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基于MAFFT的多序列比对最优参数的确定

基因组学与应用生物学 2016年第7期35卷 1668-1674页

作者：李满枝龙海侠王洪涛付海艳海南师范大学数学与统计学院海口571158 海南师范大学信息与科学学院海口571158

多序列比对是生物信息学的一个重要研究内容,比对结果高度依赖于比对工具的参数设置,包括空位罚分(GOP和GEP)以及替换矩阵。本研究基于BAli BASE3.0数据库,应用MAFFT工具(MAFFT-7.220-WIN64 version)进行多序列比对,得出替换矩阵和空位... 详细信息

多序列比对是生物信息学的一个重要研究内容,比对结果高度依赖于比对工具的参数设置,包括空位罚分(GOP和GEP)以及替换矩阵。本研究基于BAli BASE3.0数据库,应用MAFFT工具(MAFFT-7.220-WIN64 version)进行多序列比对,得出替换矩阵和空位罚分的最优参数组合,从而得到更好的比对结果。实验结果表明,通过与MAFFT(MAFFT-7.220-WIN64 version)、CLUSTALW(CLUSTALW-2.1-WIN)的默认参数比较,根据本研究得出的最优参数组合可以得到比默认参数更优的比对结果。本研究给出的最优参数组合优化了多序列比对结果,具有可行性和高效性。

关键词：多序列比对替换矩阵空位罚分 MAFFT比对工具

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峨眉武术传承与传播研究

武术研究 2018年第6期3卷 7-9页

作者：颜下里龙海霞内江师范学院体育学院四川内江641112 内江师范学院教育科学学院四川内江641112

国家级非物质文化遗产峨眉武术是巴渝地区特色文化的代表,但在现代环境中其传承与传播的过程并未得到应有的重视,导致其发展受限。文章结合当代峨眉武术在传承与传播方面的现状,从必要性入手,探讨了促进其传承与发展的策略,力求助力于... 详细信息

国家级非物质文化遗产峨眉武术是巴渝地区特色文化的代表,但在现代环境中其传承与传播的过程并未得到应有的重视,导致其发展受限。文章结合当代峨眉武术在传承与传播方面的现状,从必要性入手,探讨了促进其传承与发展的策略,力求助力于国家级非物质文化遗产峨眉武术的传承与传播,以利于弘扬传统文化。

关键词：峨眉武术非物质文化遗产传承与传播

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公立医院招标采购常见风险及防控措施研究

现代医院 2022年第8期22卷 1242-1243,1247页

作者：魏海宁龙海霞广东省人民医院//广东省医学科学院广东广州510100

公立医院采购项目招投标过程严谨,基本流程包括前期调研确定采购需求、招标文件编制、院内流程审核、委托代理机构、开评标程序、采购方案确定、合同签署、项目验收等多个阶段,涉及多种风险。本文介绍了公立医院采购项目招标投标过程中... 详细信息

公立医院采购项目招投标过程严谨,基本流程包括前期调研确定采购需求、招标文件编制、院内流程审核、委托代理机构、开评标程序、采购方案确定、合同签署、项目验收等多个阶段,涉及多种风险。本文介绍了公立医院采购项目招标投标过程中的常见风险,结合具体风险问题探讨了相对应的风险防控措施,旨在合法合规、兼顾公平与效率地完成招标采购工作,切实保障公立医院采购的权益。

关键词：招标投标采购风险法律风险风险防控

人卵巢癌细胞系A2780中肿瘤干细胞的分离及鉴定

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第三军医大学学报 2011年第4期33卷 356-359页

作者：谢伟龙海霞张恒向橦朱波谢荣凯第三军医大学新桥医院全军肿瘤诊治研究所重庆400037 第三军医大学新桥医院妇产科重庆400038

目的从人卵巢癌细胞系A2780中分离并鉴定卵巢癌干细胞。方法将A2780细胞置于含人重组表皮生长因子(epidermal growth factor,EGF)、人重组碱性成纤维生长因子(basic fibroblast growth factor,bFGF)、牛血清白蛋白和人胰岛素的无血清培... 详细信息

目的从人卵巢癌细胞系A2780中分离并鉴定卵巢癌干细胞。方法将A2780细胞置于含人重组表皮生长因子(epidermal growth factor,EGF)、人重组碱性成纤维生长因子(basic fibroblast growth factor,bFGF)、牛血清白蛋白和人胰岛素的无血清培养基中培养,采用连续传代诱导培养肿瘤干细胞,对每代分离出来的肿瘤干细胞进行流式检测,并对第4代肿瘤干细胞进行免疫荧光检测和逆向分化实验。结果从A2780细胞中成功分离出肿瘤干细胞,在上述无血清培养基中呈悬浮生长,具有很强的自我更新能力,流式检测显示随着传代诱导,CD133阳性率依次升高,免疫荧光进一步证实了CD133是卵巢癌干细胞的表面标记物,诱导分化实验说明其可逆向分化成为A2780肿瘤细胞。结论体外培养的卵巢癌细胞株A2780中存在卵巢癌干细胞,并能将其分离培养和诱导分化。

关键词：卵巢肿瘤肿瘤细胞,培养的肿瘤干细胞分离鉴定

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金银腊牛肝的研制

食品与发酵工业 2019年第20期45卷 164-168页

作者：郭列娥朱丹丹韩玲武永琴龙海霞孔钦文甘肃农业大学食品科学与工程学院

为综合利用牛副产物,丰富牛肝产品的种类,采用均匀试验设计对金银腊牛肝生产过程中原料去腥、腌制及干制工艺参数进行优化筛选,为其产品开发提供科学依据。结果表明,金银腊牛肝最佳去腥工艺参数为陈皮添加量1.5%(质量分数),时间3 h,牛... 详细信息

为综合利用牛副产物,丰富牛肝产品的种类,采用均匀试验设计对金银腊牛肝生产过程中原料去腥、腌制及干制工艺参数进行优化筛选,为其产品开发提供科学依据。结果表明,金银腊牛肝最佳去腥工艺参数为陈皮添加量1.5%(质量分数),时间3 h,牛肝与去腥剂质量比为1∶2;腌制工艺参数为食盐3.0%(质量分数),红曲红0.030%(质量分数),腌制时间40 h、脂肪6%(质量分数)、异抗坏血酸钠0.04%(质量分数);干制工艺参数为时间11 d,温度40℃,湿度70%。经验证,此工艺条件下的金银腊牛肝成品口感良好,风味独特。

关键词：腊制品牛肝均匀试验陈皮去腥

低剂量超微分割与常规分割放疗对脑胶质瘤细胞的生物学效应比较

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第三军医大学学报 2012年第11期34卷 1026-1030页

作者：陈媛媛汤金梁龙海霞李光辉许建平第三军医大学新桥医院病理科重庆400037 第三军医大学新桥医院肿瘤科重庆400037

目的比较低剂量超微分割放疗与常规分割放疗对脑胶质瘤细胞的作用效果。方法以低剂量率超微分割放疗(每0.2 Gy间隔3 min,剂量率为0.066 7 Gy/min)和常规分割(剂量率4～6 Gy/min)2种方法照射脑胶质瘤GL261细胞,分别在第1、2、3天采用彗... 详细信息

目的比较低剂量超微分割放疗与常规分割放疗对脑胶质瘤细胞的作用效果。方法以低剂量率超微分割放疗(每0.2 Gy间隔3 min,剂量率为0.066 7 Gy/min)和常规分割(剂量率4～6 Gy/min)2种方法照射脑胶质瘤GL261细胞,分别在第1、2、3天采用彗星分析和流式细胞分析检测细胞DNA损伤、凋亡、细胞周期分布。结果彗星实验显示低剂量率超微分割放疗可产生与常规分割等效的细胞DNA损伤,2组间各时间点彗星荧光图像的尾部DNA百分含量(tail DNA%)、尾长(tail length)、尾距(tail moment)均数差异无显著性(P>0.05)。细胞凋亡、存活情况显示超微分割组各时间点的细胞存活率较常规分割组低,差异有显著性(P0.05)。结论低剂量率超微分割放疗对脑胶质瘤细胞GL261可产生与常规分割等效的DNA损伤,但对细胞的杀伤作用强于常规分割照射。该现象可能与低剂量率超微分割照射胶质瘤细胞后有不同的DNA损伤修复机制有关。

关键词：神经胶质瘤放射治疗剂量细胞凋亡 DNA损伤

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蛙皮降压肽类似物构效关系的研究

计算机与应用化学 2007年第11期24卷 1461-1464页

作者：王槐亮王远强龙海霞万瑾王晓宇林治华重庆工学院生物工程学院重庆400050

蛙皮降压肽(Sauvagine,Svg)是一种良好的促肾上腺皮质激素,释放因子2受体(CRF2R)激动剂,但它是一种非选择性激动剂,作用于CRF1R而产生副作用。为了探讨蛙皮降压肽类似物对CRF2R与CRF1R选择性的影响,本文使用正交因子(Orthogonal Factors... 详细信息

蛙皮降压肽(Sauvagine,Svg)是一种良好的促肾上腺皮质激素,释放因子2受体(CRF2R)激动剂,但它是一种非选择性激动剂,作用于CRF1R而产生副作用。为了探讨蛙皮降压肽类似物对CRF2R与CRF1R选择性的影响,本文使用正交因子(Orthogonal Factors,Orth-Factors)描述子,对45个蛙皮降压肽类似物与CRF2F、CRF1R的亲合力进行了QSAR研究,所建立的QSAR模型预测能力良好。通过QSAR模型信息,设计了17个蛙皮降压肽类似物,其中3个对CRF2R与CRF1R受体选择性良好(SQ:110,TQ:105,VQ:110),有进一步研究的价值。

关键词：促肾上腺皮质激素释放因子2受体蛙皮降压肽多肽定量构效关系

青海大通“8·18”山洪灾害特征及风险分析

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自然资源遥感 2024年第2期36卷 135-141页

作者：和海霞李博应急管理部国家减灾中心北京100024 应急管理部国家自然灾害防治研究院北京100085

2022年8月18日凌晨,青海省西宁市大通回族土族自治县发生山洪灾害,导致26人死亡、5人失联,这是典型的小溪小河发生灾害造成多人伤亡事件。降雨叠加是此次山洪灾害的直接原因,前期连续降雨使土壤含水量达到或接近饱和,2022年8月17日晚超... 详细信息

2022年8月18日凌晨,青海省西宁市大通回族土族自治县发生山洪灾害,导致26人死亡、5人失联,这是典型的小溪小河发生灾害造成多人伤亡事件。降雨叠加是此次山洪灾害的直接原因,前期连续降雨使土壤含水量达到或接近饱和,2022年8月17日晚超历史记录局地短时强降雨难以通过土壤下渗或被植被截留,形成山洪灾害。综合分析遥感数据、数字高程模型、现场数据和媒体数据发现,山洪区具有汇水面大、河谷狭窄、相对高差大、河道较浅、障碍物多等特征,造成山洪势能大、运动距离长、局地雍水外溢严重,致使沟道两侧部分房屋、农田、道路等被冲毁。全球变化背景下,西北干旱区、青藏高原等山洪低风险区降水量显著增加,局地短时强降水时有发生,小溪小河发生山洪甚至特大山洪风险形势日益严峻,如再次遭遇强降雨灾区存在山洪灾害复发风险。

关键词：山洪灾害成因特点遥感监测风险分析

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基于弱化图卷积网络的文本分类

计算机科学 2023年第S1期50卷 83-87页

作者：黄玉娇陈铭凯郑媛范兴刚肖杰龙海霞浙江工业大学之江学院浙江绍兴312030 浙江工业大学计算机科学与技术学院杭州310000

文本分类是自然语言处理领域中的经典问题。传统的文本分类模型存在需要人工提取特征,分类准确率不高,难以处理非欧氏空间数据等问题。为了解决上述问题,进一步提高文本分类的准确率,提出了W-GCN模型。该模型在Text-GCN模型的基础上加... 详细信息

文本分类是自然语言处理领域中的经典问题。传统的文本分类模型存在需要人工提取特征,分类准确率不高,难以处理非欧氏空间数据等问题。为了解决上述问题,进一步提高文本分类的准确率,提出了W-GCN模型。该模型在Text-GCN模型的基础上加以改进,建立了全新的弱化结构模型,用以替换Text-GCN模型中对神经元的Dropout操作,并通过弱化权重,精确控制弱化力度大小,在一定程度保留Dropout防止过拟合功能的基础上,避免了由直接丢弃神经元造成的特征丢失问题,因此提高了模型分类的准确率。与Text-GCN模型相比,基于弱化图卷积网络建立的W-GCN模型,在R8数据集上准确率提高了0.38%,在R52数据集上准确率提高了0.62%。实验结果证明了模型改进和弱化结构的有效性。

关键词：图卷积网络文本分类文本图构建方法弱化结构 Dropout