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福美双诱导的肉鸡胫骨生长板异常增殖软骨细胞相关基因表达研究

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畜牧与饲料科学 2015年第Z1期 232-237页

作者：张晨亮赵晋锋喻进王倩倩卢晓晓李娜娜李欣张宁张鼎宁官保李宏全马海利高文伟赵宇军高诗敏李桂兰李建慧闫芳陈书明田文霞山西农业大学动物科技学院

[目的]探讨HDAC1、MTA1、H4、PCNA等与肿瘤发生和发展相关基因的差异表达与肉鸡TD发生之间的相关性。[方法]利用课题组已建立的肉鸡TD模型,采用荧光定量PCR技术及免疫组织化学技术,对TD模型胫骨生长板中HDAC1、MTA1、H4和PCNA基因的表... 详细信息

[目的]探讨HDAC1、MTA1、H4、PCNA等与肿瘤发生和发展相关基因的差异表达与肉鸡TD发生之间的相关性。[方法]利用课题组已建立的肉鸡TD模型,采用荧光定量PCR技术及免疫组织化学技术,对TD模型胫骨生长板中HDAC1、MTA1、H4和PCNA基因的表达进行定量和定位研究。[结果]荧光定量PCR结果显示:与对照组相比,TD模型胫骨生长板中HDAC1、MTA1、H4、和PCNA基因在转录水平均呈现出差异性表达。HDAC1基因在第1、2、4和6天表达上调且差异极显著(P<0.01);MTA1基因表达上调,在第1、2天差异极显著(P<0.01);H4基因转录水平增强,且在第2、4天表达差异极显著(P<0.01);PCNA基因表达在第1、2、4天出现下调,且差异均极显著(P<0.01)。免疫组织化学结果显示,TD模型中HDAC1和MTA1蛋白在胫骨生长板不同区域的软骨细胞中存在不同程度的表达。HDAC1蛋白在各区域表达总体上调,其中在第1天的增殖区和第6天的肥大区软骨细胞中表达极显著差异(P<0.01),第2天的增殖区和第1、2天的肥大区表达显著差异(P<0.05);MTA1蛋白除在第2天的前肥大区无差异性表达外,在第1、4、6天其余各区的表达均呈现极显著上调表达(P<0.01)。[结论]在mRNA水平,HDAC1、MTA1、H4和PCNA基因在肉鸡TD模型胫骨生长板软骨细胞中均呈现差异性表达,与前期基因芯片结果相符。在蛋白水平,HDAC1蛋白与MTA1蛋白在TD模型生长板增殖区也呈现差异表达。该结果表明上述基因的差异性表达与肉鸡TD生长板软骨细胞异常增殖相关。

关键词：福美双胫骨软骨发育不良细胞增殖荧光定量PCR 免疫组织化学

塞来昔布对福美双诱导的肉鸡TD中COX-1/2、ColⅩ和MMP-13表达的影响

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畜牧与饲料科学 2015年第Z1期 238-246页

作者：喻进张晨亮赵晋锋卢晓晓李娜娜王倩倩李欣张宁张鼎宁官保李宏全马海利高文伟赵宇军高诗敏李桂兰李建慧闫芳陈书明田文霞山西农业大学动物科技学院

[目的]研究环氧酶通路与肉鸡胫骨软骨发育不良(TD)早期发生关系。[方法]参照本课题组前期研究方法复制肉鸡TD早期模型。通过添加塞来昔布,观察肉鸡早期临床症状,生长板剖检形态,进行TD评价,并应用荧光定量PCR,免疫组化方法分别检测环氧... 详细信息

[目的]研究环氧酶通路与肉鸡胫骨软骨发育不良(TD)早期发生关系。[方法]参照本课题组前期研究方法复制肉鸡TD早期模型。通过添加塞来昔布,观察肉鸡早期临床症状,生长板剖检形态,进行TD评价,并应用荧光定量PCR,免疫组化方法分别检测环氧酶(COX-1/2)、基质金属蛋白酶13(MMP-13)、Ⅹ型胶原(ColⅩ)基因及蛋白的表达。[结果 ](1)COX-1与COX-2蛋白均表达于正常生长板,且COX-2呈现高表达;(2)肉鸡TD早期生长板中COX差异表达明显,COX-1基因在不同阶段高表达(P<0.01),而蛋白则低表达;COX-2基因(P<0.01)与蛋白在不同阶段表达出现规律性变化;MMP-13基因第1天表达急剧上调(P<0.01),第2、4天表达无明显变化,MMP-13蛋白表达均减少;第6天MMP-13基因(P<0.01)及蛋白急剧下降;ColⅩ基因表达均上调(P<0.01)。以上结果表明TD发生可能与COX-1/2,MMP-13和ColⅩ变化相关;(3)添加塞来昔布,COX-1与COX-2基因(P<0.01)及蛋白表达接近于对照组,MMP-13,ColⅩ基因(P<0.01)与MMP-13蛋白表达于前者相类似,TD严重程度明显缓解。[结论]环氧酶通路在TD早期发生中可能扮演一定角色。

关键词：塞来昔布 TD 福美双环氧酶基质金属蛋白酶13 Ⅹ型胶原

福美双诱导的TD肉鸡生长板中p-STAT3、SOCS3的时序性表达研究

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畜牧与饲料科学 2015年第Z1期 260-265页

作者：赵晋锋张晨亮喻进李娜娜卢晓晓王倩倩张宁李欣张鼎宁官保李宏全马海利高文伟赵宇军高诗敏李桂兰李建慧闫芳陈书明田文霞山西农业大学动物科技学院

[目的]研究旨在观察p-STAT3与SOCS3在肉鸡TD发生过程中的时序性表达,初步探讨JAKSTAT信号通路与肉鸡TD的相关性。[方法]利用实验室建立的肉鸡TD模型,采用Real-time q PCR、免疫组化技术研究TD发生过程中p-STAT3与SOCS3在转录水平和翻译... 详细信息

[目的]研究旨在观察p-STAT3与SOCS3在肉鸡TD发生过程中的时序性表达,初步探讨JAKSTAT信号通路与肉鸡TD的相关性。[方法]利用实验室建立的肉鸡TD模型,采用Real-time q PCR、免疫组化技术研究TD发生过程中p-STAT3与SOCS3在转录水平和翻译水平的时序性表达差异。[结果]结果表明,与对照组相比,饲喂福美双组肉鸡生长板STAT3基因在第1天表达变化不明显,第2、4、6天表达增加,差异极显著(P<0.01)。SOCS3基因在第1、2、6天表达增加,第4天表达降低,差异极显著(P<0.01)。p-STAT3蛋白在生长板增殖区、前肥大区与肥大区均表达。与对照组相比,饲喂福美双组增殖区p-STAT3蛋白在第1、2、4天表达均上调,第6天表达下调;在前肥大区与肥大区,第1、2、4天均上调表达,第6天表达量下调。SOCS3蛋白在生长板各区也均有表达,与对照组相比,饲喂福美双组增殖区SOCS3在第1、4、6天表达上调,第2天表达下调。在前肥大区,第1、4、6天表达上调,第2天表达下调;SOCS3在肥大区第1、2、4、6天均表达上调。[结论]结果提示,在转录水平STAT3与SOCS3基因表达均呈先上升后下降的趋势,差异表达结果与基因芯片结果相吻合。p-STAT3和SOCS3蛋白在生长板增殖区、前肥大区与肥大区均有表达。上述结果提示,福美双可能通过JAK-STAT信号通路调节软骨细胞的增殖、分化及凋亡。

关键词：胫骨软骨发育不良生长板磷酸化信号转导和转录激活因子3 细胞因子信号传导抑制蛋白3

FungalTraits:a user-friendly traits database of fungi and fungus-like stramenopiles

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Fungal Diversity 2020年第6期107卷 I0001-I0016页

作者： Sergei Põlme Kessy Abarenkov RHenrik Nilsson Björn D.Lindahl Karina Engelbrecht Clemmensen Havard Kauserud Nhu Nguyen Rasmus Kjøller Scott T.Bates Petr Baldrian Tobias Guldberg Frøslev Kristjan Adojaan Alfredo Vizzini Ave Suija Donald Pfister Hans-Otto Baral Helle Järv Hugo Madrid Jenni Nordén Jian-Kui Liu Julia Pawlowska Kadri Põldmaa Kadri Pärtel Kadri Runnel Karen Hansen Karl-Henrik Larsson Kevin David Hyde Marcelo Sandoval-Denis Matthew E.Smith Merje Toome-Heller Nalin N.Wijayawardene Nelson Menolli Jr Nicole K.Reynolds Rein Drenkhan Sajeewa S.N.Maharachchikumbura Tatiana B.Gibertoni Thomas Læssøe William Davis Yuri Tokarev Adriana Corrales Adriene Mayra Soares Ahto Agan Alexandre Reis Machado Andrés Argüelles-Moyao Andrew Detheridge Angelina de Meiras-Ottoni Annemieke Verbeken Arun Kumar Dutta Bao-Kai Cui C.K.Pradeep César Marín Daniel Stanton Daniyal Gohar Dhanushka N.Wanasinghe Eveli Otsing Farzad Aslani Gareth W.Griffith Thorsten H.lumbsch Hans-Peter Grossart Hossein Masigol Ina Timling Inga Hiiesalu Jane Oja John Y.Kupagme József Geml Julieta Alvarez-Manjarrez Kai Ilves Kaire Loit Kalev Adamson Kazuhide Nara Kati Küngas Keilor Rojas-Jimenez Krišs Bitenieks Laszlo Irinyi LászlóGNagy Liina Soonvald Li-Wei Zhou Lysett Wagner M.Catherine Aime MaarjaÖpik María Isabel Mujica Martin Metsoja Martin Ryberg Martti Vasar Masao Murata Matthew PNelsen Michelle Cleary Milan C.Samarakoon Mingkwan Doilom Mohammad Bahram Niloufar Hagh-Doust Olesya Dulya Peter Johnston Petr Kohout Qian Chen Qing Tian Rajasree Nandi Rasekh Amiri Rekhani Hansika Perera Renata dos Santos Chikowski Renato L.Mendes-Alvarenga Roberto Garibay-Orijel Robin Gielen Rungtiwa Phookamsak Ruvishika S.Jayawardena Saleh Rahimlou Samantha C.Karunarathna Saowaluck Tibpromma Shawn P.Brown Siim-Kaarel Sepp Sunil Mundra Zhu-Hua luo Tanay Bose Tanel Vahter Tarquin Netherway Teng Yang Tom May Torda Varga Wei Li Victor Rafael Matos Coimbra Virton Rodrigo Targino de Oliveira Vitor Xavier de Lima Vladimir S.Mikryukov Yongzhong lu Yosuke Matsuda Yumiko Miyamoto Urm Institute of Ecology and Earth Sciences University of Tartu14A Ravila50411 TartuEstonia Natural History Museum University of Tartu46 Vanemuise Str51003 TartuEstonia Gothenburg Global Biodiversity Centre Box 46140530 GothenburgSweden Department of Biological and Environmental Sciences University of GothenburgGothenburgSweden Department of Soil and Environment Swedish University of Agricultural SciencesBox 701475007 UppsalaSweden Department of Forest Mycology and Plant Pathology Swedish University of Agricultural SciencesBox 702675007 UppsalaSweden Section for Genetics and Evolutionary Biology(EvoGene) Department of BiosciencesUniversity of OsloP.O.Box 1066BlindernNO-0316 OsloNorway University of Hawaiʻi at Mānoa 3190 Maile WaySt.John 102HonoluluHIUSA Department of Biology University of CopenhagenUniversitetsparken 152100 CopenhagenØDenmark Purdue University Northwest WestvilleIN 46391USA Institute of Microbiology Czech Academy of SciencesVidenska 108314220 Praha 4Czech Republic GLOBE Institute University of CopenhagenØster Farimagsgade 5KH7.2.321353 CopenhagenDenmark Dipartimento di Scienze della Vita e Biologia dei Sistemi Universitàdi TorinoViale Mattioli 2510125 TorinoItaly Department of Organismic and Evolutionary Biology and Farlow Library and Herbarium Harvard University22 Divinity AveCambridgeMA 02138USA Blaihofstr.42 72074 TübingenGermany SYNLAB Estonia Veerenni 53aTallinn 11313Estonia Escuela de Tecnología Médica Universidad Santo TomásLos Carreras 753OsornoChile Centro de Genómica y Bioinformática Universidad MayorCamino La Pirámide 5750HuechurabaSantiagoChile Norwegian Institute for Nature Research(NINA) Sognsveien 680855 OsloNorway School of Life Science and Technology University of Electronic Science and Technology of ChinaChengdu 611731People’s Republic of China Evolutionary Biology Faculty of BiologyBiological and Chemical Research CentreUniversity of Warsawul.Zwirki i Wigury 10102-089 WarsawPoland Department of Botany Swedish Museum of

The cryptic lifestyle of most fungi necessitates molecular identification of the guild in environmental studies.Over the past decades,rapid development and affordability of molecular tools have tremendously improved insights of the fungal diversity in all ecosystems and habitats.Yet,in spite of the progress of molecular methods,knowledge about functional properties of the fungal taxa is vague and interpretation of environmental studies in an ecologically meaningful manner remains challenging.In order to facilitate functional assignments and ecological interpretation of environmental studies we introduce a user friendly traits and character database FungalTraits operating at genus and species hypothesis levels.Combining the information from previous efforts such as FUNGuild and FunFun together with involvement of expert knowledge,we reannotated 10,210 and 151 fungal and Stramenopila genera,respectively.This resulted in a stand-alone spreadsheet dataset covering 17 lifestyle related traits of fungal and Stramenopila genera,designed for rapid functional assignments of environmental stud-ies.In order to assign the trait states to fungal species hypotheses,the scientific community of experts manually categorised and assigned available trait information to 697,413 fungal ITS sequences.On the basis of those sequences we were able to summarise trait and host information into 92,623 fungal species hypotheses at 1%dissimilarity threshold.

关键词： Fungal traits Trophic modes Function Guild Bioinformatics High-throughput sequencing Community ecology