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Deep Sc-RNA sequencing decoding the molecular dynamic architecture of the human retina

Science China(Life Sciences) 2023年第3期66卷 496-515页

作者： Lulin Huang Runze Li Lin Ye Shanshan Zhang huaping tian Mingyan Du Chao Qu Shujin Li Jie Li Mu Yang Biao Wu Ran Chen Guo Huang Ling Zhong Hongjie Yang Man Yu Yi Shi Changguan Wang Houbin Zhang Wei Chen Zhenglin Yang The Key Laboratory for Human Disease Gene Study of Sichuan Province and the Department of Laboratory Medicine Sichuan Provincial People's HospitalUniversity of Electronic Science and Technology of ChinaChengdu 610075China Research Unit for Blindness Prevention of Chinese Academy of Medical Sciences(2019RU026) Sichuan Academy of Medical SciencesChengdu 610075China Department of Ophthalmology Sichuan Provincial People's HospitalUniversity of Electronic Science and Technology of ChinaChengdu 610075China School of Ophthalmology and Optometry Wenzhou Medical CollegeWenzhou 325035China Department of Organ Transplant Center Sichuan Provincial People's HospitalUniversity of Electronic Science and Technology of ChinaChengdu 610075China Department of Ophthalmology Peking University Third HospitalBejing 100730China

The human retina serves as a light detector and signals transmission *** insights into retinal disease mechanisms and therapeutic strategies require a deep understanding of healthy retina molecular ***,we sequenced the m RNA of over 0.6 million single cells from human retinas across six regions at nine different *** cell sub-types have been identified from the human mature retinas with unique *** revealed regional and age differences of gene expression profiles within the human ***-cell interaction analysis indicated a rich synaptic connection within the retinal *** expression regulon analysis revealed the specific expression of transcription factors and their regulated genes in human retina cell *** of the gene’s expression,such as DKK3,are elevated in aged retinas.A further functional investigation suggested that over expression of DKK3 could impact mitochondrial ***,decoding the molecular dynamic architecture of the human retina improves our understanding of the vision system.

关键词： deep Sc-RNA sequencing human retina aging

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侗水语中指示词的两个语法化现象

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北部湾大学学报 2021年第1期36卷 92-100页

作者：覃凤余田华萍广西大学文学院广西南宁535001

侗水语中指示词"na:i^(24)/na:i^(33)「这」""za^(35)/■a^(33)「那」""ja^(6)「这样」"有两条语法化路径,即"指示形容词>后置定语标记(>名词化标记/句末直陈语气词)"和"指示代名词>篇章回指>句间连词(>话语标记)"。这两条路径在体现人... 详细信息

侗水语中指示词"na:i^(24)/na:i^(33)「这」""za^(35)/■a^(33)「那」""ja^(6)「这样」"有两条语法化路径,即"指示形容词>后置定语标记(>名词化标记/句末直陈语气词)"和"指示代名词>篇章回指>句间连词(>话语标记)"。这两条路径在体现人类语言共性的同时,也显示了壮侗语的个性特点。

关键词：侗水语指示词语法化

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高血压脑出血碎吸术病人的护理

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护理研究 2009年第33期23卷 3080-3081页

作者：田华平朱永梅山西省五台县第一人民医院山西医科大学第一医院

据最新数据统计,高血压在我国人群中发病率高达27%左右,病人人数已达约1.3亿.高血压性脑出血更是临床上中、老年病人最常见的急危症,尤其是近年来发病越来越趋向于年轻化,其发病率、致残率及死亡率均高于其他病因.

关键词：病人碎吸术引流袋颅内血肿引流管血凝块脑出血脑病高血压

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重组山羊凝乳酶的原核表达、纯化及多克隆抗体的制备

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华西药学杂志 2023年第1期38卷 57-61页

作者：程琳田华平兰景彬舒丹成都医学院生物科学与技术学院四川成都610500 成都中医药大学基础医学院四川成都611373 电子科技大学医学院四川成都610054

目的原核表达纯化山羊凝乳酶(CYM)蛋白,制备针对凝乳酶蛋白的多克隆抗体并进行抗体验证。方法将pET-32a-TEV-CYM重组质粒转化至表达菌Escherichia coli BL21(DE3),用IPTG诱导重组凝乳酶蛋白表达,并通过镍柱亲和层析纯化、TEV酶酶切等... 详细信息

目的原核表达纯化山羊凝乳酶(CYM)蛋白,制备针对凝乳酶蛋白的多克隆抗体并进行抗体验证。方法将pET-32a-TEV-CYM重组质粒转化至表达菌Escherichia coli BL21(DE3),用IPTG诱导重组凝乳酶蛋白表达,并通过镍柱亲和层析纯化、TEV酶酶切等方法获得凝乳酶蛋白。将纯化的凝乳酶蛋白免疫新西兰大白兔,以获得针对凝乳酶蛋白的多克隆抗体。通过ELISA检测凝乳酶抗体与重组凝乳酶蛋白的特异性免疫反应。结果重组凝乳酶蛋白可被IPTG诱导表达,亲和层析纯化获得高纯度的凝乳酶蛋白。该蛋白在新西兰大白兔体内能够诱导产生多克隆抗体,且能与重组凝乳酶蛋白特异结合。结论成功原核表达纯化出重组凝乳酶蛋白并制备相应兔多克隆抗体,为后续开发天然凝乳酶含量检测试剂盒提供了基础。

关键词：原核表达山羊凝乳酶大肠杆菌基因克隆重组表达蛋白纯化包涵体多克隆抗体免疫原性制备

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基于模糊贝叶斯网络的引水隧洞安全评价模型分析

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太赫兹科学与电子信息学报 2024年第5期22卷 558-564页

作者：皮明杨涛张良田华平黄山河西南科技大学信息工程学院四川绵阳621010

为准确预测黄河引水隧洞安全隐患,提出基于模糊集理论和主观贝叶斯方法的模糊贝叶斯安全评价模型。结合实际巡检数据,模型使用贝叶斯网络处理模糊信息与不确定信息,将巡检数据中给出的多态性故障事件模糊化;再通过贝叶斯网络的条件概率... 详细信息

为准确预测黄河引水隧洞安全隐患,提出基于模糊集理论和主观贝叶斯方法的模糊贝叶斯安全评价模型。结合实际巡检数据,模型使用贝叶斯网络处理模糊信息与不确定信息,将巡检数据中给出的多态性故障事件模糊化;再通过贝叶斯网络的条件概率表找出不同故障事件之间的逻辑关系;最后获得对引水隧洞安全模型的整体评价。通过开展引水隧洞安全评价模型实例分析,验证了该方法的可行性。

关键词：模糊集理论主观贝叶斯理论不确定性引水隧洞安全评价模型

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融合BRIEF与ICP点云配准的零部件姿态估计方法

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计算机与数字工程 2024年第5期52卷 1383-1387,1411页

作者：田华平陈鹏飞杨涛何培垒巩鑫西南科技大学信息工程学院绵阳621010 中国航发四川燃气涡轮研究院绵阳621000 特殊环境机器人技术四川重点实验室绵阳621010

物体姿态估计在增强现实、自动驾驶和机器人操作等领域具有重要意义。在机器人抓取与辅助装配过程中实时并准确地估计目标姿态极其重要,为提高装配过程中零部件的抓取与监控的实时性与精度,研究了基于多视图特征库估计目标姿态的方法,... 详细信息

物体姿态估计在增强现实、自动驾驶和机器人操作等领域具有重要意义。在机器人抓取与辅助装配过程中实时并准确地估计目标姿态极其重要,为提高装配过程中零部件的抓取与监控的实时性与精度,研究了基于多视图特征库估计目标姿态的方法,设计融合BRIEF(Binary Robust Independent Elementary Features)特征匹配与ICP(Iterative Closest Point)点云配准的零部件姿态估计方法对零部件姿态角进行估计测量。以法兰、扳手、电钻等零件工具进行实验,实验结果表明融合BRIEF特征匹配与ICP点云配准的姿态估计方法运行耗时约200ms,而姿态估计的最大误差角度为4.5°,能有效保证零部件姿态估计方法的实时性与精度,可应用于机器人抓取作业、辅助装配监控等。

关键词： K-D树索引 BRIEF特征匹配 ICP点云配准姿态估计

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线纹尖塘鳢性别相关的2个dmrt基因结构特征及表达规律

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渔业科学进展 2025年第1期46卷 93-104页

作者：樊佳佳马冬梅朱华平林明辉钟再选田园园中国水产科学研究院珠江水产研究所农业农村部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室广东省水产动物免疫与绿色养殖重点实验室广东广州510380

线纹尖塘鳢(Oxyeleotris lineolata)具有典型性别生长二态性,雄鱼生长优势显著,doublesex and mab-3 related transcription factor(DMRT)家族是一个与性别决定相关的转录因子家族。基于线纹尖塘鳢性腺转录组数据,共获得2个dmrt基因的c... 详细信息

线纹尖塘鳢(Oxyeleotris lineolata)具有典型性别生长二态性,雄鱼生长优势显著,doublesex and mab-3 related transcription factor(DMRT)家族是一个与性别决定相关的转录因子家族。基于线纹尖塘鳢性腺转录组数据,共获得2个dmrt基因的cDNA序列,分别命名为Oxldmrt1和Oxldmrt3,并采用PCR技术扩增验证2个基因的cDNA序列。运用生物信息学方法分析2个基因序列结构特征,结果显示,Oxldmrt1和Oxldmrt3开放阅读框分别为903 bp和1363 bp,分别编码300个氨基酸和453个氨基酸;OxlDMRT1属于碱性蛋白,而OxlDMRT3属于酸性蛋白;2个基因均含有高度保守的DM结构域,OxlDMRT3还存在DMA结构域。氨基酸聚类分析显示,脊椎动物不同DMRT家族都是独立聚类,OxlDMRT1属于DMRT1家族,OxlDMRT3属于DMRT3家族,DMRT1家族最先聚类,再和DMRT3家族聚类。利用实时荧光定量PCR技术(real-time quantitative PCR,RT-qPCR)分析2个dmrt基因在雌鱼和雄鱼8个组织的表达水平,结果显示,2个基因在精巢中的表达量均显著高于其他组织(P<0.01),Oxldmrt3在脑中也有少量表达;利用RT-qPCR分析2个dmrt基因在早期不同发育时期的表达谱,显示2个基因在受精卵中的表达量均最高,Oxldmrt1在眼囊期的表达量最低,而Oxldmrt3在出膜7 d时的表达量最低。利用荧光原位杂交(fluorescencein situhybridization,FISH)对2个基因在精巢中的表达进行定位,显示2个基因在精巢中表达部位一致,均在精原细胞中有较强的表达信号。综上所述,Oxldmrt1和Oxldmrt3均在线纹尖塘鳢性腺胚胎发育阶段和精巢发育过程中起调节作用,而Oxldmrt1还可能参与胚胎后期性别决定和性别分化调控过程,Oxldmrt3还可能参与神经系统发育。本研究为线纹尖塘鳢性别决定与性别分化相关的分子机制研究提供了参考。

关键词：线纹尖塘鳢 Oxldmrt1 Oxldmrt3 基因结构基因表达荧光原位杂交

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Multi-functional supramolecular polymer produced from natural small molecules in a facile route

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Science China Chemistry 2019年第2期62卷 155-156页

作者： Shaobo Ji huaping Xu Key Lab of Organic Optoelectronics & Molecular Engineering Department of Chemistry Tsinghua University

Polymeric materials are important substrates for the realization of different *** the rapid progress, there are still two big challenges in this field:(1)how to fabricate the materials in a simplified procedure and (2)how to achieve both sophisticated properties and integrated functions in one *** address these problems,Qu, Feringa and tian et al.[1]recently reported a novel multifunctional supramolecular polymer system synthesized from simple commercial small molecules via a very easy and mild route.

关键词： Polymeric functions mild route

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BIOCELL 2022年第10期46卷 2291-2301页

作者： FEIFEI tian HUAN HU DI WANG HUAN DING QINGJIA CHI huaping LIANG WENLI ZENG School of Life Science and Engineering Southwest Jiaotong UniversityChengdu610000China Department of Engineering Structure and Mechanics School of ScienceWuhan University of TechnologyWuhan430070China State Key Laboratory of Trauma Burns and Combined InjuryResearch Institute of SurgeryDapingHospitalThe ArmyMedical UniversityChongqing400042China Renmin Hospital of Wuhan University Nursing Department Wuhan430070China

TIME,Immunity,Prognosis,BioinformaticsThis study used transcriptome and epigenetic data to predict the prognosis of immune-related genes(IRGs)Apelin(APLN)in patients with hepatocellular carcinoma(HCC).The TCGA database has gene expression and clinical data for *** DNA methylation 450 k data for HCC was download from the University of California Santa Cruz(UCSC)Xena *** clinical and prognostic analysis of APLN expression,results show that APLN is highly expressed in tumor *** it has an increasing trend with the development of clinical stage and T *** explore the prognostic role of APLN,the Immune-related DNA methylation(DNAm)sites associated with APLN analyzed by *** COX screened the methylation sites that are related to both APLN and *** risk score related to methylation site signature was determined according to their least absolute shrinkage and selection operator(LASSO)*** the patients were divided into high-risk groups and low-risk *** differences in overall survival(OS)were found in the training *** shows that APLN or methylation signature can effectively predict the prognosis of HCC *** summary,APLN may be a diagnostic and prognostic marker for HCC.

关键词： TIME Immunity Prognosis Bioinformatics

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柯萨奇病毒A组16型抗原ELISA定量检测方法的建立与初步应用

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质量安全与检验检测 2023年第6期33卷 32-37页

作者：张浩然姜莉刘鹏田华平刘碧云徐华曹明翔杨二霞艾美行动生物制药有限公司江苏泰州225300

为建立柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CA16)抗原双抗体夹心ELISA定量检测方法,用于CA16灭活疫苗的研发和生产。本文以纯化的CA16病毒颗粒免疫新西兰兔,分离含有CA16-IgG的血清,经纯化得到纯度较好的CA16-IgG作为包被抗体;将辣... 详细信息

为建立柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CA16)抗原双抗体夹心ELISA定量检测方法,用于CA16灭活疫苗的研发和生产。本文以纯化的CA16病毒颗粒免疫新西兰兔,分离含有CA16-IgG的血清,经纯化得到纯度较好的CA16-IgG作为包被抗体;将辣根过氧化物酶标记到CA16-IgG上作为酶标抗体。用CA16抗原国家标准品对建立方法的特异性、稳定性、精密度、准确度及线性和最低检测下限进行验证。用建立的方法检测疫苗生产中各工艺段关键中间品(包括CA16收获液、超滤浓缩液、纯化液、原液)的抗原含量。结果显示建立了CA16抗原的ELISA定量检测方法。该方法的线性范围为0.71~45.45 ng/mL,决定系数>0.99,最低检测下限为2.84 ng/mL;精密度良好,变异系数0.99且变异系数<15%,稳定性良好;与CA16以外的其他样品无交叉反应,特异性良好。随着CA16疫苗制备过程的不断推进,中间品的比活呈上升趋势。构建的CA16抗原ELISA定量检测方法符合定量检测需要,可用于CA16疫苗研发及生产。

关键词：柯萨奇病毒A组16型酶联免疫吸附测定手足口病

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