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基于基因表达综合数据库的缺血性卒中缺氧相关差异基因表达分析

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中国脑血管病杂志 2023年第12期20卷 825-836页

作者：苏允琦蒋兴伟马骏巩家媛高锋华安华英宁畅文魏汉琪刘鹏宇王哲于群军事科学院军事医学研究院卫生勤务与血液研究所北京100850

目的基于基因表达综合(GEO)数据库,采用生物信息学方法分析缺血性卒中的基因表达情况,结合缺氧相关基因,解析缺氧相关差异基因(HRDEGs)表达特征,筛选出关键基因,为深入了解缺血性卒中提供重要支撑。方法从GEO数据库下载GSE16561和GSE58... 详细信息

目的基于基因表达综合(GEO)数据库,采用生物信息学方法分析缺血性卒中的基因表达情况,结合缺氧相关基因,解析缺氧相关差异基因(HRDEGs)表达特征,筛选出关键基因,为深入了解缺血性卒中提供重要支撑。方法从GEO数据库下载GSE16561和GSE58294两个数据集,采用Python软件进行数据合并,利用Combat方法消除批次效应,同时保留疾病分组特征。对消除批次效应前后的数据采用主成分分析法进行降维处理,并对缺血性卒中组和正常对照组人群进行组内相关系数(ICC)检测。对合并及批次效应消除后数据集进行基因集富集分析(GSEA)及单样本GSEA,以名义P值(NOM P-val)<0.05且假阳性率P值(FDR P-val)<0.25作为标准,筛选出具有显著差异的基因集。利用R软件对GSE16561和GSE58294数据集合并及批次效应消除后的缺血性卒中患者和正常对照者之间的差异表达基因进行鉴定[以log 2基因表达差异倍数(FC)的绝对值≥0.58和矫正P值(P adj)<0.05作为筛选标准],并与在美国国立生物技术信息中心(NCBI)中获取的缺氧相关基因进行交集,得到HRDEGs。对HRDEGs进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,使用STRING数据库构建差异表达基因的蛋白质互相作用网络,利用Cytoscape3.8软件筛选排名前10位的关键基因。结果ICC分析结果显示,消除批次效应后的GSE16561和GSE58294数据集中缺血性卒中和正常对照者的ICC分别为0.94和0.98,一致性极好。GSEA结果显示,对GSE16561和GSE58294合并及批次效应消除后的新数据集中,34个基因集在缺血性卒中样本中显著富集,筛选出表达差异基因404个(均P adj<0.05),其中高表达基因354个,低表达基因50个。与缺氧相关基因进行交集,获得64个HRDEGs。GO富集分析表明,HRDEGs主要在囊泡腔、细胞质囊泡腔、分泌颗粒腔和特殊颗粒中显著富集,具有酰胺结合、肽结合、磷脂结合和酶抑制活性等分子功能,主要参与了细胞因子产生的正向调节、炎性反应的调节、对细菌来源分子的反应和对脂多糖的反应等生物学过程。KEGG富集分析表明,HRDEGs主要在血脂与动脉粥样硬化、沙门氏菌感染、中性粒细胞胞外陷阱形成、核苷酸结合寡聚化结构域样受体信号通路、癌症中的蛋白聚糖、结核病和坏死性凋亡等通路上存在富集。基于蛋白质互相作用网络,最终筛选出了10个关键基因,分别为ARG1(精氨酸酶1)、CASP1(含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶1)、IL-1R1(白细胞介素1受体1型)、ITGAM(整合素亚基αM)、MMP9(基质金属蛋白酶9)、PTGS2(前列腺素内过氧化物合酶2)、STAT3(信号传感器和转录激活剂3)、TLR2(Toll样受体2)、TLR4、TLR8。。结论通过生物信息学挖掘,本研究获得了10个缺血性卒中与缺氧相关的关键基因,可能为后续研究工作及诊断治疗提供了潜在靶点。

关键词：缺血性卒中差异表达基因基因表达综合数据库缺氧相关基因

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基于有效值的台区电流不平衡度计算方法研究

电测与仪表 2020年第11期57卷 30-36页

作者：艾精文张华赢汪清朱明星高敏深圳供电局有限公司电力科学研究院广东深圳518000 安徽大学电气工程与自动化学院合肥230601

为解决在相位信息缺失条件下三相电流不平衡度准确计算的难题,提出了一种基于基波电流有效值的低压台区电流不平衡度计算方法。文章分析了基于对称分量法的电流不平衡度计算方法,以及在相位信息缺失条件下,4种常用三相电流不平衡度工程... 详细信息

为解决在相位信息缺失条件下三相电流不平衡度准确计算的难题,提出了一种基于基波电流有效值的低压台区电流不平衡度计算方法。文章分析了基于对称分量法的电流不平衡度计算方法,以及在相位信息缺失条件下,4种常用三相电流不平衡度工程计算方法的差异性;基于对称分量法分解规律,将三相不平衡电流相量分解为两组相位对称的电流相量。在相位对称条件下,推出基于基波电流有效值的电流不平衡度计算式,确定不同工况下两组电流不平衡度的主从关系;结合低压台区负荷电流的不平衡特性,分析了计算方法在低压台区三相电流不平衡度计算中的适用性及差异性,并对低压台区运行数据进行实测验证。与4种常用工程计算方法相比,所提方法与对称分量法计算结果更加接近,且基本一致。

关键词：低压台区电能质量三相不平衡不平衡度

Molecular Variability and Phylogenetic Relationship Among Acidovorax avenae Strains Causing Red Stripe of Sugarcane in China

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甘蔗胚性愈伤组织发生与发育的组织细胞学观察

中国植物病理学会2017年学术年会

作者： Li Xiaoyan Sun Huidong Wang Jinda Fu huaying Huang Meiting Zhang Qingqi gao Sanji National Engineering Research Center for Sugarcane Fujian Agriculture and Forestry University College of Crop Science Fujian Agriculture and Forestry University

Sugarcane red stripe is a bacterial disease that has worldwide prevalence and is caused by Acidovorax avenae subsp.avenae(Aaa).In this study,we collected 108 sugarcane leaf samples from nine different sugarcane planting regions in China between 2013 and 2016.The causal A.avenae bacteria were successfully isolated in the red stripe leaf samples.PCR assays were carried out on DNA isolated from all collected samples using novel primers targeted to the A.avenae 16 S-23 S rDNA spacer regions.Positiveresults were obtained for 96.4%(81/84) of symptomatic(red stripe) and 83.3%(20/24) of asymptomatie leaves.All the amplified fragments were cloned and sequenced,which revealed that the Chinese A.avenae strains hada significant degree of length variation(43654 base pairs,bp) and sequence identity(89.2%100%).The 142 A.avenae sequences originated from this study were clustered into six phylogenetic groups(H,HE,El-l,El-2,E2-1,E2-2) and had sequence identity that ranged between 89.2%and 99.5%.In silico and polyacrylamide gel electrophoresis analysis of PCR products digested with Hind III and Eco RI revealed that these sequences showed various restriction fragment length polymorphism(RFLP) profiles that were closely associated according to phylogenetic grouping.Furthermore,phylogeny analysis based on these Chinese A.avenae sequences,22 corresponding sequences from two Acidovorax species and two other A.avenae subspecies,revealed that all the tested strains in the A.avenae species fell into clade Ⅰ,including the six distinct Chinese A.avenae groups mentioned above,A.avenae suhsp.cattleyae(Aaca),and A.avenae subsp.citrulli(Aac).A.konjaci and A.facilis species appeared in elades Ⅱ and Ⅲ,respectively.This is the first report of PCRbased identification and molecular characterization of A.avenae infecting sugarcane plants in China.

关键词： Saccharum spp Red stripe disease Acidovorax avenae PCR detection Genetic variation

来源： cnki会议评论

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热带作物学报 2010年第8期31卷 1303-1308页

作者：林庆良许莉萍高世武傅华英农业部甘蔗遗传改良重点开放实验室福州350002

运用石蜡切片染色和显微技术相结合的方法,对FN15和ROC22两个不同基因型甘蔗品种,在心叶诱导愈伤组织和愈伤组织继代过程的不同阶段,对愈伤组织胚性细胞、体细胞胚和芽原体的发生与发育进行了研究。结果表明,愈伤组织来源于切口部位、... 详细信息

运用石蜡切片染色和显微技术相结合的方法,对FN15和ROC22两个不同基因型甘蔗品种,在心叶诱导愈伤组织和愈伤组织继代过程的不同阶段,对愈伤组织胚性细胞、体细胞胚和芽原体的发生与发育进行了研究。结果表明,愈伤组织来源于切口部位、韧皮部、维管束鞘或外皮层具有活力潜能的薄壁细胞,此种愈伤组织多数为胚性细胞。基因型FN15可从心叶直接诱导出体细胞胚,而基因型ROC22则需继代培养后才发生体细胞胚。从愈伤组织表型分析,浅黄色愈伤组织多数为胚性细胞;金黄色和乳白色愈伤组织多数是已分化的各种类型的体胚;褐色愈伤组织,只有极少量细胞具有分裂能力,最终也能分化出小芽;透明状愈伤组织一般无细胞质,也不具分裂能力。因此应选择浅黄色的愈伤组织作为转基因准备受体。

关键词：细胞组织学胚胎发生愈伤组织甘蔗

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喷射沉积材料半固态成形的现状与发展前景

特种铸造及有色合金 2001年第S1期21卷 -页

作者：赵爱民毛卫民甄子胜翟华英钟雪友姜春梅高元植胡宜平北京科技大学北京联合大学

综述了喷射沉积材料的半固态成形的研究进展和发展趋势,分析了喷射沉积材料的半固态成形工艺、半固态变形特征和半固态成形的加热和保温过程中组织演变规律,提出高固相率的触变成形是喷射沉积材料半固态成形的发展方向。

关键词：喷射沉积半固态成形现状

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辐照改性对聚己内酯的影响

塑料 2006年第4期35卷 21-23页

作者：李平赵锐胜彭斌高博文成都华鹰科技有限公司四川成都610041

研究了不同填料对聚己内酯（PCL）力学性能的影响,以及在不同气氛下,射线辐照剂量对其分子量大小、交联密度,高温模量以及生物降解性的影响.结果表明,可溶性淀粉是PCL较为理想的填充剂,它的加入对PCL力学性能的影响较小;经Co60-γ射线... 详细信息

研究了不同填料对聚己内酯（PCL）力学性能的影响,以及在不同气氛下,射线辐照剂量对其分子量大小、交联密度,高温模量以及生物降解性的影响.结果表明,可溶性淀粉是PCL较为理想的填充剂,它的加入对PCL力学性能的影响较小;经Co60-γ射线辐照后,可提高PCL的分子量、交联密度、高温模量,降低生物降解性.30～90kGy的辐照剂量即可赋予材料满意的加工性和较好的生物降解性.

关键词：辐照聚己内酯生物降解性

12周乒乓球练习对7-9岁小学生动作协调能力影响的研究

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吉林体育学院学报 2010年第2期26卷 60-61页

作者：张华莹高宝国淮海工学院体育部江苏连云港222005 连云港市师专1附小江苏连云港222001

通过系统的乒乓球练习,对7-9岁小学生经过12周的观察发现,乒乓球练习能够提高7-9岁小学生动作协调能力,尤其对于精细动作协调能力和平衡能力的改善效果显著。

关键词：乒乓球练习 7-9岁小学生动作协调能力

基于“互联网+”的高职计算机专业的课程开发研究与实现

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信息与电脑 2019年第13期31卷 231-232,235页

作者：高传雨费华英合肥通用职业技术学院

信息化时代,计算机专业优势逐渐凸显,市场对专业人才的需求量呈现显著增加的趋势,计算机专业课程开发与改革开始成为高职院校研究的重要内容。笔者结合多年工作经验,通过分析人才需求与职业能力,深入研究专业课程开发内容,进而探索最佳... 详细信息

信息化时代,计算机专业优势逐渐凸显,市场对专业人才的需求量呈现显著增加的趋势,计算机专业课程开发与改革开始成为高职院校研究的重要内容。笔者结合多年工作经验,通过分析人才需求与职业能力,深入研究专业课程开发内容,进而探索最佳的"互联网+"高职计算机专业课程开发方式,期望能够为现代高职计算机专业人才培养提供更多理论支持。

关键词：课程开发 "互联网+" 计算机专业培养目标

一种基于双层人工神经网络的多时间尺度区域光伏功率预测方法

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华北电力大学学报（自然科学版） 2021年第2期48卷 55-63页

作者：杨延勇孟祥剑高峰王华莹程晓艳国网聊城供电公司山东聊城252000 山东大学电气工程学院山东济南250061

由于具有间歇性、波动性和随机性的特点,光伏发电系统的大规模并网运行会严重影响电力系统的稳定与经济运行。因此,开展区域光伏功率预测能够为调度部门提供电源出力参考信息,以合理规划调度计划及安排备用容量。提出了一种基于双层人... 详细信息

由于具有间歇性、波动性和随机性的特点,光伏发电系统的大规模并网运行会严重影响电力系统的稳定与经济运行。因此,开展区域光伏功率预测能够为调度部门提供电源出力参考信息,以合理规划调度计划及安排备用容量。提出了一种基于双层人工神经网络的多时间尺度区域光伏出力预测方法,基于选取的基准光伏电站实现预测分辨率为1 min、5 min和15 min的多时间尺度出力预测,解决了部分光伏电站因设施不完善导致的历史出力预测数据缺失与失准造成的区域功率预测精度低的问题,并降低了所需数据量。除了考虑相关系数之外,引入第一层人工神经网络的预测精度作为选择基准光伏电站的指标,有效地提高了区域功率预测精度。此外,针对基准光伏电站因云团遮挡或电网故障导致其出力波动进而影响预测精度的难题,提出了基于相邻光伏电站出力的基准电站出力修正方案,并通过山东某地市的光伏历史出力数据对所提方法进行了分析验证。

关键词：人工神经网络光伏发电多时间尺度区域功率预测