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三种强致病性冠状病毒与人蛋白质相互作用研究进展

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生命的化学 2020年第8期40卷 1243-1257页

作者：郑云萧江何伟陶生策上海交通大学系统生物医学研究院系统生物医学教育部重点实验室上海200240

2019年12月,新型冠状病毒SARS-CoV-2引起的呼吸道疾病在中国武汉暴发并迅速席卷全球。截至2020年7月7日,在全球范围内感染人数超过1150万,死亡人数达到53万。导致严重疾病的冠状病毒还包括SARS-CoV和MERS-CoV。SARS-CoV-2与SARS-CoV在... 详细信息

2019年12月,新型冠状病毒SARS-CoV-2引起的呼吸道疾病在中国武汉暴发并迅速席卷全球。截至2020年7月7日,在全球范围内感染人数超过1150万,死亡人数达到53万。导致严重疾病的冠状病毒还包括SARS-CoV和MERS-CoV。SARS-CoV-2与SARS-CoV在致病性、基因组和蛋白质组结构上高度同源,其感染及发病机制亦有较高的相似性。针对以上三种冠状病毒引起的呼吸道疾病临床上尚无有效的药物和疫苗,其中一个重要原因是对冠状病毒基本生物学机制的理解尚不充分。蛋白质在病毒的致病过程中发挥了重要作用,研究病毒与宿主的蛋白质相互作用有助于深入了解病毒的致病机制,为开发预防和治疗病毒感染的有效疫苗和高效药物提供指引。本文综述了SARS-CoV-2、SARSCoV及MERS-CoV三种冠状病毒蛋白与宿主蛋白的相互作用、病毒自身蛋白的相互作用,以及这些蛋白质相互作用所发挥的功能,如转录翻译、病毒组装、抑制免疫反应等,以期对SARS-CoV-2的机制研究及药物开发提供参考。

关键词：冠状病毒 SARS-CoV-2 SARS-CoV MERS-CoV 病毒-宿主相互作用蛋白-蛋白相互作用

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病毒受体鉴定技术最新进展

生命的化学 2023年第3期43卷 419-427页

作者：孔维莎江何伟郭书娟陶生策上海交通大学系统生物医学研究院系统生物医学教育部重点实验室上海200240

病毒感染是由病毒附着蛋白和宿主细胞表面结构之间的相互作用启动的。细胞受体是病毒入侵宿主的关键,开发高通量且准确的病毒受体鉴定方法对病毒性疾病的防控至关重要。近年来,多种技术推动了病毒受体鉴定,大体可分为基因组和相互作用... 详细信息

病毒感染是由病毒附着蛋白和宿主细胞表面结构之间的相互作用启动的。细胞受体是病毒入侵宿主的关键,开发高通量且准确的病毒受体鉴定方法对病毒性疾病的防控至关重要。近年来,多种技术推动了病毒受体鉴定,大体可分为基因组和相互作用组两大类。基因组技术包括CRISPR/Cas9敲除、CRISPR激活、cDNA文库、RNA干扰以及随机插入诱变等;相互作用组技术包括蛋白质芯片、亲和纯化质谱和交联质谱等。本文试图重点分析基于基因组和相互作用组的相关技术,对其应用及优缺点进行归纳总结,以期为病毒受体鉴定技术的进一步发展提供参考。

关键词：病毒-宿主相互作用受体鉴定基因组技术相互作用组技术

Interplay between the bacterial protein deacetylase CobB and the second messenger c-di-GMP

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Interplay between the bacterial protein deacetylase CobB and...

新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的检测技术

中国生物工程学会第十三届学术年会暨2019年全国生物技术大会

作者： Zhaowei Xu Hainan Zhang Xingrun Zhang hewei jiang Chengxi Liu Fanlin Wu Lili Qian Bingbing Hao Daniel M Czajkowsky Shujuan Guo Zhijing Xu Lijun Bi Shihua Wang Haitao Li Minjia Tan Wei Yan Lei Feng Jingli Hou Sheng-ce Tao Key Laboratory of Systems Biomedicine (Ministry of Education) Shanghai Center for Systems Biomedicine Shanghai Jiao Tong University MOE Key Laboratory of Protein Sciences Center for Structural Biology School of Life Sciences Tsinghua University Department of Basic Medical Sciences School of Medicine Tsinghua University The Chemical Proteomics Center and State Key Laboratory of Drug Research Shanghai Institute of Materia Medica Chinese Academy of Sciences School of Biomedical Engineering Shanghai Jiao Tong University College of Life Sciences Shanghai Normal University National Key Laboratory of Biomacromolecules Key Laboratory of Non-Coding RNA and Key Laboratory of Protein and Peptide Pharmaceuticals Institute of Biophysics Chinese Academy of Sciences School of Stomatology and Medicine Foshan University School of Life Science Fujian Agriculture and Forestry University Instrumental Analysis Center Shanghai Jiao Tong University State Key Laboratory of Oncogenes and Related Genes

As a ubiquitous bacterial secondary messenger, c-di-GMP plays key regulatory roles in processes such as bacterial motility and transcription regulation. CobB is the Sir2 family protein deacetylase that controls energy metabolism, chemotaxis, and DNA supercoiling in many bacteria. Using an Escherichia coli proteome microarray, we found that c-di-GMP strongly binds to CobB. Further, protein deacetylation assays showed that c-di-GMP inhibits the activity of CobB and thereby modulates the biogenesis of acetyl-CoA. Interestingly, we also found that one of the key enzymes directly involved in c-di-GMP production, DgcZ, is a substrate of CobB. Deacetylation of DgcZ by CobB enhances its activity and thus the production of cdi-GMP. Our work establishes a novel negative feedback loop linking c-di-GMP biogenesis and CobB-mediated protein deacetylation.

关键词： c-di-GMP CobB diguanylate cyclase negative feedback loop protein acetylation

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生命的化学 2020年第8期40卷 1258-1269页

作者：王雪宁朱元首江何伟陶生策上海交通大学系统生物医学研究院上海200240 系统生物医学教育部重点实验室上海200240

由新型冠状病毒(SARS-CoV-2)导致的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)正在全球蔓延,给人类生命健康带来了极大的威胁,开发快速准确的检测方法对病毒的防控至关重要。至今,国内外多个实验室及生物公司已针对SARS-CoV-2病毒开发了一系列检测方法... 详细信息

由新型冠状病毒(SARS-CoV-2)导致的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)正在全球蔓延,给人类生命健康带来了极大的威胁,开发快速准确的检测方法对病毒的防控至关重要。至今,国内外多个实验室及生物公司已针对SARS-CoV-2病毒开发了一系列检测方法,主要分为病原学检测、分子生物学检测和血清学检测三类。病原学检测主要为病毒分离培养和鉴定。分子生物学检测包括基因测序技术、实时荧光定量PCR技术、环介导等温扩增技术、微流控芯片技术、微滴式数字PCR技术以及CRISPR核酸检测技术等。血清学检测包括酶联免疫吸附测定、胶体金免疫层析技术、侧流免疫层析技术以及蛋白质芯片技术等。本文试图就新冠病毒检测技术方面的研究进展进行归纳和简要介绍,以期为该病毒检测技术的进一步发展提供参考。

关键词：新型冠状病毒新型冠状病毒肺炎病原学检测分子生物学检测血清学检测现场检测

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规模化畜牧场恒温供水装置研究

中国农机化学报 2017年第3期38卷 35-38页

作者：翟志强张华平戚江涛蒙贺伟蒋德莉石河子大学机械电气工程学院新疆石河子832000 新疆生产建设兵团第一师农业技术推广站新疆阿拉尔843300 新疆科神农业装备科技开发股份有限公司新疆石河子832000

在传统的养殖场供水系统的基础上,进行规模化畜牧场恒温供水装置研究。集成机械和电气控制技术等设计一种针对羊和犊牛饮水的恒温供水装置。通过试验验证,装置加热到设定温度值38.5℃时,温度波动变化可控制在±0.5℃范围内,满足给羊和... 详细信息

在传统的养殖场供水系统的基础上,进行规模化畜牧场恒温供水装置研究。集成机械和电气控制技术等设计一种针对羊和犊牛饮水的恒温供水装置。通过试验验证,装置加热到设定温度值38.5℃时,温度波动变化可控制在±0.5℃范围内,满足给羊和犊牛等牲畜提供恒温水的要求。

关键词：规模化畜牧场恒温供水

针对电力系统数据缺失的暂态电压稳定评估方法

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内蒙古电力技术 2024年第1期42卷 27-32页

作者：姜鸣瞻杨楚原蒋何为崔梓琪袁铭洋刘颂凯张磊国网宜昌供电公司湖北宜昌443000 三峡大学电气与新能源学院湖北宜昌443002

针对数据缺失时暂态电压稳定评估模型精度下降的问题,提出一种基于多视图缺失数据填充和门控图神经网络的电力系统暂态电压稳定评估方法。首先,基于多视图互补的时空视图来填充缺失数据,得到完整的数据集;然后,采用修复完整的数据集训... 详细信息

针对数据缺失时暂态电压稳定评估模型精度下降的问题,提出一种基于多视图缺失数据填充和门控图神经网络的电力系统暂态电压稳定评估方法。首先,基于多视图互补的时空视图来填充缺失数据,得到完整的数据集;然后,采用修复完整的数据集训练门控图神经网络模型进行暂态电压稳定评估,评估模型要进行快速更新,以提高在线应用的性能;最后,在IEEE39节点系统算例上进行验证所提方法的有效性。仿真结果表明,本文方法可以在任何同步向量测量单元放置信息丢失和网络拓扑变化的情况下及时有效地填补缺失数据,且所用评估模型的评估性能具有显著优势。

关键词：测量数据缺失时空视图门控图神经网络暂态电压稳定评估

Calibration of the simulation parameters of the particulate materials in film mixed materials

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International Journal of Agricultural and Biological Engineering 2020年第4期13卷 29-36页

作者： Rongqing Liang Xuegeng Chen Peng jiang Bingcheng Zhang hewei Meng Xiangbin Peng Za Kan College of Mechanical Electrical Engineering Shihezi UniversityShiheziXinjiang 832000China Key Laboratory of Northwest Agricultural equipment Ministry of Agriculture and Rural AffairsShiheziXinjiang 832000China

In order to obtain accurate contact parameters of a particulate material in residual film mixture collected by cotton field machine in Xinjiang,the angle of repose test and inclined plane test were carried *** the tests,the angles of repose of the particulate material with the water content of(6.26±1.5)%and(14.1±2.1)%were measured respectively,as well as the static sliding friction angle between the particulate material and the residual *** the same time,the EDEM software was used to calibrate the coefficient of restitution,static friction coefficient and dynamic friction coefficient between the material and the ***,the second-order response model between contact parameters and the angle of repose and static sliding friction angle was *** addition,the optimal contact parameters between the granular materials and the mulch were obtained by fitting the physical test *** results indicated that the errors between the physical test results and the numerical simulation results are *** was proved that the second-order response model could predict the repose angle of granular materials and the static sliding friction angle between granular materials and farmland *** study could provide theoretical support for the subsequent model construction of the residual film mixture collected by the cotton field machine.

关键词： cotton field agricultural film particulate material EDEM contact parameter response model calibration

THE EFFECT OF THE CHINESE DATE AND SEALWORT POTION ON SPORTS ABILITY (Patent Right)

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THE EFFECT OF THE CHINESE DATE AND SEALWORT POTION ON SPORTS...

西安脉冲堆燃料元件精细燃耗分布的蒙特卡罗方法研究

泛环渤海地区九省市生物化学与分子生物学会——2011年学术交流会

作者： Yu yingjun Li li Li hewei Yu shuilan jiang ying Department of chemistry and molecular biology Heilongjiang University of Chinese medicine

Purpose:The potion is combined by Chinese date and *** come true the aim of developing the sportsmen’s ability,promoting their performance and contributing to the development of our country’s sports. Methods:280 clean KunMing(KM) mice of 6-8 weeks are selected and divided into 10 groups randomly. Chinese date and sealwort are mixed into suitable dosage.A dosage of 0.4ml is poured into the stomach of

关键词： potion(of Chinese date and sealwort) sports ability

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原子能科学技术 2018年第10期52卷 1756-1761页

作者：王立鹏张信一江新标郭和伟西安交通大学核科学与技术学院陕西西安710049 西北核技术研究所陕西西安710024

本文采用RMC模拟计算了西安脉冲堆(XAPR)稳态堆芯第1循环燃料元件的精细燃耗分布情况,根据XAPR运行温度制备了多温度点氢化锆的热化截面,计算了零燃耗下XAPR冷态和热态实验的keff。分别考虑燃料棒径向和轴向空间离散化下温度反馈的结果... 详细信息

本文采用RMC模拟计算了西安脉冲堆(XAPR)稳态堆芯第1循环燃料元件的精细燃耗分布情况,根据XAPR运行温度制备了多温度点氢化锆的热化截面,计算了零燃耗下XAPR冷态和热态实验的keff。分别考虑燃料棒径向和轴向空间离散化下温度反馈的结果,确定了首循环脉冲堆三维燃耗最深的位置。结果表明,采用燃料棒径向燃耗分区的15EFPD下D5和G14燃料棒燃耗计算结果较径向不分区的结果更接近实验值,RMC应用于XAPR精细燃耗计算具有较高可靠性,可用于脉冲堆物理计算与安全分析工作。

关键词：西安脉冲堆燃耗蒙特卡罗 RMC