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Genomic insights into the genetic basis of cotton breeding in China

Molecular Plant 2023年第4期16卷 662-677页

作者： Yiqian Li Zhanfeng Si Guoping Wang Zhuolin Shi Jinwen Chen guoan qi Shangkun Jin Zegang Han Wenhao Gao Yue Tian Yun Mao Lei Fang Yan Hu Hong Chen Xiefei Zhu Tianzhen Zhang zhejiang Provincial Key Laboratory of Crop Genetic Resources the Advanced Seed InstitutePlant Precision Breeding AcademyCollege of Agriculture and BiotechnologyZhejiang UniversityHangzhouChina Xinjang Production and Construction Corps Seventh Division Agricultural Research Institute KuintunChina state Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement Nanjing Agricutural UniversityNanjingChina College of Biotechnology Jiangsu University of Science and TechnologyZhenjiangChina Key Laboratory of China Northwestern Inland Region Ministry of AgricultureCotton Research InstituteXinjiang Academy of Agricultural and Reclamation ScienceShiheziChina

The excellent Upland cotton(Gossypium hirsutum)cultivars developed since 1949 have made a huge contribution to cotton production in China,the world's largest producer and consumer of cotton.However,the genetic and genomic basis for the improvements of these cotton cultivars remains largely unclear.In this study,we selected 16 Upland cotton cultivars with important historical status in Chinese cotton breeding and constructed a multiparent,advanced generation,intercross(MAGiC)population comprising 920 recombinant inbred lines.A genome-wide association study using the MAGIC population identified 54 genomic loci associated with lint yield and fiber quality.Of them,25(46.30%)pleiotropic genomic loci cause simultaneous changes of lint yield and/or fiber quality traits,revealing complex trade-offs and linkage drags in Upland cotton agronomic traits.Deep sequencing data of 11 introduced ancestor cultivars and publicly available resequencing datasets of 839 cultivars developed in China during the past 70 years were integrated to explore the historical distribution and origin of the elite or selected alleles.Interestingly,85%oftheseelitealleles were selectedandfixed fromdifferent Americanancestors,consistentwithcotton breeding practices in China.However,seven elite alleles of native origin that are responsible for Fusarium wilt resistance,early maturing,good-quality fiber,and other characteristics were not found in American an-cestors but have greatly contributed to Chinese cotton breeding and wide cultivation.Taken together,these results provide a genetic basis for further improving cotton cultivars and reveal that the genetic composition of Chinese cotton cultivars is narrow and mainly derived from early introduced American varieties.

关键词： cotton MAGiC population GWAS whole-genome sequencing pleiotropic loci breeding history

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Joint association analysis method to dissect complex genetic architecture of multiple genetically related traits

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The Crop Journal 2020年第5期8卷 733-744页

作者： Feng Lin guoan qi Ting Xu Xiangyang Lou Yongbo Hong Haiming Xu Institute of Crop Science College of Agriculture and BiotechnologyZhejiang UniversityHangzhou 310058ZhejiangChina Department of Mathematics Zhejiang UniversityHangzhou 310058ZhejiangChina Department of Biostatistics Colleges of PHHP and the College of MedicineUniversity of FloridaGainesvilleFL 32610USA State Key Laboratory of Rice Biology and Zhejiang Key Laboratory of Super Rice Research China National Rice Research InstituteHangzhou 311401ZhejiangChina

Genome-wide association study(GWAS)has been a standard approach to discover the genetic determinants underlying complex traits.It is a major challenge in GWAS how to improve analysis power,uncover complex genetic correlation,and reveal gene-gene and gene-environment interactions through integrated analysis of multiple genetically related traits.To combat these challenges,we proposed a mixed linear model-based joint association analysis method for multiple traits,which include epistasis and geneenvironment interaction in the mapping model and utilize within-trait variance and between-trait covariance simultaneously;A F-statistics based on Wilks statistics is used to test the significance of each SNP and paired interacted SNPs,each genetic effects of QTS are estimated and tested by the MCMC method based on a QTS full model.Simulations showed that the multi-trait GWAS method could provide increased power in detecting pleiotropic loci affecting more than one trait,and can unbiasedly estimate effects of QTS.To demonstrate the performance of the proposed method,we analyzed four blood lipid traits in Multi-Ethnic Study of Atherosclerosis(MESA)Cohort and two yield-related traits in a rice immortalized F2 dataset.A software package was developed for the proposed method.

关键词： traits analysis complex

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基于MRI数据在体孕期子宫颈三维模型的构建

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中华围产医学杂志 2024年第4期27卷 317-321页

作者：刘强张国安乞文旭中国医科大学附属盛京医院放射科沈阳110004 中国医科大学第七临床学院放射科抚顺113012

目的探讨基于孕期MRI检查的原始数据集采用阈值分割方式构建子宫颈数字化三维模型的方法及意义。方法本研究为前瞻性研究,共招募了2023年6至8月在中国医科大学附属盛京医院进行盆腔MRI检查的12例健康孕妇,包括6例孕中期、6例孕晚期,利... 详细信息

目的探讨基于孕期MRI检查的原始数据集采用阈值分割方式构建子宫颈数字化三维模型的方法及意义。方法本研究为前瞻性研究,共招募了2023年6至8月在中国医科大学附属盛京医院进行盆腔MRI检查的12例健康孕妇,包括6例孕中期、6例孕晚期,利用快速平衡稳态采集序列获得层厚为4 mm、层间距为0 mm的MRI原始数据集,将原始数据集导入Mimics软件中进行子宫颈数字化三维重建,同时测量并比较孕中期与孕晚期孕妇子宫颈长度、直径、前角和后角、内口面积、表面积及体积等各项参数。采用独立样本t检验和Mann-WhitneyU检验进行统计学分析。结果12例孕妇均成功重建孕期子宫颈的数字化三维模型,该模型可以多视角、多平面地观察子宫颈的整体形态和结构,并可对子宫颈进行三维测量。孕中期孕妇的子宫颈长度[(4.15±0.80)与(2.71±0.72)cm]、子宫颈体积[(42.58±9.24)与(28.44±10.18)cm3]和子宫颈长度与直径比值(1.06±0.21与0.72±0.19)明显大于孕晚期(t值分别为3.30、-2.52及-2.98,P值均0.05)。结论基于MRI数据利用阈值分割的三维重建方法可以构建在体孕期子宫颈数字化三维模型,模型能够立体呈现孕期子宫颈的形态学特征,显示不同孕周子宫颈的结构差异,为孕期子宫颈的孕期监测、形态学观察及定量研究提供了新的方法。

关键词：子宫颈磁共振成像数字化三维模型

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祝光礼应用膏方调治女性更年期高血压经验介绍

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新中医 2021年第9期53卷 209-211页

作者：齐国安祝光礼(指导) 杭州市萧山区中医院浙江杭州311201

从临证特色、施治及病案举例三方面介绍祝光礼教授治疗更年期高血压的临床经验。临证特色主要有从肝肾亏虚论治、从阴阳两虚论治、从气血亏虚论治,补虚为要,顾护脾胃。因需采用膏方治疗,在膏方制作时,注重基质及矫味药物的选择。

关键词：更年期高血压膏方补虚为要顾护脾胃祝光礼

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中学教师社会化过程:交互作用视角

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心理科学 2011年第1期34卷 145-150页

作者：马华维乐国安姚琦天津师范大学心理学系天津300387 南开大学社会心理学系天津300071

本研究以345名教师为研究对象,基于交互作用视角建立框架模型,研究教师社会化前因变量、社会化近端结果和终极结果之间的关系,以揭示教师社会化过程。结果表明:①教师社会化近端结果在组织策略和社会化终极结果之间起部分中介作用,在教... 详细信息

本研究以345名教师为研究对象,基于交互作用视角建立框架模型,研究教师社会化前因变量、社会化近端结果和终极结果之间的关系,以揭示教师社会化过程。结果表明:①教师社会化近端结果在组织策略和社会化终极结果之间起部分中介作用,在教师主动策略和社会化终极结果之间起完全中介作用;②同事帮带仅通过促进教师对学校的了解促进教师社会化终极结果;③家长配合一方面直接促进教师工作绩效,另一方面通过角色清晰对社会化终极结果产生积极影响。

关键词：教师社会化交互作用近端结果适应中学教师

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动物行为与福利学课程思政元素融入的实践与探索

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黑龙江动物繁殖 2024年第2期32卷 63-65页

作者：赵帅王雪张琦刘东宇崔卫国尹国安黑龙江八一农垦大学动物科技学院黑龙江大庆163319

动物行为与福利学是广大农林院校动物医学与动物科学专业的主干课程,但由于其基础教学内容主要来源于欧洲,我国引入之后,无论是结构体系、概念范畴还是理论观点大多是对国外动物行为与福利知识体系的简单套用。将思政元素融入本课程的教... 详细信息

动物行为与福利学是广大农林院校动物医学与动物科学专业的主干课程,但由于其基础教学内容主要来源于欧洲,我国引入之后,无论是结构体系、概念范畴还是理论观点大多是对国外动物行为与福利知识体系的简单套用。将思政元素融入本课程的教学,有利于加快其满足国内教学需要的进程。文章从国家高等教育政策的解读出发,结合思政元素、弘扬我国文化,树立民族自信、讲述我国科学家故事,提高学生科研自豪感、传递知农爱农意识,承担强农兴农使命四个方面探索本课程思政元素的融入,目的在于提高动物行为与福利学课程的教学效果,为引导学生树立正确的价值观提供实践路径。

关键词：畜牧学科课程思政动物行为与福利学实践与探索

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复方黄芪养心合剂对心室重构大鼠心肌细胞缝隙连接蛋白43分布与表达的影响

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中国中西医结合急救杂志 2016年第1期23卷 57-61页

作者：陈启兰祝光礼龚一萍任兴昌齐国安赫小龙杭州市中医院浙江杭州310007 浙江中医药大学浙江杭州310053 浙江省杭州市萧山区中医院浙江杭州311201

目的观察复方黄芪养心合剂对冠状动脉（冠脉）结扎术后心室重构（vR）大鼠心肌缝隙连接蛋白43（Cx43）分布改变和表达的影响。方法73只健康雄性清洁级SD大鼠，随机取8只作为假手术组，其余65只大鼠行冠脉左前降支（LAD）结扎术，术后观... 详细信息

目的观察复方黄芪养心合剂对冠状动脉（冠脉）结扎术后心室重构（vR）大鼠心肌缝隙连接蛋白43（Cx43）分布改变和表达的影响。方法73只健康雄性清洁级SD大鼠，随机取8只作为假手术组，其余65只大鼠行冠脉左前降支（LAD）结扎术，术后观察10d。存活的49只大鼠按随机数字表法分为复方黄芪养心合剂高、中、低剂量组和琥珀酸美托洛尔组，每组10只，VR模型组9只。复方黄芪养心合剂高、中、低剂量组分别按14．0、7．0、3．5mL-1·kg-1·d-1。灌胃复方黄芪养合剂（黄芪20g、党参20g、太子参20g、苦参20g、丹参20g、甘松20g、炙甘草10g、生山楂15g）；琥珀酸美托洛尔组按7．0mL-1·kg-1·d-1。灌胃琥珀酸美托洛尔；VR模型组和假手术组均灌胃蒸馏水7．0mL-1·kg-1·d-1。连用8周后，取大鼠心脏组织，用免疫组化法（IHC）观察心肌Cx43分布的改变，用蛋白质免疫印迹试验（WesternBlot）检测心肌Cx43蛋白的表达。结果显微镜下可见，假手术组心肌Cx43呈棕黄色颗粒状表达；VR模型组较假手术组有所减少；琥珀酸美托洛尔组表达较假手术组减少不明显，但较VR模型组增多；复方黄芪养心合剂高、中、低剂量组表达较vR模型组有所增加，与琥珀酸美托洛尔组相近。WesternBlot结果显示：与假手术组比较，vR模型组心肌Cx43蛋白表达明显减少[（309．25±56．72）％比（597．67±78．25）％]；琥珀酸美托洛尔组和复方黄芪养心合剂高、中、低剂量组则较VR模型组明显增加[（466．81±99．29）％、（446．61±68．25）％、（455．20±81．58）％、（528．87±57．69）％比（309．25±56．72）％，P〈0．05或P〈0．01]；高、中、低剂量复方黄芪养心合剂组之间及与琥珀酸美托洛尔组比较差异均无统计学意义（均P〉0．05）。结论复方黄芪养心合剂能够改善冠脉结扎术后VR大鼠心肌细胞Cx43的分布变化与表达减少，作用与琥珀酸美托洛尔相近，但其作用无剂量依赖性。

关键词：复方黄芪养心合剂美托洛尔心室重构心律失常缝隙连接蛋白43

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镉污染农田安全利用技术研究进展

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现代农业科技 2024年第9期 128-131页

作者：陈国安宋肖琴金成舟胡洪法肖林林李齐义乌市农技推广服务中心浙江义乌322000 浙江农林大学浙江杭州311300

镉是农田土壤污染较为突出的重金属元素之一,具有较高的毒性、移动性和生物有效性,对农产品安全生产造成严重影响。镉的生物有效性决定了植物根部对镉的吸收。土壤镉生物有效性调控技术成为近年来农业资源利用领域的研究热点。本文综合... 详细信息

镉是农田土壤污染较为突出的重金属元素之一,具有较高的毒性、移动性和生物有效性,对农产品安全生产造成严重影响。镉的生物有效性决定了植物根部对镉的吸收。土壤镉生物有效性调控技术成为近年来农业资源利用领域的研究热点。本文综合评述了镉污染农田安全利用技术,包括原位钝化技术、叶面阻控技术以及农艺调控技术,针对各种修复技术的特点,提出了镉污染农田土壤修复技术的研究和发展方向,以期为镉污染农田安全利用技术的研究提供参考。

关键词：镉安全利用修复农田土壤

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黄芪失笑散对急性心肌梗死大鼠Fas、FasL表达的影响

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河南中医 2012年第2期32卷 159-161页

作者：赫小龙祝光礼陈铁龙齐国安浙江中医药大学浙江杭州310007 杭州市中医院浙江杭州310006

目的:观察不同剂量黄芪失笑散对急性心肌梗死大鼠梗死边缘区细胞凋亡及Fas、FasL蛋白表达的影响。方法:取雄性SD大鼠60只,随机分为黄芪失笑散高剂量组、黄芪失笑散中剂量组、黄芪失笑散低剂量组、模型组和对照组。连续灌胃7d后,结扎冠... 详细信息

目的:观察不同剂量黄芪失笑散对急性心肌梗死大鼠梗死边缘区细胞凋亡及Fas、FasL蛋白表达的影响。方法:取雄性SD大鼠60只,随机分为黄芪失笑散高剂量组、黄芪失笑散中剂量组、黄芪失笑散低剂量组、模型组和对照组。连续灌胃7d后,结扎冠状动脉左前降支造成急性心肌梗死模型,对照组不结扎。手术后4.5h留取心脏标本,采用原位末端标记染色法(TUNEL)检测细胞凋亡指数,采用Western blot法检测Fas、FasL蛋白表达量。结果:与对照组比较,黄芪失笑散各组可明显降低心肌细胞凋亡指数和Fas、FasL的蛋白表达量(P0.05),且黄芪失笑散大剂量组效果最好。结论:黄芪失笑散能够保护急性心肌梗死大鼠的缺血心肌,其作用机制可能与降低梗死边缘区Fas、FasL蛋白表达水平从而抑制心肌细胞凋亡有关。

关键词：黄芪失笑散急性心肌梗死凋亡指数 Fas FasL 大鼠

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腹腔镜肝门部胆管癌根治术8例临床体会

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肝胆胰外科杂志 2024年第5期36卷 276-281页

作者：张素芳徐建波洪晟乾李国安严雨楼祁付珍南京医科大学附属淮安第一医院肝胆胰外科江苏淮安223300

目的探讨腹腔镜肝门部胆管癌根治术的可行性。方法回顾性分析2019年6月至2023年11月7例以及2024年1月1例于南京医科大学附属淮安第一医院行腹腔镜肝门部胆管癌根治术的共8例患者的临床资料,分析患者临床资料、手术情况及术后恢复情况。... 详细信息

目的探讨腹腔镜肝门部胆管癌根治术的可行性。方法回顾性分析2019年6月至2023年11月7例以及2024年1月1例于南京医科大学附属淮安第一医院行腹腔镜肝门部胆管癌根治术的共8例患者的临床资料,分析患者临床资料、手术情况及术后恢复情况。结果8例行腹腔镜肝门部胆管癌根治术的患者中,2例术前行经皮经肝胆管穿刺引流(PTCD)减轻黄疸,复查肝功能提示总胆红素降至80μmol/L以内后手术。Bismuth分型:Ⅰ型2例,Ⅱ型3例,Ⅲa型1例,Ⅲb型2例。手术方式:5例行腹腔镜肝门部肿瘤切除术,2例行腹腔镜肝门部肿瘤+左半肝+尾状叶切除术,1例行腹腔镜肝门部肿瘤+右半肝+尾状叶切除术。中位手术时间375(270~720)min,中位出血量350(200~800)mL,中位淋巴结清扫数7(3~11)个,R0切除率100%。术后8例患者平均引流管留置时间(11.0±2.5)d,平均镇痛时间(4.0±0.8)d,平均禁食时间(2.7±1.0)d,中位住院时间17(15~25)d,平均住院费用(7.8±2.2)万元。3例出现围手术期并发症,1例腹腔感染,1例A级胆瘘,1例上消化道出血,均经保守治疗后病情稳定,顺利出院。随访至2024年3月,中位随访时间16(2~48)个月。6例患者存活,2例因术后复发死亡,患者中位生存时间34个月。结论本临床中心的初步研究表明,通过精准的术前评估,腹腔镜肝门部胆管癌根治术是安全可行的。

关键词：肝门部胆管癌腹腔镜手术三维成像根治性切除生存时间

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