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Structure, variation and assembly processes of bacterial communities in different root-associated niches of tomato under periodic drought and nitrogen addition

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Pedosphere 2024年第5期 892-904页

作者： Dan HE Ruifeng GAO honghong dong Xiaodi LIU Lijuan REN Qinglong WU Qing YAO Honghui ZHU Southern Marine Science and Engineering Guangdong Laboratory (Guangzhou) Key Laboratory of Agricultural Microbiomics and Precision Application (MARA) State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China Institute of Microbiology Guangdong Academy of Sciences College of Plant Protection South China Agricultural University Department of Ecology Institute of Hydrobiology Jinan University College of Horticulture South China Agricultural University

Root-associated bacteria play a vital role in the growth and adaptation of host plants to drought stress. These bacteria can be classified as rhizoplane and rhizosphere bacteria based on their distance from the root surface. Tomato plants are often exposed to periodic drought and nitrogen (N) addition throughout their life cycle, but the impacts of these factors on the plant and root-associated bacteria are not well understood. To gain insight into this relationship, we conducted an experiment to monitor the effects of periodic drought and N addition on rhizoplane and rhizosphere bacteria of tomato plants. Drought and N addition had interactive effects on plant and soil properties, which varied with the timing of drought. There were clear divergences in community traits such as alpha diversity, beta diversity, and network topological features between the two types of bacteria. The rhizoplane bacteria showed lower alpha diversity but higher beta diversity and were more sensitive to drought and N addition than the rhizosphere bacteria. Nitrogen addition could downsize the effects of drought on rhizoplane bacterial community compositions. The higher proximity to the root might induce a community to develop more cooperation between different members to cope with plant metabolites, as revealed by the more connected and modularized community network of the rhizoplane bacteria. Drought at the seedling stage had great legacy effects on plant and soil properties. It may enhance selection, cause the dominance of deterministic processes in the assembly of rhizoplane bacteria, and reduce bacterial community network complexity. In conclusion, N addition could interact with drought in affecting tomato plants and their root-associated bacteria, depending on the timing of drought and the fineness of root niches. The higher sensitivity of rhizoplane bacteria to drought and N addition calls for more research due to their higher proximity and importance to plants in future environment

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云南小粒咖啡湿法发酵过程中细菌分离与鉴定

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北京化工大学学报（自然科学版） 2013年第B12期40卷 26-31页

作者：董红红杨盼吕杰盛军北京化工大学生命科学与技术学院北京100029 云南农业大学普洱茶学教育部重点实验室云南昆明650201

咖啡发酵过程中微生物种类、数量的变化及它们的代谢产物如酸等引起的发酵体系变化将直接影响着咖啡的最终品质。本文首次对云南小粒咖啡湿法发酵体系中的pH值和8种有机酸的含量变化进行了测定,并分离和鉴定了发酵过程中的细菌种类。结... 详细信息

咖啡发酵过程中微生物种类、数量的变化及它们的代谢产物如酸等引起的发酵体系变化将直接影响着咖啡的最终品质。本文首次对云南小粒咖啡湿法发酵体系中的pH值和8种有机酸的含量变化进行了测定,并分离和鉴定了发酵过程中的细菌种类。结果发现在整个发酵过程中,pH值变化整体呈下降趋势;本文所测pH值变化与利用HPLC法检测的有机酸草酸、乙酸、乳酸含量变化规律相吻合,而苹果酸、柠檬酸、琥珀酸和丙酸基本上保持不变,其中丙酸含量最低。在20℃下,结合发酵过程中的pH值,采用传统的微生物培养法,对整个发酵过程的细菌进行了分离、纯化和鉴定。结果发现存在大量的产果胶酶的细菌,包括产气肠杆菌Enterobacter aerogenes、肠膜明串珠菌Leuconostoc mesenteroides、枯草芽孢杆菌Bacillus subtilis、蜡样芽孢杆菌Bacillus cereus、巨大芽孢杆菌Bacillus megaterium,冰核活性细菌Erwinia herbicola、肺炎克雷伯菌Klebsiella pneumoniae等,并对分离、鉴定出来的细菌在发酵中所起的作用进行了剖析。

关键词：小粒咖啡湿法发酵细菌 pH值有机酸

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基于PCR-DGGE的咖啡湿法发酵酵母菌的分离鉴定

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云南农业大学学报（自然科学版） 2014年第2期29卷 251-257页

作者：董红红杨盼吕杰盛军北京化工大学生命科学与技术学院北京100029 云南农业大学、普洱茶学教育部重点实验室云南昆明650201

为了更全面系统的反映出咖啡发酵体系中的原始状态,分别对发酵堆的上部、中部、下部以及混合样品(上、中、下的混合)进行采集,并对发酵堆这3部分的温度进行了测定,同时采用了7种培养基,分别对上、中、下以及混合样进行酵母菌的培养、分... 详细信息

为了更全面系统的反映出咖啡发酵体系中的原始状态,分别对发酵堆的上部、中部、下部以及混合样品(上、中、下的混合)进行采集,并对发酵堆这3部分的温度进行了测定,同时采用了7种培养基,分别对上、中、下以及混合样进行酵母菌的培养、分离、纯化及鉴定。之后通过PCR-DGGE方法确定了酵母的优势菌种。结果发现发酵堆的上部、中部和下部的温差很小,随着发酵的进行,整体变化不大,基本保持在20℃左右,且出现了大量产果胶酶的酵母菌,包括异常毕赤酵母Pichia anomala,毕赤克鲁维酵母***,葡萄汁有孢汉生酵母Hanseniaspora uvarum等。其中,毕赤克鲁维酵母***,葡萄汁有孢汉生酵母***为优势菌种,并对其在发酵过程中所起的作用进行了深入剖析,这些酵母菌在咖啡湿法发酵中起到了关键的作用。

关键词：咖啡湿法发酵酵母

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《胸部恶性肿瘤围术期静脉血栓栓塞症预防中国专家共识（2018版）》解读之D-二聚体篇

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中国肺癌杂志 2019年第12期22卷 761-766页

作者：陈青山章智荣董红红苗劲柏李辉首都医科大学附属北京朝阳医院胸外科

胸部恶性肿瘤患者围术期发生静脉血栓栓塞症(venous thromboembolism,VTE)风险较高,VTE的发生将影响患者的预后、远期生活质量,严重者甚至致死。为了加强胸外科医生对胸部恶性肿瘤患者围术期VTE的了解和重视,中国胸外科静脉血栓栓塞症... 详细信息

胸部恶性肿瘤患者围术期发生静脉血栓栓塞症(venous thromboembolism,VTE)风险较高,VTE的发生将影响患者的预后、远期生活质量,严重者甚至致死。为了加强胸外科医生对胸部恶性肿瘤患者围术期VTE的了解和重视,中国胸外科静脉血栓栓塞症研究协作组发布了《胸部恶性肿瘤围术期静脉血栓栓塞症预防中国专家共识(2018版)》。本文针对共识中D-二聚体在VTE中的诊断价值及风险预测价值进行详细解读,并对其他生物标记物在肿瘤患者VTE的作用做简要拓展,以加深胸外科医生对D-二聚体在VTE中临床意义的理解。

关键词：胸部恶性肿瘤静脉血栓栓塞症 D-二聚体临床意义

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种子携带病毒对烟草苗期病毒病发生的影响

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烟草科技 2017年第4期50卷 18-24页

作者：董红红邓海滨王晓宾李华平阮小蕾华南农业大学农学院广州市天河区五山路483号510642 广东省烟草南雄科学研究所广东省南雄市河南工业开发区512400 中国烟草总公司广东省公司广州市林和东路128号510610

为了有效控制烟草苗期病毒病,进行了种子携带病毒对烟草苗期病毒病发生的影响盆栽试验。取健康烟草种子用不同浓度的TMV、CMV和PVY侵染液浸泡处理后进行漂浮育苗。在烟苗大十字期测定浸种烟苗的病毒携带率及含量。结果表明,种子经TMV、... 详细信息

为了有效控制烟草苗期病毒病,进行了种子携带病毒对烟草苗期病毒病发生的影响盆栽试验。取健康烟草种子用不同浓度的TMV、CMV和PVY侵染液浸泡处理后进行漂浮育苗。在烟苗大十字期测定浸种烟苗的病毒携带率及含量。结果表明,种子经TMV、CMV和PVY侵染液浸泡的处理烟苗均不同程度地感染了病毒病。导致烟苗带毒的侵染液最低病毒浓度(阈值)TMV为7.46×10~4copies/μL、CMV为7.44×10~4copies/μL、PVY为7.52×10~4copies/μL。烟苗携带病毒含量与侵染液的病毒浓度不相关。烟草种子表面携带病毒含量高于阈值则导致烟草苗期感染病毒病。

关键词：烟草种子病毒病 TMV CMV PVY 侵染

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低温好氧反硝化菌的选育以及脱氮性能

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河北师范大学学报（自然科学版） 2022年第4期46卷 404-409页

作者：姚甜甜董红红周小峰深圳市长隆科技有限公司迈葳生物事业部广州深圳518116

通过接种某污水处理厂循环活性污泥工艺(cyclic sludge system,CASS)反应池出口活性污泥到培养基,经过对污泥驯化从中分离出1株低温好氧反硝化菌IL-2,温度4℃.对IL-2菌进行常规的生理生化鉴定和16S rDNA测序,鉴定出IL-2菌为Pseudomonas... 详细信息

通过接种某污水处理厂循环活性污泥工艺(cyclic sludge system,CASS)反应池出口活性污泥到培养基,经过对污泥驯化从中分离出1株低温好氧反硝化菌IL-2,温度4℃.对IL-2菌进行常规的生理生化鉴定和16S rDNA测序,鉴定出IL-2菌为Pseudomonas属.考察了不同C/N质量浓度比、温度、溶解氧、接种量、处理时间对菌株IL-2反硝化脱氮效果的研究.随着C/N质量浓度比、处理时间、溶解氧的不断增加,菌株IL-2的脱氮效果逐渐增强;随着温度和接种量的不断增加,菌株IL-2的脱氮效果先逐渐增强后减弱.该菌株在初始硝态氮质量浓度为20 mg/L,C/N质量浓度比为10,温度为4℃,溶解氧为3.5 mg/L,接种量所占体积为30%,处理10 h的条件下硝态氮的去除效果最好,为95.95%.该菌株主要适用于冬季温度较低的市政污水的处理.

关键词：低温好氧反硝化菌株IL-2 脱氮性能

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固定化反硝化菌的脱氮性能

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河北师范大学学报（自然科学版） 2022年第4期46卷 397-403页

作者：闫征楚董红红周小峰深圳市长隆科技有限公司万葳生物事业部广东深圳518116

利用聚乙烯醇等通过包埋方式固定化反硝化菌,制备了一种微生物载体,对其生物传质性能进行了验证,碳酸氢钠溶液最适体积分数为0.6%.利用所制备微生物载体对金属表面处理废水进行脱氮处理,考察了处理过程中碳氮质量浓度比、载体填充率等... 详细信息

利用聚乙烯醇等通过包埋方式固定化反硝化菌,制备了一种微生物载体,对其生物传质性能进行了验证,碳酸氢钠溶液最适体积分数为0.6%.利用所制备微生物载体对金属表面处理废水进行脱氮处理,考察了处理过程中碳氮质量浓度比、载体填充率等因素对水中氨氮、硝态氮、亚硝态氮、总氮的影响,结果表明当碳氮质量浓度比为2.0,载体填充率为20%时,污水中氨氮质量浓度低于0.1 mg/L,硝态氮、亚硝态氮、总氮处理效率均高于95%.固定化反硝化菌为微生物水处理技术提供了更广阔的应用空间.

关键词：固定化反硝化菌硝态氮金属表面处理废水

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Ⅰa期非小细胞肺癌术后静脉血栓栓塞症发生情况及相关因素分析

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中华医学杂志 2021年第41期101卷 3417-3421页

作者：董红红蔡永圣梁晓宁苗劲柏陈青山高英迪李辉首都医科大学附属北京朝阳医院胸外科北京100020 首都医科大学附属北京朝阳医院超声科北京100020 首都医科大学附属北京朝阳医院心外科北京100020

目的分析Ⅰa期非小细胞肺癌(NSCLC)患者术后静脉血栓栓塞症(VTE)的发生情况及相关因素,从而为进一步预防性抗凝的研究提供依据。方法回顾性选择2017年1月至2020年10月在首都医科大学附属北京朝阳医院胸外科接受住院手术治疗的132例Ⅰa期... 详细信息

目的分析Ⅰa期非小细胞肺癌(NSCLC)患者术后静脉血栓栓塞症(VTE)的发生情况及相关因素,从而为进一步预防性抗凝的研究提供依据。方法回顾性选择2017年1月至2020年10月在首都医科大学附属北京朝阳医院胸外科接受住院手术治疗的132例Ⅰa期NSCLC患者,男42例,女90例,年龄26-79(57±10)岁。术前术后均行下肢静脉超声,按照术后是否发生VTE分为VTE组(11例)和非VTE组(121例)。比较两组间手术情况、检验指标、影像学信息、病理学信息等的差异,并将差异有统计学意义的因素纳入logistic回归分析得到独立相关因素。结果术后共发生VTE 11例(8.3%),其中下肢深静脉血栓形成(DVT)10例(90.9%),DVT合并肺栓塞(PE)1例(9.1%)。VTE组年龄大于非VTE组[(65±9)岁比(57±10)岁,P=0.009];两组术后第5天D-二聚体值及其较术前的差值的差异具有统计学意义[3.18(1.55,5.15)比1.54(1.09,2.57),2.66(1.17,4.65)比1.34(0.78,2.04)](均P0.05)。将上述差异有统计学意义的因素纳入logistic回归分析得到术中切除淋巴结的数量是VTE发生的独立相关因素[OR=1.306(95%CI:1.000-1.600),P<0.05]。结论Ⅰa期NSCLC患者术后VTE发生率约为8.3%,术中切除淋巴结的数量可能是Ⅰa期非小细胞肺癌患者术后VTE发生的独立相关因素。

关键词：癌,非小细胞肺静脉血栓栓塞症手术

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好氧耐盐反硝化菌选育及脱氮性能

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河北师范大学学报（自然科学版） 2022年第4期46卷 391-396页

作者：董红红赵子闻李腾周小峰深圳市长隆科技有限公司迈葳生物事业部广州深圳518116

从活性污泥中分离出一株好氧耐盐反硝化菌YFX-6,耐盐度10%.经生理生化鉴定和16S rDNA测序,鉴定出菌株YFX-6属于Halomonas sp.考察了不同C/N质量浓度比、溶解氧、接种量、处理时间对菌株YFX-6在粮果实际废水中反硝化脱氮效果的研究.随着... 详细信息

从活性污泥中分离出一株好氧耐盐反硝化菌YFX-6,耐盐度10%.经生理生化鉴定和16S rDNA测序,鉴定出菌株YFX-6属于Halomonas sp.考察了不同C/N质量浓度比、溶解氧、接种量、处理时间对菌株YFX-6在粮果实际废水中反硝化脱氮效果的研究.随着C/N质量浓度比的不断增加,菌株YFX-6的反硝化脱氮效果先逐渐增强后又减弱;随着溶解氧、处理时间和接种量的不断增加,菌株YFX-6的脱氮效果逐渐增强后趋于稳定.初始硝态氮质量浓度约为108.5 mg/L,氯化钠质量浓度为10 mg/L,C/N质量浓度比为8,溶解氧为3.5 mg/L,接种量所占体积分数为20%,处理16 h时,硝态氮去除率为98.69%.因此,筛选出的一株好养耐盐的异氧反硝化菌可以在上述条件下表现出良好的脱氮性能.

关键词：耐盐好氧反硝化菌株YFX-6 脱氮性能

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复方消化酶片治疗消化不良症状的临床疗效和安全性

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中国临床药学杂志 2016年第6期25卷 357-360页

作者：颜耀东温泉董宏鸿杨忠民空军航空医学研究所附属医院北京100089 空军勤务学院徐州221000 北京清瑞医药技术开发有限公司北京100101

目的评价复方消化酶片(商品名:贝尔渭)治疗消化不良症状的有效性和安全性。方法用多中心、随机、双盲双模拟、阳性药物平行对照设计。共有141例消化不良症状受试者完成试验,其中试验组71例和对照组70例。试验组予复方消化酶片1片,对照... 详细信息

目的评价复方消化酶片(商品名:贝尔渭)治疗消化不良症状的有效性和安全性。方法用多中心、随机、双盲双模拟、阳性药物平行对照设计。共有141例消化不良症状受试者完成试验,其中试验组71例和对照组70例。试验组予复方消化酶片1片,对照组予复方消化酶胶囊(商品名:达吉)2粒,tid,连续口服2周。结果用药2周后,2组受试者消化不良反应症状的改善情况基本一致,组间比较差异无统计学意义。且2组不良反应发生率之间差别也未见统计学意义。结论复方消化酶片可以有效治疗消化不良症状,且安全性良好。

关键词：复方消化酶片消化不良临床疗效

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