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Using MiddRAD-seq data to develop polymorphic microsatellite markers for an endangered yew species

Plant Diversity 2017年第5期39卷 294-299页

作者： hantao qin Guoqian Yang Jim Provan Jie Liu Lianming Gao Key Laboratory for Plant Diversity and Biogeography of East Asia Kunming Institute of BotanyChinese Academy of SciencesKunmingYunnan650201 China University of Chinese Academy of Sciences Beijing100049China Germplasm Bank of Wild Species in Southwest China Kunming Institute of BotanyChinese Academy of SciencesKunming650201China Institute of Biological Environmental and Rural Sciences (IBERS)Aberystwyth UniversityPengiaisAberystwythSY23 3DAUK

Microsatellites are highly polymorphic markers which have been used in a wide range of genetic *** recent years, various sources of next-generation sequencing data have been used to develop new microsatellite loci, but compared with the more common shotgun genomic sequencing or transcriptome data, the potential utility of RAD-seq data for microsatellite ascertainment is comparatively *** this study, we employed MiddRAD-seq data to develop polymorphic microsatellite loci for the endangered yew species Taxus florinii. Of 8,823,053 clean reads generated for ten individuals of a population, 94,851(~1%) contained microsatellite motifs. These corresponded to 2993 unique loci, of which 526(~18%) exhibited polymorphism. Of which, 237 were suitable for designing microsatellite primer pairs, and 128 loci were randomly selected for PCR validation and microsatellite screening. Out of the 128 primer pairs, 16 loci gave clear, reproducible patterns, and were then screened and characterized in 24 individuals from two populations. The total number of alleles per locus ranged from two to ten(mean=4.875), and within-population expected heterozygosity from zero to 0.789(mean = 0.530),indicating that these microsatellite loci will be useful for population genetics and speciation studies of T. florinii. This study represents one of few examples to mine polymorphic microsatellite loci from ddRAD data.

关键词： MiddRAD-seq Endangered species Microsatellite Next-generation sequencing Taxus florinii

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Comparative population genetic analyses suggest hybrid origin of Rhododendron pubicostatum,an endangered plant species with extremely small populations endemic to Yunnan,China

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Plant Diversity 2020年第4期42卷 312-318页

作者： Xuemei Zhang hantao qin Weijia Xie Yongpeng Ma Weibang Sun Yunnan Key Laboratory for Integrative Conservation of Plant Species with Extremely Small Populations Kunming Institute of BotanyChinese Academy of Sciences(CAS)Kunming650201YunnanChina Key Laboratory for Plant Diversity and Biogeography of East Asia Kunming Institute of BotanyChinese Academy of Sciences(CAS)Kunming650201China University of Chinese Academy of Sciences 100049BeijingChina Flower Research Institute Yunnan Academy of Agriculture SciencesKunming650201China

Gene flow between sympatric congeneric plants is thought to be very common and may pose serious threats to endangered *** the present study,we evaluate the genetic diversity and divergence of three sympatric Rhododendron species in Jiaozi Mountain using newly developed microsatellites through the Illumina MiSeq sequencing *** diversity of all three Rhododendron species studied was moderate in comparison to genetic parameters previously reported from species of this ***,genetic structure analysis of the three species identified a possible hybrid origin of the threatened *** sympatry should be considered a unimodal hybrid zone,since *** is predominant *** hybrid zones are uncommon in Rhododendron,despite the fact that hybridization frequently occurs in the *** pertaining to the conservation of *** resulting from admixture of genetic material from its parental species are discussed.

关键词： Rhododendron pubicostatum Plant Species with Extremely Small Populations(PSESP) Microsatellite markers Illumina MiSeq sequencing Conservation management

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洁净与覆冰条件下风力发电机输出功率计算方法及现场试验验证

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电工技术学报 2023年第11期38卷 3041-3051页

作者：舒立春于周李瀚涛胡琴蒋兴良重庆大学雪峰山能源装备安全国家野外科学观测研究站重庆400044 中国电力科学研究院有限公司北京100192

高海拔地区风能资源丰富,然而建设于此的风力发电机面临严重覆冰问题。覆冰会破坏叶片气动结构,造成输出功率损失,影响供电质量。了解不同工况下的风力发电机输出功率情况,有助于电力部门进行合理的电力调度。该文提出了一种适用于洁净... 详细信息

高海拔地区风能资源丰富,然而建设于此的风力发电机面临严重覆冰问题。覆冰会破坏叶片气动结构,造成输出功率损失,影响供电质量。了解不同工况下的风力发电机输出功率情况,有助于电力部门进行合理的电力调度。该文提出了一种适用于洁净和覆冰条件下的风力发电机输出功率计算方法。该方法以叶素动量理论为基础,同时引入二维计算流体动力学(CFD)仿真方法来计算叶素的升力与阻力系数。将计算结果与现场试验运行结果对比发现,该计算方法可以在工程应用允许的误差范围内获得风力发电机的输出功率。此外,通过比较基于该方法获得的关键气动参数在不同风速下沿叶片翼展方向的分布发现,冰层的存在会降低叶片对风能的利用率,减小叶片旋转扭矩,从而导致输出功率降低;并且随着风速的增加,覆冰所带来的负面影响更加明显。

关键词：风力发电机输出功率叶素动量理论覆冰

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The geology and geochemistry of the Shizitou molybdenum deposit, Jiangxi province, China: Implications for the geodynamic setting

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Acta Geologica Sinica(English Edition) 2017年第S1期91卷 233-234页

作者： WANG Cheng SHAO Yongjun LIU Zhongfa ZHANG Yu WEI hantao Key Laboratory of Metallogenic Prediction of Non-ferrous Metals and Geological Environment Monitoring(Central South University) Ministry of EducationChangsha 410083 School of Geo-sciences and Info-physics Central South UniversityChangsha 410083 Guangzhou Institute of Geochemistry Chinese Academy of SciencesGuangzhou 51064

1 Introduction The qin-Hang suture zone is the most important polymetallic metallogenic zone in southern China[1-2]and has the greatest resource *** recent years,a group of molybdenum(Mo)deposits have been discovered in the northeastern part of the qin-Hang belt[3].From Mar.2006to Dec.2014,the Jiangxi Copper Group Geological Exploration Engineering Co.,*** prospecting,

关键词： Mo In Jiangxi province China Implications for the geodynamic setting

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lncRNA TTN-AS1调控miR-134-5p/MBTD1信号轴促进骨肉瘤的生长和转移

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国际检验医学杂志 2022年第23期43卷 2863-2868页

作者：刘汉涛秦宏敏赵良虎攀枝花学院附属医院骨科四川攀枝花617000

目的探究长链非编码RNA(lncRNA)TTN-AS1对骨肉瘤生长和转移的影响及机制。方法采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测TTN-AS1在hFoB1.19、U2-OS、MG-63、SOSP-9607、SAOS2细胞中的表达水平,将其中TTN-AS1表达水平最高的SAOS2细胞分为Control组(未转染)、si-NC组[转染TTN-AS1小干扰RNA(siRNA)阴性对照]、si-TTN-AS1组(转染TTN-AS1 siRNA)、si-TTN-AS1+微小RNA(miR)-134-5p inhibitor组(共转染TTN-AS1 siRNA和miR-134-5p inhibitor)、si-TTN-AS1+含MBT结构域蛋白1(MBTD1)组(共转染TTN-AS1 siRNA和MBTD1质粒)。采用CCK8法检测细胞的增殖能力,Transwell小室法检测细胞的迁移和侵袭能力,双荧光素酶报告基因实验验证TTN-AS1与miR-134-5p的靶向关系以及miR-134-5p与MBTD1的靶向关系。结果TTN-AS1在U2-OS、MG-63、SOSP-9607、SAOS2细胞中的表达水平明显高于hFoB1.19细胞(P<0.05)。si-TTN-AS1组细胞增殖、迁移和侵袭能力均明显低于si-NC组(P<0.05)。双荧光素酶报告基因实验证实,miR-134-5p为TTN-AS1的靶基因,MBTD1为miR-134-5p的靶基因。si-TTN-AS1+miR-134-5p inhibitor组和si-TTN-AS1+MBTD1组细胞增殖、迁移和侵袭能力均明显强于si-TTN-AS1组(P<0.05)。结论抑制TTN-AS1的表达可抑制骨肉瘤细胞的增殖、迁移和侵袭,其机制为TTN-AS1调控miR-134-5p/MBTD1信号轴。

关键词：骨肉瘤长链非编码RNA TTN-AS1 含MBT结构域蛋白1 微小RNA-134-5p

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转管继代对黑木耳菌种质量的影响

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吉林农业大学学报 2022年第3期44卷 293-299页

作者：王毓婧姚方杰孙旭陈涵涛秦红宇鲁丽鑫吉林农业大学园艺学院长春130118 吉林农业大学食药用菌教育部工程研究中心长春130118

以5个在4℃低温保藏的黑木耳审定品种A9、A10、A13、A19、A20为供试菌种,研究低温继代保藏中转管继代对黑木耳菌种质量的影响,以期筛选出退化菌种开展退化机制的研究。未转管继代低温保藏7年的菌种作为对照,每隔1年转管继代1次,连续转... 详细信息

以5个在4℃低温保藏的黑木耳审定品种A9、A10、A13、A19、A20为供试菌种,研究低温继代保藏中转管继代对黑木耳菌种质量的影响,以期筛选出退化菌种开展退化机制的研究。未转管继代低温保藏7年的菌种作为对照,每隔1年转管继代1次,连续转管继代2次后继续保藏5年、转管继代6次后保藏1年的菌种作为处理,共15个试验菌种,研究菌种的菌丝特征、胞外酶活性及出耳特性。结果表明:大部分品种转管继代6次的菌种菌丝生长速度、菌丝生物量显著高于转管继代2次及对照菌种,其中,A10(6)的菌丝生长速度比A10(0)提高了11.72%,菌丝生物量增加了403.70%。经过转管继代后菌种的纤维素酶、漆酶、淀粉酶活性均较对照菌种酶活性有所提高,半纤维素酶活性变化无显著差异。出耳试验也表明,转管继代6次的菌种比对照菌种生育期缩短、产量显著提高。说明转管继代能够保持黑木耳菌种活力,不同品种转管继代2次和对照菌种存在不同程度退化,筛选出2株退化严重的菌种A10(0)、A20(0),用于后续黑木耳菌种退化机制的研究。

关键词：黑木耳转管继代菌丝特征胞外酶产量

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股骨近端防旋髓内钉-Ⅱ固定治疗伴外侧壁骨折的股骨转子间骨折

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中华创伤骨科杂志 2019年第9期21卷 777-782页

作者：秦宏敏刘汉涛刘典锋四川省攀枝花学院附属医院骨科医院髋关节外科 617000

目的探讨股骨近端防旋髓内钉-Ⅱ(PFNAⅡ)固定治疗伴外侧壁骨折的股骨转子间骨折的临床疗效。方法回顾性分析2013年1月至2017年12月期间四川省攀枝花学院附属医院骨科医院髋关节外科采用PFNAⅡ固定治疗的491例股骨转子间骨折患者资料。... 详细信息

目的探讨股骨近端防旋髓内钉-Ⅱ(PFNAⅡ)固定治疗伴外侧壁骨折的股骨转子间骨折的临床疗效。方法回顾性分析2013年1月至2017年12月期间四川省攀枝花学院附属医院骨科医院髋关节外科采用PFNAⅡ固定治疗的491例股骨转子间骨折患者资料。根据是否伴外侧壁骨折分为两组:外侧壁骨折组104例,男43例,女61例;年龄为(72.3±2.1)岁;按外侧壁骨折形态分型:Ⅰ型45例,Ⅱ型23例,Ⅲ型36例。外侧壁无骨折组387例,男186例,女201例;年龄为(74.7±1.5)岁。比较两组患者的手术切口长度、手术时间、术中出血量、骨折愈合时间、末次随访时髋关节Harris评分及并发症发生情况等。结果两组患者术前一般资料比较差异均无统计学意义(P>0.05),具有可比性。491例患者术后获平均25.5个月(12~50个月)随访。外侧壁骨折组患者的骨折愈合时间[(27.2±12.1)周]显著长于外侧壁无骨折组患者[(13.1±2.2)周],骨折延迟愈合发生率(16.4%,17/104)显著高于外侧壁无骨折组患者(2.3%,9/387),差异均有统计学意义(P0.05)。结论PFNAⅡ固定治疗伴外侧壁骨折的股骨转子间骨折可取得良好疗效,但是骨折愈合时间长于外侧壁无骨折的股骨转子间骨折患者。

关键词：髋骨折骨折固定术,髓内骨钉外侧壁

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考虑覆冰粗糙度影响的风力发电机叶片气动性能数值仿真

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电工技术学报 2018年第10期33卷 2253-2260页

作者：李瀚涛舒立春胡琴蒋兴良邱刚输配电装备及系统安全与新技术国家重点实验室(重庆大学) 重庆400030

针对高湿、寒冷地区覆冰造成机组出力减少的问题,以NREL S809二维翼型及某型300k W风力机三维风轮为研究对象,采用计算流体力学(CFD)数值仿真方法,结合覆冰粗糙度模型,研究分析覆冰粗糙度对风力机叶片气动性能的影响规律。计算结果表明... 详细信息

针对高湿、寒冷地区覆冰造成机组出力减少的问题,以NREL S809二维翼型及某型300k W风力机三维风轮为研究对象,采用计算流体力学(CFD)数值仿真方法,结合覆冰粗糙度模型,研究分析覆冰粗糙度对风力机叶片气动性能的影响规律。计算结果表明:对于改变翼型气动外形较小的覆冰,二维翼型的气动性能随着覆冰粗糙度大小、覆冰相对宽度的增加而降低,随着攻角的增加影响变大;对于改变翼型气动外形较大的覆冰(雾凇或雨凇),雨凇覆冰的破坏作用更大,但雾凇覆冰翼型受覆冰粗糙度影响更大;叶片覆冰导致三维风轮气动性能降低,在大风速下更为显著;随着覆冰粗糙度大小的增加,三维风轮输出转矩和轴向推力降低,且随着风速的增加,降低程度变大。该文的计算结果对覆冰地区风电场运行及机组性能评估有一定的参考价值和借鉴意义。

关键词：风力发电机叶片覆冰覆冰粗糙度气动特性计算流体力学数值模拟

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风机叶片电加热除冰及电阻丝布置方式试验研究

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中国电机工程学报 2017年第13期37卷 3816-3822页

作者：舒立春戚家浩胡琴蒋兴良邱刚李瀚涛输配电装备及系统安全与新技术国家重点实验室(重庆大学) 重庆市沙坪坝区400030

为研究外界因素对风机叶片电阻加热除冰时间的影响规律,以及电阻丝布置方式对融冰过程的影响,该文在多功能人工气候室内对风机叶片进行了电阻加热除冰试验研究,分析了覆冰厚度、环境温度、相对风速和液态水含量(liquid water content,L... 详细信息

为研究外界因素对风机叶片电阻加热除冰时间的影响规律,以及电阻丝布置方式对融冰过程的影响,该文在多功能人工气候室内对风机叶片进行了电阻加热除冰试验研究,分析了覆冰厚度、环境温度、相对风速和液态水含量(liquid water content,LWC)对除冰时间的影响规律,并提出了合理的电阻丝布置方式。结果表明:覆冰厚度较小时,其对除冰时间的影响较为明显,随着覆冰厚度的继续增大,除冰时间无明显差异;除冰时间随加热功率和环境温度的增大而降低,随相对风速和LWC的增大而增大,且不同覆冰厚度下除冰时间随上述因素的变化曲线会有较大不同;叶片尖部电阻丝宜采用弦向布置,根部电阻丝宜采用展向布置;除冰过程中,叶片尖部冰层易发生脱落,根部冰层易被融化。

关键词：电加热除冰时间:电阻丝布置方式融化水

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自然覆冰对限功率运行风力机变桨特性的影响

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中国电机工程学报 2019年第16期39卷 4838-4845页

作者：胡琴杨大川舒立春蒋兴良李瀚涛吴彬输配电装备及系统安全与新技术国家重点实验室(重庆大学) 重庆市沙坪坝区400030 国网重庆市电力公司重庆市渝中区400015

针对自然覆冰环境下风力机桨距角变化问题,以300kW风力机为研究对象,采用限功率运行控制方式,通过现场试验研究自然覆冰环境下风力机变桨特性。结果表明:限功率运行时桨距角随风速增加呈上升态势;相较于洁净环境,轻度覆冰导致β-v曲线... 详细信息

针对自然覆冰环境下风力机桨距角变化问题,以300kW风力机为研究对象,采用限功率运行控制方式,通过现场试验研究自然覆冰环境下风力机变桨特性。结果表明:限功率运行时桨距角随风速增加呈上升态势;相较于洁净环境,轻度覆冰导致β-v曲线整体降低,当功率限定值分别为50、100、150kW时,桨距角平均值分别降低2.3°、3.9°、4.5°,平均降幅分别为35.7%、51.5%、80.3%;风速增加会减弱轻度覆冰对桨距角的影响程度,功率限定值的提高会加大轻度覆冰对桨距角的影响程度;轻度覆冰后,β-v曲线随功率限定值增加而整体降低,每增加50kW功率限定值,桨距角平均降低35%~45%。该文试验数据和研究结果可为自然覆冰环境下风力机的机组控制提供参考,对其稳定合理运行具有重要意义。

关键词：风力机限功率运行自然覆冰桨距角 β-v曲线

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