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Diversity, novelty, antimicrobial activity, and new antibiotics of cultivable endophytic actinobacteria isolated from psammophytes collected from Taklamakan Desert

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Journal of Pharmaceutical Analysis 2021年第2期11卷 241-250页

作者： Ting Wang feina li Qinpei Lu Gang Wu Zhongke Jiang Shaowei liu Xugela Habden Elizaveta A.Razumova Ilya A.Osterman Petr V.Sergiev Olga A.Dontsova Xinxin Hu Xuefu You Chenghang Sun Institute of Medicinal Biotechnology Chinese Academy of Medical Sciences&Peking Union Medical CollegeBeijing100050China Beijing Key Laboratory of Antimicrobial Agents Institute of Medicinal BiotechnologyChinese Academy of Medical Sciences&Peking Union Medical CollegeBeijing100050China College of life Science Xinjiang Normal UniversityUrumchi830054China Lomonosov Moscow State University Moscow119992Russia Center of life Sciences Skolkovo Institute of Science and TechnologyMoscow143025Russia Shemyakin-Ovchinnikov Institute of Bioorganic Chemistry Russian Academy of SciencesMoscow119992Russia

Three hundred and twenty endophytic actinobacterial strains were isolated from psammophytes collected from Taklamakan Desert and identified. Among them, three strains already had been identified as new species of two genera and sixteen isolates showed relatively low 16 S rRNA similarities lidly described species. Seventy-five of the isolates were selected as representative strains to screen antibacterial activity and mechanism. Forty-seven strains showed antagonistic activity against at least one of the indicator bacteria. Two Streptomyces strains produced bioactive compounds inducing DNA damage, and two Streptomyces strains produced bioactive compounds with inhibitory activity on protein biosynthesis. Notably, the strain Streptomyces sp. 8P21H-1 that demonstrated both strong antibacterial activity and inhibitory activity on protein biosynthesis was prioritized for exploring new *** the strategy of integrating genetics-based discovery program and MS/MS-based molecular networking, two new streptogramin-type antibiotics, i.e., acetyl-griseoviridin and desulphurizing griseoviridin, along with known griseoviridin, were isolated from the culture broth of strain 8P21H-1. Their chemical structures were determined by HR-MS, and 1D and 2D NMR. Desulphurizing griseoviridin and griseoviridin exhibited antibacterial activities by inhibiting translation.

关键词： Taklamakan desert Endophytic actinobacteria Novelty Diversity Streptogramin-type antibiotic

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水通道蛋白5在免疫调控中的研究进展

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标记免疫分析与临床 2022年第10期29卷 1777-1783页

作者：王晓彤李飞娜申晨国家儿童医学中心国家呼吸系统疾病临床医学研究中心教育部儿科重大疾病研究重点实验室首都医科大学附属北京儿童医院北京市儿科研究所儿童呼吸道感染性疾病研究北京市重点实验室、呼吸疾病研究室北京100045

水通道蛋白5(aquaporin 5,AQP5)作为一个多次跨膜通道蛋白,在多个器官中表达,在水分子的跨膜转运中发挥着重要的生理和病理作用。已有的研究提示,AQP5在感染性疾病、自身免疫性疾病、肿瘤等疾病的免疫应答中可能发挥重要作用。本文就AQP... 详细信息

水通道蛋白5(aquaporin 5,AQP5)作为一个多次跨膜通道蛋白,在多个器官中表达,在水分子的跨膜转运中发挥着重要的生理和病理作用。已有的研究提示,AQP5在感染性疾病、自身免疫性疾病、肿瘤等疾病的免疫应答中可能发挥重要作用。本文就AQP5在炎症免疫、感染免疫和肿瘤免疫的相关研究进展进行综述,以期指导临床诊疗。

关键词：水通道蛋白5 组织分布亚细胞定位感染与炎症免疫

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肺炎支原体P1黏附蛋白结构与功能及其致病性的研究新进展

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标记免疫分析与临床 2023年第9期30卷 1601-1604页

作者：王晓彤李飞娜申晨国家儿童医学中心国家呼吸系统疾病临床医学研究中心教育部儿科重大疾病研究重点实验室首都医科大学附属北京儿童医院北京市儿科研究所儿童呼吸道感染性疾病研究北京市重点实验室呼吸疾病研究室北京100045

肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae,MP)是一种基因组较小的微小生物,它是最小的可自由生活、无细胞壁、可自我复制的原核生物。MP是引起社区获得性肺炎(community-acquired pneumonia,CAP)的常见病原体,可侵犯呼吸道引起喉炎、咽炎、支... 详细信息

肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae,MP)是一种基因组较小的微小生物,它是最小的可自由生活、无细胞壁、可自我复制的原核生物。MP是引起社区获得性肺炎(community-acquired pneumonia,CAP)的常见病原体,可侵犯呼吸道引起喉炎、咽炎、支气管炎、非典型肺炎和加重哮喘,亦可引起肺外并发症。MP通过黏附细胞器黏附于宿主呼吸道上皮细胞从而破坏气道黏膜的完整性和免疫防御功能,P1蛋白作为一个关键黏附蛋白,不仅在MP与宿主细胞黏附过程中发挥重要作用,还参与MP在气道表面的滑行和在气道的定殖和致病性。本文对P1蛋白的结构、功能及其致病性等方面进行综述,重点关注P1蛋白参与MP黏附、滑行和致病的作用机制。

关键词：肺炎支原体 P1黏附蛋白儿童致病机制唾液酸

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儿童耐药结核病诊治研究进展

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结核与肺部疾病杂志 2022年第5期3卷 403-405页

作者：郑惠文李飞娜申晨国家儿童医学中心国家呼吸系统疾病临床医学研究中心教育部儿科重大疾病研究重点实验室/首都医科大学附属北京儿童医院北京市儿科研究所儿童呼吸道感染性疾病研究北京市重点实验室呼吸疾病研究室北京100045

耐药结核病是严重危害儿童健康的重要疾病之一。儿童结核病患者临床症状不典型、细菌载量低、病原学难以确诊,在诊断和治疗上均存在较大困难,对结核病防控构成了严重的威胁。作者对儿童耐药结核病诊断与治疗最新进展进行综述。

关键词：结核儿童结核,抗多种药物性综述文献(主题)

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结核分枝杆菌Rv1973重组载体构建及其异源性表达

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标记免疫分析与临床 2022年第12期29卷 2107-2111,2153页

作者：王晓彤李飞娜陈豪申晨国家儿童医学中心国家呼吸系统疾病临床医学研究中心教育部儿科重大疾病研究重点实验室首都医科大学附属北京儿童医院北京市儿科研究所儿童呼吸道感染性疾病研究北京市重点实验室、呼吸疾病研究室北京100045

目的Rv1973是人型结核分枝杆菌(***,Mt)RD区(region of differences)基因表达的一个外膜蛋白(OMP),其功能尚不明确。分枝杆菌和革兰氏阴性菌的外膜结构与其毒力、耐药性等常密切相关。本研究拟构建Mt-Rv1973及其耻垢分枝杆菌(***,Ms)同... 详细信息

目的Rv1973是人型结核分枝杆菌(***,Mt)RD区(region of differences)基因表达的一个外膜蛋白(OMP),其功能尚不明确。分枝杆菌和革兰氏阴性菌的外膜结构与其毒力、耐药性等常密切相关。本研究拟构建Mt-Rv1973及其耻垢分枝杆菌(***,Ms)同源基因MSMEG_0353(Ms-Rv1973)重组表达载体并建立其异源性表达的菌株,用于目的蛋白的诱导表达及其生物学功能的相关研究。方法将密码子优化的Mt-Rv1973与Ms-Rv1973的编码序列重组入pMAL-c6T载体并转化入低内毒素的ClearColi BL21(DE3)大肠杆菌中获得异源性Mt-Rv1973与Ms-Rv1973融合表达菌株,并通过对目的蛋白进行诱导表达、SDS-PAGE分析和液相色谱-质谱(LC-MS)鉴定、Ni2+亲和层析和标签切割等获得纯化的目的蛋白。结果成功构建了Mt-Rv1973与Ms-Rv1973表达载体和异源性表达菌株,并经诱导表达和纯化获得了目的蛋白。结论为研究该蛋白的功能奠定了基础。

关键词：结核分枝杆菌外膜蛋白载体构建蛋白纯化

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Aqp5-C末端截断小鼠的构建及其潜在应用

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标记免疫分析与临床 2024年第1期31卷 142-150页

作者：王晓彤陈豪李德泽李飞娜郑惠文李晶晶丁谦文申晨国家儿童医学中心国家呼吸系统疾病临床医学研究中心教育部儿科重大疾病研究重点实验室首都医科大学附属北京儿童医院北京市儿科研究所儿童呼吸道感染性疾病研究北京市重点实验室呼吸疾病研究室北京100045 首都医科大学附属北京口腔医院首都医科大学北京100050

目的 Aqp5蛋白的C末端结构对其功能的发挥起着重要作用。本研究旨在通过构建Aqp5-C末端6个氨基酸缺失的突变小鼠,验证Aqp5-C末端6个氨基酸缺失对该蛋白亚细胞定位的影响,并初步比较研究此突变小鼠的肺脏组织结构和转录组的改变,探讨该... 详细信息

目的 Aqp5蛋白的C末端结构对其功能的发挥起着重要作用。本研究旨在通过构建Aqp5-C末端6个氨基酸缺失的突变小鼠,验证Aqp5-C末端6个氨基酸缺失对该蛋白亚细胞定位的影响,并初步比较研究此突变小鼠的肺脏组织结构和转录组的改变,探讨该突变小鼠用于Aqp5功能研究的潜在应用价值。方法采用基于gRNA的CRISPER Cas 9技术构建Aqp5末端6个氨基酸缺失的突变小鼠(Aqp5-p.I260*)并进行序列鉴定,采用组织切片、荧光染色和显微镜观察等手段明确突变蛋白在肺泡上皮细胞的亚细胞定位和突变小鼠肺组织结构,采用转录组测序研究突变小鼠肺脏基因差异表达。结果本研究成功构建了Aqp5蛋白C末端截断小鼠,发现p.I260*改变了亚细胞定位,Aqp5-p.I260*鼠肺泡数目少于野生鼠;Aqp5-p.I260*小鼠肺组织的转录组上调基因主要富集于发育和造血细胞谱系等通路,其Aqp5功能缺陷后诱发炎症相关通路基因(Hspa1a、IL-1β、Col3a1等)的表达水平改变。结论本研究在体验证了小鼠Aqp5蛋白C末端6个氨基酸缺失突变对该蛋白细胞膜定位的关键作用,表明了以该小鼠作为Aqp5功能缺陷模型探讨Aqp5蛋白在肺发育和骨髓造血、炎症和免疫调节等生物学功能的潜在应用价值。

关键词：水通道蛋白5 基因突变细胞膜小鼠模型转录组

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基于SAT技术探讨新冠肺炎疫情下北京地区儿童肺炎支原体感染流行病学特征

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标记免疫分析与临床 2022年第7期29卷 1089-1092,1147页

作者：李飞娜郑惠文杨海明肖婧李洁琼陈玉莹刘秀云申晨国家儿童医学中心国家呼吸系统疾病临床医学研究中心教育部儿科重大疾病研究重点实验室首都医科大学附属北京儿童医院北京市儿科研究所儿童呼吸道感染性疾病研究北京市重点实验室呼吸疾病研究室北京100045 国家儿童医学中心国家呼吸系统疾病临床研究中心首都医科大学附属北京儿童医院呼吸二科北京100045 国家儿童医学中心国家呼吸系统疾病临床研究中心首都医科大学附属北京儿童医院呼吸一科北京100045

目的研究北京地区儿童肺炎支原体(MP)感染情况和流行病学特征,为新冠肺炎疫情下本地区MP感染的防治提供理论依据。方法选择2018年1月至2021年12月在首都医科大学附属北京儿童医院就诊的5951例社区获得性肺炎患儿为研究对象。所有患儿采... 详细信息

目的研究北京地区儿童肺炎支原体(MP)感染情况和流行病学特征,为新冠肺炎疫情下本地区MP感染的防治提供理论依据。方法选择2018年1月至2021年12月在首都医科大学附属北京儿童医院就诊的5951例社区获得性肺炎患儿为研究对象。所有患儿采集咽拭子标本,采用实时荧光核酸恒温扩增技术(SAT)检测MP靶标RNA。结果5951例患儿的MP总检出率为36.62%(2179/5951)。4年中MP出现一次暴发流行(2018年至2019年),流行年检出率可高达42.81%。新冠肺炎疫情爆发后,MP感染率明显降低;不同季节MP检出率差异具有统计学意义(P0.05)。结果MP是北京地区儿童社区获得性肺炎的主要病原体,其分布特点具有季节、年龄和性别差异。新冠肺炎疫情下,MP感染率明显降低,但无显著性别差异,且高发季节发生改变。

关键词：肺炎支原体儿童流行病学特点北京

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Taste mechanism of kokumi peptides from yeast extracts revealed by molecular docking and molecular dynamics simulation

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Journal of Future Foods 2022年第4期2卷 358-364页

作者： Jincui Chang Tao Feng Haining Zhuang Shiqing Song Min Sun lingyun Yao Huatian Wang feina Hou Jian Xiong Fan li Pei li Wenhui Zhu School of Perfume and Aroma Technology Shanghai Institute of TechnologyShanghai 201418China School of Health and Social Care Shanghai Urban Construction Vocational CollegeShanghai 201415China Angel Yeast Co. Ltd.Yichang 443000China College of Food Science and Engineering Bohai UniversityJinzhou 121013China

Peptides have been used as flavors for decades,however,their tasting mechanism remains not entirely *** the present work,10 kokumi peptides identified in yeast extracts were selected as *** binding mechanism to calcium-sensitive receptors(CaSR)were investigated at molecular level by using molecular docking and molecular dynamics *** results showed that all kokumi peptides could bind to CaSR to form complexes,of whichγ-Glu-Cys-Gly(GSH),γ-Glu-Leu(EL)andγ-Glu-Tyr(EY)being the top 3 peptides with higher ***66,Ser147 and Ala168 may be the active sites of CaSR and interact with CaSR through hydrogen bonds;the different kokumi peptides and CaSR mainly rely on hydrogen bonding,electrostatic interaction and hydrophobic interaction to bind each *** study provides a theoretical reference for the interaction between kokumi peptides and their receptors.

关键词： Kokumi peptides Yeast extracts Calcium-sensitive receptor Molecular docking Molecular dynamics simulation

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单电子束双波段同轴相对论返波管粒子模拟

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强激光与粒子束 2013年第5期4卷 1184-1188页

作者：唐永福蒙林李海龙张斐娜电子科技大学物理电子学院成都610054

设计了一种能在C波段和X波段实现稳定双频输出的带有非对称谐振反射腔的单电子束同轴相对论返波振荡器。采用耦合阻抗跃变型慢波结构,使用粒子PIC模拟软件进行了粒子模拟研究。模拟结果显示:轴向电场在系统中的分布得到改进,电子束的能... 详细信息

设计了一种能在C波段和X波段实现稳定双频输出的带有非对称谐振反射腔的单电子束同轴相对论返波振荡器。采用耦合阻抗跃变型慢波结构,使用粒子PIC模拟软件进行了粒子模拟研究。模拟结果显示:轴向电场在系统中的分布得到改进,电子束的能散得到改善。在电子束电压511kV,电流8.95kA,引导磁场0.73T的条件下,双频器件实现了8.09GHz和9.91GHz的双波段频率稳定输出,平均功率为1.0GW,波束互作用效率为21.9%,效率高于空心双波段返波管及其他双波段器件。器件辐射功率的拍频为1.82GHz,拍波更为明显和稳定。模拟研究中同时发现,随着慢波结构之间漂移段的变化,双频频率都呈现一种准周期的变化。

关键词：同轴相对论返波管双波段耦合阻抗跃变粒子模拟

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X波段高效双频同轴相对论返波管粒子模拟

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强激光与粒子束 2012年第10期24卷 2415-2419页

作者：唐永福蒙林李海龙王彬殷勇张斐娜电子科技大学物理电子学院成都610054

提出了一种能在X波段实现稳定双频输出的带有谐振反射器的高效率同轴相对论返波振荡器,并使用2.5维全电磁粒子PIC模拟软件进行了粒子模拟研究。模拟结果显示:在电子束电压520kV、电流8.5kA、轴向引导磁场2.35T的条件下,器件实现了9.41GH... 详细信息

提出了一种能在X波段实现稳定双频输出的带有谐振反射器的高效率同轴相对论返波振荡器,并使用2.5维全电磁粒子PIC模拟软件进行了粒子模拟研究。模拟结果显示:在电子束电压520kV、电流8.5kA、轴向引导磁场2.35T的条件下,器件实现了9.41GHz和10.29GHz的稳定双频输出,平均输出功率为1.35GW,波束互作用效率为30.5%。此外,双频频谱及双频中较小的频率随着漂移段的变化而准周期地变化,实现了带宽约400MHz的频率捷变输出。

关键词：同轴相对论返波管谐振反射器双频高效率粒子模拟频率捷变

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