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MECE:基于深度神经网络及进化分析提高糖苷水解酶的催化效率

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Science Bulletin 2023年第22期68卷 2793-2805,M0006页

作者：刘汗青关菲菲刘拓宇杨丽鑫范灵熙刘晓青罗会颖伍宁丰姚斌田健黄火清 Institute of Animal Science Chinese Academy of Agricultural SciencesBeijing 100193China Biotechnology Research Institute Chinese Academy of Agricultural SciencesBeijing 100081China

糖苷水解酶(glycoside hydrolases,GHs)在各个行业广泛应用,其需求量不断增加.然而,如何提高酶的催化效率仍然是一个挑战.本文开发了基于深度神经网络和分子进化的策略(MECE)预测提高糖苷水解酶催化活性的突变体.作者首先从CAZy数据库... 详细信息

糖苷水解酶(glycoside hydrolases,GHs)在各个行业广泛应用,其需求量不断增加.然而,如何提高酶的催化效率仍然是一个挑战.本文开发了基于深度神经网络和分子进化的策略(MECE)预测提高糖苷水解酶催化活性的突变体.作者首先从CAZy数据库中收集整理了119个糖苷水解酶家族的蛋白序列,建立了能够识别糖苷水解酶家族和功能残基的深度学习模型DeepGH,通过10倍交叉验证结果显示DeepGH模型的预测准确率为96.73%.随后利用梯度加权类激活图谱(Grad-CAM)方法提取分类相关特征,结合序列进化信息对突变体进行设计最后获得了具有7个氨基酸突变位点的壳聚糖酶突变体CHIS1754-MUT7.实验结果表明,CHIS1754-MUT7的k_(cat)/K_m是野生型的23.53倍.该策略计算效率高,实验成本低,具有显著的优势,为酶催化效率的智能设计提供了一种新的途径,具有广泛的应用前景.

关键词： MECE Deep learning Catalytic efficiency Glycoside hydrolases Feature extraction

中央孔型有晶状体眼人工晶状体植入术矫正中低度近视与高度近视术后视觉质量对照研究

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临床眼科杂志 2022年第4期30卷 303-307页

作者：关念沈政伟张晓农吴慧莺武汉普瑞眼科医院 430000 南昌普瑞眼科医院

目的评价中央孔型有晶状体眼人工晶状体(ICL)植入术矫正中低度近视与高度近视的术后视觉质量。方法回顾性病例分析。选取2019年10月至2020年1月行EVO-ICL晶状体植入术的近视患者101例(101只眼),其中男性42例,女性59例,年龄(27.08±5.16)... 详细信息

目的评价中央孔型有晶状体眼人工晶状体(ICL)植入术矫正中低度近视与高度近视的术后视觉质量。方法回顾性病例分析。选取2019年10月至2020年1月行EVO-ICL晶状体植入术的近视患者101例(101只眼),其中男性42例,女性59例,年龄(27.08±5.16)岁(21~44岁)。按术前屈光度分组:组1为中低度近视组35例(35只眼),屈光度球镜-2.00~-5.75 D,柱镜0~-4.00 D,等效球镜(-6.01±1.32)D;组2为高度近视组66例(66只眼),屈光球镜-6.00~-18.00 D,柱镜0~-4.50 D,等效球镜(-10.31±2.51)D。记录术前、术后1 d、1周、1个月、3个月及6个月的裸眼视力(UCVA)、最佳矫正视力(BCVA)、等效球镜(SE)和眼压,使用iTrace视功能分析仪测量术前及术后1个月和6个月全眼总高阶像差均方根值(RMS)及去除离焦像差的调制传递函数(MTF)平均值。采用独立样本t检验和重复测量方差分析进行统计学分析比较两组间差异,P0.05)。在自然瞳孔状态下测量的术后1个月和6个月RMS值两组均低于术前,差异有统计学意义(均P0.05),两组随时间变化呈递减趋势且逐渐接近;MTF值术前、术后1个月和6个月组1与组2差异无统计学意义(t=1.683,1.246,1.312;均P>0.05),两组随时间变化呈递增趋势。结论中央孔型有晶状体眼人工晶状体植入术矫正中低度近视与高度近视均具有良好的有效性和安全性,术后视觉质量与术前比较有明显改善,矫正中低度近视与高度近视的临床疗效基本一致。

关键词：有晶状体眼后房型人工晶状体中低度近视高度近视像差调制传递函数

393例乙型肝炎病毒相关慢加急性肝衰竭死亡患者死因及临床特征分析

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中华肝脏病杂志 2015年第9期23卷 704-706页

作者：刘晓燕陈婧童晶晶肖珑关崇丹张惠英逢菲辛绍杰胡瑾华解放军三○二医院肝衰竭诊疗与研究中心

我们回顾性分析了2008年1月至2011年1月期间在我院住院诊断乙型肝炎病毒相关慢加急性肝衰竭（HBV—rdated acute-on-chronic liver failure, HBV-ACLF）并于半年内死于肝衰竭的患者相关资料，旨在了解该类患者的直接死亡原因以及疾病特... 详细信息

我们回顾性分析了2008年1月至2011年1月期间在我院住院诊断乙型肝炎病毒相关慢加急性肝衰竭（HBV—rdated acute-on-chronic liver failure, HBV-ACLF）并于半年内死于肝衰竭的患者相关资料，旨在了解该类患者的直接死亡原因以及疾病特点，以期寻找预后相关因素及降低病死率的预防措施。一。

关键词：肝炎病毒,乙型肝功能衰竭死亡原因

一种改进的大鼠大脑皮质星形胶质细胞的培养方法

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神经解剖学杂志 2017年第3期33卷 349-353页

作者：丁娟丁敬宾马小虎关立锋杨慧莹王志军刘娟宁夏医科大学宁夏颅脑疾病重点实验室银川750004 宁夏医科大学基础医学院银川750004 宁夏医科大学宁夏医科大学总医院银川750004

目的:改进大鼠大脑皮质星形胶质细胞的培养方法,从而获取高纯度星形胶质细胞用于神经科学研究。方法:新生大鼠(2~3日龄),75%酒精消毒后断头,于冰上取大脑皮质置于冰冷的D-Hanks液中,去除脑膜和血管,剪碎后用0.25%胰酶消化并分离细胞,以1... 详细信息

目的:改进大鼠大脑皮质星形胶质细胞的培养方法,从而获取高纯度星形胶质细胞用于神经科学研究。方法:新生大鼠(2~3日龄),75%酒精消毒后断头,于冰上取大脑皮质置于冰冷的D-Hanks液中,去除脑膜和血管,剪碎后用0.25%胰酶消化并分离细胞,以1×10~5/ml的密度接种于预铺0.015%多聚赖氨酸的细胞瓶中培养。细胞纯化采用"差速贴壁法"、"梯度血清法"和"十字手摇法",以获取高纯度星形胶质细胞。通过星形胶质细胞特异性表达蛋白即胶质原纤维酸性蛋白(GFAP)行免疫细胞荧光染色来鉴定细胞纯度。结果:星形胶质细胞纯度大于98%,可多次传代,细胞增殖快,且生长良好。结论:改进的原代星形胶质细胞培养方法,操作简单,细胞纯度高,能满足各种神经科学研究中对高纯度星形胶质细胞培养的实验要求,适宜推广。

关键词：原代培养星形胶质细胞细胞纯化

土壤盐碱胁迫程度对番茄生长、离子稳态及ROS清除能力的影响

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北方园艺 2023年第7期 9-17页

作者：崔洪鑫柴亚倩关思慧万文亮刘慧英刁明石河子大学农学院特色果蔬栽培生理与种质资源利用兵团重点实验室新疆石河子832003

以C2和C5不同抗性番茄种质为试材,采用盆栽土培的方式,设置3个不同胁迫程度盐碱土处理,以当地非盐碱胁迫土壤为对照,研究了不同盐碱胁迫程度对2个番茄品种生长、离子平衡及活性氧(ROS)清除能力的影响差异及其与抗性的关系,以期明确其抗... 详细信息

以C2和C5不同抗性番茄种质为试材,采用盆栽土培的方式,设置3个不同胁迫程度盐碱土处理,以当地非盐碱胁迫土壤为对照,研究了不同盐碱胁迫程度对2个番茄品种生长、离子平衡及活性氧(ROS)清除能力的影响差异及其与抗性的关系,以期明确其抗盐碱机制,为进一步全面解析番茄耐盐碱机制和抗盐碱育种提供参考依据。结果表明:盐碱胁迫对番茄表型的生长产生抑制,在生理响应方面,盐碱胁迫破坏了细胞膜完整性,使H_(2)O_(2)含量、超氧阴离子产生速率和丙二醛含量增加,番茄通过提高抗氧化酶活性清除ROS维持植株的正常生理活动适应胁迫环境。盐碱胁迫使番茄过量吸收Na+从而抑制了对K^(+)、Ca^(2+)、Mg^(2+)的吸收,降低K^(+)/Na^(+)、Ca^(2+)/Na^(+)、Mg^(2+)/Na^(+),影响细胞膜完整性和蛋白的合成;盐碱胁迫下,抗性强的C2品种较抗性弱的C5品种具有较强的降低叶片和根系Na^(+)的吸收、维持离子稳态平衡和较低氧化胁迫内环境的能力,因此生长受抑制程度显著低于C5品种。

关键词：番茄盐碱胁迫离子稳态平衡抗氧化

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数控重型卧式车床的模块化设计研究

机床与液压 2011年第18期39卷 9-11页

作者：崔江红裴有珍陈卫星白忠海赵惠英管朋冲中原工学院河南郑州450007 青海华鼎重型机床有限责任公司青海西宁810100 西安交通大学陕西西安710049

基于模块化的设计理念,针对数控重型卧式车床模块化设计需求,结合企业生产实际,阐述数控重型卧式车床模块化设计的基本思路、模块划分原则;分析数控重型卧式车床功能与模块的关系,并提出数控重型卧式车床的模块划分方案和设计方法。模... 详细信息

基于模块化的设计理念,针对数控重型卧式车床模块化设计需求,结合企业生产实际,阐述数控重型卧式车床模块化设计的基本思路、模块划分原则;分析数控重型卧式车床功能与模块的关系,并提出数控重型卧式车床的模块划分方案和设计方法。模块化设计的实现可以保证机床产品的结构设计和生产具有很大的灵活性和应变性,是解决机床产品定制化生产和批量化生产矛盾的有效途径。

关键词：数控重型卧式车床模块化设计

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串联渠系多渠池蓄量平衡控制模式研究

灌溉排水学报 2021年第2期40卷 84-92页

作者：管光华李慧滢苏海旺桑国庆武汉大学水资源与水电工程科学国家重点实验室武汉430072 中水北方勘测设计研究有限责任公司天津300222 济南大学水利与环境学院济南250022

【目的】解决渠道控制中以单个渠段蓄量为控制对象时,存在调蓄容量有限、相邻渠池间的蓄量变化无法相互调节的问题。【方法】提出一种等下游水深的多渠池蓄量平衡运行方式,并建立了基于蓄量变化的闸门目标流量计算方法,采用南水北调东... 详细信息

【目的】解决渠道控制中以单个渠段蓄量为控制对象时,存在调蓄容量有限、相邻渠池间的蓄量变化无法相互调节的问题。【方法】提出一种等下游水深的多渠池蓄量平衡运行方式,并建立了基于蓄量变化的闸门目标流量计算方法,采用南水北调东线济平干渠为工程背景进行建模仿真验证。【结果】多渠池蓄量平衡模式下,对蓄量差乘以一定权重系数能有效降低闸门流量超调、缩短稳定时间;在正常运行工况下,该算法较常规下游常水位控制模式对渠首水库造成的调蓄压力更小,各无量纲性能指标整体较优,系统稳定时间最长缩短10 h;考虑流量变化较大的工况时,针对济平干渠渠池长度差异将近10倍的现状,发现增设节制闸减小单渠池长度后,该算法整体稳定时间进一步减小,各无量纲性能指标均不同程度提高。【结论】多渠池蓄量控制优于单个渠池蓄量控制,此算法为多渠池蓄量控制的进一步研究奠定基础。

关键词：渠系控制运行方式控制蓄量变目标水深南水北调东线济平干渠段

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居民健康卡注册管理系统设计

中国卫生信息管理杂志 2013年第3期10卷 200-204页

作者：郝惠英王存库管正涛陈益洲孟群卫生部统计信息中心北京市100044 江苏省卫生厅南京市210008 河南省卫生厅信息中心郑州市450003

本文通过审视居民健康卡与电子健康档案的内在有机联系,根据部、省、市(县)各级开展的居民健康卡注册管理业务需求与特点,提出了基于三级卫生信息平台的三级卡管系统架构设计、系统功能设计;还提出了系统为居民、卡管理机构、医疗卫生... 详细信息

本文通过审视居民健康卡与电子健康档案的内在有机联系,根据部、省、市(县)各级开展的居民健康卡注册管理业务需求与特点,提出了基于三级卫生信息平台的三级卡管系统架构设计、系统功能设计;还提出了系统为居民、卡管理机构、医疗卫生机构、其他机构带来的重要应用。为促进分级建设的卡注册管理系统实现互联互通,本文最后阐述了在系统建设中应依据的标准与规范内容,提出了开展卡管系统建设的几点思考。

关键词：居民健康卡系统架构功能设计

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福建省居民茶叶消费行为调查

林业经济问题 2016年第4期36卷 369-372页

作者：陈萍王宇婷管曦黄建锋安品弟蒋慧颖马玉仙杨江帆福建农林大学经济学院福州350002 福建农林大学茶叶科技与经济研究所福州350002 福建农林大学园艺学院福州350002

根据问卷调查对福建省居民的茶叶消费行为进行研究,从消费需求、购买价格等几方面揭示福建省居民茶叶消费的特点,分析影响福建省居民茶叶消费的主要因素。得出结论:福建省居民消费茶叶以乌龙茶为主,多选择在实体店购买1 000元/kg及以下... 详细信息

根据问卷调查对福建省居民的茶叶消费行为进行研究,从消费需求、购买价格等几方面揭示福建省居民茶叶消费的特点,分析影响福建省居民茶叶消费的主要因素。得出结论:福建省居民消费茶叶以乌龙茶为主,多选择在实体店购买1 000元/kg及以下品质优的"大众茶"。因此,在礼品茶消费大幅萎缩的情况下,开发适合老百姓消费得起的优质且普遍要求简化包装的"大众茶"显得尤为重要。

关键词：茶叶消费行为问卷调查