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A complete sequence and comparative analysis of a SARS-associated virus(Isolate BJ01)

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Chinese Science Bulletin 2003年第10期48卷 941-948页

作者： QIN E'de ZHU Qingyu YU Man FAN Baochang CHANG Guohui SI Bingyin YANG Bao PENG Wenming JIANG Tao LIU Bohua DENG Yongqiang LIU Hong ZHANG Yu WANG Cui LI Yuquan gan Yonghua LI Xiaoyu L Fushuang TAN gang CAO Wuchun YANG Ruifu WANG Jian LI Wei XU Zuyuan LI Yan WU Qingfa LIN Wei CHEN Weijun TANG Lin DENG Yajun HAN Yujun LI Changfeng LEI Meng LI Guoqing LI Wenjie L Hong SHI jianping TONG Zongzhong ZHANG Feng LI Songgang LIU Bin LIU Siqi DONG Wei WANG Jun gane K-S Wong YU Jun YANG Huanming Institute of Microbiology and Epidemiology Chinese Academy of Military Medical Sciences Beijing 100071 China Beijing Genomics Institute Chinese Academy of Sciences Beijing 101300 National Center for Genome Information Beijing 101300 China

The genome sequence of the Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS)-associated virus provides essential information for the identification of pathogen(s), exploration of etiology and evolution, interpretation of transmission and pathogenesis, development of diagnostics, prevention by future vaccination, and treatment by developing new drugs. We report the complete genome sequence and comparative analysis of an isolate (BJ01) of the coronavirus that has been recognized as a pathogen for SARS. The genome is 29725 nt in size and has 11 ORFs (Open Reading Frames). It is composed of a stable region encoding an RNA-dependent RNA polymerase (composed of 2 ORFs) and a variable region representing 4 CDSs (coding sequences) for viral structural genes (the S, E, M, N proteins) and 5 PUPs (putative uncharacterized proteins). Its gene order is identical to that of other known coronaviruses. The sequence alignment with all known RNA viruses places this virus as a member in the family of Coronaviridae. Thirty putative substitutions have been identified by comparative analysis of the 5 SARS- associated virus genome sequences in GenBank. Fifteen of them lead to possible amino acid changes (non-synonymous mutations) in the proteins. Three amino acid changes, with predicted alteration of physical and chemical features, have been detected in the S protein that is postulated to beinvolved in the immunoreactions between the virus and its host. Two amino acid changes have been detected in the Mprotein, which could be related to viral envelope formation. Phylogenetic analysis suggests the possibility of non-human origin of the SARS-associated viruses but provides noevidence that they are man-made. Further efforts should focus on identifying the etiology of the SARS-associated virus and ruling out conclusively the existence of otherpossible SARS-related pathogen(s).

关键词：比较分析 SARS 非典型肺炎冠状病毒病因学发病机理诊断学疫苗

多元线性回归分析数据可视化的R Studio软件实践

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中国循证医学杂志 2021年第4期21卷 482-490页

作者：李多多俞兴韩晟朱贺苑艺沈捷林景峰黎霞甘叶娜刘建平北京中医药大学东直门医院北京100700 北京大学药学院北京100191 北京大学医药管理国际研究中心北京100191 爱合健康科技(上海)有限公司上海200235 北京中医药大学第二临床医学院北京100078 北京中医药大学循证医学中心北京100029

目的为多元线性回归分析数据可视化提供方法参考。方法数据加载入R Studio软件后首先构建全域数据之间关系,进一步拟合自变量与因变量的线性关系,在确认观察值的独立性、因变量的正态性、变量间线性关系满足条件的基础上进行初步建模,... 详细信息

目的为多元线性回归分析数据可视化提供方法参考。方法数据加载入R Studio软件后首先构建全域数据之间关系,进一步拟合自变量与因变量的线性关系,在确认观察值的独立性、因变量的正态性、变量间线性关系满足条件的基础上进行初步建模,然后进行参数估计、多重共线性识别处理、显著性检验和残差分析来校正数据保证模型构建,最后运用模型进行预测。结果R Studio软件在实现多元线性回归分析较传统R语言软件具有更好的可视化功能和更简便的操作。结论R Studio软件在实现多元线性回归分析数据可视化中具有较好的应用价值。

关键词： R语言数据可视化 R Studio 医学多元线性回归分析

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细菌纤维素在食品工业中的应用研究进展

现代食品 2021年第16期6卷 23-28页

作者：吕橄赵文韬龚建萍武广珩武夷学院福建省生态产业绿色技术重点实验室福建武夷山354300 武夷学院生态与资源工程学院福建武夷山354300

细菌纤维素是由微生物产生的胞外多糖,与植物纤维素相比,具有高持水能力、高表面积、流变学特性以及生物相容性等优良特性。本文对细菌纤维素的生物合成、菌株选育及应用进行了论述,并提出了其在生产应用中的潜在挑战。

关键词：细菌纤维素生物合成菌株选育食品工业

白细胞介素-13RS20541位点基因多态性与肠道病毒71型感染手足口病相关性

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中华实用儿科临床杂志 2017年第10期32卷 763-766页

作者：康美华龚晓辉甘拓域王成段建平陈丽霞湘潭市中心医院儿科 411100 湘潭市中心医院分子生物室 411100 中南大学湘雅二医院儿童医学中心儿童心血管专科长沙410011

目的探讨白细胞介素－13RS20541（IL－13RS20541）位点基因多态性与肠道病毒71型（EV71）感染手足口病的关系。方法以湘潭市中心医院123例确诊为EV71感染患儿为试验组，并根据其病情轻重分为轻症EV71感染组（轻症组，62例），重症EV71... 详细信息

目的探讨白细胞介素－13RS20541（IL－13RS20541）位点基因多态性与肠道病毒71型（EV71）感染手足口病的关系。方法以湘潭市中心医院123例确诊为EV71感染患儿为试验组，并根据其病情轻重分为轻症EV71感染组（轻症组，62例），重症EV71感染组（重症组，61例）。按年龄和性别匹配同期健康体检儿童52例为对照（健康对照组）。留取静脉血2 mL，－80 ℃冰箱冻存。送北京优博兰基因公司进行DNA提取及使用SNaPshot技术进行IL－13基因型检测。采用SPSS 18.0软件进行数据处理和分析。结果IL－13RS20541位点存在AA、GA、GG 3种基因型；试验组AA、GA、GG频率分别为4.07%、44.71%、51.22%，与健康对照组（AA、GA、GG频率分别为11.54%、32.69%和55.77%）比较差异无统计学意义（χ^2＝4.676，P〉0.05）；试验组等位A、G频率为26.42%、73.58%，与健康对照组（27.88%、72.12%）比较差异无统计学意义（χ^2＝0.080，P〉0.05）。EV71感染所致轻症组、重症组和健康对照组3组间基因型频率[（AA＋GA）分别为53.22%、44.26%、44.23%；GG分别为46.78%、55.74%、55.77%]及等位基因频率（A频率：30.65%、22.13%、27.88%；G频率：69.35%、77.87%、72.12%）比较差异均无统计学意义（χ^2＝1.294、2.349，均P〉0.05）。结论IL－13RS20541位点基因多态性与EV71易感性及EV71致病严重程度之间无明显相关性。

关键词：手足口病肠道病毒71型白细胞介素-13 基因多态性

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磨溪008-H21井斜井段钻井提速实践

钻采工艺 2017年第6期40卷 32-34页

作者：涂建平甘霖李锐中国石油川庆钻探工程公司川西钻探公司中国石油西南油气田分公司安全环保与技术监督研究院

四川磨溪气田龙王庙气藏,垂深超过4 600 m,该地区水平井定向段岩石可钻性差、栖霞组易漏、造斜率低、托压严重、储层垂深差异大,对水平井钻井技术提出了更高要求。磨溪008-H21井是磨溪构造东高点高部位的一口水平井,通过优化设计轨迹、... 详细信息

四川磨溪气田龙王庙气藏,垂深超过4 600 m,该地区水平井定向段岩石可钻性差、栖霞组易漏、造斜率低、托压严重、储层垂深差异大,对水平井钻井技术提出了更高要求。磨溪008-H21井是磨溪构造东高点高部位的一口水平井,通过优化设计轨迹、基于滑动方式的井眼轨迹控制技术优化、钻头和螺杆优选、防托压技术、先进高温高压MWD仪器应用,解决了高温环境下井眼轨迹的测量及控制问题。根据地层岩性特点调整钻井液性能,满足了磨溪深井水平井高温稳定性、携砂和润滑性要求。通过磨溪008-H21井斜井段定向钻井施工,总结了一套适合磨溪地区龙王庙水平井斜井段钻井技术。

关键词：井眼轨迹控制微摆减阻螺杆混镶PDC钻头狮虎兽钻头

Spin injection into heavily-doped n-gan via Schottky barrier

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Journal of Semiconductors 2023年第8期44卷 57-61页

作者： Zhenhao Sun Ning Tang Shuaiyu Chen Fan Zhang Haoran Fan Shixiong Zhang Rongxin Wang Xi Lin jianping Liu Weikun Ge Bo Shen State Key Laboratory of Artificial Microstructure and Mesoscopic Physics School of PhysicsPeking UniversityBeijing 100871China Frontiers Science Center for Nano-optoelectronics&Collaboration Innovation Center of Quantum Matter Peking UniversityBeijing 100871China Suzhou Institute of Nano-Tech and Nano-Bionics(SINANO) Chinese Academy of SciencesSuzhou 215123China International Center for Quantum Materials Peking UniversityBeijing 100871China

Spin injection and detection in bulk gan were investigated by performing magnetotransport measurements at low temperatures.A non-local four-terminal lateral spin valve device was fabricated with Co/gan Schottky *** spin injection efficiency of 21%was achieved at 1.7 *** was confirmed that the thin Schottky barrier formed between the heavily ndoped gan and Co was conducive to the direct spin tunneling,by reducing the spin scattering relaxation through the interface states.

关键词： gan spin injection Schottky barrier magnetoresistance

RFID在道路交通信息实时采集系统中的应用

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公路交通技术 2012年第3期28卷 125-129页

作者：甘琴瑜周建平梁楚华王兵新疆大学机械工程学院乌鲁木齐830047

为实现城市道路路段及交叉路口的交通流量统计、行驶机动车辆监管、交通拥堵状况缓解,提出采用非接触式、自动化识别、双向通信射频识别(RFID)技术对路网上的行驶车辆进行实时信息采集和数据信息交互,并结合物联网无线传感网络技术,将... 详细信息

为实现城市道路路段及交叉路口的交通流量统计、行驶机动车辆监管、交通拥堵状况缓解,提出采用非接触式、自动化识别、双向通信射频识别(RFID)技术对路网上的行驶车辆进行实时信息采集和数据信息交互,并结合物联网无线传感网络技术,将获取的信息发送到后台信息处理中心,再将数据信息通过全球定位系统或交通诱导信息系统提供给交通参与者,使其合理选择最优路径,快速、准确地到达目的地。研究结果表明,RFID技术应用于实时动态交通信息采集比较可行。将RFID技术与物联网技术相结合并应用于智能交通,可为智能交通物联网的发展和实现提供一定的思路。

关键词：交通工程交通信息采集交通信息诱导射频识别技术智能交通物联网

2015—2018年厦门市海沧区游泳池水质监督抽检结果分析

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中国卫生监督杂志 2019年第4期26卷 362-366页

作者：吴晓军谢石荣温建平干红芳陈清金甘伟厦门市海沧区卫生和计划生育监督所福建厦门361026 厦门大学附属妇女儿童医院厦门市妇幼保健院福建厦门361003 厦门市海沧区卫生健康局福建厦门361026

目的对厦门市海沧区2015—2018年游泳池水质监督抽检结果进行对比分析,对检测指标进行相关研究,为进一步加强卫生监督管理提供科学依据。方法2015—2018年厦门市海沧区共抽取水样181份,依据相关检验标准对细菌总数、大肠菌群、pH值、游... 详细信息

目的对厦门市海沧区2015—2018年游泳池水质监督抽检结果进行对比分析,对检测指标进行相关研究,为进一步加强卫生监督管理提供科学依据。方法2015—2018年厦门市海沧区共抽取水样181份,依据相关检验标准对细菌总数、大肠菌群、pH值、游离性余氯、浑浊度、尿素6项指标进行检测,对4年来水质抽检结果进行回顾性分析。结果2015—2018年4年间厦门市海沧区监督抽检总合格率为65.7%,各年度合格率分别为38.7%、57.4%、76%、79.2%,差异有统计学意义(χ2=18.122,P=0.000)。不同指标的总合格率为浑浊度100%,大肠菌群100%,细菌总数99.4%,尿素96.7%,pH值91.7%,游离性余氯69.6%,差异具有统计学意义(χ2=192.8,P=0.000),其中尿素、pH值、游离性余氯3项指标不同年度间合格率差异具有统计学意义(P<0.05)。成人泳池水质合格率高于儿童泳池(χ2=9.600,P=0.002),不同经营类型的游泳池水质合格率差异有统计学意义(χ2=12.525,P=0.006)。游离性余氯与尿素(r=-0.318,P=0.000)、pH值(r=-0.338,P=0.000)和细菌总数(r=-0.524,P=0.000)均呈负相关,尿素与细菌总数(r=0.414,P=0.000)和pH值(r=0.298,P=0.000)均呈正相关,相关性具有统计学意义。结论厦门市海沧区游泳池水质状况逐步改善,但仍不容乐观,应进一步改进工作方法,推进游泳池水在线监测,居民小区内设游泳池和体育健身游泳池为监测重点区域,尿素、pH值和游离性余氯为监测项目的关键性指标。

关键词：游泳池水质监督抽检

Timing and Single-pulse Study of Pulsar J1909+0122 Discovered by CRAFTS

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Research in Astronomy and Astrophysics 2023年第8期23卷 319-331页

作者： Yutong Chen Pei Wang Di Li Erbil Gügercinoğlu Rushuang Zhao Lingqi Meng jianping Yuan Jiarui Niu Weiwei Zhu Yi Feng Chenchen Miao Chenhui Niu Qingdong Wu Na Wang Shen Wang Xiaoyao Xie Mengyao Xue Jumei Yao Mao Yuan Shanping You Xuhong Yu Youling Yue Jie Zhang Junshuo Zhang Lei Zhang Yabiao Wang Zhenye gan Yuxi Li Zhongyi Sun Chengjie Wang National Astronomical Observatories Chinese Academy of SciencesBeijing 100101China University of Chinese Academy of Sciences Beijing 100049China Institute for Frontiers in Astronomy and Astrophysics Beijing Normal UniversityBeijing 102206China Research Center for Intelligent Computing Platforms Zhejiang LaboratoryHangzhou 311100China Guizhou Normal University Guiyang 550001China Xinjiang Astronomical Observatory Chinese Academy of SciencesUrumqi 830011China College of Physical Science and Technology Central China Normal UniversityWuhan 430079China Fudan University Shanghai 200443China Qilu Normal University Jinan 250200China Tencent Youtu Lab Shanghai 200233China

We report the discovery of PSR J1909+0122 by the Five-hundred-meter Aperture Spherical Radio Telescope(FAST)as part of the Commensal Radio Astronomy FAST *** J1909+0122 has a spin period of 1.257 s and a dispersion measure of 186.2 pc cm^(-3).The averaged pulse profile shows two distinct *** performed a single-pulse study based on a one-hour observation at 1.25 GHz on 2021 August *** used a threshold of 5σ_(ep) to measure the nulling fraction(NF)as 63%±1.5%.The longitude-resolved fluctuation spectra and fast Fourier transform spectra of the binary sequences revealed the quasi-periodicity of nulling with a period of 30 rotation *** examined the reliability of the periodicity by comparing it to random noise *** NF,E,and modulation periodicity P_(M) of PSR J1909+0122 were compared with other periodic nulling pulsars,showing that the source of J1909+0122 has the second largest NF in the ***-term timing observations over six months were used to derive the phase-connected ephemeris of this *** measured P and P values disfavor dipolar geometry for polar gap models,and the prediction for a space-charge-limited flow model in the case of inverse Compton scattering is only just above the death *** this work,PSR J1909+0122 has revealed possible correlations between nulling behavior and pulsar properties,which will help to shed light on the pulsar emission mechanism and its temporal evolution in future observations.

关键词： (stars:)pulsars general-(stars:)pulsars individual(PSR J1909+0122)-stars neutron