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Genomic surveillance of coxsackievirus A10 reveals genetic features and recent appearance of genogroup D in Shanghai,China,2016–2020

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Virologica Sinica 2022年第2期37卷 177-186页

作者： Jiayu Wang Jiajing Liu fanghao fang Jiajin Wu Tianjiao Ji Yuying Yang Ling Liu Chongshan Li Wanju Zhang Xi Zhang Zheng Teng Microbiology Department Shanghai Municipal Center for Disease Control and PreventionShanghai200336China Microbiology Department Songjiang District Center for Disease Control and PreventionShanghai201620China WHO WPRO Regional Polio Reference Laboratory NHC Key Laboratory for BiosafetyNHC Key Laboratory for Medical VirologyNational Institute for Viral Disease Control and PreventionChinese Center for Disease Control and PreventionBeijing102206China

Coxsackievirus A10(CVA10)is one of the major causative agents of hand,foot and mouth disease(HFMD).To investigate the epidemiological characteristics as well as genetic features of CVA10 currently circulating in Shanghai,China,we collected a total of 9,952 sporadic HFMD cases from January 2016 to December *** the past five years,CVA10 was the fourth prevalent causatives associated with HFMD in Shanghai and the overall positive rate was 2.78%.The annual distribution experienced significant fluctuations over the past five *** addition to entire VP1 sequencing,complete genome sequencing and recombination analysis of CVA10 isolates in Shanghai were further performed.A total of 64 near complete genomes and 11 entire VP1 sequences in this study combined with reference sequences publicly available were integrated into phylogenetic *** CVA10sequences in this study mainly belonged to genogroup C and presented 91%-100%nucleotide identity with other Chinese isolates based on VP1 *** the first time,our study reported the appearance of CVA10 genogroup D in Chinese mainland,which had led to large-scale outbreaks in Europe *** recombination analysis showed the recombination break point located between 5,100 nt and 6,700 nt,which suggesting intertypic recombination with CVA16 genogroup *** conclusion,CVA10 genogroup C was the predominant genogroup in Shanghai during ***10 recombinant genogroup D was firstly reported in circulating in Chinese *** surveillance is needed to better understand the evolution relationships and transmission pathways of CVA10 to help to guide disease control and prevention.

关键词： Coxsackievirus A10(CVA10) Genogroup D Intertypic recombination Hand foot and mouth disease(HFMD)

Virology features of a family cluster of SARS-CoV-2 infections in Shanghai,China

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Biosafety and Health 2021年第4期3卷 187-189页

作者： Yanqiu Zhou Zheng Teng Hongyou Chen Xiaoxian Cui fanghao fang Jiabin Mou Hui Jiang Xi Zhang Shanghai Municipal Center for Disease Control and Prevention Shanghai 200336China

The global spread of SARS-CoV-2 is currently continuing,and the World Health Organization has announced the risk assessment of the viruses as *** this study,we analyzed virology features of SARS-CoV-2 causing a family cluster *** the six family members,five have been laboratory-confirmed infection of SARS-CoV-2 viruses.A total of five SARS-CoV-2 viruses have been isolated from the nasopharyngeal *** complete genome of the viruses exhibited 100%nucleotide identity with each *** two nucleotide differences have been observed between genomes of the isolated viruses and the HCoV/Wuhan/IVDC-HB-01/2019 ***,SARS-CoV-2 has been confirmed as the causation of the family cluster infections.

关键词： SARS-CoV-2 Family cluster Nasopharyngeal swab Full genome sequencing

First Imported Case of SARS-CoV-2 Omicron Subvariant BA.5—Shanghai Municipality,China,May 13,2022

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China CDC weekly 2022年第30期4卷 665-666页

作者： Hui Jiang Changcheng Wu Wenbo Xu Hongyou Chen fanghao fang Min Chen Chaonan Wang Lingyue Yuan Huanyu Wu Zheng Teng Jinyuan Guo Yaxu Zheng Xihong Lyu Xuefei Qiao Guizhen Wu Wenjie Tan Xi Zhang Shanghai Municipal Center for Disease Control and Prevention ShanghaiChina National Institute for Viral Disease Control and Prevention China CDCBeijingChina Songjiang District Center for Disease Control and Prevention ShanghaiChina.

On April 27,2022,an international flight KL857 from Amsterdam,the Netherlands arrived at Pudong International Airport,Shanghai *** were transferred to the quarantine hotel for a routine 14-day medical observation in Songjiang District and regularly tested for severe acute respiratory syndrome coronavirus 2(SARS-CoV-2).One of the passengers(a 37-year-old Chinese male)was reported positive and diagnosed as a mild case on April *** case set out from Uganda(flight KL535)on April 25 and transferred at Amsterdam,the Netherlands on April 26 and Seoul,the Republic of Korea(KL857)on April *** patient has been vaccinated in four doses against coronavirus disease 2019(COVID-19)(Beijing Institute of Biological Products Co.,Ltd)in China and *** diagnosis,he was transferred to Shanghai Public Health Clinical Center for *** recovered after treatment and was discharged on May 12.

关键词： transferred routine doses

无机有机杂化材料催化合成乙酸异戊酯及动力学研究

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重庆大学学报（自然科学版） 2017年第6期40卷 86-94页

作者：梁娟娟赵宇钱李芳浩韩晓祥方苗利浙江工商大学应用化学系杭州310018 杭州医学院杭州310053

以甘氨酸(Gly)和磷钨酸为原料合成的一系列无机有机杂化材料为催化剂,考察各因素对其催化合成乙酸异戊酯的影响,并利用响应面分析法优化乙酸异戊酯合成工艺。研究表明,[GlyH]_(1.0)-H_(2.0)PW_(12)O_(40)催化剂具有最高的催化酯化反应... 详细信息

以甘氨酸(Gly)和磷钨酸为原料合成的一系列无机有机杂化材料为催化剂,考察各因素对其催化合成乙酸异戊酯的影响,并利用响应面分析法优化乙酸异戊酯合成工艺。研究表明,[GlyH]_(1.0)-H_(2.0)PW_(12)O_(40)催化剂具有最高的催化酯化反应活性和重复使用性能。响应面分析法优化乙酸异戊酯合成的最佳条件为:醇酸摩尔数比为1.05∶1,催化剂用量为酸质量的4.5%,反应时间2.0h,带水剂量10mL,该条件下,乙酸异戊酯产率为98.5%,结果与模型预测值基本相符。优化条件下[GlyH]_(1.0)-H_(2.0)PW_(12)O_(40)催化酯化反应表观活化能为79.73kJ/mol。

关键词：磷钨酸甘氨酸乙酸异戊酯响应面分析法动力学

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人副流感病毒疫苗研究进展

中华实验和临床病毒学杂志 2023年第5期37卷 558-563页

作者：王环茹房方皓赵雪王葳陈敏滕峥上海市疾病预防控制中心病原所上海200336

人副流感病毒是一种重要的呼吸道病原体,可在婴幼儿和其他免疫力低下人群中引起支气管炎和肺炎。目前全球尚无获批上市的疫苗与特异性药物可用于人副流感病毒的预防与治疗。国内外关于人副流感病毒疫苗的研究众多,本文将这些研究分为灭... 详细信息

人副流感病毒是一种重要的呼吸道病原体,可在婴幼儿和其他免疫力低下人群中引起支气管炎和肺炎。目前全球尚无获批上市的疫苗与特异性药物可用于人副流感病毒的预防与治疗。国内外关于人副流感病毒疫苗的研究众多,本文将这些研究分为灭活疫苗、减毒活疫苗、亚单位疫苗、mRNA疫苗以及联合疫苗5个方向进行梳理,并以此为依据展开综述。

关键词：副流感病毒疫苗呼吸道感染预防

沉积边缘与跌积边缘—碳酸盐大陆斜坡古代实例及特征

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西南石油学院学报 1989年第4期11卷 25-31页

作者：穆曙光侯方浩方少仙西南石油学院石油勘探系

大陆斜坡是联系浅水台地与深水盆地的枢纽地带,以包括巨大岩块在内的巨厚斜坡边缘型沉积为特征。黔南地区在中三叠世时,具有活跃的碳酸盐大陆斜坡沉积,按其性质,该期斜坡环境可分为沉积边缘型与跌积边缘型。它们主要受强烈而不均匀的断... 详细信息

大陆斜坡是联系浅水台地与深水盆地的枢纽地带,以包括巨大岩块在内的巨厚斜坡边缘型沉积为特征。黔南地区在中三叠世时,具有活跃的碳酸盐大陆斜坡沉积,按其性质,该期斜坡环境可分为沉积边缘型与跌积边缘型。它们主要受强烈而不均匀的断裂作用控制。在不同类型斜坡上,各种沉积作用标志也有较明显的差异。

关键词：大陆斜坡沉积迎缘跌积边缘

2018-2019监测年度上海市A(H1N1)pdm09亚型流感病毒抗原性及HA基因特性分析

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中华实验和临床病毒学杂志 2020年第1期34卷 12-17页

作者：赵雪滕峥房方皓蒋慧周艳秋姜晨彦潘浩袁政安张曦上海市疾病预防控制中心病原生物检定所病毒检测实验室 200336

目的了解上海市在2018—2019流感监测年度中分离的A(H1N1)pdm09亚型流感病毒抗原性及血凝素(hemagglutinin,HA)基因变异情况。方法利用血凝抑制试验,对2018年4月至2019年3月上海市分离的84株A(H1N1)pdm09亚型流感毒株进行了抗原性分析,... 详细信息

目的了解上海市在2018—2019流感监测年度中分离的A(H1N1)pdm09亚型流感病毒抗原性及血凝素(hemagglutinin,HA)基因变异情况。方法利用血凝抑制试验,对2018年4月至2019年3月上海市分离的84株A(H1N1)pdm09亚型流感毒株进行了抗原性分析,并对其中65株病毒的HA基因进行了序列测定及分析。结果2018—2019流感监测年度上海市主要流行6B.1分支的A(H1N1)pdm09亚型流感病毒,少数流行株属于6B.2分支。抗原性分析结果显示监测毒株中97.62%为疫苗株A/Michigan/45/2015鸡胚株的类似株;核苷酸序列分析显示,6B.1分支毒株的HA基因核苷酸序列与疫苗株A/Michigan/45/2015的同源性为97.1%~98.8%,与WHO推荐的2019-2020年度的疫苗株A/Brisbane/02/2018的同源性为97.5%~99.4%;氨基酸序列分析显示,HA蛋白主要发生了15个位点改变,其中S91R、S181T及T202I位点变异分别涉及到Cb区、Sa区及Sb区3个抗原决定簇,提示病毒发生了抗原漂移。结论本监测年度上海市流行的绝大部分A(H1N1)pdm09亚型流感病毒与WHO推荐的疫苗组分匹配性良好,但HA基因与其编码的氨基酸持续变异,应继续病毒变异监测,为疫苗筛选提供有效的数据。

关键词： A(H1N1)pdm09亚型流感病毒血凝素抗原性基因特性

新型冠状病毒肺炎患者粪便中新型冠状病毒的分离鉴定

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上海预防医学 2022年第12期34卷 1173-1179页

作者：周艳秋崔晓娴牟嘉斌房方皓滕峥吴寰宇陈敏张曦上海市疾病预防控制中心病原生物检定所上海200336 上海市疾病预防控制中心上海200336

【目的】分离鉴定新型冠状病毒肺炎(COVID-19)患者粪便标本中的新型冠状病毒(SARS-CoV-2),并进行生物学特性分析。【方法】利用Vero E6细胞对收集到的SARS-CoV-2核酸阳性粪便标本开展病毒分离,对产生细胞病变的培养物进行病毒核酸检测... 详细信息

【目的】分离鉴定新型冠状病毒肺炎(COVID-19)患者粪便标本中的新型冠状病毒(SARS-CoV-2),并进行生物学特性分析。【方法】利用Vero E6细胞对收集到的SARS-CoV-2核酸阳性粪便标本开展病毒分离,对产生细胞病变的培养物进行病毒核酸检测、免疫荧光抗原检测、病毒含量测定及全基因组测序分型。收集每代细胞培养物后进行半数组织培养感染剂量(TCID50)实验。【结果】8份粪便标本经处理后分别接种Vero E6细胞,培养48 h,1份标本在Vero E6细胞上发现明显细胞病变。8例COVID-19患者粪便病毒核酸阳性标本中分离到1株SARS-CoV-2,阳性分离率为12.5%。病毒能稳定传至第3代,P1代病毒TCID50为104.0/0.2 mL,P2代病毒TCID50为104.5/0.2 mL,P3代病毒TCID50为104.75/0.2 mL。8份粪便样本中仅1份有SARS-CoV-2活毒的复制扩增,传代培养的核酸检测Ct值约为10。该分离株的序列与Wuhan-Hu-1株序列(Gen Bank MN908947)的同源性>99.99%。【结论】从COVID-19患者粪便中分离到SARS-CoV-2活毒株,COVID-19患者中不仅存在粪便排毒的现象,且有活病毒存在。

关键词：新型冠状病毒粪便 Vero E6细胞聚合酶链反应全基因组测序

2018-2020年上海市B/Victoria系流感病毒的流行特征及基因特性分析

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疾病监测 2020年第12期35卷 1074-1080页

作者：赵雪滕峥房方皓袁芳姜晨彦袁政安张曦上海市疾病预防控制中心上海200336

目的分析2018—2020年上海市分离的B/Victoria系流感毒株与疫苗株的匹配性及基因变异情况。方法利用血凝抑制实验,对142株B/Victoria系流感毒株进行了抗原性分析,并选取了63株开展了血凝素(HA)及神经氨酸酶(NA)基因序列分析。结果2018—... 详细信息

目的分析2018—2020年上海市分离的B/Victoria系流感毒株与疫苗株的匹配性及基因变异情况。方法利用血凝抑制实验,对142株B/Victoria系流感毒株进行了抗原性分析,并选取了63株开展了血凝素(HA)及神经氨酸酶(NA)基因序列分析。结果2018—2020年上海市流行的B/Victoria系流感毒株主要属于V1A.3分支,少数属于V1A.1分支及未缺失的V1A分支;抗原性分析显示,26.76%的流行株是疫苗株B/Colorado/06/2017鸡胚株的低反应株,与疫苗株相比,V1A.3分支流行株在HA蛋白的120环、150环、160环及190螺旋等关键的抗原决定簇及受体结合关键部位发生了5个氨基酸位点改变。结论2018—2020监测年度B/Victoria系流行株与世界卫生组织推荐的疫苗株组分B/Colorado/06/2017匹配性不佳,仍需密切监测流行株的谱系及变异情况,为疫苗株的筛选提供可靠的数据。

关键词： B/Victoria系流感病毒血凝素神经氨酸酶抗原性基因特性