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SARS-CoV-2:Air pollution highly correlated to the increase in *** case of Guadalajara,Jalisco,Mexico

Infectious Disease Modelling 2023年第2期8卷 445-457页

作者： Elizabeth Torres-Anguiano Itzel Sanchez-Lopez Angeles Garduno-Robles Jorge David Rivas-Carrillo Edgar Alfonso Rivera-leon Sergio Sanchez-Enríquez Luis Fernando Ornelas-Hernandez Fernando Zazueta leon-quintero eduardo narciso salazar leon-quintero Guillermo Enrique Juarez-Lopez Fernando Antonio Sanchez-Zubieta Mariana Ochoa-Bru Abraham Zepeda-Moreno Onkogenetik/Mexicana de Investigacion y Biotectogía S.A.de C.V GuadalajaraJaliscoMexico Unidad de Biología Molecular Investigacion y DiagnosticoHospital San JavierGuadalajaraJaliscoMexico Departamento de Fisiología Centro Universitario de Ciencias de la SaludUniversidad de GuadalajaraGuadalajaraJaliscoMexico Departamento de Biología Molecular y Genomica Centro Universitario de Ciencias de la SaludUniversidad de GuadalajaraGuadalajaraJaliscoMexico Departamento de Clínicas Centro Universitario de los AltosUniversidad de GuadalajaraTepatitlan de MorelosJaliscoMexico Departamento de Clínicas Medicas Centro Universitario de Ciencias de la SaludUniversidad de GuadalajaraGuadalajaraJaliscoMexico Servicio de Hemato-Oncología Pediatrica Hospital Civil de Guadalajara“Dr.Juan I.Menchaca”GuadalajaraJaliscoMexico Hospital Civil de Guadalajara“Fray Antonio Alcalde” GuadalajaraJaliscoMexico

Objectives:To determine whether air pollution or changes in SARS-CoV-2 lineages lead to an increase in ***:Descriptive statistics were used to calculate rates of infection(2020-2021).RT ePCR was used to compare viral loads from October 2020 to February *** sequencing(NGS)(n=92)was used to examine and phylogenetically map SARS-CoV-2 lineages.A correlative“air pollution/temperature”index(I)was developed using regression ***_(2.5),PM_(10),O_(3),NO_(2),SO_(2),and CO concentrations were analyzed and compared to the ***:The mortality rate during the last year was~32%.Relative SARS-CoV-2 viral loads increased in December 2020 and January *** revealed that approximately 80%of SARS-CoV-2 linages were B.1.243(33.7%),B1.1.222(11.2%),B.1.1(9%),B.1(7%),B.1.1.159(7%),and B.1.2(7%).Two periods were analyzed,the prehigh-and high-mortality periods and no significant lineage differences or new lineages were *** correlations of air pollution/temperature index values with mortality were found for IPM_(2.5) and IPM_(10).INO_(2).ISO_(2),and ICO but not for O_(3).Using ICO,we developed a model to predict mortality with an estimated variation of~±5 deaths per day.

关键词： Air pollution COVID-19 Guadalajara Mexico SARS-CoV-2 SARS-CoV-2 lineages

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