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甘蓝型油菜种子和角果皮中硫苷含量的动态变化及转录组关联分析

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中国农业科学 2018年第4期51卷 635-651页

作者：田志涛赵永国 LENKA Havlickova HE Zhesi REA L Harper ian bancroft 邹锡玲张学昆陆光远中国农业科学院油料作物研究所/农业部油料作物生物学重点实验室 CNAP University of York

【目的】探索甘蓝型油菜不同发育时期种子和角果皮硫苷含量的动态变化规律,通过转录组关联分析解析控制硫苷含量变异的遗传机制。【方法】在由113个油菜品种构成的自然群体中,利用高效液相色谱法检测不同发育时期油菜种子及角果皮中的... 详细信息

【目的】探索甘蓝型油菜不同发育时期种子和角果皮硫苷含量的动态变化规律,通过转录组关联分析解析控制硫苷含量变异的遗传机制。【方法】在由113个油菜品种构成的自然群体中,利用高效液相色谱法检测不同发育时期油菜种子及角果皮中的硫苷含量。提取油菜幼嫩叶片m RNA并进行m RNA-Seq测序,开发了355 536个单核苷酸多态性标记(SNP)和116 098个基因表达量标记(GEM)。将开发的SNPs和GEMs分别导入到混合线性模型(MLM)和回归分析模型中进行关联分析,获得与油菜硫苷表型变异显著相关的遗传位点,进一步通过序列比对和功能预测筛选确定候选基因。【结果】授粉后15 d(15 DAP),油菜种子和角果皮的硫苷含量变异范围分别是1.69—20.45和1.47—25.23μmol·g-1。25 DAP种子、25 DAP角果皮以及成熟种子的硫苷变异范围分别是2.17—147.21、0.73—130.77和8.87—111.83μmol·g-1。后两个时期(即25 DAP和成熟期)的硫苷含量表现出较大变异,适合进行转录组关联分析。基于m RNA-Seq测序数据,经质量控制后获得256 397个高质量的SNP标记(MAF>0.01)和53 889个GEM标记(平均基因表达量>0.4)。利用SNP标记对成熟种子、25 DAP种子和25 DAP角果皮硫苷含量进行关联分析,分别检测到167、158和3个显著关联位点(-log10P>6.71)。其中,与成熟种子显著关联的SNP标记形成5个明显的关联峰,分别位于A2、A9、C2、C7和C9染色体上。同时,利用GEM标记进行的关联分析中,分别检测到127、16和24个与成熟种子、25 DAP种子、25 DAP角果皮硫苷含量显著关联的位点(-log10P>6.03),这些位点主要分布在A2、A8、A9、C2和C9染色体上并形成明显的关联峰。其中,成熟种子和25 DAP角果皮在A9、C2和C9染色体上形成共同的关联峰。通过与公共数据库的基因组序列比对和功能注释,共筛选到295个功能基因,其中25个基因涉及硫苷代谢网路途径,直接参与硫苷的调控。其余基因虽然没有直接参与硫苷代谢过程,但是它们大多属于转录因子基因、刺激响应因子基因,涉及细胞过程或是具有催化活性,因而推测在硫苷积累中同样起到重要作用。【结论】油菜角果皮中的硫苷含量较高,而且与种子硫苷含量显著正相关,是硫苷合成或转运的重要器官。共检测到328个SNP显著标记和144个GEM显著标记,筛选到25个与硫苷合成或者转运有关的功能基因以及73个功能未知的新基因。

关键词：甘蓝型油菜硫代葡萄糖苷动态变化转录组关联分析单核苷酸多态性标记基因表达量标记

X-ray absorption study of tribofilms from ZDDP and overbased salicylate detergents

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Chinese Chemical Letters 2009年第1期20卷 119-122页

作者： Yong Wan M. Kasrai G.M. bancroft School of Mechanical Engineering Qingdao Technological University Qingdao 266033 China Department of Chemistry University of Western Ontario London Ontario N6A 5B7 Canada

The interaction of overbased salicylate detergents with zinc dialkyldithiophosphates （ZDDP） and its effect on the formation of tribofilms under boundary lubrication have been studied by means of X-ray absorption near-edge structure spectroscopy. The results show that addition of metallic detergents to neat ZDDP results in the change of surface chemistry of the tribofilm formed from neat ZDDP. Calcium from detergents is digested in the tribofilm. For the high overbased detergents, the deposit of overbasing agent CaCO3 in the tribofilm is also observed along with the formation of calcium phosphate in tribofilms.

关键词： ZDDP Salicylate detergent Surface chemistry XANES analysis

XANES analysis of tribo-chemical and thermal films generating from some organic polysulfides

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Chinese Science Bulletin 2006年第22期51卷 2710-2716页

作者： YI Hongling ZENG Xiangqiong CAO Yan RENTianhui M. Kasrai G. M. bancroft School of Chemistry and Chemical Engineering Shanghai Jiaotong University Shanghai 200240 China Department of Chemistry University of Western Ontario LondonOntario N6A5B7 Canada

X 光检查吸收近的边结构(XANES ) 光谱学第一被用来描绘从烷基，本甲基和包含酰的器官的 polysulfides 产生的 triboehemical 和热电影的化学性质。从这些 polysulfides 产生的热电影主要由 FeSO4l 和烷基化二硫组成，这被发现了也存在... 详细信息

X 光检查吸收近的边结构(XANES ) 光谱学第一被用来描绘从烷基，本甲基和包含酰的器官的 polysulfides 产生的 triboehemical 和热电影的化学性质。从这些 polysulfides 产生的热电影主要由 FeSO4l 和烷基化二硫组成，这被发现了也存在在表面下并且从包含酰的 polysulfides 产生的热电影的体积。Undertriboehemical 条件，电影的作文依赖于添加剂的分子结构。也就是，从烷基 polysulfide 产生的 triboehemical 电影由烷基化二硫组成在外面表面， FeSO_4 的混合物， FeS_2 和亚在表面下，并且 FeSO_4in 体积；为本甲基 polysulfide 的 triboehemical 电影的作文由 FeSO4 组成在外面，出现作文在表面下并且体积与烷基 *** 一样是包含酰的 polysulfides， triboehemical 电影由烷基化二硫组成在外面表面，和 FeS_2 在表面下并且体积。

关键词：有机聚硫化物 XANES 薄膜学 X射线吸收

Sequence-led genomics in Brassica

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Sequence-led genomics in Brassica

高碱值硫化烷基酚钙盐摩擦膜的XANES研究

第十一届全国植物基因组学大会

作者： lan bancroft John Innes Centre Norwich Research ParkColneyNorwich NR4 7UHU.K

The cultivated Brassica species,like Arabidopsis thaliana,are members of the Brassicaceae family. Brassica rapa(n=10) contains the Brassica A genome,which is the smallest(～500 Mb),*** (n=8) contains the B genome and ...

关键词：

来源： cnki会议评论

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真空科学与技术学报 2009年第1期29卷 78-81页

作者：万勇 M. Kasrai G.M. bancroft 青岛理工大学机械工程学院青岛266033 Department of Chemistry The University of Western Ontario Ontario Canada N6G 5B7

本文利用碳的K-边、钙的L-边和硫的K-边和L-边X射线吸收精细结构光谱(XANES)系统研究了高碱值烷基酚盐润滑下摩擦膜的表面化学结构。摩擦学实验在高频摩擦磨损试验机上进行,结果表明,高碱值烷基酚盐具有一定的抗磨性能,其原因在于摩擦... 详细信息

本文利用碳的K-边、钙的L-边和硫的K-边和L-边X射线吸收精细结构光谱(XANES)系统研究了高碱值烷基酚盐润滑下摩擦膜的表面化学结构。摩擦学实验在高频摩擦磨损试验机上进行,结果表明,高碱值烷基酚盐具有一定的抗磨性能,其原因在于摩擦导致清净剂胶体结构被破坏,释放的碳酸钙纳米颗粒沉积在表面上形成摩擦膜,从而降低了材料的接触,起到抗磨作用。

关键词：抗磨性能薄膜金属清净剂 X射线吸收精细结构光谱(XANES)

标准化测试在学校问责制中的角色——美国加州的经验教训

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考试研究 2010年第4期6卷 4-20页

作者： Kim bancroft 杜承达美国加州大学萨克拉门托分校教师教育系北京大学外国语学院

以一年或者更短的间隔为期,通过对学生进行标准化测试的方法,收集反映学生学习程度以及学校、教师教学能力的相关数据,是当前美国学校教育改革中的一个重要内容。文章以美国加利福尼亚州为例,考察了上述改革的实施情况,认为在《不让一... 详细信息

以一年或者更短的间隔为期,通过对学生进行标准化测试的方法,收集反映学生学习程度以及学校、教师教学能力的相关数据,是当前美国学校教育改革中的一个重要内容。文章以美国加利福尼亚州为例,考察了上述改革的实施情况,认为在《不让一个孩子掉队》(NCLB)法案推动下,相应的"学校文化"正在逐渐形成,即教师、学生和家长都开始认识到标准化测试在学生学业进步中的重要作用,成绩不好的学生也可以从中得到他们需要的帮助。在此过程中,一些在测试中成绩不佳的学校,可以以标准化测验的成绩为依据,转而雇佣职业素质更佳的校长与教师。然而,学校问责制对标准化测试的过分依赖也产生了一系列问题,如学校在有限的学科里减少与测试无关的课程安排,或者由于测试成绩不佳而惩罚一些在提高学生成绩方面能力有限的学校,包括那些学生大多是穷孩子或者移民后裔的学校。

关键词：标准化测验问责制改革加利福尼亚州经验教训

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泰国的红宝石

国外非金属矿与宝石 1990年第2期 37-39,42页

作者： Peter bancroft 王家枢中国地质矿产信息研究院

泰国盛产红宝石,近年来已成为著名的国际宝石中心。本文全面地描述了泰国红宝石的开采、加工、贸易及市场概况。（共4页)

关键词：泰国红宝石矿床地质采矿

几种有机多硫化物的摩擦膜和热膜的XANES分析

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科学通报 2006年第16期51卷 1875-1880页

作者：易红玲曾祥琼曹燕任天辉 M. Kasrai G. M. bancroft 上海交通大学化学化工学院上海200240 Department of Chemistry University of Western Ontario London Ontario N6A5B7 Canada

采用X射线吸收精细结构光谱(XANES)对烷基、苄基以及两种酰基有机多硫化物与钢表面反应生成的摩擦膜和热膜的化学特征进行了分析.结果表明,热氧化条件下,4种多硫化物与钢表面反应生成的热膜的主要成分是FeSO4,酰基多硫化物BOOS形成的热... 详细信息

采用X射线吸收精细结构光谱(XANES)对烷基、苄基以及两种酰基有机多硫化物与钢表面反应生成的摩擦膜和热膜的化学特征进行了分析.结果表明,热氧化条件下,4种多硫化物与钢表面反应生成的热膜的主要成分是FeSO4,酰基多硫化物BOOS形成的热膜的次表面和本体中还含有少量烷基二硫化物.生成的摩擦膜中,多硫化物的结构不同呈现出不同的特征,其中烷基多硫化物最外层表面以烷基二硫化物为主,苄基多硫化物最外层表面以FeSO4为主,两者摩擦膜的次表面主要是FeSO4,FeS2和亚砜的混合物,本体是FeSO4;而两种酰基多硫化物摩擦膜的最外层表面都是以烷基二硫化物为主,次表面和本体主要是FeS2.

关键词：有机多硫化物 XANES 摩擦膜热膜

The HIF-1α/PLOD2 axis integrates extracellular matrix organization and cell metabolism leading to aberrant musculoskeletal repair

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Bone Research 2024年第2期12卷 289-301页

作者： Heeseog Kang Amy L.Strong Yuxiao Sun Lei Guo Conan Juan Alec C.bancroft Ji Hae Choi Chase A.Pagani Aysel A.Fernandes Michael Woodard Juhoon Lee Sowmya Ramesh Aaron W.James David Hudson Kevin N.Dalby Lin Xu Robert J.Tower Benjamin Levi Center for Organogenesis Regeneration and TraumaDepartment of SurgeryUniversity of Texas SouthwesternDallasTX 75390USA Section of Plastic Surgery Department of SurgeryUniversity of MichiganAnn ArborMI 48109USA Quantitative Biomedical Research Center Peter O’Donnell Jr.School of Public HealthUniversity of Texas SouthwesternDallasTX 75390USA Department of Orthopedics and Sports Medicine University of WashingtonSeattleWA 98195USA Division of Chemical Biology and Medicinal Chemistry College of PharmacyUniversity of Texas at AustinAustinTX 78712USA Department of Pathology Johns Hopkins UniversityBaltimoreMD 21218USA

While hypoxic signaling has been shown to play a role in many cellular processes,its role in metabolism-linked extracellular matrix(ECM)organization and downstream processes of cell fate after musculoskeletal injury remains to be ***(HO)is a debilitating condition where abnormal bone formation occurs within extra-skeletal *** andhypoxia-inducible factor 1α(HIF-1α)activation have been shown to promote ***,the underlying molecular mechanisms bywhich the HIF-1αpathway in mesenchymal progenitor cells(MPCs)contributes to pathologic bone formation remain to ***,we used a proven mouse injury-induced HO model to investigate the role of HIF-1αon aberrant cell ***-cell RNA sequencing(scRNA-seq)and spatial transcriptomics analyses of the HO site,we found that collagen ECM organizationis the most highly up-regulated biological process in *** mesenchymal cell-specific deletion of Hif1α(Hoxa11-CreER^(T2);Hif1a^(fl/fl))significantly mitigated HO in ***-seq analysis of these Hoxa11-CreER^(T2);Hif1a^(fl/fl)mice identified the PLOD2/LOXpathway for collagen cross-linking as downstream of the HIF-1αregulation of ***,our scRNA-seq data and mechanisticstudies further uncovered that glucose metabolism in MPCs is most highly impacted by HIF-1α*** a translational aspect,a pan-LOX inhibitor significantly decreased HO.A newly screened compound revealed that the inhibition of PLOD2 activity in MPCssignificantly decreased osteogenic differentiation and glycolytic *** suggests that the HIF-1α/PLOD2/LOX axis linked tometabolism regulates HO-forming MPC *** results suggest that the HIF-1α/PLOD2/LOX pathway represents a promisingstrategy to mitigate HO formation.

关键词： metabolism skeletal aberrant