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Analysis of codon usage patterns in Bupleurum falcatum chloroplast genome

Chinese Herbal Medicines 2023年第2期15卷 284-290页

作者： Mengqi Gao xiaowei huo Liting Lu Mengmeng Liu Gang Zhang College of Traditional Chinese Medicine Hebei UniversityBaoding 071002China College of Pharmaceutical Science Institute of Life Science and Green DevelopmentHebei UniversityBaoding 071002China College of Pharmacy and Shaanxi Qinling Application Development and Engineering Center of Chinese Herbal Medicine Shaanxi University of Chinese MedicineXi’an 712046China

Objective In order to distinguish the traditional Chinese medicine Bupleurum falcatum and its adulterants effectively and develop a better understanding of the factors affecting synonymous codon usage,codon usage patterns of chloroplast genome,we determine the complete chloroplast(cp)genome of *** and clarify the main factors that influence codon usage patterns of 78 genes in *** chloroplast *** The total genomic DNA of fresh leaves from a single individual of *** was extracted with EASYspin plus Total DNA Isolation Kit and 2μg genome DNA was sequenced using Illumina Hiseq 2500 Sequencing *** cp genome of *** was reconstructed with MITObim v1.8 and annotated in the program CPGAVAS2 with default *** script and Codon W were used to calculate the codon usage bias *** The full length of *** cp genome was 155851 bp,132 different genes were annotated in this cp genome containing 80 protein-coding genes,30 tRNA genes,and four rRNA *** codon usage models tended to use A/T-ending *** neutrality plot,ENC plot,PR2-Bias plot and correspondence analysis showed that both compositional constraint under selection and mutation could affect the codon usage models in *** cp ***,three optimal codons were identified and most of these three optimal codons ended with G/*** The cp genome of *** has been characterized and the codon usage bias in *** cp genome is influenced by natural selection,mutation pressure and nucleotide *** results will provide much more barcode information for species discrimination and lay a foundation for future research on codon optimization of exogenous genes,genetic engineering and molecular evolution in ***.

关键词： Bupleurum falcatum L. chloroplast genome codon usage

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Rumen Degradation Characteristics of Six Types of Common Roughage in Khorchin Beef Cattle in Tongliao City

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Animal Husbandry and Feed Science 2018年第3期10卷 201-205页

作者： huo xiaowei Wuha Gantu College of Animal Science and Technology Inner Mongolia University for Nationalities Tongliao 028000 China Epidemic Control Center of Ongniud Bannar Agriculture and Animal Husbandry Bureau Chifeng 024500 China

[Objective] The paper was to study the degradation characteristics of different types of roughage in Khorchin beef cattle. [Method] The nylon bag method was used to determine the rumen degradability of six types of roughage： dry matter （DM）, crude protein （CP）, neutral detergent fiber （NDF） and acid detergent fiber （ADF）. [Result] Among the six types of roughage, alfalfa hay had the highest effective degradability of DM and CP in rumen; followed by alfalfa block, corn silage, leymus chinensis and corn stover, and the effective degradability of rice straw was lowest. In terms of effective degradability of NDF and ADF, alfalfa hay was the most effective, while leymus chinensis was the least effective. [Conclusion] Considering degradation characteristics of six types of roughage in Khorchin beef cattle, alfalfa hay possesses the highest nutritional value, while rice straw has the lowest value.

关键词： Beef cattle Rumen degradability Nylon-bag method

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日本目录规则的嬗变

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图书馆 2017年第12期 51-55,106页

作者：霍晓伟国家图书馆北京100081

我国历来重视对西方世界编目规则的研究,却极少关注日文编目规则。文章系统梳理了日本目录规则的历史变迁,总结其特点、内容的变化、编目理念受国际编目环境的影响程度以及编目思想的精髓等,以期为我国的日文编目及语言与编目传统都具... 详细信息

我国历来重视对西方世界编目规则的研究,却极少关注日文编目规则。文章系统梳理了日本目录规则的历史变迁,总结其特点、内容的变化、编目理念受国际编目环境的影响程度以及编目思想的精髓等,以期为我国的日文编目及语言与编目传统都具有一定相似性的中文编目提供借鉴。

关键词：日本目录规则嬗变款目原则国际化

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Rumen Degradation Regularity of Dry Matter and Crude Protein of Common Roughage in Beef Cattle

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Animal Husbandry and Feed Science 2016年第2期8卷 106-109页

作者： Zhang Ying huo xiaowei Zhang YaLi Institute of Animal Science and Technology Inner Mongolia University for Nationalities Tongliao 028000 China Institute of Animal Disease Prevention and Control Tonghao 028000 China Aohan Qi Xinhui High School Chifeng 024300 China

Three individuals of Horqin yellow cattle equipped with permanent fistula, weighed （548 ±21） kg, were sdected as the experimental animals. The ru- men degradation characteristics of dry matter （DM） and crude protein （CP） of roughage at 6, 12, 24, 48 and 72 h were measured by nylon bag method. The re- suits showed that the effective degradation rates of DM and CP of alfalfa hay were the highest, while higher contents of rapid degradation part and potential degrada- tion part of DM and CP also resulted in higher degradation rates of DM and CP. The effective degradation rates of CP and DM of roughage presented strong positive correlation with CP, but showed strong negative correlation with neutral detergent fiber （NDF）. The effective degradation rates of CP of five roughages successively were alfalfa hay 〉 alfalfa block 〉 ryegrass 〉 silage corn 〉 straw.

关键词： Dry matter Crude protein Roughage Rumen degradation rate

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《新日本目录规则》的结构和内容特点浅议

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国家图书馆学刊 2017年第3期26卷 87-92页

作者：霍晓伟白婧国家图书馆

基于2009年编制的《资源描述与检索》,日本编目委员会深入研究并修订了本国编目规则———《新日本目录规则》。分析《新日本目录规则》与以往各版本《日本目录规则》及RDA在结构与内容方面的变化或异同,在此基础上总结其特点,以期为我... 详细信息

基于2009年编制的《资源描述与检索》,日本编目委员会深入研究并修订了本国编目规则———《新日本目录规则》。分析《新日本目录规则》与以往各版本《日本目录规则》及RDA在结构与内容方面的变化或异同,在此基础上总结其特点,以期为我国日文编目应用RDA提供借鉴。

关键词：新日本目录规则结构特点内容特点 RDA 国际化

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北京古城城市设计中的人文尺度

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世界建筑 2002年第2期 66-71页

作者：张杰霍晓卫清华大学建筑学院

北京古城的规划设计中存在人文尺度的设计原则,这些原则包括空间距离与视域范围两个方面,二者同时作用于城市、建筑群,赋予北京古城城市设计丰富的人文含义,对于现代城市设计具有重要的启示。

关键词：北京古城城市设计人文尺度空间距离

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不同粗饲料组合日粮对不同牧草在肉牛瘤胃内降解特性的影响

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河南农业科学 2015年第2期44卷 135-138,155页

作者：张颖霍晓伟内蒙古民族大学动物科学技术学院内蒙古通辽028000 内蒙古民族大学畜禽疫病防控研究所内蒙古通辽028000

为研究不同粗饲料日粮在肉牛瘤胃中的降解规律,选择3头体质量相近的装有永久性瘘管的科尔沁黄牛为试验动物,饲喂含有不同苜蓿比例（0~70%）的稻草基础日粮,采用尼龙袋法测定瘤胃中7种牧草（稻草、王草、东非狼尾草、幼嫩苜蓿、苜蓿草块... 详细信息

为研究不同粗饲料日粮在肉牛瘤胃中的降解规律,选择3头体质量相近的装有永久性瘘管的科尔沁黄牛为试验动物,饲喂含有不同苜蓿比例（0~70%）的稻草基础日粮,采用尼龙袋法测定瘤胃中7种牧草（稻草、王草、东非狼尾草、幼嫩苜蓿、苜蓿草块、三叶草、小冠花）干物质（DM）、粗蛋白（CP）、中性洗涤纤维（NDF）48 h的降解特性。结果显示,随着日粮中苜蓿比例的增加,7种牧草DM、CP和NDF的降解率增加,当日粮中苜蓿比例从0增到30%时,7种牧草DM、CP和NDF降解率提高的幅度比较大,苜蓿含量从50%增到70%时,降解率提高的幅度降低。苜蓿比例为70%时,稻草、王草、三叶草、小冠花、东非狼尾草DM的降解率分别比苜蓿比例0组显著高3.74%、1.96%、1.46%、1.88%、1.73%,稻草、王草、苜蓿草块、三叶草、小冠花、东非狼尾草NDF的降解率分别比苜蓿比例0组显著高5.17%、2.69%、1.69%、2.01%、1.67%、2.19%。7种牧草CP的降解率在各苜蓿比例（0、30%、50%、70%）组间差异均不显著。可见,稻草日粮中添加苜蓿可明显提高牧草DM、NDF的瘤胃降解率,对CP影响较小。

关键词：瘤胃降解率牧草干物质粗蛋白中性洗涤纤维

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“织补城市”思想引导下的株洲旧城更新

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城市规划 2009年第1期33卷 51-56页

作者：张杰刘岩霍晓卫清华大学建筑学院北京清华城市规划设计研究院北京清华城市规划设计研究院历史文化名城所

随着城市化的推进和城市功能结构的提升,"退二进三"已成为株洲旧城发展的重要方面。文章首先在理论上阐述了"织补城市"规划思想的发展和基本原则,然后结合株洲旧城改造和整治的实践,在生态、用地与产业、公共设施、交通、形态肌理和特... 详细信息

随着城市化的推进和城市功能结构的提升,"退二进三"已成为株洲旧城发展的重要方面。文章首先在理论上阐述了"织补城市"规划思想的发展和基本原则,然后结合株洲旧城改造和整治的实践,在生态、用地与产业、公共设施、交通、形态肌理和特色环境、社会结构等方面,系统地提出了株洲旧城织补的规划战略和控制内容。

关键词：株洲旧城织补

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Prokaryotic Expression and Antigenic Analysis of Wbkc Gene from Brucella abortus

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Agricultural Biotechnology 2014年第2期3卷 51-53页

作者： Xiangyang LI Xueli WANG Kai LIU xiaowei huo Yinghong WU Xianhua ZHANG Jiabao ZHANG Adult Education College Inner Mongolia University for the Nationalities College of Animal Science and Technology Inner Mongolia University for the Nationalities Institute of Agricultural Technology Development and Application in Farming-pastoral Zone Inner Mongolia University for the Nationalities Department of Agronomy Jilin University

[ Objective ] This study aimed to clone and express formyltransferase （Wbkc） gene from Brucella abortus in E. coli, purify the expressed protein and analyze its immunogenicity. [Method] A gene encoding 27 -35 ku formyltransferase （Wbkc） was amplified from the genomic DNA of BruceUa abortus by PCR. The amplified fragments were digested with BamH I and Sal I, and inserted into pET28a vector. The constructed recombinant plasmid pET 28a-Wbkc was trans- formed into E. coli BL21 and was induced to express the fusion protein. Subsequently, the protein was purified by histidine-binding resin column chromatography, and the immunogenicity was detected by Western blot assay. The recombinant plasmid was identified by colony PCR, double digestion and sequencing analysis. [ Result] Wbkc was successfully cloned and expressed in E. coli. A specific protein band of 29 ku was detected by SDS-PAGE. Western blot showed specific im- munoreactivity of the purified fusion protein. [ Conclusion] This study provided a solid foundation for further investigating diagnostic proteins for brucellosis and developing Brucella gene-deletion vaccines.

关键词： Brucella abortus Formyltransferase (Wbkc) gene Prokaryotic expression Antigenicity

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世界文化遗产地对城镇旅游经济发展的影响

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城市规划 2012年第9期36卷 85-90页

作者：张杰卢刘颖霍晓卫清华大学建筑学院中国城市规划学会北京清华城市规划设计研究院

在我国,世界文化遗产基本都采取了在属地设立专门机构直接管理的方式,所以世界文化遗产的保护与利用与遗产地所在的城镇的社会经济发展密切相关。近年来,世界文化遗产地产生的旅游经济效益备受关注。如何全面、理性地把握这种效益对城... 详细信息

在我国,世界文化遗产基本都采取了在属地设立专门机构直接管理的方式,所以世界文化遗产的保护与利用与遗产地所在的城镇的社会经济发展密切相关。近年来,世界文化遗产地产生的旅游经济效益备受关注。如何全面、理性地把握这种效益对城镇的影响,是我国现有的32处世界文化遗产地及更多潜在的遗产地城镇需要重视的课题。本文拟通过大量数据分析对此进行系统讨论。

关键词：世界文化遗产地城镇旅游经济发展

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