检索结果-南通市图书馆

硫模块启动子对提高L-甲硫氨酸的生物合成的影响及发酵培养条件的优化

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食品与发酵工业 2019年第19期45卷 8-16页

作者：金利群金伟熔柳志强浙江省生物有机合成技术研究重点实验室(浙江工业大学) 浙江杭州310014 生物转化与生物净化教育部工程研究中心(浙江工业大学) 浙江杭州310014 手性生物制造国家地方联合工程研究中心(浙江工业大学) 浙江杭州310014

研究生物合成硫模块对L-甲硫氨酸产量的影响并优化了发酵条件。利用实验室构建的重组菌株,用trc启动子替换基因组上cysK的组成型启动子,在质粒pA*H上插入glpE和nrdH基因;通过构建PG3启动子文库,获得转录强度最高的p32启动子,进一步优化... 详细信息

研究生物合成硫模块对L-甲硫氨酸产量的影响并优化了发酵条件。利用实验室构建的重组菌株,用trc启动子替换基因组上cysK的组成型启动子,在质粒pA*H上插入glpE和nrdH基因;通过构建PG3启动子文库,获得转录强度最高的p32启动子,进一步优化硫模块,最后通过对培养基的优化提高了硫代硫酸盐的供给,从而提高L-甲硫氨酸产量。结果表明:使用构建得到的*** W3110 JAHFEBL trc-cysK/pA*H-p32-nrdH-glpE菌株,发酵48 h后L-甲硫氨酸摇瓶水平产量达到1.3 g/L,较对照组提升了41.5%;通过对培养基的进一步优化,L-甲硫氨酸产量最终达到2.3 g/L,相比未优化的发酵水平提高了77.0%,且该研究为其他含硫氨基酸的生物合成提供了基础。

关键词： L-甲硫氨酸启动子优化硫同化模块生物合成硫代硫酸盐

The mutation network for the hemagglutinin gene from the novel influenza A (H1N1) virus

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Chinese Science Bulletin 2009年第13期54卷 2168-2170页

作者： HE YunGang DING GuoHui BIAN Chao HUANG Zhong LAN Ke SUN Bing WANG XueCai LI YiXue WANG HongYan WANG XiaoNing YANG Zhong ZHONG Yang jin weirong XIONG Hui DAI JianXin GUO YaJun WANG Hao CHE XiaoYan WU Fan YUAN ZhenAn ZHANG Xi CAO ZhiWei ZHOU XiaoNong ZHOU JiaHai MA ZhiYong TONG GuangZhi ZHAO GuoPing jin Li Shanghai Institutes of Biological Sciences Chinese Academy of Sciences (Key Laboratory of Computational Biology CAS-MPG Partner Institute of Computational Biology Center of Bioinformatics Key Lab of System Biology Lab of Synthetic Biology Institute of Plant Physiology & Ecology Institute Pasteur) Shanghai 200031 China School of Life Sciences Fudan University Shanghai 200433 China Shanghai-MOST Key Laboratory for Disease and Health Genomics Chinese National Human Genome Center at Shanghai Shanghai 201203 China Cancer Institute Second Military Medical University Shanghai 200433 China School of Life Sciences and Technology South China University of Technology Guangzhou 510641 China National Engineering Research Center for Antibody Drugs Shanghai 201203 China Zhujiang Hospital Southern Medical University G uangzhou 510282 China Shanghai Municipal Center for Disease Control & Prevention Shanghai 200336 China Shanghai Center for Bioinformation Technology Shanghai 200235 China School of Life Sciences and Technology Tongji University Shanghai 200092 China National Institute for Parasitic Diseases Chinese Center for Disease Control and Prevention Shanghai 200025 China Shanghai Institute of Organic Chemistry Chinese Academy of Sciences Shanghai 200032 China Shanghai Veterinary Research Institute Chinese Academy of Agricultural Sciences Shanghai 200241 China National Engineering Research Center for Biochip Technology Shanghai Biochip Co. Ltd Shanghai 201203 China

A mutation network for the hemagglutinin gene(HA) of the novel type A(H1N1) influenza virus was *** homology analysis indicated that one HA sequence type from the viruses mainly isolated from Mexico was likely the original type in this *** on the 658A and 1408T mutations in HA,the viruses evolving into this epidemic were divided into three categories,the Mexico,the transitional and the New York *** three groups of viruses presented distinctive clustering features in their geographic distributions.

关键词：流感病毒血凝素基因流行性感冒突变网络序列类型同源性分析地理分布

Subtyping of type A influenza by sequencing the variable regions of HA gene specifically amplified with RT-PCR

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Chinese Science Bulletin 2009年第13期54卷 2164-2167页

作者： YAN An DING GuoHui ZHOU ZhenFeng DONG Hui ZHANG YaKun ZHU Lei HE YunGang ZHANG GuoQing LI YiXue SUN Bing HUANG Zhong LAN Ke jin Li WANG HongYan WANG XiaoNing YANG Zhong ZHONG Yang DAI JianXin GUO YaJun WANG Hao CHE XiaoYan WU Fan YUAN ZhenGan ZHANG Xi CAO ZhiWei ZHOU XiaoNong ZHOU JiaHai MA ZhiYong TONG GuangZhi ZHAO GuoPing jin weirong XIONG Hui Shanghai-MOST Key Laboratory for Disease and Health Genomics Chinese National Human Genome Center at Shanghai Shanghai 201203 China Shanghai Institutes of Biological Sciences Chinese Academy of Sciences (Lab of Computational Genomics CAS-MPG Partner Institute of Computational Biology Center of Bjoinformatics Key Lab of System Biology Lab of Synthetic Biology Institute of Plant Physiology & Ecology Institute Pasteur) Shanghai 200031 China National Engineering Research Center for Biochip Technology Shanghai Biochip Co. Ltd Shanghai 201203 China Shanghai Center for Bioinformation Technology Shanghai 200235 China School of Life Sciences Fudan University Shanghai 200433 China School of Life Sciences and Technology South China University of Technology Guangzhou 510641 China Cancer Institute Second Military Medical University Shanghai 200433 China National Engineering Research Center for Antibody Drugs Shanghai 201203 China Zhujiang Hospical Southern Medical University Guangzhou 510282 China Shanghai Municipal Center for Disease Control & Prevention Shanghai 200336 China School of Life Sciences and Technology Tongji University Shanghai 200092 China National Institute for Parasitic Diseases Chinese Center for Disease Control and Prevention Shanghai 200025 China Shanghai Institute of Organic Chemistry Chinese Academy of Sciences Shanghai 200032 China Shanghai Veterinary Research Institute Chinese Academy of Agricultural Sciences Shanghai 200241 China

The outbreak of a novel influenza A(H1N1) virus across the globe poses a threat to human *** is of paramount importance to develop a rapid,reliable and inexpensive diagnostic *** on the bioinformatic information from public database,primers specific for influenza A virus surface protein haemagglutinin(HA) of several subtypes(including H1,H2,H3,H5,H7 and H9) were ***-specific PCR products were subjected to sequencing for accurately distinguishing H1 and H3 subtypes from *** sequencing-based detection method will not only be applied to rapid detection and simultaneous subtype identification of new influenza A virus H1N1,but also provide the strategies to monitor other new types ofinfluenza virus with explosive potential.

关键词：流感病毒 H9亚型 PCR产物 HA基因测序可变区生物信息学 RT

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赣南基于山塘引水的产汇流模型研究

水利规划与设计 2020年第11期 64-69页

作者：靳伟荣江西省灌溉试验中心站江西南昌330201

文章通过选取赣南脐橙种植区典型山塘,对山塘水位、蒸发量、降雨量、地形地势勘测等数据进行收集,采用前期影响雨量代替土壤含水量和多次洪水逐渐逼近的方法推求流域最大蓄水容量,并建立不同坡度的野外径流小区,拟合得出径流系数与坡度... 详细信息

文章通过选取赣南脐橙种植区典型山塘,对山塘水位、蒸发量、降雨量、地形地势勘测等数据进行收集,采用前期影响雨量代替土壤含水量和多次洪水逐渐逼近的方法推求流域最大蓄水容量,并建立不同坡度的野外径流小区,拟合得出径流系数与坡度、降雨量、前期影响雨量、流域最大蓄水容量之间的函数关系,在此基础上建立基于山塘引水的赣南脐橙种植区坡面产汇流模型,并进行模型验证和评估,为开展山塘可供水量分析提供支撑,也为确定脐橙灌溉保证率和种植规模提供依据。

关键词：蓄水容量赣南脐橙径流系数前期影响雨量坡度

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平板闸门自由-淹没孔流统一流量率定模型

农业工程学报 2020年第22期36卷 197-204页

作者：管光华黄一飞熊骥靳伟荣武汉大学水资源与水电工程科学国家重点实验室武汉430072 湖北省国际灌排研究培训中心武汉430072 江西省灌溉实验中心站南昌330201

中国灌区的常用量水方法中,利用水工建筑物尤其是闸门量水是目前应用最为广泛的,但传统的闸门过流公式众多,实际应用中需区分自由、淹没流态选择对应的公式,理论值与实测值偏差较大。该研究拟提出一种基于实测数据率定的形式简单、可应... 详细信息

中国灌区的常用量水方法中,利用水工建筑物尤其是闸门量水是目前应用最为广泛的,但传统的闸门过流公式众多,实际应用中需区分自由、淹没流态选择对应的公式,理论值与实测值偏差较大。该研究拟提出一种基于实测数据率定的形式简单、可应用于多种流态的流量计算模型。主要采用三维数值模拟的方法,通过建立实际水闸的三维流体力学模型,研究不同流态下的闸门水力特性,并结合室内模型试验和野外原型观测提出基于实测数据率定的流量计算模型。研究步骤为:1)验证基于实测数据的率定模型的有效性及精确性;2)分析该模型应用于闸门不同流态的率定效果,判断其是否可用于自由及淹没孔流建立统一的流量关系;3)对所提出的模型方法进行野外实测数据验证,并进行误差来源分析。结果表明:1)该模型能够进行区分流态的率定且精度较高,90.63%的数据误差在5%以内;2)该模型能够统一自由-淹没孔流率定,使用仿真数据进行统一率定时数据误差在5%以内的占比为86.67%,使用南水北调中线某闸门8、10、11月份验证模型精度达到77.64%的数据误差在5%以内,95%以上数据误差在10%以内的效果。该模型具有简单、光滑连续的特点,在实际工程应用中建议通过大量实测提高模型精度。

关键词：模型流量测量灌溉渠道水闸 Flow-3D软件三维数值模拟

Structure modeling and spatial epitope analysis for HA protein of the novel H1N1 influenza virus

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Chinese Science Bulletin 2009年第13期54卷 2171-2173页

作者： WU Di XU TianLei SUN jing DAI JianXin DING GuoHui HE YunGang ZHOU ZhengFeng XIONG Hui DONG Hui jin weirong BIAN Chao jin Li WANG HongYan WANG XiaoNing YANG Zhong ZHONG Yang WANG Hao CHE XiaoYan HUANG Zhong LAN Ke SUN Bing WU Fan YUAN ZhenAn ZHANG Xi ZHOU XiaoNong ZHOU JiaHai MA ZhiYong TONG GuangZhi GUO YaJun ZHAO GuoPing LI YiXue CAO ZhiWei School of Life Sciences and Technology Tongji University Shanghai 200092 China Shanghai Center for Bioinformation Technology Shanghai 200235 China School of Life Sciences Fudan University Shanghai 200433 China Cancer Institute of the Second Military Medical University Shanghai 200433 China School of Life Sciences and Technology South China University of Technology Guangzhou 510641 China National Engineering Research Center for Antibody Drugs Shanghai 201203 China Zhujiang Hospital Southern Medical University Guangzhou 510282 China Shanghai Municipal Center for Disease Control & Prevention Shanghai 200336 China Shanghai Institutes of Biological Sciences Chinese Academy of Sciences (Lab of Computational Genomics CAS-MPG Partner Institute of Computational Biology Center of Bioinformatics Key Lab of System Biology Lab of Synthetic Biology Institute of Plant Physiology & Ecology Institute Pasteur) Shanghai 200031 China National Engineering Research Center for Biochip Technology Shanghai Biochip Co. Ltd Shanghai 201203 China National Institute for Parasitic Diseases Chinese Center for Disease Control and Prevention Shanghai 200025 China Shanghai Institute of Organic Chemistry Chinese Academy of Sciences Shanghai 200032 China Shanghai Veterinary Research Institute Chinese Academy of Agricultural Sciences Shanghai 200241 China

In recent months,a novel influenza virus H1N1 broke out around the *** bioinformatics technology,the 3D structure of HA protein was obtained,and the epitope residues were predicted with the method developed in our group for this novel flu virus.58 amino acids were identified as potential epitope residues,the majority of which clustered at the surface of the globular head of HA *** it is located at the similar position,the epitope of HA protein for the novel H1N1 flu virus has obvious differences in the electrostatic potential compared to that of HA proteins from previous flu viruses.

关键词：禽流感病毒抗原表位 A蛋白结构建模和空间生物信息学技术三维结构残留物

基于条件风险价值的灌区水质水量配置模型研究

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人民长江 2023年第7期54卷 98-103,127页

作者：王发强付湘靳伟荣谢亨旺武汉大学水资源工程与调度全国重点实验室湖北武汉430074 武汉大学海绵城市建设水系统科学湖北省重点实验室湖北武汉430074 江西省灌溉试验中心站江西南昌330201

随着全社会用水需求不断增加,水资源利用冲突与矛盾加剧,水量与水质问题不容乐观。以赣抚平原灌区为例,在总结现有研究成果的基础上,引入条件风险价值理论,基于合作博弈建立水质水量配置模型,并从多个方面对模型效果进行了评估。结果表... 详细信息

随着全社会用水需求不断增加,水资源利用冲突与矛盾加剧,水量与水质问题不容乐观。以赣抚平原灌区为例,在总结现有研究成果的基础上,引入条件风险价值理论,基于合作博弈建立水质水量配置模型,并从多个方面对模型效果进行了评估。结果表明:随着风险控制的置信水平提高,经济和社会效用升高,供水量增加,环境效用下降;随经济损失容忍度提高,经济和社会效用均降低,供水量降低,环境效用升高;考虑初始点的随机模型能够保证较多的总供水量、较高的经济效益和用水满足度;同时可在灌区的实际可供水量条件下,达到灌区缺水损失风险规避要求。研究可为水资源利用冲突管理提供参考。

关键词：水资源配置条件风险价值合作博弈不确定性赣抚平原灌区

一种高效扩增血清松弛环状乙型肝炎病毒DNA全长基因组方法的研究

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空军医学杂志 2015年第3期31卷 147-150页

作者：张纯瑜金维荣董辉解放军第180医院南京军区临床肝病中心福建泉州362000 上海人类基因组研究中心上海市疾病与健康基因组学重点实验室上海201203

目的建立基于滚环复制的、高效扩增血清松弛环状乙型肝炎病毒DNA（HBV RC-DNA）全长基因组的方法。方法以60例慢性乙型肝炎患者血清HBV RC-DNA为研究对象,利用T4 DNA polymerase和T4 DNA ligase,封闭HBV RC-DNA基因组上的缺口,使之成为... 详细信息

目的建立基于滚环复制的、高效扩增血清松弛环状乙型肝炎病毒DNA（HBV RC-DNA）全长基因组的方法。方法以60例慢性乙型肝炎患者血清HBV RC-DNA为研究对象,利用T4 DNA polymerase和T4 DNA ligase,封闭HBV RC-DNA基因组上的缺口,使之成为闭合环状结构;再通过Phi29 DNA polymerase的作用,对闭合环状的HBV基因组进行滚环复制,以滚环复制后的RC-DNA为模板扩增HBV全长基因组。结果成功建立了基于滚环复制的HBV RC-DNA全长基因组扩增方法,可从病毒载量为108~104拷贝/ml样本中扩增出HBV全长基因组。对于107~105拷贝/ml血清样本来说,使用基于RC-DNA滚环复制的全长基因组扩增方法,与以往的一步法扩增相比,扩增效率显著提高。结论基于滚环复制的HBV RC-DNA全长基因组扩增方法具有较高的灵敏度。该方法的建立为HBV全基因组研究提供了一种新的、有效的工具,有望在基础和临床研究中广泛应用。

关键词：松弛环状乙型肝炎病毒DNA 全长基因组扩增滚环复制

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自适应差分进化算法在灌区频率分析中的应用

灌溉排水学报 2019年第2期38卷 101-107页

作者：李天磊殷国玺郭相平刘方平靳伟荣河海大学农业工程学院南京210098 江西省灌溉试验中心站南昌330096

在较短水文系列下灌区规划设计水文频率分析中,枯水设计年的年径流量和年降雨量的精确度难以保证。差分进化算法具有收敛快、参数较少、较强的鲁棒性等特性,但标准差分进化算法具有搜索能力与开发能力相矛盾的缺点。【目的】引入一种随... 详细信息

在较短水文系列下灌区规划设计水文频率分析中,枯水设计年的年径流量和年降雨量的精确度难以保证。差分进化算法具有收敛快、参数较少、较强的鲁棒性等特性,但标准差分进化算法具有搜索能力与开发能力相矛盾的缺点。【目的】引入一种随机扰动与三角函数相结合的迭代结构,保证迭代过程中变异随机性的同时加大收敛速率,构建可用于有较短水文系列的P-Ⅲ型分布曲线参数估值的自适应差分进化算法。【方法】以江西省赣州市南康区窑下坝站的实测降雨资料为例,分别选取1956—2010年和1981—2010年实测降雨量资料为长短系列降雨资料,计算长系列降雨资料下应用OLS准则的离差平方和及其在不同迭代次数下的标准差,计算长短系列降雨资料下不同枯水年的设计值,将自适应差分进化算法与遗传算法及传统的参数估计方法加以比较。【结果】自适应差分进化算法效率高、精度高、寻优结果稳定、鲁棒性强,在长短系列之间4个枯水年的设计值的误差之和最小。【结论】自适应差分进化算法适用于灌区规划的水文频率分析。

关键词：灌区规划优化适线法自适应差分进化算法水文频率分析水平年