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Comparative Transcriptional Profiling and Preliminary Study on Heterosis Mechanism of Super-Hybrid Rice

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Molecular Plant 2010年第6期3卷 1012-1025页

作者： Gui-Sheng Song Hong-Li Zhai Yong-Gang Peng Lei Zhang Gang Wei Xiao- Ying Chen Yu-Guo Xiao Lili Wang Yue-Jun Chen Bin Wu Bin Chen Yu Zhang Hua Chen Xiu-Jing feng Wan-Kui Gong Yao Liu Zhi-Jie Yin feng Wang Guo-Zhen Liu Hong-Lin Xu Xiao-Li Wei Xiao-Ling Zhao Pieter B.f. Ouwerkerk Thomas Hankemeier Theo Reijmers Rob van der Heijden Cong-Ming Lu mei Wang Jan van der Greef Zhen Zhu State Key Laboratory of Plant Genomics Institute of Genetics and Developmental Biology Chinese Academy of Sciences Beijing 100101 China National Plant Gene Research Center (Beijing) Institute of Genetics and Developmental Biology Chinese Academy of Sciences Beijing 100101 China State Key Laboratory of Genetic Engineering Institute of Genetics School of Life Sciences Fudan University Shanghai 200433 China Key Laboratory of Photosynthesis and Environmental Molecular Physiology Institute of Botany Chinese Academy of Sciences Beijing 100093 China fujian Province Key Laboratory of Genetic Engineering for Agriculture Fujian Academy of Agricultural Sciences Fuzhou 350003 China Beijing Institute of Genomics Chinese Academy of Sciences Beijing 101300 China Institute of Biology Leiden University Sylvius Laboratory Wassenaarseweg 72 2333 BE Leiden The Netherlands Leiden/Amsterdam Center for Drug Research Center for Medical Systems Biology Leiden University Einsteinweg 5 2500 RA Leiden The Netherlands SU BioMedicine and TNO Quality of Life Utrechtseweg 48 3700 AJ Zeist The Netherlands

Heterosis is a biological phenomenon whereby the offspring from two parents show improved and superior performance than either inbred parental lines. Hybrid rice is one of the most successful apotheoses in crops utilizing heterosis. Transcriptional profiling of f1 super-hybrid rice Liangyou-2186 and its parents by serial analysis of gene expression （SAGE） revealed 1183 differentially expressed genes （DGs）, among which DGs were found significantly enriched in pathways such as photosynthesis and carbon-fixation, and most of the key genes involved in the carbon-fixation pathway exhibited up-regulated expression in f1 hybrid rice. Moreover, increased catabolic activity of corresponding enzymes and photosynthetic efficiency were also detected, which combined to indicate that carbon fixation is enhanced in f1 hybrid, and might probably be associated with the yield vigor and heterosis in super-hybrid rice. By correlating DGs with yield-related quantitative trait loci （QTL）, a potential relationship between differential gene expression and phenotypic changes was also found. In addition, a regulatory network involving circadian-rhythms and light signaling pathways was also found, as previously reported in Arabidopsis, which suggest that such a network might also be related with heterosis in hybrid rice. Altogether, the present study provides another view for understanding the molecular mechanism underlying heterosis in rice.

关键词： Heterosis super-hybrid rice transcriptional profiling photosynthesis carbon fixation regulatory network.

荧光光谱法研究核黄素与核黄素结合蛋白的相互作用

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光谱学与光谱分析 2012年第3期32卷 719-722页

作者：武小芬蔡朝霞孙术国黄群任国栋何兰马美湖国家蛋品加工技术研发分中心华中农业大学食品科学技术学院湖北武汉430070

运用荧光光谱研究了核黄素与核黄素结合蛋白的相互作用,并探讨了两者间的结合类型、结合常数、结合过程中热力学参数和能量转移。结果表明:核黄素结合蛋白内源荧光的猝灭是由于核黄素与蛋白质之间形成复合物,并符合静态猝灭机理。298,30... 详细信息

运用荧光光谱研究了核黄素与核黄素结合蛋白的相互作用,并探讨了两者间的结合类型、结合常数、结合过程中热力学参数和能量转移。结果表明:核黄素结合蛋白内源荧光的猝灭是由于核黄素与蛋白质之间形成复合物,并符合静态猝灭机理。298,308,318K下核黄素与核黄素结合蛋白的结合常数分别为:5.35×108,1.54×108,0.56×108 ***-1。热力学数据表明核黄素与核黄素结合蛋白之间主要作用力为氢键和范德华力。frster能量转移理论确定了核黄素与核黄素结合蛋白的作用距离与能量转移效率分别为0.70nm与0.39。利用同步荧光光谱研究了核黄素结合蛋白与核黄素结合过程中构象的变化。

关键词：核黄素核黄素结合蛋白荧光光谱荧光猝灭

水杨醛双缩二氨基硫脲二丁基锡配合物的合成及杀菌活性研究

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化学研究与应用 2009年第5期21卷 680-684页

作者：方小牛戴美珍李晓红匡仁云井冈山大学化学化工学院江西吉安343009 江西省峡江中学江西峡江331409

利用1,5-水杨醛双缩二氨基硫脲席夫碱与二丁基氧化锡为原料,在苯-甲苯混合溶剂中回流反应合成了有机锡席夫碱配合物,用元素分析、红外光谱、核磁共振谱对目标化合物结构进行了结构表征,并用X-射线单晶衍射对其结构进行了确证。晶体结构... 详细信息

利用1,5-水杨醛双缩二氨基硫脲席夫碱与二丁基氧化锡为原料,在苯-甲苯混合溶剂中回流反应合成了有机锡席夫碱配合物,用元素分析、红外光谱、核磁共振谱对目标化合物结构进行了结构表征,并用X-射线单晶衍射对其结构进行了确证。晶体结构分析表明,标题配合物的晶体属三斜晶系,P-1空间群,每个独立单元中含有两个分子结构单元,晶胞参数:a=1.29705(6)nm,b=1.36654(7)nm,c=1.68517(8)nm,α=72.059(1)o,β=87.339(1)o,γ=63.435(1)o,V=2.5270(2)nm3,Z=4,Dcalc=1.433 g/cm3,μ=1.119 mm-1,f(000)=1112,R1=0.0563,wR2=0.1530。分子间经典的N—H…N氢键使分子相互缔合形成二聚体,后者再通过范德华作用力结合堆积形成完全的晶体结构。杀菌活性测定结果表明,标题化合物及其类似物的杀菌活性具有较大的选择性,对苏云金杆菌(***)和枯草杆菌(***)的杀菌能力较高,而对大肠杆菌(***)和金黄色葡萄球菌(***)的杀菌能力较低。

关键词：有机锡配合物晶体结构抑菌活性

分子内电荷转移荧光探针1-酮-2-(对二甲氨基苯亚甲基)-四氢萘与人血清白蛋白作用

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应用化学 2010年第11期27卷 1313-1317页

作者：蔡雪梅李建晴卫艳丽董川山西大学环境科学与工程研究中心太原030006 晋中学院化学化工学院

采用荧光及紫外光谱研究了1-酮-2-(对二甲氨基苯亚甲基)-四氢萘(KDTN)与人血清白蛋白(HSA)相互作用的光谱特性。结果表明,静态猝灭和非辐射能量转移是导致KDTN对HSA荧光猝灭的主要原因。测得17、27和37℃3个温度下的结合常数KA分别为1.... 详细信息

采用荧光及紫外光谱研究了1-酮-2-(对二甲氨基苯亚甲基)-四氢萘(KDTN)与人血清白蛋白(HSA)相互作用的光谱特性。结果表明,静态猝灭和非辐射能量转移是导致KDTN对HSA荧光猝灭的主要原因。测得17、27和37℃3个温度下的结合常数KA分别为1.633×108、0.7998×108和0.347×108L/mol,结合位点数n分别为1.7、1.6和1.7;据frster偶极-偶极非辐射能量转移理论,计算得到KDTN与HSA在3个温度下的作用距离r分别为2.64、2.59和2.64nm;能量转移效率E分别为0.5100、0.4797和0.4210。热力学参数表明,二者主要以范德华力或氢键结合;用同步荧光技术研究了KDTN对HSA构象的影响,结果表明,KDTN的加入对HSA构象影响不大。

关键词：酮-(对二甲氨基苯亚甲基)-四氢萘人血清白蛋白荧光光谱法

脱氧雪腐镰刀菌烯醇与人免疫球蛋白的相互作用研究

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分析测试学报 2010年第6期29卷 533-538页

作者：李晓梅李玉琴侯海峰冀海伟李群伟泰山医学院流行病研究所山东泰安271000 泰山医学院药学院山东泰安271016

利用分子模拟技术结合荧光猝灭法、紫外光谱(UV)、傅立叶红外光谱(fTIR)和圆二色性光谱(CD)在模拟生理条件下研究了脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)和人免疫球蛋白(H IgG)的结合常数、主要作用力以及DON对HIgG二级结构的影响。在304、310、318 ... 详细信息

利用分子模拟技术结合荧光猝灭法、紫外光谱(UV)、傅立叶红外光谱(fTIR)和圆二色性光谱(CD)在模拟生理条件下研究了脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)和人免疫球蛋白(H IgG)的结合常数、主要作用力以及DON对HIgG二级结构的影响。在304、310、318 K温度下,测得DON和H IgG的结合常数分别为2.069×104、0.754 9×104、0.523 8×***-1;其焓变(ΔH)和熵变(ΔS)分别为-78.52 ***-1、-176.9 J.(mol.K)-1,研究表明其主要作用力为氢键和范德华力。根据f rster能量非辐射转移理论测得结合位置与色氨酸残基间的距离r为4.62 nm。同步荧光、CD和fTIR研究表明,DON使HIgG的二级结构发生了变化。分子模拟显示DON与HIgG的相互作用力主要是氢键和疏水作用,与实验测得的热力学参数提供的作用力信息一致。该研究为DON在人体内的储存、运输、作用机理及毒理学研究提供了理论依据。

关键词：脱氧雪腐镰刀菌烯醇人免疫球蛋白相互作用

荧光光谱研究吡虫啉与牛血清白蛋白的相互作用

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化学世界 2006年第12期47卷 730-733,761页

作者：张根成王彦卿张红梅陶为华唐树和江苏省滩涂生物资源与环境保护重点建设实验室盐城师范学院应用化学与环境工程研究所江苏盐城224002

运用荧光光谱、紫外光谱法研究了农药吡虫啉与牛血清白蛋白(BSA)的相互作用。实验结果表明,农药分子与BSA形成基态复合物导致BSA内源荧光猝灭,猝灭机理主要为静态猝灭和非辐射能量转移。测定了不同温度下该反应的表观结合常数KA、结合... 详细信息

运用荧光光谱、紫外光谱法研究了农药吡虫啉与牛血清白蛋白(BSA)的相互作用。实验结果表明,农药分子与BSA形成基态复合物导致BSA内源荧光猝灭,猝灭机理主要为静态猝灭和非辐射能量转移。测定了不同温度下该反应的表观结合常数KA、结合位点数n及结合热力学参数,热力学参数的变化表明上述作用过程是自由能降低的自发分子间作用过程,农药分子与BSA之间以氢键和范德华作用力为主;根据f rster能量转移理论,测得供体与受体间结合距离r与能量转移效率E;并用同步荧光技术考察了农药分子对BSA构象的影响。

关键词：吡虫啉牛血清白蛋白荧光猝灭热力学参数能量转移

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头孢克肟与胃蛋白酶相互作用的光谱法研究

化学研究与应用 2016年第5期28卷 673-680页

作者：贾悦杨洪芹郭刘奇王庆黄燕梅李晖四川大学化学工程学院四川成都610065

在胃生理酸度pH=2.0(柠檬酸-柠檬酸钠缓冲)条件下,利用荧光和紫外吸收光谱法及分子对接技术,研究了第三代口服头孢菌素--头孢克肟与胃蛋白酶间的相互作用。实验结果表明:头孢克肟对胃蛋白酶荧光猝灭作用明显,且猝灭过程为静态猝灭。298K... 详细信息

在胃生理酸度pH=2.0(柠檬酸-柠檬酸钠缓冲)条件下,利用荧光和紫外吸收光谱法及分子对接技术,研究了第三代口服头孢菌素--头孢克肟与胃蛋白酶间的相互作用。实验结果表明:头孢克肟对胃蛋白酶荧光猝灭作用明显,且猝灭过程为静态猝灭。298K,304K,310K下,根据Stern-Volmer方程计算的头孢克肟与胃蛋白酶结合常数Ka分别为6.612×10~4,2.740×104,1.024×10~4L·mol^(-1),结合位点数近似为1。ΔGforster非辐射能量转移实验和理论研究,二者间作用距离r=2.053 nm,能量转移效率E=0.525。头孢克肟与胃蛋白酶相互作用的结果,导致胃蛋白酶构象及微环境的变化。分子模拟对接技术的应用,在分子水平确定了头孢克肟与胃蛋白酶结合的适宜位点。

关键词：头孢克肟胃蛋白酶荧光光谱法相互作用分子对接

4,4′-二(2,2′:6′,2″-三联吡啶-4′-酚羟甲基)联苯(L^1)的合成及结构表征

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黑龙江大学自然科学学报 2009年第4期26卷 522-526页

作者：马东升李伟张秀梅陆占国黑龙江大学化学化工与材料学院哈尔滨150080 哈尔滨商业大学食品工程学院化学中心哈尔滨150086

合成了一个新的具有刚性间隔体的双三联吡啶配体—4,4′-二(2,2′∶6′,2″-三联吡啶-4′-酚羟甲基)联苯(L1)。核磁氢谱及X射-线单晶结构表征表明:配体L1晶体属于三斜晶系,P-1空间群,晶胞参数a=1.3247(6)nm,b=1.3704(5)nm,c=1.3892(7)nm... 详细信息

合成了一个新的具有刚性间隔体的双三联吡啶配体—4,4′-二(2,2′∶6′,2″-三联吡啶-4′-酚羟甲基)联苯(L1)。核磁氢谱及X射-线单晶结构表征表明:配体L1晶体属于三斜晶系,P-1空间群,晶胞参数a=1.3247(6)nm,b=1.3704(5)nm,c=1.3892(7)nm,α=103.870°,β=97.650(15)°,δ=115.750(12)°,V=2 122.5(15)3,Z=2,f(000)=868,R=0.0890,wR=0.1856。在分子间氢键作用和范德华力作用下形成三维堆积网状结构。

关键词：双三联吡啶合成晶体结构

新型药物2-甲基-2,4-二乙氧羰基-6-三氟甲氧基-1,2-二氢喹啉的合成及其与HSA的相互作用

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分析试验室 2016年第7期35卷 745-749页

作者：黄小艳程姣燕余腊妹余茜黄振钟江西师范大学化学与化工学院南昌330022

合成了一种新化合物2-甲基-2,4-二乙氧羰基-6-三氟甲氧基-1,2-二氢喹啉(M DTDQ),采用共振光散射法(RLS)、荧光光谱法、紫外光谱法以及电化学阻抗法(EIS)研究了MDTDQ与人血清白蛋白(HSA)的作用机理。电化学阻抗及共振光散射光谱分析表明... 详细信息

合成了一种新化合物2-甲基-2,4-二乙氧羰基-6-三氟甲氧基-1,2-二氢喹啉(M DTDQ),采用共振光散射法(RLS)、荧光光谱法、紫外光谱法以及电化学阻抗法(EIS)研究了MDTDQ与人血清白蛋白(HSA)的作用机理。电化学阻抗及共振光散射光谱分析表明HSA与MDTDQ发生结合形成了复合物;MDTDQ对HSA有荧光猝灭作用,由Stern-Volmer方程以及紫外吸收光谱判断其猝灭过程主要为静态猝灭;通过双对数方程计算出298 K,304 K,310 K时两者的结合常数及其相应的结合位点数;根据热力学参数方程计算出△H、△S和△G的值分别为-64.28 k J/mol,-131.70 J·mol-1·K-1,-24.95k J/mol,推断两者之间的作用力类型主要是氢键和范德华力;由frster非辐射能量转移理论得到MDTDQ与HSA的结合距离为2.85 nm;同步荧光光谱数据表明MDTDQ引起了HSA构象的变化。采用分子模拟对接分析了MDTDQ与HSA的结合,所得结论与实验研究结果一致。

关键词： 2-甲基-2,4-二乙氧羰基-6-三氟甲氧基-1,2-二氢喹啉人血清白蛋白荧光光谱静态猝灭共振光散射