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A telomere-to-telomere genome assembly of Zhonghuang 13,a widely-grown soybean variety from the original center of Glycine max

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The Crop Journal 2024年第1期12卷 142-153页

作者： Anqi Zhang Tangchao Kong Baiquan Sun Shizheng Qiu jiahe guo Shuyong Ruan Yu guo Jirui guo Zhishuai Zhang Yue Liu Zheng Hu Tao Jiang Yadong Liu Shuqi Cao Shi Sun Tingting Wu Huilong Hong Bingjun Jiang Maoxiang Yang Xiangyu Yao Yang Hu Bo Liu Tianfu Han Yadong Wang Center for Bioinformatics School of Computer Science and TechnologyHarbin Institute of TechnologyHarbin 150001HeilongjiangChina Ministry of Agriculture Key Laboratory of Soybean Biology(Beijing) Institute of Crop SciencesChinese Academy of Agricultural SciencesBeijing 100081China National Key Facility for Crop Gene Resources and Genetic Improvement Institute of Crop SciencesChinese Academy of Agricultural SciencesBeijing 100081China

Soybean(Glycine max)stands as a globally significant agricultural crop,and the comprehensive assembly of its genome is of paramount importance for unraveling its biological characteristics and evolutionary ***,previous soybean genome assemblies have harbored gaps and incompleteness,which have constrained in-depth investigations into ***,we present Telomere-to-Telomere(T2T)assembly of the Chinese soybean cultivar Zhonghuang 13(ZH13)genome,termed ZH13-T2T,utilizing PacBio Hifi and ONT ultralong *** employed a multi-assembler approach,integrating Hifiasm,NextDenovo,and Canu,to minimize biases and enhance assembly *** assembly spans 1,015,024,879 bp,effectively resolving all 393 gaps that previously plagued the reference *** annotation efforts identified 50,564 high-confidence protein-coding genes,707 of which are ***13-T2T revealed longer chromosomes,421 not-aligned regions(NARs),112 structure variations(SVs),and a substantial expansion of repetitive element compared to earlier ***,we identified 25.67 Mb of tandem repeats,an enrichment of 5S and 48S rDNAs,and characterized their genotypic *** summary,we deliver the first complete Chinese soybean cultivar T2T *** comprehensive annotation,along with precise centromere and telomere characterization,as well as insights into structural variations,further enhance our understanding of soybean genetics and evolution.

关键词： Soybean Telomere-to-Telomere assembly Zhonghuang 13 Structure variations

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Enhancing the peroxidase-like activity of MoS_(2)-based nanozymes by introducing attapulgite for antibacterial application and sensitive detection of glutathione

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Nano Research 2024年第8期17卷 7415-7426页

作者： Feng Feng Yihe Zhang Xiao Zhang Bin Mu jiahe Zhang Wenjie Qu Wangshu Tong Minmin Liang Qi An Zhanjun guo Lu Zhao Engineering Research Center of Ministry of Education for Geological Carbon Storage and Low Carbon Utilization of Resources Beijing Key Laboratory of Materials Utilization of Nonmetallic Minerals and Solid WastesNational Laboratory of Mineral MaterialsSchool of Materials Science and TechnologyChina University of Geosciences(Beijing)Beijing 100083China Key Laboratory of Clay Mineral Applied Research of Gansu Province Lanzhou Institute of Chemical PhysicsChinese Academy of SciencesLanzhou 730000China Experimental Center of Advanced Materials School of Materials Science and Engineering School of Materials Science and EngineeringBeijing Institute of TechnologyBeijing 100081China

Nanozymes are next-generation of nanomaterials with enzyme-like *** particular,nanozymes with peroxidase(POD)-like activity have been utilized in various fields,including antibacterial,detection,degradation,***,their extensive applications were limited by their low catalytic activity ***,we have presented a composite nanozyme based on attapulgite(ATP)(Fe-ATP-MoS_(2)(FAM)),which exhibited enhanced POD-like activity(185.33 U·mg^(−1)),4.25 times higher than that of Fe-MoS_(2)(FM)(43.63 U·mg^(−1)).The density functional theory(DFT)calculations indicated that the addition of ATP increased the electron density of metal centers(Mo and Fe).More importantly,Michaelis–Menten kinetics revealed that the introduction of ATP significantly enhanced the binding affinities of substrates through the pores of ATP,forming a highly concentrated substrate microenvironment and thus promoting its POD-like ***,from molecular size and kinetic analysis,we proposed that the changes in substrate size before and after oxidation also significantly affected its Michaelis-constant(Km)***,we utilized FAM in the applications of highly effective antibacterial application and sensitive detection of glutathione(GSH).In conclusion,this work provides a novel approach for designing a highly efficient nanozyme based on natural mineral composites.

关键词： attapulgite peroxidase electron density affinity antibacterial

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Advances in molecular regulation of goat lipid metabolism and FAS structure and function regulation

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BIOCELL 2021年第4期45卷 835-847页

作者： jiahe guo XIAOGUANG JI YONGJIANG MAO ZHANGPING YANG ZHI CHEN YUAN YUAN School of Nursing Yangzhou UniversityYangzhou225009China College of Animal Science and Technology Yangzhou UniversityYangzhou225009China Hubei Blue Valley Microbial Technology Co. Ltd.Yichang443100China

Goat milk is widely recognized for its nutritional *** acid synthase(FAS)is the crucial enzyme of fatty acid de novo *** plays an important role in the formation of goat milk *** this paper,we first introduced the molecular regulation process of goat milk fat metabolism based on the structure research of ***,we reviewed some key factors in FAS transcription and post-transcriptional regulation of the goat mammary gland and preliminarily constructed the expression network of the goat mammary gland FAS *** purpose of this paper is to systematically introduce the role of FAS in goat milk fat metabolism and to provide a reference for future studies on the mechanism of goat milk fat metabolism.

关键词： Fatty acid synthase Molecular regulation FAS Goat’s milk

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A telomere-to-telomere genome assembly of Zhonghuang 13,a widely-grown soybean variety from the original center of Glycine max

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The Crop Journal 2024年第1期

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基于语言文化双重维度的中华民族特有事物词汇翻译策略考察——以《孙子兵法》中“九地”“九天”俄译为例

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孙子研究 2022年第5期 92-104页

作者：郭佳贺中国人民解放军某部队

民族特有事物词汇是一个民族历史文化的生动写照与精神特质的集中体现。作为中华民族特有事物词汇的典型代表,“九地”“九天”两词不仅具有神秘哲学色彩,更蕴含独特的符号意义,对这一概念的译介直接影响着中华文化对外传播的质量和效率... 详细信息

民族特有事物词汇是一个民族历史文化的生动写照与精神特质的集中体现。作为中华民族特有事物词汇的典型代表,“九地”“九天”两词不仅具有神秘哲学色彩,更蕴含独特的符号意义,对这一概念的译介直接影响着中华文化对外传播的质量和效率,必须采取特定翻译策略。

关键词：孙子兵法九地九天翻译策略民族特有事物

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《孙子兵法》数词探赜:内涵建构、外延界定与多维分类--基于吴九龙等《孙子校释》

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孙子研究 2022年第3期 45-65页

作者：郭佳贺中国人民解放军某部队

内涵、外延与分类等基本问题是汉语数词研究的重点和难点之一。由于数词语义和语用功能的多元差异,以及研究方法和实践标准的思维局限,这些问题至今仍存有争议。内涵是本质规定,外延是范围制约,分类则是特性区分加同质聚合。内涵建构以... 详细信息

内涵、外延与分类等基本问题是汉语数词研究的重点和难点之一。由于数词语义和语用功能的多元差异,以及研究方法和实践标准的思维局限,这些问题至今仍存有争议。内涵是本质规定,外延是范围制约,分类则是特性区分加同质聚合。内涵建构以外延界定为前提,外延界定以内涵建构为目的,二者共同决定多维分类的研究对象。数词外延可依据意义标准、兼顾形态和功能标准进行界定,并据此建构内涵,进行多维分类。《孙子兵法》数词元素广泛、类型各异,具有一定代表性和典型性,通过讨论《孙子兵法》数词基本问题可为汉语数词研究提供现实思路和可行方法。

关键词：孙子兵法数词内涵外延分类汉语语法

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湖羊繁殖性状的调控机制研究进展

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南京农业大学学报 2022年第5期45卷 1032-1040页

作者：张艳丽郭佳禾姚晓磊王锋南京农业大学动物科技学院/湖羊研究院江苏南京210095

繁殖力是影响养羊业经济效益的重要指标之一,而繁殖性状遗传力低、周期长、选育进展慢。湖羊作为我国著名的绵羊品种,以“全年发情、多胎”而著称,是当前国内绵羊杂交育种和肉羊生产最重要的母本品种,也是研究家畜高繁机制的理想模型。... 详细信息

繁殖力是影响养羊业经济效益的重要指标之一,而繁殖性状遗传力低、周期长、选育进展慢。湖羊作为我国著名的绵羊品种,以“全年发情、多胎”而著称,是当前国内绵羊杂交育种和肉羊生产最重要的母本品种,也是研究家畜高繁机制的理想模型。繁殖性状是一个极其复杂的性状,受遗传、表观修饰、激素和营养等多因素调控,本文主要从下丘脑-垂体-性腺轴及子宫的分子调控和卵泡、子宫及胎盘发育的营养调控2个层面综述了湖羊繁殖性状调控机制的研究进展;同时指出了当前以湖羊作为多胎种质资源研究存在的问题并就未来研究方向进行了展望。

关键词：湖羊繁殖性状多胎功能基因营养调控

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基于改进GRNN模型的个性化推荐算法研究

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计算机应用文摘 2023年第21期39卷 111-114,118页

作者：郭家赫乔宇许馨中南民族大学武汉430074

为解决数据稀疏性问题导致的算法性能问题,文章引入GRNN模型,学习并填充用户评分矩阵,采用协同过滤的方法进行个性化推荐。相较于传统的机器学习方法,GRNN模型具有强大的学习能力以及更少的学习参数。此外,文章提出使用果蝇寻优算法自... 详细信息

为解决数据稀疏性问题导致的算法性能问题,文章引入GRNN模型,学习并填充用户评分矩阵,采用协同过滤的方法进行个性化推荐。相较于传统的机器学习方法,GRNN模型具有强大的学习能力以及更少的学习参数。此外,文章提出使用果蝇寻优算法自动寻优平滑因子,在提升算法性能的同时提高预测准确率。实验结果表明,基于果蝇算法优化的GRNN预测模型能显著改善F1及MAE指标。

关键词：推荐算法广义回归神经网络果蝇优化算法

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基于语料库的《孙子兵法》的数量词汇语义场分布特征研究

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现代语文 2020年第12期 21-29页

作者：郭佳贺国防科技大学国际关系学院江苏南京210039

《孙子兵法》中的大量表示数量意义的词汇,形成了一个语义场。这一语义场可以从结构形式、语法分类、词汇意义三个层面,划分为不同的子语义场。从结构形式上看,可分为词和固定短语两个子场;从语法分类上看,可分为体词性词汇、谓词性词... 详细信息

《孙子兵法》中的大量表示数量意义的词汇,形成了一个语义场。这一语义场可以从结构形式、语法分类、词汇意义三个层面,划分为不同的子语义场。从结构形式上看,可分为词和固定短语两个子场;从语法分类上看,可分为体词性词汇、谓词性词汇和加词性词汇三个子场;从词汇意义上看,可分为表计算、表顺序等十一个子场。

关键词：《孙子兵法》语料库数量词汇语义场

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Separation efficiency of liquid-solid undergoing vibration based on breakage of liquid bridge

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Particuology 2022年第2期20卷 103-110页

作者： Jian Chen jiahe Shen Jie guo Geoff Wang School of Mechanical Engineering The University of NewcastleCallaghan 2308Australia School of Chemical Engineering The University of QueenslandSt Lucia 4072Australia Centre for Bulk Solids and Particulate Technologies Newcastle Institute for Energy and ResourcesThe University of NewcastleCallaghan 2308Australia

Vibrating separation is a significant method for liquid-solid separation.A typical example is the vibrating screen to dewater wet granular *** properties of granular matter and the vibrating parameters significantly affect the separation *** study investigates the effect of vibration parameters in separation based on the breakage of large-scale liquid bridge numerically by using a calibrated simulation *** analysing the simulation results,the liquid bridge shape and the volume between two sphere particles for various particle sizes and particle distances were studied in the static condition under the effect of *** results show a general reducing trend of liquid bridge volume when the radius ratio of two particles increases,particularly when the ratio increases to ***,a set of vibrating motion was applied to the liquid bridge in the simulation model.A group of experiments were also performed to validate the simulation model with ***,the effect of vibrating peak acceleration,distance between spheres and radius on the separation efficiency which was reflected by the residual water were *** is found that separation efficiency increased obviously with the peak acceleration and the increase slowed down after the peak acceleration over 1 m/s^(2).

关键词： Liquid bridge shape Liquid bridge volume Retention capacity Vibration VOF model

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