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Profiling of the assembly of RecA nucleofilaments implies a potential target for environmental factors to disturb DNA repair

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Journal of Environmental Sciences 2021年第4期33卷 283-290页

作者： Zheng yuan fangzhi yu Dapeng Zhang Hailin Wang Research Center for Eco-Environmental Sciences Chinese Academy of SciencesBeijing 100085China University of Chinese Academy of Sciences Beijing 100049China Institute of Environment and Health Jianghan UniversityWuhan 430056China Institute of Environment and Health Hangzhou Institute for Advanced StudyUCASHangzhou 430056China

Double-strand breaks(DSBs),one class of the most harmful DNA damage forms that bring elevated health risks,need to be repaired timely and ***,an increasing number of environmental pollutants have been identified to impair DSB repair from various *** previous work indicated that the formation of unsaturated Rec A nucleofilaments plays an essential role in homology recombination(HR) pathway which can accurately repair *** this study,by developing a benzonase cutting protection assay and combining it with traditional electrophoretic mobility shift assay(EMSA) analysis,we further investigated the assembly patterns of four Rec A mutants that display differential DSB repair ability and ATPase *** observed that the mutants(G204S and S69G) possessing both ATP hydrolysis and DSB repair activities form unsaturated nucleofilaments similar to that formed by the wild type Rec A,whereas the other two ATP hydrolysis-deficient mutants(K72R and E96D) that fail to mediate HR form more compacted nucleofilaments in the presence of *** results establish a coupling of ATPase activity and effective DSB repair ability via the assembly status of Rec A *** linkage provides a potential target for environmental factors to disturb the essential HR pathway for DSB repair by suppressing the ATPase activity and altering the assembly pattern of nucleofilaments.

关键词： DNA double-strand breaks(DSBs) RecA assembly Homology recombination(HR) ATP hydrolysis DNA damage repair Environmental health

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An AND-Gate DNA Nanodevice for Dual Protein-Mediated,Tumor-Specific Imaging

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Chinese Journal of Chemistry 2023年第12期41卷 1437-1442页

作者： Zetan Fan fangzhi yu Mingming yu Lele Li CAS Key Laboratory for Biomedical Effects of Nanomaterials and Nanosafety National Center for Nanoscience and Technology Beijing 100190 China Beijing Municipal Pollution Source Management Center Beijing 100089 China Green Catalysis Center and College of Chemistry Zhengzhou University Zhengzhou Henan 450001 China

Sensitive and specific imaging of tumor-associated biomarkers offers an effective way for cancer ***,most of the reported imaging probes are limited to the targeting of a single biomarker,which may impair imaging ***,we report an aptamer-based,AND-gate DNA nanodevice that relies on the sequential processing of two tumor-associated proteins to produce a specific fluorescent signal for precise tumor *** DNA nanodevice integrates an AS1411 aptamer to bind cell surface nucleolin for tumor targeting and a DNA sensor to respond to intracellular apurinic/apyrimidinic endonuclease 1 for activatable *** evaluated the performance of the system in both living cells and a tumor-bearing mouse model,and demonstrated its capability in tumor cell-specific *** anticipate that this strategy will accelerate the design of multivariate protein-stimulated probes for tumor diagnosis.

关键词： Aptamer DNA nanodevice Protein Sensor Bioimaging

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Preparation and Characterization of pH-Responsive Charge Reversal Nanocomposite for miRNA Delivery

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Journal of Wuhan University of Technology(Materials Science) 2024年第4期39卷 1048-1052页

作者：余丹 YE Liyuan LI Binbin MOU fangzhi 殷义霞 State Key Laboratory of Advanced Technology for Materials Synthesis and Processing Wuhan University of TechnologyWuhan 430070China Hainan Institute Wuhan University of TechnologySanya 572000China Biomedical Materials and Engineering Research Center of Hubei Province Wuhan University of TechnologyWuhan 430070China

pH-responsive charge reversal loaded miRNA nanocomposite was prepared by electrostatic *** morphology,particle size and zeta potential of the nanocomposites were analyzed by transmission electron microscopy and dynamic light *** synthesis of the polymer was analyzed by^(1)*** zeta-potential changes and cellular uptake effects of the nanocomplexes under different pH environments were *** experimental results show that the surface morphology of the nanocomposite is spherical,and the average particle size is about 135 *** the pH value of the solution gradually decreases,the surface charge of the nanocomposite reverses from negative charge to positive charge(from-9.4 to+17.1 mV).Cellular uptake mediated by pH-responsive nanocomposite is selective for tumor cells,and the cellular uptake effect in tumor cells at pH 6.5 was approximately 3 times higher than that at pH *** pH responsive charge reversal nanocomposite has promising application prospects for gene delivery in the weak acid environment of tumors.

关键词： charge conversion siRNA delivery pH responsive cancer therapy

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基于DNA与上转换纳米颗粒相结合的生物传感与成像研究进展

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高等学校化学学报 2022年第12期43卷 282-289页

作者：赵恒智余方志李翔菲李乐乐国家纳米科学中心中国科学院纳米生物效应与安全性重点实验室北京100190

脱氧核糖核酸(DNA)的分子识别特性与功能使其在生物传感与成像领域得到了广泛应用.另一方面,得益于自身独特的光学性质,镧系元素掺杂的上转换纳米颗粒在生物医学应用中备受关注.特别地,二者的有机结合可产生新的性质与功能,在生物传感... 详细信息

脱氧核糖核酸(DNA)的分子识别特性与功能使其在生物传感与成像领域得到了广泛应用.另一方面,得益于自身独特的光学性质,镧系元素掺杂的上转换纳米颗粒在生物医学应用中备受关注.特别地,二者的有机结合可产生新的性质与功能,在生物传感与成像领域展现出优势,推动了该领域的发展.本文综合评述了基于DNA与上转换纳米颗粒相结合的生物传感与成像技术的研究进展,重点聚焦于相关方法的分类与设计原理,简要概述了相关的应用研究,并对该领域目前存在的挑战与未来的发展前景进行了讨论.

关键词：上转换纳米颗粒脱氧核糖核酸生物传感器生物成像纳米探针

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亲和毛细管电泳技术在蛋白质-DNA相互作用研究中的应用

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色谱 2020年第10期38卷 1133-1142页

作者：余方志章大鹏袁征赵强汪海林中国科学院生态环境研究中心环境化学与生态毒理学国家重点实验室北京100085 中国科学院大学北京100049

蛋白质-DNA的相互作用在决定细胞命运的许多过程中发挥重要作用,对蛋白质-DNA相互作用的分子机制研究有利于对基本生命过程的理解,为相关疾病的临床治疗及药物筛选提供理论指导。另一方面,利用一些已知的蛋白质-DNA相互作用可以帮助开... 详细信息

蛋白质-DNA的相互作用在决定细胞命运的许多过程中发挥重要作用,对蛋白质-DNA相互作用的分子机制研究有利于对基本生命过程的理解,为相关疾病的临床治疗及药物筛选提供理论指导。另一方面,利用一些已知的蛋白质-DNA相互作用可以帮助开发先进的生物工程和生命分析技术,为相关研究提供有力的技术支持。因此,建立灵敏、快速的分析方法用于表征蛋白质-DNA的相互作用十分重要。高效毛细管电泳(capillary electrophoresis,CE)技术因其超高的分离效率、极低的样品消耗与较短的分析时间等优势被广泛应用于化学、生命科学和环境科学等多个研究领域。其中,亲和毛细管电泳(affinity capillary electrophoresis,ACE)技术已经成为考察分子间相互作用的重要研究工具。这篇文章综述了亲和毛细管电泳技术自建立以来在蛋白质-DNA相互作用分析方面的研究进展,并对经典的研究工作进行了着重介绍,主要包括三方面的内容:(1)亲和毛细管电泳技术简介;(2)利用亲和毛细管电泳技术进行蛋白质-DNA相互作用的基础分子机制研究;(3)利用已知的蛋白质-DNA相互作用发展针对目标分子及目标反应的亲和毛细管电泳检测技术。本文还对该领域的未来发展趋势进行了展望与探讨,提出应从以下两个方面增强亲和毛细管电泳技术的分析能力:(1)充分发挥CE技术样品消耗少和高通量等优势,分别发展针对少量珍贵生物样品的高灵敏检测方法和针对大量未知因素的高通量筛选方法;(2)结合DNA测序及质谱技术快速筛选、鉴定未知的蛋白质-DNA相互作用的精确靶点。

关键词：亲和毛细管电泳蛋白质-DNA相互作用亲和分析综述

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近视眼黄斑区视网膜厚度的研究

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眼科研究 2008年第6期26卷 436-438页

作者：李娜廖华萍俞方知王玲上海交通大学医学院附属瑞金医院眼科上海瑞视眼科中心 200025

目的探讨近视眼黄斑区视网膜厚度的特点。方法122例除视盘旁近视弧外无其他眼部异常的近视患者,等效球镜度数-1.50^-15.25D(-6.18±2.61)D,每例随机选取1眼受检。所有受检眼行屈光检查和眼轴长度测定。将黄斑区分为9个区域,测定各区域... 详细信息

目的探讨近视眼黄斑区视网膜厚度的特点。方法122例除视盘旁近视弧外无其他眼部异常的近视患者,等效球镜度数-1.50^-15.25D(-6.18±2.61)D,每例随机选取1眼受检。所有受检眼行屈光检查和眼轴长度测定。将黄斑区分为9个区域,测定各区域视网膜厚度后,进行相关因素分析。结果受检者黄斑中心凹视网膜厚度与年龄及眼轴长度均不相关。旁中心各区域视网膜厚度与年龄不相关,与眼轴长度呈负相关,鼻侧内圈除外;随眼轴增长,外圈视网膜厚度较内圈变薄明显。结论随着近视眼眼轴长度增加,除黄斑中心凹视网膜厚度无变化外,旁中心视网膜厚度呈变薄趋势,且外圈变薄较内圈明显。

关键词：近视光学相干断层扫描视网膜厚度

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CYFRA21-1、CEA联合测定对癌性胸水的诊断价值

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实用肿瘤杂志 1998年第3期13卷 149-151,153页

作者：于方治马立雄吴京沈馨上海市胸科医院

检测了１１８例胸水ＣＹＦＲＡ２１－１和ＣＥＡ浓度以及ＡＤＡ活性。其中癌性胸水６７例，结核性胸水４０例，其它良性渗漏液１１例。ＣＹＦＲＡ２１－１对癌胸水的敏感度为６２．６％，特异度为９０．２％；ＣＥＡ的敏感度为５５．２... 详细信息

检测了１１８例胸水ＣＹＦＲＡ２１－１和ＣＥＡ浓度以及ＡＤＡ活性。其中癌性胸水６７例，结核性胸水４０例，其它良性渗漏液１１例。ＣＹＦＲＡ２１－１对癌胸水的敏感度为６２．６％，特异度为９０．２％；ＣＥＡ的敏感度为５５．２％，特异度为１００％。联合测定ＣＹＦＲＡ２１－１和ＣＥＡ对癌性胸水的敏感度可提高到８５．１％。

关键词：胸腔积液癌性诊断 CYFRA21-1 CEA

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半剂量维替泊芬光动力疗法治疗中心性浆液性脉络膜视网膜病变临床观察

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中国实用眼科杂志 2018年第3期36卷 204-208页

作者：孙悦葛健陈琦王芳俞方知朱彩红上海交通大学医学院附属瑞金医院眼科上海200025

目的探讨半剂量维替泊芬光动力疗法(photodynamic therapy,PDT)治疗中心性浆液性脉络膜视网膜病变(central serous chorioretinopathy,CSC)的临床疗效和安全性。方法病例回顾性研究。选择15例(17只眼)确诊CSC患者,患眼病程3〜120个月。... 详细信息

目的探讨半剂量维替泊芬光动力疗法(photodynamic therapy,PDT)治疗中心性浆液性脉络膜视网膜病变(central serous chorioretinopathy,CSC)的临床疗效和安全性。方法病例回顾性研究。选择15例(17只眼)确诊CSC患者,患眼病程3〜120个月。予以半剂量PDT治疗,治疗后随访6〜12个月,分析比较患者PDT前后的最佳矫正视力(BCVA)、间接眼底镜检查、荧光素眼底血管造影(FFA)和光学相干断层扫描(OCT)结果。对同一患眼治疗前后BCVA和黄斑中心凹区视网膜厚度(central foveal thickness,CFT)比较,采用配对f检验。结果患眼经半剂量PDT治疗后末次随访时BCVA为(0.89±0.42),与治疗前BCVA比较,差异有统计学意义(t=3.58;P<0.05)。治疗后末次随访时OCT检查示CFT为(204.00±45.13)μm,与治疗前(413.18±118.69μm)比较,差异有统计学意义(t=-6.289,P<0.05)。患者病程时长与PDT治疗前后BCVA提高值显著相关(r=-0.494,P<0.05)。随访期间患眼视力稳定,病变无复发。结论半剂量维替泊芬光动力疗法对CSC患者的治疗安全有效。为了不导致患者视力不可逆的损伤,还应尽早积极地治疗。

关键词：维替泊芬光动力疗法中心性浆液性脉络膜视N膜病变

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Facile fabrication of the porous adsorbent from natural plant Angelica Sinensis stabilized liquid foam for dye removal

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Green Chemical Engineering 2022年第1期3卷 83-91页

作者： fangzhi Duan Yongfeng Zhu Hui yu Aiqin Wang Key Laboratory of Clay Mineral Applied Research of Gansu Province Center of Eco-material and Green ChemistryLanzhou Institute of Chemical PhysicsChinese Academy of SciencesLanzhou730000China Certer of Materials Science and Optoelectronics Engineering University of Chinese Academy of SciencesBeijing100049China

Porous materials as emerging high-efficiency adsorbents have attracted increasing attention in recent years,due to the high specific surface area,fast adsorption rate,favorable adsorption capacity to heavy metal,dyes,and other pollutants,*** various approaches,the foam template method with the advantage of flexible operation and controllable pores structure is proposed to prepare net type of porous adsorbents with superior adsorption capacity and rapid adsorption *** this process,natural plant Angelica Sinensis(AS)was treated with a simple alkalineheat process,and the resultant product was used firstly to prepare foam with high stability,and the positive effect of the cellulose dissociation and the conversion of ligustilide into amphiphilic moleculars on improving the stability of Pickering foam was *** liquid foam can serve as pore-foaming template and precursor of polymerization for synthesizing porous adsorbent by one-step integrated process of free radical polymerization and silane *** porous adsorbent showed the sufficient porous structure and excellent adsorption performance for cationic dye,with maximum adsorption capacities of 386.13 mg g^(-1) and 284.20 mg g^(-1) for methyl violet(MV)and malachite green(MG).In a word,the novel approach can provide an important reference for green synthesis of high stable foam and the superporous material,and the adsorbent showed great application potential in the field of water treatment.

关键词： Adsorbent Angelica Sinensis Pickering foam Adsorption Dye

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青光眼药物治疗依从性评估工具的适用性

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临床眼科杂志 2019年第2期27卷 138-141页

作者：王晶陈俊邦吴彦霖胡起维俞方知孙昕上海交通大学医学院附属瑞金医院眼科 200025

目的验证青光眼药物治疗依从性评估工具(中文版)在国内的适用性。方法招募112名开角型青光眼或高眼压症患者,所有患者自行完成青光眼药物治疗依从性评估的问卷调查2次,2次调查之间间隔2个月。采用主成分分析(正交旋转)的方法判断青光眼... 详细信息

目的验证青光眼药物治疗依从性评估工具(中文版)在国内的适用性。方法招募112名开角型青光眼或高眼压症患者,所有患者自行完成青光眼药物治疗依从性评估的问卷调查2次,2次调查之间间隔2个月。采用主成分分析(正交旋转)的方法判断青光眼治疗依从性评估工具的各模块是否合理;采用克朗巴哈系数(Cronbach'sα)来判断各模块的内部一致性信度;采用斯皮尔曼等级相关性判断2次问卷调查的稳定性,采用频度分析天花板和地板效应。我们用单变量线性回归的方法统计一般情况中各项指标与用药依从性的关联度。结果本问卷的47个题目中可以提取出24个题目组成6个模块,所有6个模块的内部一致性信度都在可接受的范围(α≥0. 6)。此问卷可重复性也很好,所有的题目都不存在天花板或地板效应。根据线性回归分析结果,发现年龄和婚姻状况与用药依从性相关(P <0. 05)。结论青光眼药物治疗依从性评估工具(中文版)适用于在中文环境下的青光眼患者中应用。如果经过适当的精修,研究者和临床医生都可以将这份问卷用于分析影响患者用药依从性的主要因素和验证干预措施的效果。

关键词：用药依从性青光眼评估工具青光眼局部药物治疗

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