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Genome-wide alternative splicing variation and its potential contribution to maize immature-ear heterosis

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基于RNA结合蛋白转录组数据构建食管鳞癌预后预测模型

The Crop Journal 2021年第2期

作者： Xiaojiao hu Hongwu Wang Kun Li Xiaogang Liu Zhifang Liu yujin Wu Shuqiang Li Changling huang

来源：评论

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中华实验外科杂志 2022年第11期39卷 2211-2214页

作者：胡力文郭梓鑫宋丛宽汪育锦王青雯李炫飞胡卫东武汉大学中南医院胸外科湖北省肿瘤临床研究中心肿瘤生物学行为湖北重点实验室 430071 武汉大学中南医院胃肠外科 430071

目的基于美国癌症基因组图谱(TCGA)数据库的RNA结合蛋白转录组数据构建食管鳞癌预后预测模型。方法从TCGA数据库下载80例食管鳞癌组织及11例正常组织的转录组数据及临床资料。应用倍数差异法筛选队列中差异表达基因,分析其KEGG通路、GO... 详细信息

目的基于美国癌症基因组图谱(TCGA)数据库的RNA结合蛋白转录组数据构建食管鳞癌预后预测模型。方法从TCGA数据库下载80例食管鳞癌组织及11例正常组织的转录组数据及临床资料。应用倍数差异法筛选队列中差异表达基因,分析其KEGG通路、GO生物功能。使用survival程序包对食管癌数据RBPs进行单变量Cox分析,进一步筛选出重要的候选基因。利用LASSO-Cox回归分析,筛选出食管癌预后相关标志物,与食管癌预后相关的临床特征相结合,构建多变量Cox回归模型。利用Kaplan-Meier分析、ROC分析验证所构建的模型的预测性能。采用实时荧光定量PCR技术检测10例食管癌组织和10例癌旁组织中特征基因的表达,两组间比较采用t检验。结果在食管鳞癌组织和正常食管组织中进行差异基因分析筛选得到差异表达的38个RBPs,其中16个在肿瘤组织中上调、22个下调。经Cox回归分析后,3个RBPs(TRIT1、PIWIL4、ANG)被纳入模型的构建。根据中位风险评分生存分析,将患者分为低危组和高危组,结果表明,无论是在TCGA训练集还是测试集,高危亚组患者总体生存时间低于低危亚组患者,其结果具有统计学意义(P<0.05)。训练集中模型预测3年生存率的ROC曲线下面积为0.749,在测试集则为0.738,提示模型准确率较高。在独立预后分析中,单因素Cox、多变量Cox结果表明,风险评分与患者的OS相关(P<0.05),说明该预后模型可以作为独立的预后因子预测食管鳞癌患者的生存。最后通过qRT-PCR验证食管鳞癌患者的癌组织和癌旁组织中特征基因的表达,结果显示,食管鳞癌患者肿瘤组织ANG、TRIT1基因表达显著高于癌旁组织(13.661±10.354比2.500±2.333、24.551±22.518比1.752±2.057),差异有统计学意义(t=2.782、2.470,P<0.05),PIWIL4基因表达显著低于癌旁组织(0.229±0.341比1.511±1.180),差异有统计学意义(t=-2.763,P<0.05)。结论本研究构建的基于3个RBPs的食管鳞癌风险预测模型具有较好的预测性能,有助于患者的个体化治疗。

关键词：食管癌 RNA结合蛋白预后风险评分模型美国癌症基因组图谱

以妊娠期高血糖起病同时合并葡萄糖激酶和B淋巴细胞酪氨酸激酶基因变异的青少年发病的成人型糖尿病2型家系报道

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中华糖尿病杂志 2022年第3期14卷 274-277页

作者：彭慧芳段倩雯张文张文博胡可嫣付留俊马瑜瑾姜宏卫河南科技大学临床医学院河南科技大学第一附属医院内分泌代谢中心河南省遗传罕见病医学重点实验室国家代谢性疾病临床医学研究中心洛阳分中心洛阳471003

报道1例以妊娠期高血糖起病同时合并葡萄糖激酶(GCK)和B淋巴细胞酪氨酸激酶(BLK)基因变异的青少年的成人起病型糖尿病2型(MODY2)家系。先证者以"妊娠6个月,围产期血糖升高"为主诉入院,通过家系临床资料分析和遗传学检测,发现同时携带GCK... 详细信息

报道1例以妊娠期高血糖起病同时合并葡萄糖激酶(GCK)和B淋巴细胞酪氨酸激酶(BLK)基因变异的青少年的成人起病型糖尿病2型(MODY2)家系。先证者以"妊娠6个月,围产期血糖升高"为主诉入院,通过家系临床资料分析和遗传学检测,发现同时携带GCK c.793G>A和BLK c.274G>C变异,以及单独携带GCK变异的成员符合MODY2的主要临床症状特点,而仅携带BLK基因变异的成员口服糖耐量试验结果正常,诊断该家系主要致病原因为GCK基因变异引起的MODY2。先证者予以胰岛素强化治疗,控制饮食,适当活动,3个月后足月分娩一男婴,新生儿血糖筛查正常。我们结合文献探讨其临床特征、诊治要点,旨在扩展内分泌医师对相关遗传基因的认识,提高诊治MODY的能力。

关键词：糖尿病妊娠期高血糖青少年发病的成人型糖尿病2型葡萄糖激酶基因 B淋巴细胞酪氨酸激酶基因

Vadimezan原料药中光降解杂质的结构确证及其含量测定

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中国测试 2023年第7期49卷 61-68页

作者：庄钰金胡小爱曾敏张皓然冯菊龙珊珊任凤英成都大学四川抗菌素工业研究所抗生素研究与再评价四川省重点实验室四川成都610106 甘肃省静宁县中医院甘肃静宁743400 四川百利天恒药业有限公司四川成都610000

采用LC-MS/Q-TOF、NMR(1H,13C,DEPT)对Vadimezan原料药中光降解杂质进行结构确证。通过HPLC法对Vadimezan中的光降解杂质进行含量测定,以Agilent ZORBAX Eclipse XDB-C8(4.6 mm×250 mm,5μm)为色谱柱,检测波长为243 nm,柱温为40℃,进样量为10μL,流量为1 mL/min,流动相A为0.08%磷酸水溶液,流动相B为乙腈,梯度洗脱。试验结果表明Vadimezan在光照强度为4500 lx±500 lx的光照箱中,产生光降解杂质3,4,5-三甲基-9H-呫吨-9-酮。该研究对Vadimezan的质量控制具有参考价值。

关键词： Vadimezan 光降解杂质结构确证含量测定

同方期刊数据库博看期刊评论

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中国超深层构造型大气田高效开发策略

石油勘探与开发 2018年第1期45卷 111-118页

作者：李熙喆郭振华胡勇罗瑞兰苏云河孙贺东刘晓华万玉金张永忠李蕾中国石油勘探开发研究院河北廊坊065007 中国石油天然气集团公司天然气成藏与开发重点实验室河北廊坊065007

通过对中国超深层构造型大气田开发的跟踪分析,从影响开发技术政策制定的地质与生产动态特征出发,提出实现气田高效开发的策略。依据储集层基质物性、裂缝发育程度以及基质与裂缝匹配关系的差异,将气藏储集层划分为单孔单渗、双孔双渗... 详细信息

通过对中国超深层构造型大气田开发的跟踪分析,从影响开发技术政策制定的地质与生产动态特征出发,提出实现气田高效开发的策略。依据储集层基质物性、裂缝发育程度以及基质与裂缝匹配关系的差异,将气藏储集层划分为单孔单渗、双孔双渗和双孔单渗3种类型,明确了不同类型储集层在不同尺度渗透率、动态与静态储量比值以及水侵风险程度等开发生产特征方面的差异。指出气田开发规模确定和水侵风险快速识别是影响超深层构造型气藏开发效果的主要因素;明确气藏特征并有针对性地制定技术政策是实现高效开发的关键。具体策略包括:进一步强化气藏前期评价技术和内容,通过部署高精度开发地震、分批次部署开发评价井和规模试采,准确认识构造、储集层类型、气水分布等气藏特征,落实可动用储量;合理控制建产节奏,保证前期评价时间,确保评价效果;制定合理开发技术政策,以落实的可动用储量作为开发方案编制的基础,重点考虑水侵风险与基质供气能力两个因素,优化开发井位部署和单井配产;持续加强关键技术研究与攻关。

关键词：超深层构造型大气田气藏特征储集层高效开发水侵风险开发策略

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表皮生长因子受体在三阴性乳腺癌中的表达及其与临床病理特征相关性的meta分析

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中国普外基础与临床杂志 2023年第1期30卷 72-79页

作者：高旭东胡莺菡陈进杨瑜瑾权毅西南医科大学附属医院乳腺外科四川泸州646000

目的探讨表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)在三阴性乳腺癌(triplenegative breast cancer,TNBC)中的表达及它与TNBC患者临床病理特征的关系。方法计算机检索PubMed、Web of Science、中国知网、万方数据和维普数据库,按照纳入和排除标准选取EGFR在TNBC中表达的有关临床研究,检索时间为建库至2022年1月。由2名研究者独立筛选文献、提取资料并进行文献质量评价后采用RevMan 5.4软件进行meta分析。结果共纳入28项研究,包括7956例患者。meta分析结果显示,EGFR在TNBC患者中的表达阳性率高于非TNBC患者[OR=5.16,95%CI(4.04,6.58),P2 cm[OR=2.09,95%CI(1.18,3.72),P=0.01]患者在EGFR阳性者中占比高于EGFR阴性者,而未发现TNBC组织学分级(WHO分级)3级患者在EGFR阳性和EGFR阴性者中的占比比较差异有统计学意义(P=0.07)。结论从本meta分析结果提示,EGFR与TNBC的发生、发展及转移可能有一定的关系。

关键词：表皮生长因子受体三阴性乳腺癌 meta分析

玉米株高和穗位高在不同环境下的数量遗传分析

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作物杂志 2017年第3期 13-18页

作者：何文昭王红武胡小娇李坤王琪吴宇锦刘志芳黄长玲中国农业科学院作物科学研究所北京100081

以玉米杂交种中单909的双亲郑58和HD568及其组配得到的220个重组自交系为材料,在3个环境下对株高和穗位高的遗传特性进行剖析。通过对群体表型数据的分析,发现株高和穗位高受环境影响显著,两者的广义遗传力均较大。对株高和穗位高进行... 详细信息

以玉米杂交种中单909的双亲郑58和HD568及其组配得到的220个重组自交系为材料,在3个环境下对株高和穗位高的遗传特性进行剖析。通过对群体表型数据的分析,发现株高和穗位高受环境影响显著,两者的广义遗传力均较大。对株高和穗位高进行联合分离分析发现,株高在2015年夏河南新乡(环境Ⅰ)环境下符合F-2遗传模型,在2016年夏河南新乡(环境Ⅱ)和2016年春吉林公主岭(环境Ⅲ)环境下均符合G-0遗传模型;穗位高在环境Ⅰ和Ⅱ符合F-2遗传模型,在环境Ⅲ符合G-0遗传模型,说明株高和穗位高的遗传模型受环境的影响很大。该结果为相关QTL定位和广适性玉米品种选育提供理论基础。

关键词：玉米株高穗位高遗传模型

水泥混凝土桥面铺装抗泛白性能评价方法及影响因素研究

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中外公路 2023年第5期43卷 198-207页

作者：李宁博郝培文王雨谨胡小金长安大学公路学院陕西西安710000 中国市政工程西北设计院有限责任公司陕西西安710000 陕西路桥集团有限公司陕西西安710054

该文分析不同泛白现象产生的原因,并确定气压差为主要的泛白驱动力。采用自行设计沥青混合料“临界气压差试验”分析不同压实方式以及级配类型下沥青混合料的抗泛白性能,并提出“临界气压差”“2 kPa下开始唧浆时间”和“2 kPa下、3 mi... 详细信息

该文分析不同泛白现象产生的原因,并确定气压差为主要的泛白驱动力。采用自行设计沥青混合料“临界气压差试验”分析不同压实方式以及级配类型下沥青混合料的抗泛白性能,并提出“临界气压差”“2 kPa下开始唧浆时间”和“2 kPa下、3 min唧浆量”可以有效评价沥青混合料抗泛白性能。结果表明:压实方式上沥青混合料抗泛白性能排序为:旋转压实成型、马歇尔击实成型、轮碾成型;级配设计上SMA抗泛白性能优于AC,并且集料粒径越大,抗泛白性能越优。

关键词：沥青混合料泛白现象压实方式临界气压差开始唧浆时间唧浆量抗泛白性能改善措施

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Alstrom综合征2例并文献复习

中华糖尿病杂志 2022年第4期14卷 381-385页

作者：彭慧芳王松段倩雯林玉玲胡可嫣金文波马瑜瑾姜宏卫河南科技大学临床医学院河南科技大学第一附属医院内分泌代谢中心河南省遗传罕见病医学重点实验室国家代谢性疾病临床医学研究中心洛阳分中心洛阳471003 南阳市中心医院内分泌科南阳473000

该文报道2例分别因"糖尿病"和"低钾血症"就诊,且均有糖尿病、胰岛素抵抗、黑棘皮病、视网膜色素变性、高脂血症、肝肾功能损伤的患者临床资料,并进行全外显子基因测序,结果显示,2例患者分别携带ALMS1基因c.2179dupT和c.10825C>T、c.2433... 详细信息

该文报道2例分别因"糖尿病"和"低钾血症"就诊,且均有糖尿病、胰岛素抵抗、黑棘皮病、视网膜色素变性、高脂血症、肝肾功能损伤的患者临床资料,并进行全外显子基因测序,结果显示,2例患者分别携带ALMS1基因c.2179dupT和c.10825C>T、c.2433dupA和c.11042dupT复合杂合突变,综合临床症状诊断为Alstrom综合征。目前已报道的84例中国Alstrom综合征患者主要临床症状为肥胖或超重、视力受损、听力受损、2型糖尿病等。该文中2例Alstrom综合征患者的c.2433dupA和c.11042dupT为新的致病突变位点,伴发低钾血症和胰腺炎并不常见,中国人ALMS1基因突变集中在第8和第16外显子上。

关键词：糖尿病,2型低钾血症 Alstrom综合征急性胰腺炎 ALMS1基因