and host-controlled autoregulation of nodulation(AON).However,how these pathways are integrated and their underlying mechanisms are ***,we report that microRNA172c(miR172c)activates soybean(Glycine max)R hizobia-induced CLE1(GmRICI)and GmRIC2 by removing the transcriptional repression of these genes by Nodule Number Control 1(NNC1),leading to the activation of the AON ***1 interacts with GmNINa,the soybean ortholog of Lotus NODULE INCEPTION(NIN),and hampers its transcriptional activation o i G m RICI and ***,GmNINa acts as a transcriptional activator of ***,NNC1 can transcriptionally repress miR172c expression,adding a negative feedback loop into the NNC1 regulatory ***,GmNINa interacts with NNC1 and can relieve the NNC1-mediated repression of miR172c ***,the GmNINa-miR172c-NNC1 network is a master switch that coordinately regulates and optimizes NF and AON signaling,supporting the balance between nodulation and AON in soybean.

关键词： nodule number autoregulation of nodulation miR172c-NNC1 negative feedback loop nodule inception

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Edge Detection Based on Generative Adversarial Networks

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Journal of New Media 2020年第2期2卷 61-77页

作者： Xiaoyan chen jiahuan chen Zhongcheng Sha Nanjing University of Information Science and Technology Nanjing210044China

Aiming at the problem that the detection effect of traditional edge detection algorithm is not good,and the problem that the existing edge detection algorithm based on convolution network cannot solve the thick edge problem from the model itself,this paper proposes a new edge detection method based on the generative adversarial *** confrontation network consists of generator network and discriminator network,generator network is composed of U-net network and discriminator network is composed of five-layer convolution *** this paper,we use BSDS500 training data set to train the ***,several images are randomly selected from BSDS500 test set to compare with the results of traditional edge detection algorithm and HED *** results of BSDS500 benchmark test show that the ODS and OIS indices of the proposed method are 0.779 and 0.782 respectively,which are much higher than those of traditional edge detection algorithms,and the indices of HED algorithm using non-maximum suppression are similar.

关键词： Edge detection generative adversarial network computer vision image processing

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Multi-omics analyses of G6PD deficiency variants in Chinese population

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Journal of Genetics and Genomics 2024年第1期51卷 100-104页

作者： He Ji jiahuan chen Peide Huang Zhimin Feng Weining Hu Mengyao Dai Xiaohui Sun Xiao Jin Guangquan chen Guang Ning Lin Li Weiqing Wang Yanan Cao Department of Endocrine and Metabolic Diseases Shanghai Institute of Endocrine and Metabolic DiseasesNational Clinical Research Centre for Metabolic DiseasesState Key Laboratory of Medical GenomicsResearch Unit of Clinical and Basic Research on Metabolic Diseases of Chinese Academy of Medical SciencesRuijin Yangtze River Delta Health InstituteWuxi Branch of Ruijin HospitalRuijin HospitalShanghai Jiao Tong University School of MedicineShanghai 200025China National Research Center for Translational Medicine National Key Scientific Infrastructure for Translational MedicineShanghai Jiao Tong UniversityShanghai 200240China SJTU-BGI Innovation Research Center Shanghai 200240China BGI-ShenZhen ShenzhenGuangdong 518083China

Glucose-6-phosphate dehydrogenase(G6PD)deficiency is one of the most prevalent hereditary and X-linked enzyme disorders caused by the pathogenetic G6PD(NM_001042351.2)variants(Yang et al.,2016).The clinical manifestations of G6PD deficiency offer a wide spectrum of diverse disease phenotypes(Hecker et al.,2013).Investigations of prevalence and molecular epidemiology demonstrate that G6PD deficiency affects over 400 milion individuals worldwide and leads to thousands of deaths annually(Mortality and Causes of Death,2015).

关键词： al. G6PD epidemiology

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Comparative Profiling of Coral Symbiont Microbial Communities from the South China Sea and Moorea

Comparative Profiling of Coral Symbiont Microbial Communitie...

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中国生物工程学会第六次全国会员代表大会暨第九届学术年会

作者：韩毛振 Yanhai Gong jiahuan chen 宁康华中科技大学生命科学与技术学院 Bioinformatics Group of Single Cell Center Shandong Key Laboratory of Energy Genetics and CAS Key Laboratory of BiofuelsQingdao Institute of Bioenergy and Bioprocess TechnologyChinese Academy of Sciences School of Life Science and Technology Huazhong University of Science and Technology College of Marine Life Ocean University of China 华中科技大学生物信息系

Coral reefs represent one of the richest ocean micro-scale environments that include diverse collection of both basic and advanced *** of the microbial communities that live with coral reefs could help to answer key ecological questions about coral *** connection of community structure and the environmental factors would also provide clues for important chemical *** this work,we have collected sequencing data associated with coral reef microbial communities collected from two distinct geological locations:the South China Sea and Moorea.A number of 25 coral reefs samples were collected,and categorized into 7 groups:Porites Iutea(Pl),Galaxea fascicularis(Gf),Acropora millepora(Am),Paopao Bay,Fore reef,Back reef and Fringing reef,from the datasets downloaded from NCBI(SRR82519 and SRP007926).The number of reads ranged from 554 to 23,858 in each ***,199,860 reads were remained after quality filtering and clustered into 2,149 different *** sequences were grouped under 31 high-level taxonomic groups at the phylum ***,the microbial communities from these two locations were largely different and the species with different abundances,especially cyanobacteria,were found to be indicators that could reflect human activities and coral reefs’ health *** dominant phyla (Proteobacteria,Firmicutes and Bacteroidetes) comprised 58.6% and 71.0% of the Pl and Gf communities,***,for Am,three dominant phyla(Proteobacteria,Firmicutes and Deinococcus-Thermus) comprised 97.3% of the communities and 2 predominant phylum(Proteobacteria and Cyanobacteria) comprised 80.95% of the A,B,C,D,E and H sites ***,the results of NMDS,PCoA and Clustering analysis showed that these samples could be divided into three groups:Am group,Moorea group and Pl+Gf group,and the results were consistent with the result of ***,based on Kruskal-Wallis test among classes and the pairwise Wilcoxon test amon

关键词： coral reefs microbial community symbiont cyanobacteria wellness indicators

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基于CPSOGSA算法的风-光-小水电微电网负荷频率最优H_(2)/H_(∞)鲁棒控制

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电力系统保护与控制 2022年第11期50卷 42-51页

作者：邹屹东钱晶张文英梅宏陈家焕曾云昆明理工大学冶金与能源工程学院云南昆明650000 昆明理工大学电力工程学院云南昆明650500 昆明理工大学城市学院云南昆明650000

提出在优化过程中考虑H_(2)/H_(∞)范数权重来设计最优混合H_(2)/H_(∞)鲁棒控制器的方法,并将其应用在含风电、光伏以及小水电三个分布式电源的微电网负荷频率控制上。在对所建立的微电网负荷频率控制器优化中以系统的频率波动平方积... 详细信息

提出在优化过程中考虑H_(2)/H_(∞)范数权重来设计最优混合H_(2)/H_(∞)鲁棒控制器的方法,并将其应用在含风电、光伏以及小水电三个分布式电源的微电网负荷频率控制上。在对所建立的微电网负荷频率控制器优化中以系统的频率波动平方积分最小作为最优化目标,并综合H_(2)/H_(∞)两个范数所表述的鲁棒性能,设计了具有最优的混合H_(2)/H_(∞)鲁棒控制器。采用基于收缩系数的粒子群引力搜索算法(CPSOGSA)对反映系统H_(2)性能、H_(∞)性能的权重值以及输出鲁棒性能的有关加权矩阵进行选优,从而能够使得控制器在满足约束条件下达到最优。通过仿真验证可知,所提的方法对该微电网的负荷频率在外部扰动和系统内部参数扰动下具有更好的动态性能。

关键词：微电网小水电负荷频率控制鲁棒控制混沌粒子群引力搜索算法

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Wnts及其相关分子在小鼠外胎盘锥中的表达

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农业生物技术学报 2011年第2期19卷 314-322页

作者：彭莎陈家欢曹选红西北农林科技大学动物医学院陕西省干细胞工程技术研究中心陕西省农业分子生物学重点实验室

本研究通过RT-PCR的方法检测了妊娠第8天小鼠(Mus musculus)外胎盘锥(ectoplacental cone,EPC)中Wnts及其相关分子mRNA的表达,并用免疫荧光化学的方法检测了经典Wnt通路关键分子β-catenin及此通路抑制因子Dkk1在体外培养的EPC中的蛋白... 详细信息

本研究通过RT-PCR的方法检测了妊娠第8天小鼠(Mus musculus)外胎盘锥(ectoplacental cone,EPC)中Wnts及其相关分子mRNA的表达,并用免疫荧光化学的方法检测了经典Wnt通路关键分子β-catenin及此通路抑制因子Dkk1在体外培养的EPC中的蛋白表达,通过EPC体外扩展实验初步研究了经典Wnt信号通路在滋养层侵入中的作用。结果显示,Wnt家族中的11个成员、Frizzled受体家族的10个成员、Wnt家族的抑制剂sFRP家族的5个成员、Dkk基因家族和受体kremen的mRNA在小鼠EPC中都有不同程度的表达。β-catenin在从体外培养的EPC迁移出的滋养层细胞核中有强烈表达,而Dkk1不表达,用经典Wnt信号通路抑制因子Dkk1处理EPC后,滋养层细胞扩展直径增加,这表明经典的Wnt信号通路可能抑制滋养层侵入。本研究为揭示Wnt信号通路在胎盘建成的滋养层侵入过程的作用和机制提供理论基础。

关键词： Wnt通路外胎盘锥(EPC) 滋养层侵入

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猪羊水干细胞特异向跳动心肌细胞诱导分化

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生物工程学报 2011年第8期27卷 1206-1214页

作者：陈家欢魏育蕾彭莎王华岩西北农林科技大学动物医学院陕西省干细胞工程技术研究中心杨凌712100

为了筛选并建立一种由猪羊水干细胞向心肌细胞分化的有效方法,以猪羊水干细胞为研究对象,以5-氮胞苷(5-aza)和维生素C(Vc)为诱导剂,对猪羊水干细胞形成的类胚体(EBs)进行诱导分化。应用免疫荧光、RT-PCR、透射电镜技术检测跳动细胞团中... 详细信息

为了筛选并建立一种由猪羊水干细胞向心肌细胞分化的有效方法,以猪羊水干细胞为研究对象,以5-氮胞苷(5-aza)和维生素C(Vc)为诱导剂,对猪羊水干细胞形成的类胚体(EBs)进行诱导分化。应用免疫荧光、RT-PCR、透射电镜技术检测跳动细胞团中心肌特异性标记的表达情况。结果显示,在猪羊水干细胞形成的类胚体中加入心肌细胞诱导剂,10 d后即见到节律性跳动的细胞团,t检验发现0.1 mmol/L Vc加5μmol/L 5-aza联合诱导组的诱导效率最高,达33%。免疫荧光结果显示跳动心肌细胞团表达细胞骨架蛋白α-actin和肌钙蛋白Tnni3。RT-PCR检测跳动心肌细胞团,发现心肌细胞特异性标记分子TbX5、Gata4、α-MHC、Tnni3均呈阳性表达。借助透射电镜观察诱导后的跳动样细胞团,能清晰可见其中的肌丝、糖原粒、糖原池等结构。说明5-氮胞苷和维生素C可以促进猪羊水干细胞向心肌细胞的诱导分化。

关键词：猪羊水干细胞(pAFS) 心肌细胞 5-氮胞苷维生素C

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元基因组学及其在转化医学中的应用

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遗传 2015年第7期37卷 645-654页

作者：陈嘉焕孙政王晓君苏晓泉宁康中国科学院青岛生物能源与过程研究所青岛266101

微生物群落遍布于人体的每个角落,与人共生并对人体健康产生重要和深刻的影响。与人类共生的全部微生物的基因组总和称为"元基因组"或"人类第二基因组"。研究人体微生物群落及相关元基因组数据,对转化医学领域的基础研究和临床应用具有... 详细信息

微生物群落遍布于人体的每个角落,与人共生并对人体健康产生重要和深刻的影响。与人类共生的全部微生物的基因组总和称为"元基因组"或"人类第二基因组"。研究人体微生物群落及相关元基因组数据,对转化医学领域的基础研究和临床应用具有重要的价值。通过对生物医学相关的高通量元基因组数据进行分析,不仅能为基础医学研究向医学临床应用转化提供新思路和新方法,而且具有广阔的应用前景。基于新一代测序技术产生的数据,元基因组分析技术和方法能够弥补以往人体微生物先培养后鉴定方法的缺陷,同时能有效鉴定和分析微生物群落的组成及功能,从而进一步探究和揭示微生物群落与机体生理状态之间的关系,为解决许多医学领域的难题提供了全新的切入角度和思维方法。文章系统介绍了元基因组研究的现状,包括元基因组的方法概念和研究进展,并以元基因组在医学研究中的应用为着眼点,综述了元基因组在转化医学方面的研究进展,进一步阐述了元基因组研究在转化医学应用领域中具有的重要地位。

关键词：转化医学人体微生物群落元基因组

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粘弹塑性有限单元法及其在隧道分析中的应用

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土木工程学报 1993年第3期26卷 13-21页

作者：詹美礼钱家欢陈绪禄河海大学上海隧道设计院

本文运用笔者的粘弹塑性双屈服面流变模型,根据有限元分析理论建立了一整套的相应计算公式和分析方法。依上海市打浦路隧道现场软粘土试样进行三轴流变试验所获得的参数,对打浦路隧道1~#井进行了三维粘弹塑性及土体固结的有限元分析,揭... 详细信息

本文运用笔者的粘弹塑性双屈服面流变模型,根据有限元分析理论建立了一整套的相应计算公式和分析方法。依上海市打浦路隧道现场软粘土试样进行三轴流变试验所获得的参数,对打浦路隧道1~#井进行了三维粘弹塑性及土体固结的有限元分析,揭示了隧道与1~#井刚性连接部位开裂的原因。通过沉降实测与计算结果的对比分析,论证了模型的合理性和计算方法的正确性。

关键词：隧道有限元法粘弹塑性

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桥梁落梁后支座脱空时的力学研究

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江苏科技信息 2021年第6期38卷 48-50页

作者：蔡洁陈佳欢湖北工业大学湖北武汉430000

随着桥梁施工工艺的发展,顶推技术已经普遍应用于各类桥梁的建造。顶推施工过程中,桥梁受力体系的转换相对更为复杂,对误差的控制也更加严格,但在某些特殊条件下,仍存在落梁后支座脱空的可能。文章结合某实际工程,研究其在支座脱空时的... 详细信息

随着桥梁施工工艺的发展,顶推技术已经普遍应用于各类桥梁的建造。顶推施工过程中,桥梁受力体系的转换相对更为复杂,对误差的控制也更加严格,但在某些特殊条件下,仍存在落梁后支座脱空的可能。文章结合某实际工程,研究其在支座脱空时的钢梁受力并验算桥墩的承载能力,检验这种工况下桥梁的安全性,为落梁的管控与实施提供技术分析。

关键词：顶推落梁支座脱空

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