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Engineering 2023年第9期28卷 21-25页

作者： Peng Jiang Hengqian Gan Rui Yao Jinghai Sun Jiguang Lu dongjun yu Hui Li Jinglong yu Bin Dong Xiaoming Chai Jianing Yin Guizhou Radio Astronomical Observatory Guizhou UniversityGuiyang 550025China FAST Operation and Development Center National Astronomical ObservatoriesChinese Academy of SciencesBeijing 100101China

In the 90 years since its inception,radio astronomy has become the setting of almost all major astronomical discoveries and a hothouse for Nobel Prizes in *** a result,countries all over the world have actively explored new engineering concepts to build large-aperture radio *** by their self-weight and wind load,100 m radio telescopes are regarded as the maximum limit of traditional radio *** perspective allowed the Arecibo 305 m telescope—built by Cornell University in the United States in 1963—to dominate the field for more than half a *** this period,scholars have been exploring how to further expand their horizons in order to make a breakthrough in the problem of the universe.

关键词： breakthrough telescope horizon

Commissioning progress of the FAST

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Science China(Physics,Mechanics & Astronomy) 2019年第5期62卷 3-24页

作者： Peng Jiang YouLing yue HengQian Gan Rui Yao Hui Li GaoFeng Pan JingHai Sun dongjun yu HongFei Liu Ningyu Tang Lei Qian JiGuang Lu Jun Yan Bo Peng ShuXin Zhang QiMing Wang Qi Li Di Li CAS Key Laboratory of FAST National Astronomical Observatories Chinese Academy of Sciences School of Astronomy and Space Science University of Chinese Academy of Sciences

The Five-hundred-meter Aperture Spherical radio Telescope(FAST) was completed with its main structure installed on September 25, 2016, after which it entered the commissioning phase. This paper aims to introduce the commissioning progress of the FAST over the past two years. To improve its operational reliability and ensure effective observation time, FAST has been equipped with a real-time information system for the active reflector system and hierarchical commissioning scheme for the feed support system, which ultimately achieves safe operation of the two systems. For meeting the high-performance indices, a highprecision measurement system was set up based on the effective control methods that were implemented for the active reflector system and feed support system. Since the commissioning of the FAST, a low-frequency ultra-wideband receiver and 19-beam1.05-1.45 GHz receiver have been mainly used. Telescope efficiency, pointing accuracy, and system noise temperature were completely tested and ultimately achieved the acceptance indices of the telescope. The FAST has been in the process of national acceptance preparations and has begun to search for pulsars. In the future, it will still strive to improve its capabilities and expand its application prospects.

关键词： radio telescopes and instrumentation astronomical observations radio wave receivers algorithms and implementation control systems

基于加权朴素贝叶斯分类器和极端随机树的蛋白质接触图预测

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南京航空航天大学学报 2018年第5期50卷 619-628页

作者：金康荣於东军南京理工大学计算机科学与工程学院南京210094

提出一个新的基于集成学习的预测器(TargetPCM),对蛋白质接触图(特别是中长程)进行高精度的预测。首先,TargetPCM使用加权朴素贝叶斯分类器(Weighted Nave Bayes classifier,WNBC)融合3个接触图预测器的输出,其中WNBC中的权重参数通... 详细信息

提出一个新的基于集成学习的预测器(TargetPCM),对蛋白质接触图(特别是中长程)进行高精度的预测。首先,TargetPCM使用加权朴素贝叶斯分类器(Weighted Nave Bayes classifier,WNBC)融合3个接触图预测器的输出,其中WNBC中的权重参数通过粒子群算法优化得到;其次,将WNBC融合后的输出和基于序列的特征进行组合,得到更具鉴别能力的特征;在此基础上,应用极端随机树训练得到最终的蛋白质接触图预测模型。为了验证TargetPCM的有效性,在包含98个非冗余蛋白质的数据集上进行了测试。结果表明:对于短程、中程和长程接触,TargetPCM的Top L/5精度比现有最好的集成预测器(NeBcon)分别提高了8.2%,16.1%和5.3%。在CASP11上进一步的验证表明,对于短程、中程和长程接触,TargetPCM的Top L/5精度比现有最好的基于协同进化的集成预测器(MetaPSICOV)分别提高了7.4%,9.1%和7.5%。实验结果验证了本文所提蛋白质接触图预测方法的有效性。

关键词：模式识别与智能系统蛋白质接触图特征提取加权朴素贝叶斯分类器粒子群算法极端随机树

Status and perspectives of the CRAFTS extra-galactic HI survey

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Science China(Physics,Mechanics & Astronomy) 2019年第5期62卷 52-60页

作者： Kai Zhang JingWen Wu Di Li Marko Krco Lister Staveley-Smith Ningyu Tang Lei Qian MengTing Liu ChengJin Jin YouLing yue Yan Zhu HongFei Liu dongjun yu JingHai Sun GaoFeng Pan Hui Li HengQian Gan Rui Yao FAST Collaboration National Astronomical Observatories Chinese Academy of SicencesBeijing 100101China University of Chinese Academy of Sciences Beijing 100049China CAS Key Laboratory of FAST National Astronomical Obserx'atoriesChinese Academy of SciencesBeijing 100101China International Centre for Radio Astronomy Research (ICRAR) The University1 of Western AustraliaPerth 6907Australia ARC Centre of Excellence for All Sky Astrophysics in 3 Dimensions (ASTRO 3D) The University of Western AustraliaPerth 6907Australia 不详

The Five-hundred-meter Aperture Spherical radio Telescope(FAST) is expected to complete its commissioning in 2019. FAST will soon begin the Commensal Radio Astronomy FasT Survey(CRAFTS), a novel and unprecedented commensal drift scan survey of the entire sky visible from FAST. The goal of CRAFTS is to cover more than 20000 deg2 and reach redshift up to about 0.35. We provide empirical measurements of the beam size and sensitivity of FAST across the 1.05 to 1.45 GHz frequency range of the FAST L-band array of 19-beams(FLAN). Using a simulated HI-galaxy catalogue based on the HI Mass Function(HIMF), we estimate the number of galaxies that CRAFTS may detect. At redshifts below 0.35, over 6 × 105 HI galaxies may be detected. Below the redshift of 0.07, the CRAFTS HIMF will be complete above a mass threshold of 109.5 M⊙. FAST will be able to investigate the environmental and redshift dependence of the HIMF to an unprecedented depth, shedding light onto the missing baryon and missing satellite problems.

关键词： HI regions and 21-cm lines radio telescopes and instrumentation statistical and correlative studies of properties

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蛋白质残基接触图预测

南京理工大学学报 2019年第1期43卷 1-12页

作者：於东军李阳南京理工大学计算机科学与工程学院江苏南京210094

蛋白质是由多个氨基酸组成的长链,是生物体的必要组成成分,参与了生命活动的每一个进程。蛋白质结构决定了许多蛋白质的功能,准确预测蛋白质中氨基酸残基接触对于蛋白质结构预测具有重要意义,蛋白质残基接触问题已经成为当前生物信息领... 详细信息

蛋白质是由多个氨基酸组成的长链,是生物体的必要组成成分,参与了生命活动的每一个进程。蛋白质结构决定了许多蛋白质的功能,准确预测蛋白质中氨基酸残基接触对于蛋白质结构预测具有重要意义,蛋白质残基接触问题已经成为当前生物信息领域的热点问题。该文首先给出了蛋白质残基接触图预测的相关背景知识及其重要意义;其次,总结了当前国内外研究的主流方法,包括基于局部相关性的方法、直接耦合分析法与其后处理的方法、以及基于有监督机器学习的方法,并对其中的代表性方法进行了阐述;结合国际蛋白质结构预测竞赛(Critical assessment of protein structure prediction,CASP)的结果对现有模型的性能做了对比和分析;在此基础上,探讨了残基接触图预测在蛋白质结构功能建模中的应用;最后,针对蛋白质接触图预测中存在的若干难点问题,给出了有望取得突破的若干研究方向。

关键词：蛋白质残基接触图蛋白质结构预测协同进化机器学习国际蛋白质结构预测竞赛

基于多视角特征组合与随机森林的G蛋白偶联受体与药物相互作用预测

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南京理工大学学报 2016年第1期40卷 1-9页

作者：刘光徽胡俊於东军南京理工大学计算机科学与工程学院江苏南京210094 南京财经大学信息工程学院江苏南京210046

为了提高G蛋白偶联受体(G-protein-coupled receptors,GPCR)与药物相互作用预测的精度,该文提出一种基于多视角特征组合与随机森林的GPCR-Drug相互作用预测新方法。该方法首先从氨基酸组成成分和蛋白质进化视角分别抽取GPCR的序列特征,... 详细信息

为了提高G蛋白偶联受体(G-protein-coupled receptors,GPCR)与药物相互作用预测的精度,该文提出一种基于多视角特征组合与随机森林的GPCR-Drug相互作用预测新方法。该方法首先从氨基酸组成成分和蛋白质进化视角分别抽取GPCR的序列特征,并从分子指纹视角抽取药物分子的特征;将所抽取的多视角特征进行组合,得到GPCR-Drug配对的特征表示;基于所提出的GPCR-Drug特征表示方法,使用随机森林构建预测模型。在标准数据集上的交叉验证和独立测试结果验证了该文所述方法的有效性。

关键词：偶联受体 G蛋白偶联受体药物多视角特征氨基酸组分序列特征分子指纹随机森林

基于一维卷积神经网络的蛋白质-ATP绑定位点预测

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计算机应用 2019年第11期39卷 3146-3150页

作者：张寓於东军南京理工大学计算机科学与工程学院

为了提高预测腺嘌呤核苷三磷酸(ATP)绑定位点的准确率,提出了一种基于一维卷积神经网络(1D-CNN)的方法。首先,以蛋白质的序列信息为基础,融合位置特异性得分矩阵信息、二级结构信息和水溶性信息,使用随机下采样的方法消除数据不平衡的影... 详细信息

为了提高预测腺嘌呤核苷三磷酸(ATP)绑定位点的准确率,提出了一种基于一维卷积神经网络(1D-CNN)的方法。首先,以蛋白质的序列信息为基础,融合位置特异性得分矩阵信息、二级结构信息和水溶性信息,使用随机下采样的方法消除数据不平衡的影响,再对缺失的特征进行再编码补齐,得到训练特征。训练一个1D-CNN来预测蛋白质-ATP绑定位点,优化网络结构,并且进行实验来对比所提方法和其他机器学习方法的优劣。实验结果展示了所提方法的有效性,并且该方法与传统支持向量机(SVM)相比在AUC指标上有部分的提升。

关键词：蛋白质-ATP 卷积神经网络数据不平衡问题分类

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用于行人重识别的多类型特征网络

模式识别与人工智能 2020年第10期33卷 879-888页

作者：王鹏宋晓宁吴小俊於东军江南大学人工智能与计算机学院无锡214122 南京理工大学计算机科学与工程学院南京210094

近年来,注意机制在行人重识别任务中效果较优,但是不同类型的注意机制(如空间注意、自注意等)联合使用的效果仍然有待提高.因此,文中首先提出改进型的卷积块注意模型(CBAM-Pro),再提出多类型特征网络模型.对CBAM-Pro与自注意机制的集成... 详细信息

近年来,注意机制在行人重识别任务中效果较优,但是不同类型的注意机制(如空间注意、自注意等)联合使用的效果仍然有待提高.因此,文中首先提出改进型的卷积块注意模型(CBAM-Pro),再提出多类型特征网络模型.对CBAM-Pro与自注意机制的集成提取不同关注域的特征,同时引入不同划分粒度的局部特征,联合进行行人重识别.在现有的通用基准数据集上的实验验证文中模型的有效性与可靠性.

关键词：行人重识别注意机制特征划分多类型特征

基于主元分析和线性判别分析降维的稀疏表示分类

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南京理工大学学报 2018年第3期42卷 286-291页

作者：那天宋晓宁於东军江南大学物联网工程学院江苏无锡214122 南京理工大学计算机科学与工程学院江苏南京210094

为解决传统的稀疏表示分类(SRC)算法在小样本人脸识别过程中的过大时间开销问题,该文提出2种基于降维的SRC算法。扩展主元分析(EPCA)算法利用PCA算法构造约束优化稀疏模型,对测试样本进行线性表示,通过比较测试样本和每类训练样本的重构... 详细信息

为解决传统的稀疏表示分类(SRC)算法在小样本人脸识别过程中的过大时间开销问题,该文提出2种基于降维的SRC算法。扩展主元分析(EPCA)算法利用PCA算法构造约束优化稀疏模型,对测试样本进行线性表示,通过比较测试样本和每类训练样本的重构PCA系数进行决策分类。EPCA+线性判别分析(EPCA+LDA)算法在EPCA算法的基础上增加LDA约束模型,提高重构样本的稀疏表示的鉴别性。将该文算法应用于AR和FERET人脸数据库,与扩展SRC(ESRC)、SRC、SRC_PCA、协同表达分类(CRC)算法相比,该文算法有较高的识别率和较低的时间复杂度。将EPCA算法和EPCA+LDA算法应用于FETET数据集,识别率分别为61.46%和59.17%,运行时间分别为383.02 s和220.62 s。

关键词：主元分析线性判别分析降维稀疏表示分类人脸识别协同表达分类