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Large‑scale transcriptomic and genomic analyses reveal a novel functional gene SERPINB6 for chicken carcass traits

Journal of Animal Science and Biotechnology 2024年第4期15卷 1466-1481页

作者： Di zhao Ranran Liu Xiaodong Tan Huimin Kang Jie Wang Zheng Ma Haiquan zhao Hai Xiang Zhengfen Zhang Hua Li guiping zhao Guangdong Provincial Key Laboratory of Animal Molecular Design and Precise Breeding School of Life Science and EngineeringFoshan UniversityFoshanChina State Key Laboratory of Animal Biotech Breeding Institute of Animal SciencesChinese Academy of Agricultural SciencesBeijingChina Guangdong Tinoo’s Foods Group Co. Ltd.QingyuanChina

Background Carcass traits are crucial indicators of meat production ***,the molecular regulatory mechanisms associated with these traits remain *** In this study,we conducted comprehensive transcriptomic and genomic analyses on 399 Tiannong partridge chickens to identify key genes and variants associated with carcass traits and to elucidate the underlying regulatory *** on association analyses with the elastic net(EN)model,we identified 12 candidate genes(AMY1A,AP3B2,CEBPG,EEF2,EIF4EBP1,FGFR1,FOXD3,GOLM1,LOC107052698,PABPC1,SERPINB6 and TBC1D16)for 4 carcass-related traits,namely live weight,dressed weight,eviscerated weight,and breast muscle ***6 was identified as the only overlapping gene by 3 analyses,EN model analysis,weighted gene co-expression network analysis and differential expression ***-level experiments confirmed that SERPINB6 promotes the proliferation of chicken DF1 cells and primary *** expression genome-wide association study and association analysis indicated that rs317934171 is the critical site that enhances SERPINB6 ***,a dual-luciferase reporter assay proved that gga-miR-1615 targets the 3′UTR of *** Collectively,our findings reveal that SERPINB6 serves as a novel gene for chicken carcass traits by promoting fibroblast and myoblast ***,the downstream variant rs317934171 regulates SERPINB6 *** results identify a new target gene and molecular marker for the molecular mechanisms of chicken carcass traits.

关键词： Carcass traits Chicken Genome SERPINB6 Transcriptome

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Transcriptome analysis reveals steroid hormones biosynthesis pathway involved in abdominal fat deposition in broilers

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Journal of Integrative Agriculture 2024年第9期 3118-3128页

作者： Yuting Zhu Yongli Wang Yidong Wang guiping zhao Jie Wen Huanxian Cui State Key Laboratory of Animal Nutrition/Key Laboratory of Animal (Poultry) Genetics Breeding and Reproduction Ministry of Agriculture and Rural Affairs/Institute of Animal SciencesChinese Academy of Agricultural Sciences

Excessive abdominal fat deposition reduces the feed efficiency and increase the cost of production in broilers. Therefore, it is an important task for poultry breeders to breed broilers with low abdominal fat. Abdominal fat deposition is a highly complex biological process, and its molecular basis remains elusive. In this study, we performed transcriptome analysis to compare gene expression profiles at different stages of abdominal fat deposition to identify the key genes and pathways involved in abdominal fat accumulation. We found that abdominal fat weight(AFW) increased gradually from day 35(D35) to 91(D91), and then decreased at day 119(D119). Accordingly, after detecting differentially expressed genes(DEGs) by comparing gene expression profiles at D35 vs. D63 and D35 vs. D91, and identifying gene modules associated with fat deposition by weighted gene co-expression network analysis(WGCNA), we performed intersection analysis of the detected DEGs and WGCNA gene modules and identified 394 and 435 intersecting genes, respectively. The results of the Gene Ontology(GO) functional enrichment analysis and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG) pathway enrichment analyses showed that the steroid hormone biosynthesis and insulin signaling pathways were co-enriched in all intersecting genes, steroid hormones have been shown that regulated insulin signaling pathway, indicating the importance of the steroid hormone biosynthesis pathway in the development of broiler abdominal fat. We then identified 6 hub genes(ACTB, SOX9, RHOBTB2, PDLIM3, NEDD9, and DOCK4) related to abdominal fat deposition. Further analysis also revealed that there were direct interactions between 6 hub genes. SOX9 has been shown to bind to proteins required for steroid hormone receptor binding, and RHOBTB2 indirectly regulates the steroid hormones biosynthesis through cyclin factor, and ultimately affect fat deposition. Our results suggest that the genes RHOBTB2 and SOX9 play an important role in

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Metabolomic reveals the inhibition mechanism of proline on hexanal production in chicken meat

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Food Science and Human Wellness 2024年

作者： Huanxian Cui Yuxi Jin Yanke Wang Xiaoya Yuan Li Liu Jie Wen guiping zhao State Key Laboratory of Animal Nutrition Institute of Animal Science Chinese Academy of Agricultural Sciences

Hexanal contributes significantly to meat flavor. The aim of this study was to identify the metabolic pathways of hexanal formation in chicken meat. We found 32 metabolites associated with hexanal content in chicken meat， mainly including fatty acids (linoleic acid， etc.， positive correlation) and some amino acids (L-proline， etc.， negative correlation). A comparative analysis of the expression of these 32 metabolites between two groups of chickens with high- and low hexanal content revealed that L-proline and phenylacetaldehyde were downregulated， while ADP-ribose and 4-methylphenol were upregulated in the high-hexanal content chickens. It was also found that the increase of ADP-ribose induced the conversion of L-proline to other amino acids， such as arginine， through a process likely involving the pyrimidine metabolism pathway， leading to a reduction in proline content， which in turn abolished the inhibitory effect of proline on hexanal and enhanced the formation of hexanal. These findings confirm the effect of linoleic acid on hexanal content， and also reveal a negative regulatory effect of proline on the production of hexanal and its elimination mechanism in chicken meat.

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增强地热系统停止运行后温度恢复过程的数值模拟

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中国科学院大学学报（中英文） 2024年第2期41卷 222-230页

作者：刘汉青胡才博赵桂萍中国科学院大学地球与行星科学学院、中国科学院计算地球动力学重点实验室北京100049

在增强地热系统(EGS)运行过程中,干热岩(HDR)人工储层的温度会迅速下降,外界的热量补充速度远远跟不上系统热量提取的速度,同时也会对人工储层的流体压力产生巨大的影响,EGS停止运行以后人工储层温度和压力场会逐渐的恢复到初始状态。... 详细信息

在增强地热系统(EGS)运行过程中,干热岩(HDR)人工储层的温度会迅速下降,外界的热量补充速度远远跟不上系统热量提取的速度,同时也会对人工储层的流体压力产生巨大的影响,EGS停止运行以后人工储层温度和压力场会逐渐的恢复到初始状态。前人对干热岩开采过程中的温度场和流体压力场变化做了大量研究,但很少关注停止开采以后人工储层的温度恢复过程和流体压力场变化,而停止开采以后的温度场恢复过程对于新的地热井选址和废弃地热井的重新利用具有重要意义。利用数值模拟软件COMSOL Multiphysics建立双井EGS运行过程和停止运行之后两个阶段的二维热-孔隙流体耦合数值模型,模型考虑了放射性生热的贡献和不同热导率的影响。研究表明:在EGS运行期间,热对流是热量交换的主要方式,人工储层温度下降过程很快,19 a后EGS已经到达运行寿命,68 a后HDR人工储层已经失去开采价值。而地热开采停止以后,人工储层温度的自然恢复过程长达万年,热传导是主要的热量传递和温度恢复方式,热导率越高,人工储层温度恢复越快。

关键词：干热岩温度恢复热传导热导率

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全基因关联分析筛选文昌鸡体尺性状相关分子标记

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中国农业科学 2024年第10期57卷 2046-2060页

作者：骆娜安炳星魏立民文杰赵桂苹海南省农业科学院三亚研究院(海南省实验动物研究中心) 海南省农业科学院畜牧兽医研究所中国农业科学院北京畜牧兽医研究所/动物营养学国家重点实验室

【目的】体尺是评价禽类生长特性的主要指标，通过筛选与文昌鸡体尺性状相关的分子标记及候选基因，为解析体尺性状的遗传机制及分子育种提供理论支撑。【方法】利用海南省文昌鸡品系3个世代（n=2 024）群体作为研究对象，测定每只鸡在... 详细信息

【目的】体尺是评价禽类生长特性的主要指标，通过筛选与文昌鸡体尺性状相关的分子标记及候选基因，为解析体尺性状的遗传机制及分子育种提供理论支撑。【方法】利用海南省文昌鸡品系3个世代（n=2 024）群体作为研究对象，测定每只鸡在上市日龄的胫长、胫围、体斜长、龙骨长及胸宽等5个体尺性状。采集血液进行鸡“京芯一号”55 K芯片测序及基因分型，使用GEMMA软件与PLINK软件进行全基因组关联分析，鉴定与体尺性状相关的SNP位点和候选基因，通过LD分析鉴定与体尺性状显著相关的单倍型。【结果】表型结果显示，113日龄文昌鸡公鸡平均胫长8.64 cm，胫围0.46 cm，体斜长19.73 cm，龙骨长12.32 cm，胸宽6.81 cm；母鸡平均胫长6.98 cm，胫围0.40 cm，体斜长17.79 cm，龙骨长10.45 cm，胸宽6.24 cm。经过质控后，共保留42 206个SNPs和2 024个个体用于后续研究。使用Plink软件进行PCA主成分分析，结果发现3个世代群体存在一定的分散情况，因此在GWAS关联分析中加入了前3个主成分作为协变量，以校正群体结构对关联分析的影响。GWAS结果研究共鉴定出19个SNPs位点与胫长性状显著或建议性显著相关（P值分别为2.17789E-06和4.35578E-05）,23个SNPs位点与胫围性状显著或建议性显著相关，7个SNPs位点与体斜长性状显著或建议性显著相关，2个SNPs位点与龙骨长性状显著或建议性显著相关，未鉴定出与胸宽性状或建议性显著相关的SNPs位点。通过对显著性位点进行注释，结果共鉴定到16个体尺性状相关的候选基因，包括羧基末端LIM结构域结合蛋白2(LIM domain binding 2,LDB2)、染色体缩合蛋白G(non-SMC condensin I complex subunit G,NCAPG)、序列相似家族184成员B基因（family with sequence similarity 184 member B,FAM184B）、A型钾离子通道调节蛋白4(potassium voltage-gated channel interacting protein 4,KCNIP4)等。通过LD单倍型分析结果显示，GGA4存在3个显著关联的单倍型，对于胫长性状，rs316943436和rs313978573两个位点位于单倍型区块中；对于胫围性状，rs313196946AA、rs316242963、rs315796839、rs313978573、rs734365522共5个位点位于单倍型区块中；对于体斜长性状，只有1个位点（rs313978573）位于单倍型区块中，其中候选基因LDB2和NCAPG在显著的block区块中被注释到。【结论】经GWAS方法筛选出SEPSECS、LGI2、DHX15、KCNIP4、NCAPG、FAM184B、LDB2、CC2D2A作为胫长性状潜在的候选基因；FH、TBC1D1、DTHD1、SEPSECS、LGI2、SOD3、PPARGC1A、KCNIP4、NCAPG、FAM184B、CLRN2、LDB2、TAPT1、CC2D2A作为胫围性状潜在的候选基因，KCNIP4、LDB2、TAPT1、NRXN3作为体斜长性状潜在的候选基因，FAM184B作为龙骨长性状潜在的候选基因。总之，本文确定了LDB2、NCAPG和FAM184B等作为胫长、胫围、体斜长和龙骨长等体尺性状的潜在功能基因。为文昌鸡体尺性能的分子标记辅助选择育种提供理论支撑。

关键词：全基因组关联分析鸡体尺性状胫长胫围

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突发事件触发的高校网络话语权危机:困境与应对

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四川职业技术学院学报 2024年第4期34卷 27-31页

作者：赵癸萍无锡职业技术学院马克思主义学院江苏无锡214121

突发事件对高校网络话语权具有肢解真实性、瓦解利益代表性、消解价值性和分解引领力等负面作用,引发沟通危机、公信力危机、价值危机和领导权危机。其根源是社会变革利益冲突、网络技术运行短板、舆论场域多维夹击、网络群体极化效应... 详细信息

突发事件对高校网络话语权具有肢解真实性、瓦解利益代表性、消解价值性和分解引领力等负面作用,引发沟通危机、公信力危机、价值危机和领导权危机。其根源是社会变革利益冲突、网络技术运行短板、舆论场域多维夹击、网络群体极化效应和网络舆情应对失当叠加触发。高校可通过强化危机预警、抢占网络话语先机,处置失范行为、筑牢网络话语根基,改善舆论氛围、引导网络话语走势,注重恢复管理、规避话语危机反弹等措施,妥善应对网络话语权危机。

关键词：突发事件意识形态网络话语权危机

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人参生长过程对外源磷肥的需求规律研究

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世界科学技术-中医药现代化 2024年第5期26卷 1213-1222页

作者：陈莹莹李洁赵贵萍张乃嘦徐福荣于大德李西文云南中医药大学中药学院中国中医科学院中药研究所盛实百草药业有限公司

目的探究农田参对外源磷肥的需求规律，为配方施肥和专用肥研发奠定基础。方法以二年生和三年生人参苗为试验材料，采用过磷酸钙及无磷霍格兰德营养液（Hoagland溶液）为供试肥料，设置P2O5浓度分别为0 mmol·L-1、0.5 mmol·L-1、1.5... 详细信息

目的探究农田参对外源磷肥的需求规律，为配方施肥和专用肥研发奠定基础。方法以二年生和三年生人参苗为试验材料，采用过磷酸钙及无磷霍格兰德营养液（Hoagland溶液）为供试肥料，设置P2O5浓度分别为0 mmol·L-1、0.5 mmol·L-1、1.5 mmol·L-1、3 mmol·L-1、6 mmol·L-1、8 mmol·L-1，监测不同浓度磷肥对人参农艺指标、光合特性以及对人参皂苷Rg1、Rb1、Re积累的影响。结果外施1.5-3.0 mmol·L-1磷肥对二年生及三年生人参的株高、茎粗、根重、叶面积、叶绿素相对含量及叶片净光合速率、总皂苷含量均有显著的促进作用。其中二年生人参根重较无磷组提高16%，皂苷含量增加24%；三年生人参根重较无磷组可提高89%，皂苷含量可增加132%。P2O5适宜施用量分别为每株26.6 mg、53.3 mg。结论外施适宜浓度磷肥，可提升人参外部形态特征、改善光合生理特性并增加活性成分含量。

关键词：人参磷肥肥料皂苷产量

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安徽省农村职业教育探析

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淮南职业技术学院学报 2024年第2期24卷 131-133页

作者：程燕飞赵桂萍安徽省淮南卫生学校安徽淮南232000

安徽省农村职业教育较落后,因此,加强职业教育势在必行。分析了安徽省农村职业教育工作存在的问题,从加大职业教育的资金投入、优化教学环境、转变培训方式和提高师资力量等方面提出了发展对策。

关键词：安徽省农村职业教育必要性

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肠道微生物对家禽抗病力的影响研究进展

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中国畜禽种业 2024年第1期20卷 29-35页

作者：李想王巧李庆贺文杰赵桂苹中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100193

家禽肠道内栖息着大量的微生物,这些微生物与宿主有着密切的联系,在维持肠道稳态和抑制有害菌生长中发挥着关键作用。建立和维持肠道微生物稳态是保障宿主健康的关键。然而肠道微生物与机体之间的关系较为复杂,影响因素较多。因此,该文... 详细信息

家禽肠道内栖息着大量的微生物,这些微生物与宿主有着密切的联系,在维持肠道稳态和抑制有害菌生长中发挥着关键作用。建立和维持肠道微生物稳态是保障宿主健康的关键。然而肠道微生物与机体之间的关系较为复杂,影响因素较多。因此,该文综述了家禽肠道微生物的组成及影响因素,并进一步深入探讨了肠道微生物抗病潜在机制,旨在为肠道微生物与抗病之间的研究提供新的思路。

关键词：家禽肠道微生物抗病

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Dominant changes in the breast muscle lipid profiles of broiler chickens with wooden breast syndrome revealed by lipidomics analyses

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Journal of Animal Science and Biotechnology 2022年第6期13卷 1703-1713页

作者： Ranran Liu Fuli Kong Siyuan Xing Zhengxiao He Lu Bai Jiahong Sun Xiaodong Tan Di zhao guiping zhao Jie Wen Institute of Animal Sciences Chinese Academy of Agricultural SciencesState Key Laboratory of Animal NutritionKey Laboratory of Animal(Poultry)Genetics Breeding and ReproductionMinistry of AgricultureBeijingChina

Background: Chicken is the most consumed meat worldwide and the industry has been facing challenging myopathies. Wooden breast(WB), which is often accompanied by white striping(WS), is a serious myopathy adversely affecting meat quality of breast muscles. The underlying lipid metabolic mechanism of WB affected broilers is not fully ***: A total of 150 chickens of a white-feathered, fast-growing pure line were raised and used for the selection of WB, WB + WS and control chickens. The lipids of the breast muscle, liver, and serum from different chickens were extracted and measured using ultra performance liquid chromatography(UPLC) plus Q-Exactive Orbitrap tandem mass spectrometry. In the breast, 560 lipid molecules were identified. Compared to controls, 225/225 of 560 lipid molecules(40.2%) were identified with differential abundance(DA), including 92/100 significantly increased neutral lipids and 107/98 decreased phospholipids in the WB/WB + WS groups, respectively. The content of monounsaturated fatty acids(MUFA) was significantly higher, and the polyunsaturated fatty acids(PUFA) and saturated fatty acids(SFA) were significantly lower in the affected breasts. In the liver, 434 lipid molecules were identified, and 39/61 DA lipid molecules(6.7%/14.1%) were detected in the WB and WB + WS groups, respectively. In the serum, a total of 529 lipid molecules were identified and 4/44 DA lipid molecules(0.8%/8.3%) were detected in WB and WB + WS group, respectively. Compared to controls, the content of MUFAs in the serum and breast of the WB + WS group were both significantly increased, and the content of SFAs in two tissues were both significantly decreased. Only five lipid molecules were consistently increased in both liver and serum in WB + WS ***: We have found for the first time that the dominant lipid profile alterations occurred in the affected breast muscle. The relative abundance of 40.2% of lipid molecules were changed and is characteri

关键词： Broiler chicken Lipid profle Liver Serum Wooden breast

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