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柑橘锈螨为害‘沃柑’果皮的结构变化和挥发油成分分析

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中国果树 2021年第3期 43-50页

作者：田帅谭梦超韦维杨娟刘慧勤黄桂香王国全植物科学国家级实验教学示范中心广西大学农学院南宁530005 南宁师范大学地理与海洋研究院广西壮族自治区林业科学研究院广西大学轻工与食品工程学院

柑橘锈螨广泛分布于世界各大柑橘产区,为害柑橘果实后形成黑皮果。以‘沃柑’正常果和锈螨为害果为试验材料,采用扫描电镜、顶空固相微萃取-气质联用等技术分析2种试验材料在微观结构和挥发油成分方面的差异。结果表明:柑橘锈螨为害‘... 详细信息

柑橘锈螨广泛分布于世界各大柑橘产区,为害柑橘果实后形成黑皮果。以‘沃柑’正常果和锈螨为害果为试验材料,采用扫描电镜、顶空固相微萃取-气质联用等技术分析2种试验材料在微观结构和挥发油成分方面的差异。结果表明:柑橘锈螨为害‘沃柑’果皮引起表皮出现龟裂,果皮微观结构被破坏。‘沃柑’正常果皮共检测出75种成分,包括萜烯烃类(65.89%)、醇类(6.94%)、酯类(3.59%)、醛类(2.89%)、烷烃类(1.02%)、酸类(0.40%)、酮类(0.58%)、酚类(0.29%),分别有20、19、15、8、4、3、3、3种成分;柑橘锈螨为害果共检测出79种成分,其中萜烯烃类(59.86%)、酯类(4.04%)、醇类(3.59%)、醛类(2.61%)、烷烃类(1.58%)、酸类(0.76%)、酮类(0.33%)、醚类(0.07%)、酚类(0.03%)分别有18、21、18、8、2、1、7、3、1种成分,2种试验材料的挥发油成分在种类及含量上存在差异。表明柑橘锈螨为害造成柑橘果皮结构和成分差异,可为研究柑橘果实抗黑皮果机理提供理论参考。

关键词：柑橘锈螨扫描电镜 GC-MS 挥发油成分

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甜橙无核品系“春蜜”遗传背景分析

中国南方果树 2019年第3期48卷 21-26页

作者：周彩霞黄桂香潘贞珍胡艺帆苏美玲何新华广西大学农学院园艺系南宁530005

甜橙无核品系"春蜜"(暂定名)发现于"春橙1号"果园,为探明"春蜜"的遗传背景,以"春蜜"和其他41份甜橙种质为试材,开展了叶片形态标记和SCoT分子标记研究。结果表明,在供试甜橙种质群体中,变异系数最大的叶片数量性状是叶质量、翼叶长和翼... 详细信息

甜橙无核品系"春蜜"(暂定名)发现于"春橙1号"果园,为探明"春蜜"的遗传背景,以"春蜜"和其他41份甜橙种质为试材,开展了叶片形态标记和SCoT分子标记研究。结果表明,在供试甜橙种质群体中,变异系数最大的叶片数量性状是叶质量、翼叶长和翼叶宽。叶身形、叶尖形、叶柄长、叶形指数、叶缘和叶基形相互之间有极强的相关性,叶尖缺刻有无、叶质量、叶厚、翼叶长和翼叶宽相互之间有极强的相关性,是适合用于甜橙的叶片形态标记指标。42份种质采用优选的扩增条带清晰、多态性高的15条引物进行SCoT-PCR,共扩增出95条带,多态性条带有62条,多态性比率为65.26%。基于叶片形态标记的和ScoT分子标记的聚类结果均显示"春蜜"与"春橙1号"有最近的亲缘关系,结合"春蜜"的来源和选育过程,初步判定"春蜜"是"春橙1号"的无核优质芽变。

关键词：甜橙春蜜无核变异叶片性状 SCoT标记亲缘关系

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扁柑种质资源亲缘关系的ISSR分析

热带作物学报 2011年第3期32卷 443-446页

作者：郭丽英黄桂香何新华张树伟李峰陈虎广西大学农学院广西南宁530004

为了准确了解广西扁柑资源现状、类型、分类地位及亲缘关系,从而更好地开发利用,本试验对35份柑橘资源,其中包括21份广西扁柑资源、2份越南柑资源及12份近缘的其它柑橘属资源进行ISSR-PCR分析。结果显示:10条引物共扩增出134条DNA片段,... 详细信息

为了准确了解广西扁柑资源现状、类型、分类地位及亲缘关系,从而更好地开发利用,本试验对35份柑橘资源,其中包括21份广西扁柑资源、2份越南柑资源及12份近缘的其它柑橘属资源进行ISSR-PCR分析。结果显示:10条引物共扩增出134条DNA片段,其中108条具有多态性,比率为81%。用UPGMA软件进行聚类分析,35份柑橘资源的遗传系数在0.64～1.00之间,在遗传系数为0.80处将35份材料划分为5类,其中所有扁柑类资源均和椪柑、南丰蜜桔聚在一类,初步证明扁柑类资源的分类地位应属于宽皮柑橘类的桔类。各扁柑资源间的相似系数在0.90以上,亲缘关系较近。

关键词：扁柑种质资源 ISSR 聚类分析

TLR4和NGAL以及uKIM-1在脓毒症患者并发急性肾损伤中的诊断价值

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临床急诊杂志 2024年第8期25卷 433-438页

作者：谢静雯黄贵祥尹彬杨红丽简阳市人民医院急救医学部四川简阳641400 四川省人民医院急诊科

目的:分析Toll样受体4(toll like receptor 4,TLR4)、中性粒细胞明胶酶相关脂质运载蛋白(neutrophil gelatinase-associated lipocalin,NGAL)、尿液肾损伤分子-1(urinary kidney injury molecules-1,uKIM-1)在脓毒症患者并发急性肾损伤(acute kidney injury,AKI)中的诊断价值。方法:选取简阳市人民医院2020年10月—2023年2月收治的脓毒症患者181例。根据是否发生AKI分为AKI组83例(AKIⅠ期30例、AKIⅡ期38例、AKIⅢ期15例)、非AKI组98例。比较AKI组、非AKI组的TLR4、NGAL、uKIM-1水平。采用单因素、多因素logistic回归分析影响脓毒症患者并发AKI的危险因素。对比不同AKI分期的血肌酐(serum creatinine,Scr)、肾小球滤过率(eGFR)、降钙素原、尿量、SOFA评分、TLR4、NGAL、uKIM-1水平。采用Pearson分析TLR4、NGAL、uKIM-1水平与Scr、eGFR、降钙素原、尿量、SOFA评分的相关性。绘制ROC曲线分析TLR4、NGAL、uKIM-1单一及联合检测脓毒症患者并发AKI的诊断价值。结果:AKI组TLR4、NGAL、uKIM1、降钙素原水平及SOFA评分高于非AKI组,尿量低于非AKI组,差异有统计学意义(P0.05)。logistic回归结果显示:降钙素原、尿量、TLR4、NGAL、uKIM-1水平上升是影响脓毒症患者并发AKI的危险因素(P0.05);AKIⅢ期降钙素原、尿量、SOFA评分、TLR4、NGAL、uKIM-1水平均高于AKIⅠ期、AKIⅡ期,AKIⅡ期降钙素原、尿量、SOFA评分、TLR4、NGAL、uKIM-1水平高于AKIⅠ期,差异有统计学意义(P0.05)。TLR4、NGAL、uKIM-1水平分别与降钙素原、SOFA评分呈正相关,与尿量呈负相关(P<0.05)。TLR4、NGAL、uKIM-1联合检测脓毒症患者并发AKI的灵敏度、特异度、AUC(95%CI)分别为0.783、0.969、0.900(0.849~0.950)。结论:脓毒症患者并发AKI存在TLR4、NGAL、uKIM-1水平升高,三者对于判定AKI发生及病情发展具有重要意义,且三者联合检测脓毒症患者并发AKI诊断价值更高。

关键词： Toll样受体4 中性粒细胞明胶酶相关脂质运载蛋白尿液肾损伤分子-1 脓毒症急性肾损伤诊断价值

应用磁共振波谱代谢组学和基因本体论建立食管癌患者病理分期预测模型的研究

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中华外科杂志 2016年第7期54卷 540-545页

作者：陈星王凯陈伟江华邓鹏翅李子建彭谨周志远杨浩黄贵祥曾俊四川省医学科学院四川省人民医院创伤代谢组多学科实验室成都610101 中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院肠外与肠内营养科四川大学分析测试中心

目的结合代谢组和计算生物学技术，探索食管癌代谢表型与病理分型的关系，发现食管癌患者代谢网络扰动机制，建立可用于术前快速对肿瘤进行精准分期的方法。方法前瞻性队列研究设计，研究起止时间为2013年4月至2016年1月。纳入2013年5月... 详细信息

目的结合代谢组和计算生物学技术，探索食管癌代谢表型与病理分型的关系，发现食管癌患者代谢网络扰动机制，建立可用于术前快速对肿瘤进行精准分期的方法。方法前瞻性队列研究设计，研究起止时间为2013年4月至2016年1月。纳入2013年5月至2014年4月在四川省人民医院确诊食管癌拟行手术患者，收集血清标本进行磁共振波谱代谢组学检测，绘制不同分期患者的血浆代谢指纹图谱。采用主成分分析、偏最小二乘法和支持向量机进行数据处理，并基于基因本体论（GO）方法建立代谢型-酶学网络-GO通路回溯分析技术探索调控食管癌代谢网络异常的酶-基因网络调节机制，最终建立食管癌分期定量预测模型。所有数据处理过程均在高性能计算平台上使用MatLab完成。计量资料的组间比较采用Wilcoxon秩和检验（非正态分布）或方差分析（正态分布）。计数资料采用）（2检验或Fisher确切概率法。结果纳入不同TNM分期食管癌患者20例，不同分期患者组间年龄无差异（F=1．086，P〉0．05），体重指数无差异（F=1．035，P〉0．05），肿瘤距门齿距离无差异（F=1．078，P〉0．05），其血浆磁共振波谱指纹图谱可特征性区分不同肿瘤分期。在不同TNM分期的患者中，其血浆代谢池中存在明显的代谢物差异：与ⅡB、ⅢA、Ⅳ期患者相比，ⅠB、ⅡA期患者血清中丁酮、乙醇胺、同型半胱氨酸、羟基丙酸、雌三醇浓度升高，而糖蛋白、肌酸、胆碱、异丁酸、丙氨酸、亮氨酸、缬氨酸水平降低。经过计算，最终筛选出4个代谢标志物：乙醇胺、羟基丙酸、同型半胱氨酸、雌三醇。GO分析表明，调控这4个关键代谢标志物的是54对酶和基因。以此为基础建立了基于磁共振波谱的食管癌TNM分期定量预测模型，交叉验证结果表明，该预测模型的均方根误为5．3，R^2=0．47（P=0．036），预测效果良好。结论基于代谢组学和酶一基因调节网络分析的系统生物医学方法能定量描绘中晚期食管癌患者代谢网络的扰动，且通过血浆磁共振波谱检验，能成功进行术前快速的食管癌患者临床分期。

关键词：食管肿瘤代谢组学外科学计算生物学代谢网络和途径基因本体论肿瘤分期

Optimal transient growth in turbulent pipe flow

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Applied Mathematics and Mechanics(English Edition) 2015年第8期36卷 1057-1072页

作者： Yang SONG Chunxiao XU Weixi huang guixiang CUI Key Laboratory of Applied Mechanics Department of Engineering MechanicsTsinghua University

The optimal transient growth process of perturbations driven by the pressure gradient is studied in a turbulent pipe flow. A new computational method is proposed, based on the projection operators which project the governing equations onto the sub- space spanned by the radial vorticity and radial velocity. The method is validated by comparing with the previous studies. Two peaks of the maximum transient growth am- plification curve are found at different Reynolds numbers ranging from 20 000 to 250 000. The optimal flow structures are obtained and compared with the experiments and DNS results. The location of the outer peak is at the azimuthal wave number n = 1, while the location of the inner peak is varying with the Reynolds number. It is observed that the velocity streaks in the buffer layer with a spacing of 100δv are the most amplified flow structures. Finally, we consider the optimal transient growth time and its dependence on the azimuthal wave length. It shows a self-similar behavior for perturbations of different scales in the optimal transient growth process.

关键词： turbulent pipe flow optimal transient growth coherent structure

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番荔枝花粉形态和授粉亲和性观察研究

中国南方果树 2016年第4期45卷 18-22页

作者：郑颖颖黄桂香潘介春李菊馨秦霞吴琳裴艳艳广西大学农学院园艺系南宁530000

以广西大学果树育种基地的番荔枝为试材,对非洲骄傲和凤梨释迦的花粉进行电镜扫描;自交和正反交授粉,调查着果率,荧光显微压片观察花粉萌发及生长动态。结果表明,非洲骄傲和凤梨释迦的花粉均为辐射对称型,外壁均为穴状纹孔,形状较为相似... 详细信息

以广西大学果树育种基地的番荔枝为试材,对非洲骄傲和凤梨释迦的花粉进行电镜扫描;自交和正反交授粉,调查着果率,荧光显微压片观察花粉萌发及生长动态。结果表明,非洲骄傲和凤梨释迦的花粉均为辐射对称型,外壁均为穴状纹孔,形状较为相似;赤道面观近椭圆形,极面观近圆形。两个番荔枝品种自交和杂交后花粉在柱头上都能萌发,但品种间存在萌发速度的差异。授粉后1h,花粉管都开始萌发,但数量有差异,凤梨释迦自交和杂交已经大量萌发,而非洲骄傲自交和杂交的则在14h才大量萌发。授粉24h,4个处理的花粉管均进入子房。凤梨释迦处理在48h后达到胚囊。这两个番荔枝品种的花粉形态相似,自交和杂交均有较好的亲和性。

关键词：番荔枝花粉形态授粉亲和性荧光显微观察

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香水柠檬RHF2A的克隆与互作蛋白的筛选

中国农业科学 2022年第24期55卷 4912-4926页

作者：李雨泽朱嘉伟林蔚蓝茉莹夏黎明张艺粒罗聪黄桂香何新华广西大学农学院/亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室/植物科学国家级实验教学示范中心福建省农业科学院亚热带农业研究所

【目的】以香水柠檬（Citrus limon (L.) Burm. F.）为研究对象，分析两个RHF2A的时空表达规律，利用酵母双杂交技术和双分子荧光互补试验（BiFC）筛选、验证其互作蛋白，为深入研究RHF2A在香水柠檬自交不亲和过程中的分子作用机制奠定... 详细信息

【目的】以香水柠檬（Citrus limon (L.) Burm. F.）为研究对象，分析两个RHF2A的时空表达规律，利用酵母双杂交技术和双分子荧光互补试验（BiFC）筛选、验证其互作蛋白，为深入研究RHF2A在香水柠檬自交不亲和过程中的分子作用机制奠定基础。【方法】从前期转录组和泛素修饰组（未公开）筛选获得2个E3泛素连接酶RHF2A(RING-H2 Zinc Finger2A)基因RHF2A-1、RHF2A-2，并克隆其全长序列，通过生物信息学分析2个RHF2A的序列和蛋白质结构，预测其启动子顺式作用元件，构建35S-RHF2A-GFP融合蛋白表达载体用于亚细胞定位分析，采用实时荧光定量PCR分析两个RHF2A的时空表达模式，构建酵母双杂诱饵载体从香水柠檬酵母文库筛选互作蛋白。构建BiFC载体，在洋葱活体细胞内对目标蛋白进行互作验证。【结果】从香水柠檬克隆获得RHF2A-1、RHF2A-2,ORF全长分别为1 161和1 134 bp;NCBI结构域预测发现其具有Ring/U-box结构域。启动子分析发现其具有花粉特异性表达相关元件POLLEN1LELAT52、GTGANTG10。组织表达分析发现RHF2A-1在花粉特异性表达，RHF2A-2在叶中特异性表达；时空表达分析结果显示，RHF2A-1在自交柱头表达量从第1天开始升高，第3天达到峰值，是杂交柱头表达量的5倍以上。亚细胞定位显示RHF2A-1和RHF2A-2定位在细胞核。经过Uniprot网站预测其互作蛋白显示RHF2A能与KRP6、AT3G57370、UBA1、FBL17、SK11蛋白相互作用，推测其参与自交不亲和泛素化反应途径、配子体发育调控、花粉的生长发育等生物学过程。通过酵母双杂交技术筛选出72个克隆，对其测序并进行Blast比对后排除重复克隆，最终得到ABCF3等20个候选互作蛋白。经过一对一互作验证、双分子荧光互补实验确定RHF2A-1与ABCF3-2存在互作关系。【结论】RHF2A-1的时空表达规律与自交不亲和过程中花粉在雌蕊上的萌发规律相吻合；筛选得到柠檬授粉过程中直接影响花粉生长发育的互作候选蛋白，初步证明RHF2A-1在自交不亲和过程中具有重要作用。

关键词：香水柠檬 RHF2A 基因克隆时空表达酵母双杂交技术

Coherent structures in wall turbulence and mechanism for drag reduction control

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Science China(Physics,Mechanics & Astronomy) 2013年第6期56卷 1053-1061页

作者： XU ChunXiao DENG BingQing huang WeiXi CUI guixiang Department of Engineering Mechanics Tsinghua University

Herein is introduced the mechanism for active control influencing the generation of the near-wall streamwise vortices,which are closely related to the production of high skin friction in wall-bounded turbulent flows.A new opposition control scheme with adjusting control amplitude is proposed and evaluated in turbulent channel flow by direct numerical *** maximum drag reduction rate can be greatly enhanced by the strengthened *** the effectiveness of the control to the coherent structures at high Reynolds numbers is investigated by using a linear transient growth model.

关键词： wall turbulence coherent structure drag reduction active control