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Hepatic steatosis is associated with dysregulated cholesterol metabolism and altered protein acetylation dynamics in chickens

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Journal of Animal Science and Biotechnology 2024年第1期15卷 53-67页

作者： xiaoli guo Qianqian Zhou Jiaming Jin Fangren Lan Chaoliang Wen Junying Li Ning Yang Congjiao Sun National Engineering Laboratory for Animal Breeding and Key Laboratory of Animal Genetics Breeding and ReproductionMinistry of Agriculture and Rural AffairsChina Agricultural UniversityBeijing 100193China

Background Hepatic steatosis is a prevalent manifestation of fatty liver, that has detrimental effect on the health and productivity of laying hens, resulting in economic losses to the poultry industry. Here, we aimed to systematically investigate the genetic regulatory mechanisms of hepatic steatosis in laying *** Ninety individuals with the most prominent characteristics were selected from 686 laying hens according to the accumulation of lipid droplets in the liver, and were graded into three groups, including the control, mild hepatic steatosis and severe hepatic steatosis groups. A combination of transcriptome, proteome, acetylome and lipidome analyses, along with bioinformatics analysis were used to screen the key biological processes, modifications and lipids associated with hepatic *** The rationality of the hepatic steatosis grouping was verified through liver biochemical assays and RNA-seq. Hepatic steatosis was characterized by increased lipid deposition and multiple metabolic abnormalities. Integration of proteome and acetylome revealed that differentially expressed proteins(DEPs) interacted with differentially acetylated proteins(DAPs) and were involved in maintaining the metabolic balance in the liver. Acetylation alterations mainly occurred in the progression from mild to severe hepatic steatosis, i.e., the enzymes in the fatty acid oxidation and bile acid synthesis pathways were significantly less acetylated in severe hepatic steatosis group than that in mild group(P < 0.05). Lipidomics detected a variety of sphingolipids(SPs) and glycerophospholipids(GPs) were negatively correlated with hepatic steatosis(r ≤-0.5, P < 0.05). Furthermore, the severity of hepatic steatosis was associated with a decrease in cholesterol and bile acid synthesis and an increase in exogenous cholesterol *** In addition to acquiring a global and thorough picture of hepatic steatosis in laying hens, we were able to reveal the role of ac

关键词： Acetylation Cholesterol metabolism Hepatic steatosis Laying hens Multiomics

Asking one mechanism in glial cells during neuroinflammation

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Neural Regeneration Research 2025年第4期20卷 1077-1078页

作者： xiaoli guo Chikako Harada Takayuki Harada Visual Research Project Tokyo Metropolitan Institute of Medical ScienceTokyoJapan

Multiple sclerosis(MS),which is characterized by inflammatory demyelination in the central nervous system(CNS),is the most common neurological disease in the young adult *** autoimmune encephalomyelitis(EAE),an animal model of MS,is often used in preclinical *** data indicate that in addition to immune cells such as T cells and dendritic cells,CNS resident microglia and astrocytes play important roles in demyelinating neuroinflammation(Healy et al.,2022).In particular,microglia are key immune-competent cells that can respond to environmental *** depletion of transforming growth factor-β-activated kinase 1,a mitogen-associated protein kinase kinase kinase,in microglia is reported to reduce CNS inflammation and diminish axonal and myelin damage *** suggests that elucidating the mechanisms of microglia-specific responses during pathologies may help in the development of treatments that reduce EAE/MS disease severity(Goldmann et al.,2013).

关键词： inflammation clinical

Monogenic gene therapy for glaucoma and optic nerve injury

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Neural Regeneration Research 2025年第3期20卷 815-816页

作者： Chikako Harada xiaoli guo Takayuki Harada Visual Research Project Tokyo Metropolitan Institute of Medical ScienceTokyoJapan

The prevalence of glaucoma, the second leading cause of global blindness, is increasing due to aging populations. In glaucoma, degeneration of the optic nerve and retinal ganglion cells(RGCs) causes visual field defec... 详细信息

关键词： visual glaucoma degeneration

Dynamic modulation of nodulation factor receptor levels by phosphorylation-mediated functional switch of a RING-type E3 ligase during legume nodulation

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Molecular Plant 2024年第7期17卷 1090-1109页

作者： Hao Li Yajuan Ou Jidan Zhang Kui Huang Ping Wu xiaoli guo Hui Zhu Yangrong Cao National Key Lab of Agricultural Microbiology Hubei Hongshan LaboratoryHuazhong Agricultural UniversityWuhan 430070China National Key Lab of Agricultural Microbiology College of Plant Science and TechnologyHuazhong Agricultural UniversityWuhan 430070China

The precise control of receptor levels is crucial for initiating cellular signaling transduction in response to specific ligands;however,such mechanisms regulating nodulation factor(NF)receptor(NFR)-mediated perception of NFs to establish symbiosis remain *** this study,we unveil the pivotal role of the NFR-interacting RING-type E3 ligase 1(NIRE1)in regulating NFR1/NFR5 homeostasis to optimize rhizobial infection and nodule development in Lotus *** demonstrated that NiRE1 has a dual function in this regulatory *** associates with both NFR1 and NFR5,facilitating their degradation through K48-linked polyubiquitination before rhizobial ***,following rhizobial inoculation,NFR1 phosphorylates NIRE1ata conserved residue,Tyr-109,inducing a functional switch in NIRE1,which enables NIRE1tomediateK63-linkedpolyubiquitination,thereby stabilizing NFR1/NFR5 in infected root *** introduction of phospho-dead NIRE1Y1osF leads to delayed nodule development,underscoring the significance of phosphorylation at Tyr-1o9 in orchestrating symbiotic ***,expression of the phospho-mimic NIRE1Y0E results in the formation of spontaneous nodules in ***,further emphasizing the critical role of the phosphorylation-dependent functional switch in *** summary,these findings uncover a fine-tuned symbiotic mechanism that a single E3 ligase could undergo a phosphorylationdependent functional switch to dynamically and precisely regulate NF receptor protein levels.

关键词： nodule symbiosis nodulation factor receptors E3 ligase ubiquitination phosphorylation protein degradation protein stabilization Lotus japonicus

职业院校教师教学学术能力的价值意蕴、现实表征与提升路径

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教育与职业 2024年第1期1049卷 86-93页

作者：马君郭小丽陕西师范大学教育学部陕西西安710062

教学学术能力有利于强化职业院校教师教学地位的“合法性”、提升职业院校教师的专业创新能力、适应职业院校育人方式的需要、激发企业参与职业院校办学的动力。职业院校教师教学学术能力当前在合法性层面、实践性层面、关联性层面、保... 详细信息

教学学术能力有利于强化职业院校教师教学地位的“合法性”、提升职业院校教师的专业创新能力、适应职业院校育人方式的需要、激发企业参与职业院校办学的动力。职业院校教师教学学术能力当前在合法性层面、实践性层面、关联性层面、保障性层面面临着一些问题。为提升职业院校教师教学学术能力,应该深化观念、强化能力、畅通交流、优化制度,从而给予教学学术地位的合法性、增强教学学术发展的动力性、加强教学学术分享的关联性、提高教学学术提升的保障性。

关键词：职业院校教师教学学术能力科教融汇

布托啡诺调节cGAS/STING信号通路对脊髓损伤大鼠神经细胞炎症的影响

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现代药物与临床 2024年第5期39卷 1085-1091页

作者：邵恳黄杨袁振武郭小丽荆门市中心医院、荆楚理工学院附属荆门市中心医院麻醉科湖北荆门448001

目的探讨布托啡诺对脊髓损伤大鼠神经细胞炎症的影响及其机制。方法复制脊髓损伤大鼠模型,将大鼠分为假手术组、模型组、布托啡诺(100μg/kg)组、布托啡诺+2',3'-cGAMP(100μg/kg布托啡诺+500μg/kg 2',3'-cGAMP)组,对大鼠进行运动功能... 详细信息

目的探讨布托啡诺对脊髓损伤大鼠神经细胞炎症的影响及其机制。方法复制脊髓损伤大鼠模型,将大鼠分为假手术组、模型组、布托啡诺(100μg/kg)组、布托啡诺+2',3'-cGAMP(100μg/kg布托啡诺+500μg/kg 2',3'-cGAMP)组,对大鼠进行运动功能评分,苏木精–伊红(HE)染色检测脊髓组织病理变化,TUNEL染色检测细胞凋亡,ELISA检测脊髓组织肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白细胞介素(IL)-1β、IL-18水平,免疫荧光染色检测小胶质细胞,Western blotting检测脊髓组织环磷酸鸟苷-磷酸腺苷酸合成酶(c GAS)、干扰素基因刺激因子(STING)、Nod样受体蛋白3(NLRP3)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白水解酶-1(Caspase-1)、IL-1β蛋白表达。结果与模型组比较,布托啡诺组脊髓组织损伤减轻,炎症细胞减少,坏死细胞减少,Basso-Beattie-Bresnahan(BBB)评分显著升高,脊髓组织细胞凋亡率、小胶质细胞及TNF-α、IL-1β、IL-18水平,c GAS、STING、NLRP3、Caspase-1、IL-1β蛋白表达水平显著降低(P<0.05);与布托啡诺组比较,布托啡诺+2',3'-cGAMP组脊髓组织损伤加重,细胞排列较为松散,炎性细胞增多,BBB评分显著降低,脊髓组织细胞凋亡率、小胶质细胞及TNF-α、IL-1β、IL-18水平,c GAS、STING、NLRP3、Caspase-1、IL-1β蛋白表达水平显著升高(P<0.05)。结论布托啡诺通过抑制c GAS/STING信号通路激活,抑制小胶质细胞激活及炎症反应,改善大鼠脊髓损伤。

关键词：布托啡诺脊髓损伤神经炎症环磷酸鸟苷-磷酸腺苷酸合成酶/干扰素基因刺激因子信号通路肿瘤坏死因子-α Nod样受体蛋白3 半胱氨酸天冬氨酸蛋白水解酶-1

基于BERT-BiLSTM-CRF模型的畜禽疫病文本分词研究

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农业机械学报 2024年第2期55卷 287-294页

作者：余礼根郭晓利赵红涛杨淦张俊李奇峰北京市农林科学院信息技术研究中心北京100097 国家数字畜牧业创新中心北京100097 华北电力大学数理学院北京102206

针对畜禽疫病文本语料匮乏、文本内包含大量疫病名称及短语等未登录词问题,提出了一种结合词典匹配的BERT-BiLSTM-CRF畜禽疫病文本分词模型。以羊疫病为研究对象,构建了常见疫病文本数据集,将其与通用语料PKU结合,利用BERT(Bidirectiona... 详细信息

针对畜禽疫病文本语料匮乏、文本内包含大量疫病名称及短语等未登录词问题,提出了一种结合词典匹配的BERT-BiLSTM-CRF畜禽疫病文本分词模型。以羊疫病为研究对象,构建了常见疫病文本数据集,将其与通用语料PKU结合,利用BERT(Bidirectional encoder representation from transformers)预训练语言模型进行文本向量化表示;通过双向长短时记忆网络(Bidirectional long short-term memory network,BiLSTM)获取上下文语义特征;由条件随机场(Conditional random field,CRF)输出全局最优标签序列。基于此,在CRF层后加入畜禽疫病领域词典进行分词匹配修正,减少在分词过程中出现的疫病名称及短语等造成的歧义切分,进一步提高了分词准确率。实验结果表明,结合词典匹配的BERT-BiLSTM-CRF模型在羊常见疫病文本数据集上的F1值为96.38%,与jieba分词器、BiLSTM-Softmax模型、BiLSTM-CRF模型、未结合词典匹配的本文模型相比,分别提升11.01、10.62、8.3、0.72个百分点,验证了方法的有效性。与单一语料相比,通用语料PKU和羊常见疫病文本数据集结合的混合语料,能够同时对畜禽疫病专业术语及疫病文本中常用词进行准确切分,在通用语料及疫病文本数据集上F1值都达到95%以上,具有较好的模型泛化能力。该方法可用于畜禽疫病文本分词。

关键词：畜禽疫病文本分词预训练语言模型双向长短时记忆网络条件随机场

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1990-2019年我国居民肺癌死亡水平与疾病负担趋势预测研究

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中华肿瘤防治杂志 2024年第2期31卷 65-73页

作者：辛雯艳郭晓莉何小双王蓓徐丽娜石河子大学第一附属医院呼吸内科新疆石河子832000 石河子大学医学院新疆石河子832000

目的探讨我国居民1990-2019年肺癌疾病负担与危险因素,并对流行趋势预测分析,为进一步防控提供依据。方法数据来源于全球疾病负担(GBD)研究,根据中国和全球肺癌的死亡人数、死亡率和标化死亡率(ASMR)描述死亡水平;采用伤残调整寿命年综... 详细信息

目的探讨我国居民1990-2019年肺癌疾病负担与危险因素,并对流行趋势预测分析,为进一步防控提供依据。方法数据来源于全球疾病负担(GBD)研究,根据中国和全球肺癌的死亡人数、死亡率和标化死亡率(ASMR)描述死亡水平;采用伤残调整寿命年综合评估疾病负担;对职业和非职业共16种危险因素负担进行归因分析。运用Joinpoint找出最优模型,即采用对数线性回归模型计算年度变化百分比(APC)和平均年度变化百分比(AAPC),并进行趋势分析。采用贝叶斯年龄-时期-队列(BAPC)模型预测我国不同性别居民肺癌2020-2035年的死亡情况。结果1990和2019年中国肺癌死亡人数分别为25.63万例和75.72万例,变化率为195.39%,AAPC=3.84%(95%CI:3.60~4.08),大约是全球(AAPC=2.27%)的2倍;死亡率从21.65/10万增长到53.23/10万,变化率为145.83%,AAPC=3.08%(95%CI:2.80~3.36),大约是全球(AAPC=0.98%)的3倍;ASMR呈上升趋势,AAPC=0.78%(95%CI:0.56~1.01),但全球呈下降趋势。2019年我国肺癌标化伤残损失寿命年(YLD)、早死损失寿命年(YLL)率和伤残调整寿命年(DALY)率较1990年分别增长了44.49%、8.96%和9.28%,AAPC分别为1.31%(95%CI:1.09~1.53)、0.32%(95%CI:0.09~0.55)和0.33%(95%CI:0.10~0.56);我国肺癌负担男性更高,且增幅更明显。2019年我国肺癌排名前3的危险因素为吸烟、环境PM2.5和二手烟,高空腹血糖水平从1990年的第6位上升至第4位,其标化DALY率上升幅度最大。预测结果显示,2020-2035年,中国男性肺癌的ASMR平缓波动,而女性表现为上升趋势。结论我国居民肺癌的死亡水平和疾病负担较全球严重,其中由高空腹血糖水平引起的负担顺位有所上升。预测2020-2035年女性肺癌标化死亡率将上升。全面掌握我国肺癌负担趋势及其影响因素,并有效预测发展趋势,可以为我国肺癌防控工作提供理论支持。

关键词：肺癌疾病负担贝叶斯年龄-时期-队列模型预测

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鸡不同红羽表型的毛囊代谢物分析

中国家禽 2024年第3期46卷 7-14页

作者：王彻郭晓莉杨静张修安孙从佼中国农业大学动物科学技术学院北京100089

试验旨在比较不同羽色的毛囊代谢组学差异,以探究鸡不同羽色形成的代谢机制。试验对红羽、浅红羽和白羽三组每组各7只鸡,采集其毛囊组织,使用液相色谱-质谱(Liquid chromatography mass spectrometrhy,LC-MS)联用技术对毛囊组织进行代... 详细信息

试验旨在比较不同羽色的毛囊代谢组学差异,以探究鸡不同羽色形成的代谢机制。试验对红羽、浅红羽和白羽三组每组各7只鸡,采集其毛囊组织,使用液相色谱-质谱(Liquid chromatography mass spectrometrhy,LC-MS)联用技术对毛囊组织进行代谢物检测,鉴定3组之间的差异代谢物,并对其代谢通路进行分析。结果显示:在红羽、浅红羽和白羽组中共检测到代谢物4426个,筛选到红羽组和白羽组间的显著差异代谢物共464个,其中在红羽组显著上调的195个,下调的269个,对这些代谢物进行富集分析,筛选出8个代谢物作为导致羽色变化的标志物,其中cAMP、甲氧沙林、GDP和半胱氨酰多巴在红羽组上调,(S)-羟基己酰辅酶A、4-吡哆酸、抗坏血酸和丁酰辅酶A在红羽组下调。研究表明cAMP、甲氧沙林、GDP等8种差异代谢物和其涉及的通路可能是造成红羽、浅红羽和白羽这3种不同羽色的原因,试验可为鸡红羽表型的形成机制解析和育种应用提供参考。

关键词：鸡羽色毛囊代谢组