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Unfoldomics of prostate cancer： on the abundance and roles of intrinsically disordered proteins in prostate cancer

Asian Journal of Andrology 2016年第5期18卷 662-672页

作者： Kevin S Landau insung na Ryan O Schenck Vladimir N Uversky DepartmentofMolecularMedicine MorsaniCollegeofMedicineUniversityofSouthFloridaTampaFL33612USA USFHealthByrdAlzheimer'sResearchInstitute MorsaniCollegeofMedicineUniversityofSouthFloridaTampaFlorida33612USA LaboratoryofStructuralDynamics StabilityandFoldingofProteinsInstituteofCytologyRussianAcademyofSciencesStPetersburgRussia

Prostatic diseases such as prostate cancer and benign prostatic hyperplasia are highly prevalent among men. The number of studies focused on the abundance and roles of intrinsically disordered proteins in prostate cancer is rather limited. The goal of this study is to analyze the prevalence and degree of disorder in proteins that were previously associated with the prostate cancer pathogenesis and to compare these proteins to the entire human proteome. The analysis of these datasets provides means for drawing conclusions on the roles of disordered proteins in this common male disease. We also hope that the results of our analysis can potentially lead to future experimental studies of these proteins to find novel pathways associated with this disease.

关键词： intrinsical ly disordered proteins posttranslational mod ifications prostate cancer protein-protein interaction proteomics proteome unfoldome

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Computational prediction and validation of specific EmbR binding site on PknH

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Synthetic and Systems Biotechnology 2021年第4期6卷 429-436页

作者： insung na Huanqin Dai Hantian Li Anvita Gupta David Kreda Powell Zhang Xiangyin Chen Lixin Zhang Gil Alterovitz Computational Health Informatics Program Boston Children’s Hospital/Harvard Medical SchoolBostonMA 02115USA Department of Medicine Brigham and Women’s Hospital/Harvard Medical SchoolBostonMA 02115USA State Key Laboratory of Mycology Institute of MicrobiologyBeijing100101 China Department of Computer Sciences Stanford UniversityStanford CA 94305USA Center for Biomedical Informatics Harvard Medical SchoolBostonMA 02115USA State Key Laboratory of Bioreactor Engineering East China University of Science and TechnologyShanghaiChina Department of Biology The Johns Hopkins UniversityBaltimoreMD 21218USA Lexington High School BostonMA 02115USA

Tuberculosis drug resistance continues to threaten global health but the underline molecular mechanisms are not ***(EMB),one of the well-known first-line drugs in tuberculosis treatment is,unfortunately,not free from drug resistance *** studies have shown that some genetic mutations in Mycobacterium tuberculosis(Mtb)EmbR,and EmbC/A/B genes cause EMB ***-PknH pair controls embC/A/B operon,which encodes EmbC/A/B genes,and EMB interacts with EmbA/B ***,the EmbR binding site on PknH was *** conducted molecular simulation on the EmbR-peptides binding structures and discovered phosphorylated PknH 273-280(N′-HEALS^(P)DPD-C′)makesβstrand with the EmbR FHA domain,asβ-MoRF(MoRF;molecular recognition feature)does at its binding *** bond number analysis also supported the peptides’β-MoRF forming activity at the EmbR FHA ***,we discovered that previously known phosphorylation residues might have their chronological order according to the phosphorylation *** discovery validated that Mtb PknH 273-280(N′-HEALSDPD-C′)has reliable EmbR binding *** approach is revolutionary in the computer-aided drug discovery field,because it is the first trial to discover the protein-protein interaction site,and find binding partner in nature from this site.

关键词： Disorder-to-order transition Protein intrinsic disorder Binding site prediction Drug resistance Molecular simulation

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开放教育:一个有待进一步研究的领域

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中国远程教育 2021年第2期 46-58,77页

作者： [德]奥拉夫·扎瓦克奇-里克特 [加]黛安·康拉德阿拉斯·博兹库尔特坚吉兹·哈坎·艾登斯韦尼亚·贝登利耶郑仁星约阿希姆·斯图特乔治·韦利特西亚诺斯丽莎·玛丽·布拉斯科梅丽莎·邦德安德里亚·布朗斯艾丽莎·布鲁恩卡莱娜·多尔西马可·卡尔兹迈克尔·克雷斯亚萨尔·孔达奇维多利亚·马林克斯汀·梅伯格沃尔夫冈·穆斯肯斯索姆·奈杜阿德南·卡尤姆詹妮弗·罗伯茨艾伯特·桑格拉弗兰克·森约·洛各洛帕特丽夏·J.斯莱格·范·特伦肖俊洪(译) 德国奥尔登堡大学开放教育研究中心COER团队德国奥尔登堡卡尔·冯·奥西茨基大学土耳其阿纳多卢大学德国埃尔朗根-纽伦堡弗里德里希·亚历山大大学日本国际基督教大学加拿大皇家大学欧洲远程E-Learning网络协会英国伦敦大学学院德国海德堡教育大学杜伊斯堡-埃森大学中东技术大学德国汉堡大学斐济南太平洋大学美国宾夕法尼亚州立大学南非大学西班牙加泰罗尼亚奥贝塔大学美国东卡罗来纳州立大学中国汕头开放大学不详

本文阐述高等教育背景下开放教育的内容。文章首先介绍开放教育的起源及其理论基础,随后根据远程开放学习研究的宏观、中观和微观层次框架讨论远程开放学习、开放教育实践、开放学术、开放教育资源、慕课、先前学习认定、学习者特征和... 详细信息

本文阐述高等教育背景下开放教育的内容。文章首先介绍开放教育的起源及其理论基础,随后根据远程开放学习研究的宏观、中观和微观层次框架讨论远程开放学习、开放教育实践、开放学术、开放教育资源、慕课、先前学习认定、学习者特征和开放教育国际化等主题的内容。最后从宏观、中观和微观层面提出今后的研究方向。

关键词：开放教育开放学习远程教育灵活学习在线学习开放教育资源国际化

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