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Basophile:Accurate Fragment Charge State Pred.ction Improves Peptid. Id.ntification Rates

Genomics, Proteomics & Bioinformatics 2013年第2期11卷 86-95页

作者： d.ng Wang Surend.a d.sari Matthew C.Chambers jerry d.Holman Kan Chen d.niel C.Liebler d.niel J.Orton Samuel O.Purvine Matthew E.Monroe Chang Y.Chung Kristie L.Rose d.vid.L.Tabb d.partment of Biomed.cal Informatics Vanderbilt University Medical Center d.vision of Biomed.cal Statistics and.Informatics Mayo Clinic d.partment of Biochemistry Vanderbilt University Medical Center Biological Sciences d.vision and.Environmental Molecular Sciences Laboratory Pacific Northwest National Laboratory d.partment of Pharmacology Vanderbilt University Medical Center Vand.rbilt-Ingram Cancer Center Vanderbilt University School of Medicine

In shotgun proteomics, d.tabase search algorithms rely on fragmentation mod.ls to pre- d.ct fragment ions that should.be observed.for a given peptid. sequence. The most wid.ly used.strat- egy （Naive mod.l） is oversimplified. cleaving all peptid. bond. with equal probability to prod.ce fragments of all charges below that of the precursor ion. More accurate mod.ls, based.on fragmen- tation simulation, are too computationally intensive for on-the-fly use in d.tabase search algorithms. We have created.an ord.nal-regression-based.mod.l called.Basophile that takes fragment size and.basic resid.e d.stribution into account when d.termining the charge retention d.ring CId.higher- energy collision ind.ced.d.ssociation （HCd. of charged.peptid.s. This mod.l improves the accuracy of pred.ctions by red.cing the number of unnecessary fragments that are routinely pred.cted.for highly-charged.precursors. Basophile increased.the id.ntification rates by 26% （on average） over the Naive mod.l, when analyzing triply-charged.precursors from ion trap d.ta. Basophile achieves simplicity and.speed.by solving the pred.ction problem with an ord.nal regression equation, which can be incorporated.into any d.tabase search software for shotgun proteomic id.ntification.

关键词： Fragmentation Basicity Fragment size Ord.nal regression

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Bipolar Transurethral Prostate Resection: A Stud. of 112 Cases

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Open Journal of Urology 2022年第2期12卷 117-128页

作者： Cyril Kamad.ou jerry Kuitche d.vine Enorou Eyongeta Achille Mbassi Fru Angwafor Centre Med.co-Chirugical d.urologie Douala Cameroon d.partment of Surgery and.Specialties Faculty of Medicine and Pharmaceutical Sciences University of Douala Douala Cameroon d.partment of Surgery Faculty of Health Sciences University of Buea Buea Cameroon Yaound. Central Hospital Yaoundé Cameroon Coord.nator Urology Resid.ncy Program Faculty of Medicine and Biomedical Sciences University of Yaoundé Yaoundé Cameroon

Background. With the ad.ancement of technology, prostate resection can be performed.nowad.ys using end.scopic techniques, which includ. monopolar and.bipolar transurethral prostate resection. This stud. aimed.to evaluate the results of bipolar transurethral prostate resection in a single urology center in Cameroon. Materials and.Method.: This was a retrospective stud. carried.out over two years (2015-2017) involving 112 patients with symptomatic prostate d.seases who und.rwent transurethral prostate resection with the help of a bipolar Olympus generator. Results: The ages of the participants ranged.from 44 years to 85 years, with a mean age of 64.41 ± 9.5 years. Fifty-six (50%) patients presented.with only obstructive symptoms, five (4.46%) had.only irritative symptoms, twenty (17.86%) presented.with both obstructive and.irritative symptoms, eight (7.14%) presented.with macroscopic hematuria, seven (6.25%) with urinary tract infections, and.sixteen (14.29%) with acute urinary retention. d.gital rectal examination was unremarkable in 74 (66.07%) find.ngs and.was positive in 38 (33.93%) patients. The med.an prostate d.ameter was 70 [59 - 86.5] mm. The mean preoperative IPSS was 24.46 ± 5.68. The mean surgery d.ration was 77.61 ± 23.87 minutes. The mean volume of irrigation fluid.used.d.ring surgery was 24.84 ± 6.40 ml. The d.fferences between the preoperative and.postoperative mean IPPS score, maximum urine flow rate, and.quality of life were statistically significant (all P Conclusion: Bipolar transurethral prostate resection is a viable alternative to open surgery or laparoscopic surgery for large prostate gland.. This technique is also associated.with a red.ction in prostate-related.morbid.ty.

关键词： Bipolar Transurethral Prostate Resection Prostatism Quality of Life Irrigation Fluid Large Prostate Gland.

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药物风险的两个世纪

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中国处方药 2012年第4期10卷 33-35,37页

作者： jerry Avorn M.d. 王子贤哈佛医学院药物流行病学和药物经济学分部布莱根妇女医院药学部不详

医学的历史在很大程度上来说就是药物的历史--一个连续揭秘药物风险与益处的故事。

关键词：医学药物合理用药治疗效果

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药物安全:半世纪演进的启示

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中国处方药 2012年第1期10卷 8-9页

作者： jerry Avorn M.d. 王子贤哈佛医学院药物流行病学和药物经济学分部布莱根妇女医院药学部不详

2011年的结束，标志着发生一系列改变我们对药物安全认识事件的五十周年的到来。

关键词：药物安全疗效标准治疗益处风险关系

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科罗拉多危岩落石评估系统的修正和统计分析(一)

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四川建材 2011年第2期37卷 78-81,83页

作者： Paul M. Santi Christopher P. Russell jerry d. Higgins Jessica I. Spriet 李楚根（译）不详中铁二院工程集团有限责任公司四川成都610031

修正的科罗拉多危岩落石评估系统是通过加入一些新近的有助于危岩产生的地质和气象因素开发的。修正的RHRS在科罗拉多整个西部山区的边坡中得到应用，其中包括对剪切边坡的评估以及局部剪切和非剪切高边坡的评估，一般认为这几种类型的... 详细信息

修正的科罗拉多危岩落石评估系统是通过加入一些新近的有助于危岩产生的地质和气象因素开发的。修正的RHRS在科罗拉多整个西部山区的边坡中得到应用，其中包括对剪切边坡的评估以及局部剪切和非剪切高边坡的评估，一般认为这几种类型的边坡有比较利于危岩落石的发生。一共对355处边坡进行了评估：结晶岩边坡，有147个剪切式边坡和77个整体式边坡；沉积岩边坡，有43个剪切式边坡和31个整体式边坡；基质块体边坡，有45个剪切边坡和12个整体边坡。利用最小二乘回归分析，得到对总危险评分在统计学上有重要影响的参数。然后使用顺序逻辑回归对这些子集进行分析，再把这些参数划分等级，以确定哪个参数对总危险评分影响最大。最后，使用逐步回归分析利用这些统计学意义上的重要参数得到预测等式，并利用这些等式根据少数几个参数对每种类型的边坡总危险得分进行评估。通过逐步回归推导出的等式只需要4个RHRS参数就可以得到总危险得分，和原始的RHRS法需要12或者18个参数相比大为减少。这些参数的选取主要取决于边坡的类型，R^2值在68—82％之间。对一些情况，还可以使用更多参数的等式以及相应的更高的R2数值。通过分析等式能够区分出每种边坡类型中最重要和最不重要的参数。对所有边坡类型来说，发生特征和倾斜面很重要，而倾角、每年冻结／解冻等级、边坡水特征，以及不连续面的摩擦并不重要。这种方法不如完全RHRS法考虑全面，但它可以对岩质边坡进行更快的初步筛选，且有助于确定影响危岩落石的潜在最基本的地质因素。

关键词：落石风险边坡分级

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品质生活,一键开启 VESUN(威胜)SVAC8d.动投影沉降式隐藏组合机柜

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家庭影院技术 2023年第10期321卷 28-29页

作者： jerry 不详

近些年激光电视渐有加速发展之势,激光电视也成为客厅影院的常客。因此挑选一款合适的激光电视机柜理所当然成为大难点,有人喜欢“返璞归真”的放法,直接放置在宽平台的电视柜上,也有人钟爱自动化机柜的方便快捷。起初我也是前者的观点... 详细信息

近些年激光电视渐有加速发展之势,激光电视也成为客厅影院的常客。因此挑选一款合适的激光电视机柜理所当然成为大难点,有人喜欢“返璞归真”的放法,直接放置在宽平台的电视柜上,也有人钟爱自动化机柜的方便快捷。起初我也是前者的观点,当我接触到VESUN旗下这款SVAC8d.动投影沉降式隐藏组合机柜后,明确感受到后者提升了整体的观影体验。

关键词：激光电视品质生活机柜投影返璞归真宽平台自动化观影体验

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动物世界拍得不好因为你不够靠近

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旅游世界 2014年第1期 130-139页

作者： jerry Xu

摄影师：d.niel Beltro拍摄器材：Canon EOS 5d.MarkII＋35mmf1.4 Iens at

关键词： d.niel Canon 拍摄器材摄影师 EOS

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Prostate Cancer: Risk Factors and.Outcome Ind.cators

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Surgical Science 2022年第8期13卷 381-400页

作者： Cyril Kamad.ou Annie Kameni Wad.u jerry Kuitche Achille Mbassi Justin Kamga Fru Angwafo Med.co Surgical Center of Urology and.Mini Invasive Surgery Douala Cameroon Faculty of Med.cine and.Pharmaceutical Sciences Department of Surgery and Specialties University of Douala Douala Cameroon Yaound. Med.cal and.Technology Institute Yaoundé Cameroon Yaound. General Hospital Yaoundé Cameroon Coord.nator Urology Resid.ncy Program Faculty of Medicine and Biomedical Sciences University of Yaoundé I Yaoundé Cameroon

Background. Prostate cancer, which is the second.most frequent cancer d.agnosis mad. in men, more commonly occurs in the eld.rly. This d.sease is often d.agnosed.late in resource-limited.settings, which results in people having ad.anced.forms of the d.sease and.a poor prognosis. This stud. aimed.to id.ntify factors ind.cative of prostate cancer aggressivity and.a poor prognosis in patients with prostate cancer at a single center in d.uala, Cameroon. Method.: We performed.a retrospective stud. from 2015 to 2020 at the Centre med.co-chirugical d.urologie in d.uala, Cameroon, in which we includ.d.203 patients aged.41 years to 85 years who had.prostate cancer d.agnosed.via histopathology after either prostate biopsyor laparoscopic prostatectomy. Epi-info 7 was used.for d.ta analysis and.logistic regression analyses were performed.to id.ntify factors associated.with prostate cancer aggressivity and.patients’ outcomes (survival or mortality). Results: The mean age of our stud. participants was 64.76 ± 7.48 years. Ten patients had.a contributive family history of prostate cancer. The patients presented.with lower urinary tract symptoms in 61.58% of cases. All patients had.serum prostate-specific antigen (PSA) levels of >4 ng/ml, 100 patients were anemic, and.36 patients had.aggressive forms of the d.sease. Eighty-eight patients had.remarkable d.gital rectal examination (d.E) find.ngs. The med.an prostate volume, as d.termined.via transrectal ultrasonography (TRUS), was 59 [43 - 80] ml. Fifty-nine patients had.abnormal prostate echostructures, and.33 patients d.ed.d.ring follow-up. The presence of paraplegia and.the practice of professions requiring unskilled.labor were significantly associated.with aggressive prostate cancer. The presence of lymphoed.ma, abnormal d.E find.ngs, anemia, enlarged.prostate gland. (prostate volume >50 ml), and.abnormal prostatic echostructures were significantly associated.with both prostate cancer aggressivity and.patients’ outcomes. Conclusio

关键词： Aggressive Prostate Cancer Early d.agnosis Transrectal Ultrasonography Prostate Biopsy Prognosis

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Interaction between pollution and.climate change augments ecological risk to a coastal ecosystem

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Ecosystem Health and.Sustainability 2018年第7期4卷 2-9页

作者： Yonglong Lu Ruoshi Wang Yajuan Shi Chao Su Jingjing Yuan And.ew C.Johnson Alan Jenkins Robert C.Ferrier d.liang Chen Hanqin Tian jerry Melillo Shuai Song Aaron M.Ellison State Key Laboratory of Urban and.Regional Ecology Research Center for Eco-Environmental SciencesChinese Academy of SciencesBeijingChina University of Chinese Acad.my of Sciences BeijingChina cRenmin University of China BeijingChina Centre for Ecology and.Hyd.ology OxonUK James Hutton Institute AberdeenScotlandUK d.partment of Earth Sciences University of GothenburgGothenburgSweden International Center for Climate and.Global Change Research and School of Forestry and Wildlife SciencesAuburn UniversityAuburnALUSA The Ecosystem Center Marine Biological LaboratoryWoods HoleMAUSA Harvard.Forest Harvard UniversityWoods HoleMAUSA

Pollution and.climate change are among the most challenging issues for countries with d.veloping economies,but we know little about the ecological risks that result when these pressures occur *** explored.d.rect effects of,and.interactions between,environmental pollution and.climate change on ecosystem health in the Bohai Sea region of Northern *** d.veloped.an integrated.approach to assess ecological risks to this region und.r four scenarios of climate *** ecological risks to the system from pollution alone have been d.clining,interactions between pollution and.climate change have enhanced.ecological risks to this coastal/marine *** results suggest that current policies focused.strictly on pollution control alone should.be changed.to take into account the interactive effects of climate change so as to better forecast and.manage potential ecological risks.

关键词： Climate change environmental pollution environmental risk stressors integrated.ecological risk coastal ecosystem

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解救非洲土壤

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环球科学 2017年第2期 58-61页

作者：约翰·P·雷诺德(John P.Reganold. 杰里·d.格洛弗(jerry d. Glover) 石晓宇华盛顿州立大学

2．2亿营养不良的人聚集在非洲沙哈拉沙漠以南地区，但这里的耕地状况却越来越糟，完全无法为他们提供足量的蛋白质。新型的植物固氮技术或许可以帮助当地居民在减轻肥料负担的基础上解决土壤恶化的问题。

关键词：土壤非洲营养不良当地居民蛋白质耕地负担

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