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Bronchoalveolar lavage fluid metagenomic next-generation sequencing assay for identifying pathogens in lung cancer patients

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BIOCELL 2024年第4期48卷 623-637页

作者： JIYU WANG huixia li DEYUAN ZHOU liHONG BAI KEJING TANG Division of Pulmonary and Critical Care Medicine The First Affiliated HospitalSun Yat-sen UniversityGuangzhouChina Institute of Pulmonary Diseases Sun Yat-sen UniversityGuangzhouChina Department of Pharmacy The First Affiliated HospitalSun Yat-sen UniversityGuangzhouChina

Background:For patients with lung cancer,timely identiﬁcation of new lung lesions as infectious or non-infectious,and accurate identiﬁcation of pathogens is very important in improving OS of *** a new auxiliary examination,metagenomic next-generation sequencing(mNGS)is believed to be more accurate in diagnosing infectious diseases in patients without underlying diseases,compared with conventional microbial tests(CMTs).We designed this study toﬁnd out whether mNGS has better performance in distinguishing infectious and non-infectious diseases in lung cancer patients using bronchoalveolar lavageﬂuid(BALF).Materials and Methods:This study was a real-world retrospective review based on electronic medical records of lung cancer patients with bronchoalveolar lavage(BAL)and BALF commercial mNGS testing as part of clinical care from 1 April 2019 through 30 April 2022 at The First Afﬁliated Hospital of Sun Yat-sen University.164 patients were included in this *** were categorized into the pulmonary non-infectious disease(PNID)group(n=64)and the pulmonary infectious disease(PID)group(n=100)groups based onﬁnal ***:BALF mNGS increased the sensitivity rate by 60%compared to CMTs(81%vs.21%,p0.1).Among the patients with PID,bacteria were the most common cause of *** infections occurred in 32%of patients,and Pneumocystis Yersini was most *** with Tyrosine kinase inhibitors(TKIs)therapy possess longer overall survival(OS)than other anti-cancer agents,the difference between TKIs and immuno-checkpoint inhibitors(ICIs)was insigniﬁcant(median OS TKIs *** ***-angiogenic *** ***=76 vs.84 vs.61 vs.58 vs.60).Conclusions:our study indicates that BALF mNGS can add value by improving overall sensitivity in lung cancer patients with potential pulmonary infection,and was outstanding in identifying Pneumocystis *** could be able

关键词： Lung cancer Bronchoalveolar lavage fluid Metagenomic next-generation sequencing Infectious diseases

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Pseudorabies virus VHS protein abrogates interferon responses by blocking NF-κB and IRF3 nuclear translocation

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Virologica Sinica 2024年第4期39卷 587-599页

作者： Zhenfang Yan Jiayu Yue Yaxin Zhang Zhengyang Hou Dianyu li Yanmei Yang Xiangrong li Adi Idris huixia li Shasha li Jingying Xie Ruofei Feng Key Laboratory of Biotechnology and Bioengineering of State Ethnic Biomedical Research Center Northwest Minzu UniversityLanzhou730030China College of life Science and Engineering Northwest Minzu UniversityLanzhou730030China Gansu Tech Innovation Center of Animal Cell Biomedical Research CenterNorthwest Minzu UniversityLanzhou730030China Engineering Research Center of Key Technology and Industrialization of Cell-based Vaccine Ministry of EducationBiomedical Research CenterNorthwest Minzu UniversityLanzhou730030China Centre for Immunology and Infection Control School of Biomedical SciencesQueensland University of TechnologyKelvin GroveQueensland4702Australia

Herpesviruses antagonize host antiviral responses through a myriad of molecular strategies culminating in the death of the host *** virus(PRV)is a significant veterinary pathogen in pigs,causing neurological sequalae that ultimately lead to the animal's *** is known to trigger apoptotic cell death during the late stages of *** virion host shutdown protein(VHS)encoded by UL41 plays a crucial role in the PRV infection *** this study,we demonstrate that UL41 inhibits PRV-induced activation of inflammatory cytokine and negatively regulates the cGAS-STING-mediated antiviral activity by targeting IRF3,thereby inhibiting the translocation and phosphorylation of ***,mutating the conserved amino acid sites(E192,D194,and D195)in the RNase domain of UL41 or knocking down UL41 inhibits the immune evasion of PRV,suggesting that UL41 may play a crucial role in PRV's evasion of the host immune response during *** results enhance our understanding of how PRV structural proteins assist the virus in evading the host immune response.

关键词： Pseudorabies virus(PRV) UL41 IRF3 Interferon cGAS-STING

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追踪隔离措施与核酸检测力度对南京新型冠状病毒肺炎疫情影响的分析与评估

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工程数学学报 2024年第2期41卷 217-231页

作者：王凯李慧霞李云赵洪涌南京航空航天大学数学学院南京211106 广州大学应用数学研究中心广州510006 飞行器数学建模与高性能计算工业和信息化部重点实验室(南京航空航天大学) 南京211106

2021年7月,南京市爆发由德尔塔变异毒株引起的新型冠状病毒肺炎疫情(COVID-19)。依据南京市卫生健康委员会公布的实际数据,建立符合疫情发展的时间依赖COVID-19传播动力学模型,将实时数据应用于模型参数估计和有效再生数计算,分析和评... 详细信息

2021年7月,南京市爆发由德尔塔变异毒株引起的新型冠状病毒肺炎疫情(COVID-19)。依据南京市卫生健康委员会公布的实际数据,建立符合疫情发展的时间依赖COVID-19传播动力学模型,将实时数据应用于模型参数估计和有效再生数计算,分析和评估了此次疫情采取的隔离防控措施和核酸检测强度。结论表明:隔离力度和核酸检测强度对疫情防控有重要影响。该研究结果在一定程度上促进了新型冠状病毒肺炎传播动力学建模与分析工作的研究,对未来应对突发性传染病有一定借鉴意义。

关键词： COVID-19 传染病动力学模型有效再生数参数估计隔离措施和核酸检测

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基层治理的地域领域化与阶级生命政治的变迁——以珠海市A镇产业园区为例

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热带地理 2024年第3期44卷 520-531页

作者：李辉霞陈世熠胡珏滢林锦标佛山科学技术学院环境与化学工程学院广东佛山528000 中山大学政治与公共事务管理学院广州510006 云南师范大学教育学部昆明650000

在城市化高速发展的背景下,如何形成空间存量的治理模式是构建现代化治理体系的棘手难题。空间存量中的领域化过程,在市场化的进程中不断地影响着不同群体的生命政治。文章在领域理论的基础上引入福柯生命政治的视角,构建了“社会资本... 详细信息

在城市化高速发展的背景下,如何形成空间存量的治理模式是构建现代化治理体系的棘手难题。空间存量中的领域化过程,在市场化的进程中不断地影响着不同群体的生命政治。文章在领域理论的基础上引入福柯生命政治的视角,构建了“社会资本—空间关系—生命政治”三方耦合互动的领域政治框架。通过对普通工人、中层管理者和高层董事的半结构访谈及问卷调查,探究基层治理领域化过程中工人的生命政治变迁规律。结果表明:产业园区的经济属性塑造了工人、中层干部、高层董事三方不同的生活、生产的空间关系,导致不同阶层的社会资本积累产生差异。同时,工人经历了自我主导到经济依附再到全面依附的生命政治过程。政府一方面需要完善薄弱地区的公共服务建设,另一方面需要逐步减少国家对社会的控制,培养社会组织能力,实现工人自我推进社会服务。文章对理解工人生计演变提供了地学理论视角,描述了不同阶层在空间分布上如何形成生命政治的差异。

关键词：领域理论生命政治基层治理产业园区珠海市

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科研院所与高校联合培养研究生新模式下学生管理工作的分析与对策研究

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科教文汇 2024年第14期 31-34页

作者：李慧霞中国科学院大学南京学院江苏南京211135

科研院所与高校联合培养研究生能充分发挥双方优势资源,有效提高研究生培养质量,实现科教融合、协作创新。在分析传统联合培养模式存在问题的基础上,根据中国科学院大学某京外学院联合培养研究生培养模式的探索和实践,总结此种新模式具... 详细信息

科研院所与高校联合培养研究生能充分发挥双方优势资源,有效提高研究生培养质量,实现科教融合、协作创新。在分析传统联合培养模式存在问题的基础上,根据中国科学院大学某京外学院联合培养研究生培养模式的探索和实践,总结此种新模式具有的优势特点。学生管理作为培养过程中重要的一环,单独分析研究本就较少,在新模式下则面临更为严峻的考验。该文提出了加强学生管理工作的对策与建议,以期为科研院所与高校联合培养研究生在学生管理工作方面提供参考。

关键词：科研院所高校联合培养研究生学生管理

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热应激对羊成肌细胞部分miRNA的影响及其生物信息学分析与靶基因预测

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南京农业大学学报 2024年第1期47卷 193-204页

作者：卢佳伟赵鹏刘媛魏宗友李惠侠南京农业大学动物科技学院江苏南京210095 太仓市农业农村科技服务中心江苏太仓215400

[目的]本文旨在探究热应激对羊成肌细胞部分miRNA的影响,并对miR-23a、miR-24、miR-27a-3p和miR-30a-5p进行生物信息学分析与靶基因预测,揭示热应激下miRNA影响骨骼肌发育的调控机制。[方法]通过RT-qPCR技术研究热应激对羊成肌细胞miRN... 详细信息

[目的]本文旨在探究热应激对羊成肌细胞部分miRNA的影响,并对miR-23a、miR-24、miR-27a-3p和miR-30a-5p进行生物信息学分析与靶基因预测,揭示热应激下miRNA影响骨骼肌发育的调控机制。[方法]通过RT-qPCR技术研究热应激对羊成肌细胞miRNA表达量的影响;利用miRBase数据库获取不同物种中miR-23a、miR-24、miR-27a-3p和miR-30a-5p的前体序列和成熟序列,并利用MEGA X软件构建系统进化树进行相似性分析;通过TargetScan、miRDB、RNA22、miRWalk对上述miRNA进行靶基因预测,使用DAVID对预测出的共同靶基因进行GO功能与KEGG通路富集分析,最后进行miRNA、共同靶基因与KEGG通路的关联分析。[结果]热应激显著下调羊成肌细胞在增殖阶段与分化阶段miRNA的表达。miR-23a、miR-24、miR-27a和miR-30a在不同物种间的保守性较高,除了牛的miR-24以外,成熟序列基本相同,种子序列完全一致。预测出的共同靶基因主要富集在细胞增殖、分化、周期、凋亡、迁移等GO条目,以及mTOR、TGFβ、MAPK、Ras、ErbB、FoxO和PI3K-Akt等KEGG通路。关联分析表明miR-24和miR-27a-3p可能靶向NLK和TAOK1以参与MAPK和FoxO信号通路来调控骨骼肌的发育。[结论]miR-23a、miR-24、miR-27a和miR-30a在不同物种中保守性较高,热应激下调羊成肌细胞部分miRNA的表达,可能影响骨骼肌的发育。

关键词：热应激成肌细胞 miRNA 生物信息学靶基因

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事业单位国有资产管理存在的问题及其对策

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经济研究导刊 2024年第14期 108-111页

作者：李慧霞自然资源实物地质资料中心河北廊坊065201

随着经济体制改革进程的加快,事业单位提供公共物品和公共服务的职能更加突出。事业单位各项工作的有序开展需要国有资产提供物质基础。为此,首先分析事业单位国有资产管理的意义,然后概括总结国有资产管理中的问题,并分析成因,在此基... 详细信息

随着经济体制改革进程的加快,事业单位提供公共物品和公共服务的职能更加突出。事业单位各项工作的有序开展需要国有资产提供物质基础。为此,首先分析事业单位国有资产管理的意义,然后概括总结国有资产管理中的问题,并分析成因,在此基础上提出建设性的解决措施,希望在保证事业单位国有资产安全完整的前提下,提高资产使用效率,预防职务贪腐现象,从而提升事业单位管理能力,为实现事业单位持续稳定发展贡献一份力量。

关键词：事业单位国有资产管理

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不同药物治疗子宫肌瘤的效果及对患者性激素水平的影响

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系统医学 2024年第1期9卷 178-181页

作者：李明李慧霞杨波巨野县人民医院药剂科山东菏泽274900 巨野县中医院感染管理科山东菏泽274900

目的探讨不同药物治疗子宫肌瘤的效果及对患者性激素水平的影响。方法选取2021年2月—2023年2月于巨野县人民医院收治的80例子宫肌瘤患者为研究对象,根据用药的不同进行分组,研究组和对照组,各40例,对照组采用米非司酮治疗,研究组在对... 详细信息

目的探讨不同药物治疗子宫肌瘤的效果及对患者性激素水平的影响。方法选取2021年2月—2023年2月于巨野县人民医院收治的80例子宫肌瘤患者为研究对象,根据用药的不同进行分组,研究组和对照组,各40例,对照组采用米非司酮治疗,研究组在对照组的基础上实施他莫昔芬治疗。统计和比较两组患者治疗效果、血清性激素、炎症因子水平、不良反应发生率。结果研究组总有效率为97.50%,相比于对照组的80.00%较高,差异有统计学意义(χ^(2)=4.507,P0.05);治疗后,研究组促卵泡素、促黄体素、雌二醇、孕酮水平均低于对照组,差异有统计学意义(P均0.05);治疗后,研究组高敏C反应蛋白、白介素-6、肿瘤坏死因子-α水平均低于对照组,差异有统计学意义(P均0.05)。结论他莫昔芬联合米非司酮治疗子宫肌瘤的效果显著,可以改善患者的血清性激素水平,降低炎症因子水平。

关键词：子宫肌瘤肿瘤坏死因子-α 炎症因子性激素

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Estimation of Regional Evapotranspiration in Alpine Area and Its Response to Land Use Change:A Case Study in Three-River Headwaters Region of Qinghai-Tibet Plateau,China

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Chinese Geographical Science 2012年第4期22卷 437-449页

作者： li huixia liU Guohua FU Bojie State Key Laboratory of Urban and Regional Ecology Research Center for Eco-Environmental Sciences Chinese Academy ofSciences Beijing 100085 China Department of Resource and Environmental Science Foshan University Foshan 528000 China

Three-River Headwaters （TRH） region involved in this paper refers to the source region of the Changjiang （Yangtze） River, the Huanghe （Yellow） River and the Lancang River in China. Taking the TRH region of the Qing- hai-Tibet Plateau as a case, the annual evapotranspiration （ET） model developed by Zhang et al. （2001） was applied to evaluate mean annual ET in the alpine area, and the response of annual ET to land use change was analyzed. The plant-available water coefficient （w） of Zhang＇s model was revised by using vegetation-temperature condition index （VTCI） before annual ET was calculated in alpine area. The future land use scenario, an input of ET model, was spa- tially simulated by using the conversion of land use and its effects at small regional extent （CLUE-S） to study the re- sponse of ET to land use change. Results show that the relative errors between the simulated ET and that calculated by using water balance equation were 3.81% and the index of agreement was 0.69. This indicates that Zhang＇s ET model based on revised plant-available water coefficient is a scientific and practical tool to estimate the annual ET in the al- pine area. The annual ET in 2000 in the study area was 221.2 ram, 11.6 mm more than that in 1980. Average annual ET decreased from southeast to northwest, but the change of annual ET between 1980 and 2000 increased from southeast to northwest. As a vast and sparsely populated area, the population in the TRH region was extremely unbalanced and land use change was concentrated in very small regions. Thus, land use change had little effect on total annual ET in the study area but a great impact on its spatial distribution, and the effect of land use change on ET decreased with in- creasing precipitation. ET was most sensitive to the interconversion between forest and unused land, and was least sen- sitive to the interconversion between cropland and low-covered grassland.

关键词： evapotranspiration (ET) land use change plant-available water coefficient alpine area Three-RiverHeadwaters (TRH) region Qinghai-Tibet Plateau

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Kinetic Control of Hexagonal Mg（OH）2 Nanoflakes for Catalytic Application of Preferential CO Oxidation

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Chinese Journal of Chemistry 2017年第6期35卷 903-910页

作者： huixia li liping li Shaoqing Chen Yuelan Zhang Guangshe li State Key Laboratory of Inorganic Synthesis and Preparative Chemistry College of Chemistry Jilin University Changchun 130012 China Key Laboratory of Design and Assembly of Functional Nanostructures Fujian Institute of Research on the Structure of Matter Fuzhou Fujian 350002 China

Controlling the growth of nanocrystals is one of the most challenged issues in current catalytic field, which helps to further understand the size and morphology related behaviors for catalytic applications. In this work, we investigated the plane growth kinetics of Mg（OH）2 for catalytic application in preferential CO oxidation. Nanoflakes were synthesized through hydrothermal method. The morphology and structure of nanoflakes were characterized by TEM, SEM, and XRD. By varying the reaction temperature and time, Mg（OH）2 nanoflakes un- derwent an anisotropic growth. Benefited from the Ostwald ripening process, the thickness of nanoflake corre- sponding to the （110） plane of Mg（OH）2 was tuned from 7.6 nm to 24.0 nm, while the diameter of （001） plane in- creased from 18.2 nm to 30.2 nm. The grain growth kinetics for the thickness was well described in terms of an equation, D5= 7.65＋ 6.9 × 10^8exp（-28.14/RT）. After depositing Pt nanoparticles onto these Mg（OH）2 nanoflakes, an excellent catalytic performance was achieved for preferential CO oxidation in H2-rich streams with a wide temper- ature window from 140 ℃ to 240 ℃ for complete CO conversion due to the interaction between Pt and hydroxyl groups. The findings reported here would be helpful in discovering novel catalysts for application of proton ex- change membrane fuel cells.

关键词： kinetics CO-PROX size-dependent nanoflakes

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